More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_2634 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010571  Oter_2634  peptidoglycan-binding LysM  100 
 
 
302 aa  588  1e-167  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.258799 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1297  LysM/M23/M37 peptidase  28.48 
 
 
301 aa  79  0.0000000000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00000265037  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2728  Lytic transglycosylase catalytic  32.65 
 
 
547 aa  74.7  0.000000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1537  lytic transglycosylase, catalytic  34.71 
 
 
580 aa  72.8  0.000000000007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.324928  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1273  membrane-bound lytic murein transglycosylase D precursor  30.4 
 
 
1001 aa  72.8  0.000000000008  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000430428  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0953  lytic transglycosylase, catalytic  33.87 
 
 
556 aa  72.4  0.00000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0087  Lytic transglycosylase catalytic  29.73 
 
 
620 aa  70.9  0.00000000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1556  Lytic transglycosylase catalytic  36.29 
 
 
440 aa  70.1  0.00000000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22030  Peptidoglycan-binding LysM  29.61 
 
 
409 aa  70.1  0.00000000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1894  lytic transglycosylase, catalytic  27.67 
 
 
553 aa  70.1  0.00000000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0630277  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1354  Lytic transglycosylase catalytic  36.51 
 
 
661 aa  69.7  0.00000000006  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.828484  normal  0.0280405 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0496  peptidoglycan-binding LysM  31.85 
 
 
337 aa  68.6  0.0000000001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.0756826 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2370  MltD domain-containing protein  35.48 
 
 
515 aa  68.9  0.0000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000000191622  normal  0.0274164 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1775  MltD domain-containing protein  34.43 
 
 
514 aa  68.9  0.0000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.0000000157284  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4147  peptidoglycan-binding LysM  32.09 
 
 
250 aa  68.2  0.0000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0392634 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2239  MltD domain-containing protein  34.68 
 
 
515 aa  67.8  0.0000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.0000290674  normal  0.325041 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1448  Peptidase M23  32.8 
 
 
509 aa  68.2  0.0000000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000360423  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0498  Lytic transglycosylase catalytic  29.93 
 
 
527 aa  67.4  0.0000000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.112584  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0538  MltD domain-containing protein  32.84 
 
 
474 aa  67  0.0000000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2115  lytic transglycosylase, catalytic  31.97 
 
 
511 aa  67  0.0000000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.00000101549  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_04231  LysM domain-containing protein  27.87 
 
 
286 aa  66.6  0.0000000004  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1112  lytic transglycosylase, catalytic  29.79 
 
 
1021 aa  66.6  0.0000000005  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0269179  normal  0.029477 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2407  lytic transglycosylase catalytic  30.33 
 
 
519 aa  66.6  0.0000000005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.0000000206679  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3414  MltD domain-containing protein  32.84 
 
 
474 aa  66.6  0.0000000005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.387896 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3033  peptidase M23B  32.52 
 
 
328 aa  66.6  0.0000000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2166  Peptidoglycan-binding lysin domain protein  35.03 
 
 
954 aa  66.6  0.0000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.16902  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2162  MltD domain-containing protein  34.68 
 
 
515 aa  66.2  0.0000000006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000015187  normal  0.0463947 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1555  peptidoglycan-binding LysM  35.16 
 
 
399 aa  66.2  0.0000000006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.212463  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2612  lytic transglycosylase catalytic  33.61 
 
 
517 aa  66.2  0.0000000006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00320162  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3257  lytic transglycosylase, catalytic  33.59 
 
 
471 aa  66.2  0.0000000007  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01980  putative membrane-bound lytic murein transglycosylase  33.33 
 
 
554 aa  66.2  0.0000000007  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.531039  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2172  peptidase M23B  29.92 
 
 
284 aa  65.5  0.0000000009  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2564  Slt family transglycosylase  33.88 
 
 
515 aa  65.1  0.000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1885  Slt family transglycosylase  30.37 
 
 
495 aa  65.5  0.000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.000000159239  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0625  MltD domain-containing protein  32.87 
 
 
483 aa  64.3  0.000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0925  peptidoglycan binding domain-containing protein  33.33 
 
 
327 aa  63.9  0.000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2010  MltD domain-containing protein  28.75 
 
 
515 aa  63.9  0.000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000075439  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3580  peptidoglycan-binding LysM  33.06 
 
 
544 aa  64.3  0.000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0532  cell wall hydrolase/autolysin  35.46 
 
 
563 aa  63.9  0.000000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.00749255  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1681  Peptidoglycan-binding lysin domain protein  35.94 
 
 
354 aa  63.5  0.000000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.86934  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3584  MltD domain-containing protein  32.09 
 
 
474 aa  63.5  0.000000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0499  lytic transglycosylase, catalytic  27.71 
 
 
524 aa  63.5  0.000000004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.0979868 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4017  Slt family transglycosylase  33.33 
 
 
477 aa  63.2  0.000000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1995  MltD domain-containing protein  28.75 
 
 
519 aa  63.2  0.000000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0597997  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0223  Peptidoglycan-binding lysin domain protein  35 
 
 
470 aa  63.2  0.000000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2328  MLTD_N domain protein  28.75 
 
 
515 aa  63.2  0.000000006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000191267  hitchhiker  0.00043621 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3484  membrane-bound lytic murein transglycosylase D precursor  34.04 
 
 
515 aa  62.8  0.000000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0499239  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1998  putative membrane-bound lytic murein transglycosylase  29.75 
 
 
552 aa  62.8  0.000000007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4066  Peptidoglycan-binding LysM  36.43 
 
