246 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccel_1111 on replicon NC_011898
Organism: Clostridium cellulolyticum H10



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011898  Ccel_1111  glycoside hydrolase family 18  100 
 
 		 426 aa  871    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0223  Peptidoglycan-binding lysin domain protein  45.79 
 
 		 470 aa  367  1e-100  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1652  peptidoglycan-binding LysM  43.74 
 
 		 423 aa  359  4e-98  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0437623  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0017  glycoside hydrolase family 18  44.55 
 
 		 428 aa  347  2e-94  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000350058  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0014  glycoside hydrolase family 18  43.62 
 
 		 428 aa  342  5.999999999999999e-93  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0258  glycoside hydrolase family 18  42.82 
 
 		 390 aa  321  1.9999999999999998e-86  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.210601  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3627  glycosy hydrolase family protein  40.73 
 
 		 430 aa  316  6e-85  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.266855  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3294  glycoside hydrolase family protein  40.27 
 
 		 430 aa  315  9.999999999999999e-85  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000717596  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3364  glycosyl hydrolase  40.05 
 
 		 430 aa  315  9.999999999999999e-85  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000727099  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1600  glycosyl hydrolase, family 18  39.72 
 
 		 430 aa  315  9.999999999999999e-85  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000035031  hitchhiker  0.0000741808 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3618  glycosyl hydrolase, family 18  40.05 
 
 		 430 aa  315  9.999999999999999e-85  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000703851 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3715  glycosyl hydrolase, family 18  39.72 
 
 		 430 aa  315  9.999999999999999e-85  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00419568  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2256  glycoside hydrolase family protein  40.18 
 
 		 430 aa  315  9.999999999999999e-85  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00349057  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3314  glycosyl hydrolase  40.27 
 
 		 430 aa  314  1.9999999999999998e-84  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000190011  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3402  glycosy hydrolase family protein  39.82 
 
 		 430 aa  313  4.999999999999999e-84  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0158491  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3668  glycosy hydrolase family protein  39.82 
 
 		 430 aa  313  4.999999999999999e-84  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0200729  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2901  glycoside hydrolase family 18  36.6 
 
 		 420 aa  271  2e-71  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2245  glycoside hydrolase family 18  35.96 
 
 		 430 aa  267  2e-70  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3633  glycosyl hydrolase, family 18  38.91 
 
 		 342 aa  214  1.9999999999999998e-54  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00032654  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4725  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  30.67 
 
 		 433 aa  166  9e-40  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0646  glycoside hydrolase family protein  32.5 
 
 		 349 aa  164  3e-39  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0248633  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21810  chitinase  31.91 
 
 		 374 aa  156  7e-37  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2159  glycoside hydrolase family protein  32.09 
 
 		 307 aa  149  9e-35  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0063  glycoside hydrolase family protein  32.79 
 
 		 312 aa  149  9e-35  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00787456 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0992  glycoside hydrolase family 18  29.31 
 
 		 426 aa  134  3.9999999999999996e-30  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00884991  hitchhiker  0.00000357477 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21670  Inactive glysosyl hydrolase family 18  26.76 
 
 		 316 aa  130  3e-29  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.057245  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01642  glycosyl hydrolase, family 18  29 
 
 		 343 aa  129  7.000000000000001e-29  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.107746  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1871  glycosyl hydrolase-like protein  31.9 
 
 		 451 aa  130  7.000000000000001e-29  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.00112913  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0072  glycoside hydrolase family 18  26.3 
 
 		 384 aa  125  2e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000514122  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0424  glycoside hydrolase family protein  31.49 
 
 		 793 aa  122  9.999999999999999e-27  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.553023  normal  0.723978 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1800  peptidoglycan-binding LysM  27.96 
 
 		 503 aa  116  7.999999999999999e-25  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.199953  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3135  group-specific protein  24.51 
 
 		 1119 aa  115  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0196  glycoside hydrolase family 18  26.26 
 
