70 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene XfasM23_1926 on replicon NC_010577
Organism: Xylella fastidiosa M23



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010577  XfasM23_1926  glycoside hydrolase family protein  100 
 
 		 356 aa  745    Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.00103696  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2002  hypothetical protein  98.31 
 
 		 356 aa  733    Xylella fastidiosa M12  Bacteria  hitchhiker  0.00113016  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01642  glycosyl hydrolase, family 18  74.56 
 
 		 343 aa  541  1e-153  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.107746  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21810  chitinase  28.21 
 
 		 374 aa  142  9e-33  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0196  glycoside hydrolase family 18  29.91 
 
 		 358 aa  140  3e-32  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0992  glycoside hydrolase family 18  26.24 
 
 		 426 aa  137  3.0000000000000003e-31  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00884991  hitchhiker  0.00000357477 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4725  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  30.49 
 
 		 433 aa  134  3e-30  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2245  glycoside hydrolase family 18  30.22 
 
 		 430 aa  133  5e-30  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2159  glycoside hydrolase family protein  29.07 
 
 		 307 aa  131  2.0000000000000002e-29  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0072  glycoside hydrolase family 18  24.53 
 
 		 384 aa  126  7e-28  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000514122  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0307  glycoside hydrolase family protein  27.91 
 
 		 426 aa  124  3e-27  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.8234  normal  0.0394761 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1378  glycoside hydrolase family 18  29.7 
 
 		 647 aa  124  4e-27  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.112456  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0236  glycoside hydrolase family protein  27.91 
 
 		 427 aa  122  8e-27  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.946452  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0242  glycoside hydrolase family 18  28.34 
 
 		 484 aa  121  1.9999999999999998e-26  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.0000000747076  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0646  glycoside hydrolase family protein  27.09 
 
 		 349 aa  118  9.999999999999999e-26  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0248633  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1167  glycoside hydrolase family protein  26.15 
 
 		 418 aa  117  3.9999999999999997e-25  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0000303009  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0063  glycoside hydrolase family protein  26.2 
 
 		 312 aa  115  1.0000000000000001e-24  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00787456 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3443  polysaccharide deacetylase/glycosyl transferase, group 2 family protein  24.16 
 
 		 1115 aa  112  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1111  glycoside hydrolase family 18  26.17 
 
 		 426 aa  110  3e-23  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0223  Peptidoglycan-binding lysin domain protein  30.35 
 
 		 470 aa  110  4.0000000000000004e-23  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3431  polysaccharide deacetylase/glycosyl transferase, group 2 family protein  24.34 
 
 		 1115 aa  110  5e-23  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1392  glycoside hydrolase family 18  28.01 
 
 		 415 aa  109  8.000000000000001e-23  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.282919  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3202  glycosyl transferase and polysaccharide deacetylase fusion  23.85 
 
 		 1115 aa  108  1e-22  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00982946  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3135  group-specific protein  23.55 
 
 		 1119 aa  108  2e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21670  Inactive glysosyl hydrolase family 18  24.69 
 
 		 316 aa  107  2e-22  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.057245  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0014  glycoside hydrolase family 18  25.83 
 
 		 428 aa  104  2e-21  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0017  glycoside hydrolase family 18  24.92 
 
 		 428 aa  103  4e-21  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000350058  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1652  peptidoglycan-binding LysM  28.3 
 
 		 423 aa  103  6e-21  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0437623  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0258  glycoside hydrolase family 18  27.89 
 
 		 390 aa  102  1e-20  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.210601  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0424  glycoside hydrolase family protein  26.57 
 
 		 793 aa  101  2e-20  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.553023  normal  0.723978 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1815  polysaccharide deacetylase/glycosyl transferase, group 2 family protein  22.94 
 
 		 1115 aa  100  3e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.259825 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0643  glycoside hydrolase family 18  24.65 
 
 		 542 aa  101  3e-20  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.649155  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3715  glycosyl hydrolase, family 18  27.34 
 
 		 430 aa  99  1e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00419568  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1600  glycosyl hydrolase, family 18  27.34 
 