 
390 aa  62.8  0.000000007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1988  lytic transglycosylase, catalytic  29.51 
 
 
519 aa  62.8  0.000000007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.010206  hitchhiker  0.00147511 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00097  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  31.82 
 
 
576 aa  62.8  0.000000007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1838  peptidoglycan-binding LysM  32.61 
 
 
443 aa  62.4  0.000000008  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.858327  unclonable  0.000000000675364 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2058  MltD domain-containing protein  28.75 
 
 
515 aa  62.8  0.000000008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000280518  decreased coverage  0.000141788 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002256  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase AmiB precursor  33.33 
 
 
571 aa  62.8  0.000000008  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000111797  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2063  Lytic transglycosylase catalytic  34.35 
 
 
445 aa  62.4  0.000000009  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1257  hypothetical protein  31.33 
 
 
479 aa  62  0.00000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1256  hypothetical protein  31.33 
 
 
479 aa  61.6  0.00000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1708  peptidoglycan-binding LysM  24.59 
 
 
286 aa  62  0.00000001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.0335669  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03214  membrane-bound lytic murein transglycosylase D  31.15 
 
 
528 aa  62  0.00000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1694  peptidoglycan-binding LysM  37.19 
 
 
444 aa  62  0.00000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.17683  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0215  Lytic transglycosylase catalytic  31.98 
 
 
733 aa  61.6  0.00000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0652  MltD domain-containing protein  31.47 
 
 
483 aa  61.2  0.00000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3737  MltD domain-containing protein  33.57 
 
 
483 aa  61.6  0.00000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2402  membrane-bound lytic murein transglycosylase D precursor  29.27 
 
 
517 aa  61.2  0.00000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0648  MLTD_N domain protein  33.57 
 
 
483 aa  61.6  0.00000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1800  peptidoglycan-binding LysM  36.07 
 
 
503 aa  60.8  0.00000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.199953  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1123  hypothetical protein  29.11 
 
 
442 aa  60.5  0.00000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_03571  LysM domain-containing protein  28.37 
 
 
253 aa  60.8  0.00000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1829  membrane-bound lytic murein transglycosylase D  31.15 
 
 
532 aa  60.5  0.00000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1571  Lytic transglycosylase catalytic  29.84 
 
 
539 aa  60.5  0.00000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.55441  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2022  lytic transglycosylase, catalytic  28.93 
 
 
518 aa  60.5  0.00000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.0000000299101  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2208  lytic transglycosylase, catalytic  28.93 
 
 
517 aa  60.5  0.00000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.738412  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1588  lytic transglycosylase, catalytic  29.75 
 
 
550 aa  60.8  0.00000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.128959  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1111  glycoside hydrolase family 18  33.05 
 
 
426 aa  60.5  0.00000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0689  CHAP domain-containing protein  35.11 
 
 
265 aa  60.1  0.00000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00699042  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0704  CHAP domain-containing protein  35.11 
 
 
265 aa  60.1  0.00000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.000444371  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1211  NLP/P60 protein  27.01 
 
 
338 aa  60.5  0.00000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.0000171376  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1755  NLP/P60 protein  35.48 
 
 
255 aa  60.5  0.00000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002769  membrane-bound lytic murein transglycosylase D precursor  30.33 
 
 
527 aa  60.1  0.00000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0709625  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2063  lytic transglycosylase, catalytic  31.79 
 
 
498 aa  59.7  0.00000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.829079  normal  0.0945255 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1767  peptidase M23B  28.12 
 
 
465 aa  59.7  0.00000006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41090  membrane-bound lytic murein transglycosylase D precursor  32.37 
 
 
534 aa  59.7  0.00000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0976  lytic transglycosylase, catalytic  32.81 
 
 
610 aa  59.7  0.00000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.773866  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4463  Lytic transglycosylase catalytic  30.6 
 
 
498 aa  59.3  0.00000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.689594  normal  0.530069 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1271  peptidoglycan-binding LysM  33.87 
 
 
307 aa  59.3  0.00000007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000333433 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2024  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase  28.26 
 
 
543 aa  59.3  0.00000008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00000000444434  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0026  peptidoglycan-binding lytic transglycosylase  31.76 
 
 
495 aa  59.3  0.00000008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.250795  normal  0.876942 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0965  Lytic transglycosylase catalytic  33.61 
 
 
570 aa  58.5  0.0000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1127  hypothetical protein  28.48 
 
 
442 aa  58.5  0.0000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1124  Lytic transglycosylase catalytic  33.88 
 
 
596 aa  58.5  0.0000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.331825  normal  0.414792 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1839  peptidoglycan-binding LysM  27.92 
 
 
314 aa  58.2  0.0000002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.955288  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_03671  hypothetical protein  23.12 
 
 
287 aa  57.8  0.0000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.651012  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1701  lytic transglycosylase catalytic  26.34 
 
 
548 aa  57.8  0.0000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.0000779386  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0421  membrane-bound lytic murein transglycosylase D  32.35 
 
 
612 aa  58.2  0.0000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1945  lytic transglycosylase  29 
 
 
445 aa  57.8  0.0000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.106918  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2755  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  32.5 
 
 
581 aa  58.2  0.0000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00949544  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0583  Lytic transglycosylase catalytic  32.35 
 
 
612 aa  58.2  0.0000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1772  peptidase M23B  30.64 
 
 
453 aa  57.4  0.0000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.306427  decreased coverage  0.00457712 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3178  Peptidase M23  28.46 
 
 
471 aa  57.4  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0130239  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3173  peptidase M23B  27.74 
 
 
314 aa  57.4  0.0000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000536198  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>