 		 358 aa  114  4.0000000000000004e-24  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1815  polysaccharide deacetylase/glycosyl transferase, group 2 family protein  24.31 
 
 		 1115 aa  113  5e-24  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.259825 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3431  polysaccharide deacetylase/glycosyl transferase, group 2 family protein  24.31 
 
 		 1115 aa  113  7.000000000000001e-24  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3443  polysaccharide deacetylase/glycosyl transferase, group 2 family protein  23.53 
 
 		 1115 aa  112  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1926  glycoside hydrolase family protein  26.17 
 
 		 356 aa  110  3e-23  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.00103696  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2002  hypothetical protein  26.17 
 
 		 356 aa  110  4.0000000000000004e-23  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  hitchhiker  0.00113016  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0307  glycoside hydrolase family protein  27.3 
 
 		 426 aa  108  2e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.8234  normal  0.0394761 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3202  glycosyl transferase and polysaccharide deacetylase fusion  22.88 
 
 		 1115 aa  107  5e-22  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00982946  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1167  glycoside hydrolase family protein  28.03 
 
 		 418 aa  103  6e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0000303009  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0236  glycoside hydrolase family protein  24.28 
 
 		 427 aa  98.2  3e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.946452  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3228  glycosyl transferase, group 2 family protein/polysaccharide deacetylase family protein  23.5 
 
 		 927 aa  94.4  4e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.80947  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0242  glycoside hydrolase family 18  25.5 
 
 		 484 aa  91.7  2e-17  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.0000000747076  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4489  glycoside hydrolase family 18  27.76 
 
 		 688 aa  91.7  2e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00179307  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2862  glycoside hydrolase family protein  23.79 
 
 		 329 aa  90.9  4e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.766607  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2895  glycoside hydrolase family protein  24.9 
 
 		 583 aa  89.7  1e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.22791  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0489  glycoside hydrolase family 18  23.08 
 
 		 579 aa  89  2e-16  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.101404 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3749  glycoside hydrolase family protein  25.16 
 
 		 567 aa  83.6  0.000000000000007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.634589  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1378  glycoside hydrolase family 18  24.53 
 
 		 647 aa  80.5  0.00000000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.112456  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1392  glycoside hydrolase family 18  23.08 
 
 		 415 aa  77.8  0.0000000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.282919  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0643  glycoside hydrolase family 18  22.64 
 
 		 542 aa  72.8  0.00000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.649155  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0397  polysaccharide deacetylase  23.91 
 
 		 1154 aa  72.4  0.00000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.553625 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0228  polysaccharide deacetylase  21.94 
 
 		 1124 aa  72  0.00000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.523895 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6504  glycoside hydrolase family 18  28.23 
 
 		 580 aa  71.2  0.00000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.462594  normal  0.267228 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1271  peptidoglycan-binding LysM  34.78 
 
 		 307 aa  70.1  0.00000000007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000333433 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1760  glycoside hydrolase family 18  26.75 
 
 		 444 aa  68.9  0.0000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_03671  hypothetical protein  38.83 
 
 		 287 aa  68.2  0.0000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.651012  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1595  polysaccharide deacetylase  24.42 
 
 		 1101 aa  67  0.0000000005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3458  group-specific protein  29.31 
 
 		 872 aa  67.4  0.0000000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1096  cell wall hydrolase, SleB  37 
 
 		 304 aa  66.2  0.000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.345588  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2172  peptidase M23B  27.85 
 
 		 284 aa  64.7  0.000000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_21721  LysM domain-containing protein  34.31 
 
 		 499 aa  64.7  0.000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0486774 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10980  peptidase M23B  35.79 
 
 		 274 aa  63.9  0.000000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000310987  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1598  copper amine oxidase domain protein  26.32 
 
 		 418 aa  62.8  0.00000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1613  glycosyl hydrolase-like protein  27.75 
 