 		 430 aa  99  1e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000035031  hitchhiker  0.0000741808 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3627  glycosy hydrolase family protein  27.64 
 
 		 430 aa  98.6  1e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.266855  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3402  glycosy hydrolase family protein  27.31 
 
 		 430 aa  97.8  2e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0158491  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3668  glycosy hydrolase family protein  27.31 
 
 		 430 aa  97.8  2e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0200729  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2862  glycoside hydrolase family protein  24.78 
 
 		 329 aa  98.2  2e-19  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.766607  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3294  glycoside hydrolase family protein  27.27 
 
 		 430 aa  98.2  2e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000717596  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0489  glycoside hydrolase family 18  24.84 
 
 		 579 aa  97.8  3e-19  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.101404 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3364  glycosyl hydrolase  27.31 
 
 		 430 aa  97.8  3e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000727099  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3314  glycosyl hydrolase  26.38 
 
 		 430 aa  97.4  3e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000190011  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3618  glycosyl hydrolase, family 18  27.31 
 
 		 430 aa  97.8  3e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000703851 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2256  glycoside hydrolase family protein  26.91 
 
 		 430 aa  97.1  4e-19  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00349057  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2895  glycoside hydrolase family protein  26.83 
 
 		 583 aa  97.1  4e-19  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.22791  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2901  glycoside hydrolase family 18  27.05 
 
 		 420 aa  96.3  8e-19  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2751  polysaccharide deacetylase  25.84 
 
 		 1118 aa  94.4  2e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.880093 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1595  polysaccharide deacetylase  24.77 
 
 		 1101 aa  94.7  2e-18  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1760  glycoside hydrolase family 18  26.8 
 
 		 444 aa  94.4  3e-18  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4489  glycoside hydrolase family 18  25.63 
 
 		 688 aa  92.4  9e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00179307  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1871  glycosyl hydrolase-like protein  26.42 
 
 		 451 aa  91.3  3e-17  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.00112913  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3749  glycoside hydrolase family protein  23.66 
 
 		 567 aa  89.7  7e-17  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.634589  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6504  glycoside hydrolase family 18  29.07 
 
 		 580 aa  88.2  2e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.462594  normal  0.267228 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3228  glycosyl transferase, group 2 family protein/polysaccharide deacetylase family protein  23.77 
 
 		 927 aa  85.1  0.000000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.80947  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0228  polysaccharide deacetylase  25.23 
 
 		 1124 aa  80.9  0.00000000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.523895 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1800  peptidoglycan-binding LysM  22.07 
 
 		 503 aa  79.7  0.00000000000007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.199953  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0397  polysaccharide deacetylase  24.78 
 
 		 1154 aa  77.4  0.0000000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.553625 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3633  glycosyl hydrolase, family 18  27.17 
 
 		 342 aa  67  0.0000000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00032654  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2061  copper amine oxidase domain protein  22.5 
 
 		 521 aa  65.1  0.000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000000589284  hitchhiker  0.0000623397 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_05077  conserved hypothetical protein  25.09 
 
 		 1782 aa  60.5  0.00000005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.724169  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1598  copper amine oxidase domain protein  31.82 
 
 		 418 aa  55.1  0.000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0744  copper amine oxidase domain-containing protein  24.31 
 
 		 418 aa  52.4  0.00001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1379  glycosyl hydrolase-like protein  27.69 
 
 		 330 aa  50.1  0.00006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.121163  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0729  copper amine oxidase domain-containing protein  25.77 
 
 		 426 aa  49.3  0.0001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3458  group-specific protein  25.22 
 
 		 872 aa  47  0.0005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2224  hypothetical protein  28.48 
 
 		 332 aa  45.1  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0285568  hitchhiker  0.000126122 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1460  glycosyl hydrolase family chitinase  25.91 
 
 		 763 aa  44.3  0.003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.860815 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1268  glycosyl hydrolase-like protein  30.86 
 
 		 808 aa  44.3  0.003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1613  glycosyl hydrolase-like protein  27.16 
 
 		 807 aa  43.9  0.004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.5027  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3356  Chitinase  30.06 
 
 		 373 aa  43.1  0.007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.934755  normal  0.141475 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>