 		 807 aa  62  0.00000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.5027  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1583  peptidoglycan-binding LysM  33.65 
 
 		 142 aa  60.8  0.00000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2634  peptidoglycan-binding LysM  33.05 
 
 		 302 aa  60.1  0.00000007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.258799 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11320  Peptidoglycan-binding LysM  34.29 
 
 		 173 aa  60.1  0.00000007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00223945  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_03561  LysM domain-containing protein  29.41 
 
 		 253 aa  60.1  0.00000008  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1998  peptidoglycan-binding LysM  32.71 
 
 		 123 aa  59.7  0.00000009  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0170304  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0925  lytic transglycosylase, catalytic  34.69 
 
 		 546 aa  59.3  0.0000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3033  peptidase M23B  41.49 
 
 		 328 aa  59.3  0.0000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2039  Peptidase M23  33.64 
 
 		 414 aa  58.5  0.0000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0205491  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2888  glycosyl hydrolase family chitinase  26.28 
 
 		 868 aa  58.9  0.0000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1839  peptidoglycan-binding LysM  29.25 
 
 		 314 aa  57.4  0.0000004  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.955288  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_03571  LysM domain-containing protein  32.74 
 
 		 253 aa  57.8  0.0000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4147  peptidoglycan-binding LysM  37.11 
 
 		 250 aa  57.4  0.0000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0392634 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2024  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase  33.02 
 
 		 543 aa  57.4  0.0000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00000000444434  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2751  polysaccharide deacetylase  23.13 
 
 		 1118 aa  57.4  0.0000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.880093 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2820  hypothetical protein  26.09 
 
 		 822 aa  57  0.0000006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.59851  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0496  peptidoglycan-binding LysM  31.13 
 
 		 337 aa  56.6  0.0000008  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.0756826 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1767  peptidase M23B  32 
 
 		 465 aa  56.6  0.0000008  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3452  molybdenum ABC transporter, periplasmic molybdate-binding protein  30.1 
 
 		 335 aa  56.6  0.0000009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0744  copper amine oxidase domain-containing protein  24.88 
 
 		 418 aa  56.6  0.0000009  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1268  glycosyl hydrolase-like protein  26.71 
 
 		 808 aa  56.2  0.000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06440  polysaccharide deacetylase  32.65 
 
 		 405 aa  56.2  0.000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.467697  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3173  peptidase M23B  29.75 
 
 		 314 aa  56.2  0.000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000536198  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0336  peptidoglycan-binding LysM  29.7 
 
 		 256 aa  55.1  0.000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.230507  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2061  copper amine oxidase domain protein  20.08 
 
 		 521 aa  55.5  0.000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000000589284  hitchhiker  0.0000623397 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2898  Lytic transglycosylase catalytic  32.22 
 
 		 849 aa  55.8  0.000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.52326 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2370  MltD domain-containing protein  32.67 
 
 		 515 aa  55.5  0.000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000000191622  normal  0.0274164 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1345  glycoside hydrolase family 18  23.56 
 
 		 377 aa  55.1  0.000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1708  peptidoglycan-binding LysM  26.47 
 
 		 286 aa  55.1  0.000003  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.0335669  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0054  cell wall hydrolase, SleB  29.06 
 
 		 261 aa  54.7  0.000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000771521 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2401  peptidase M23B  32.99 
 
 		 297 aa  54.7  0.000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0925  peptidoglycan binding domain-containing protein  32.98 
 
 		 327 aa  54.7  0.000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2064  polysaccharide deacetylase  27.55 
 
 		 368 aa  54.3  0.000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  unclonable  0.0000000000028992  hitchhiker  0.000502846 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04840  peptidase M23B  28.28 
 
 		 419 aa  54.3  0.000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000479397  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1297  LysM/M23/M37 peptidase  22.52 
 
 		 301 aa  53.9  0.000005  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00000265037  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>