199 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dhaf_4489 on replicon NC_011830
Organism: Desulfitobacterium hafniense DCB-2



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011830  Dhaf_4489  glycoside hydrolase family 18  100 
 
 
688 aa  1399    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00179307  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2312  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  39.14 
 
 
769 aa  194  6e-48  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000905322  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3298  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  39.6 
 
 
706 aa  189  1e-46  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4484  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  37.5 
 
 
543 aa  177  4e-43  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000290327  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4476  Ig domain protein group 2 domain protein  36.21 
 
 
570 aa  172  3e-41  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0496  Immunoglobulin I-set domain protein  40.84 
 
 
1550 aa  169  1e-40  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0179971  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1722  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  43.91 
 
 
530 aa  167  5e-40  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2674  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  37.95 
 
 
860 aa  166  1.0000000000000001e-39  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.0000000467202  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4506  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  45.39 
 
 
619 aa  164  3e-39  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.417765  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1849  Ig domain protein group 2 domain protein  33.23 
 
 
600 aa  161  4e-38  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000374979  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4728  Ig domain protein group 2 domain protein  33.63 
 
 
640 aa  157  8e-37  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.0000000000565945  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1937  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  40.24 
 
 
2884 aa  156  1e-36  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4482  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  35.25 
 
 
795 aa  155  2e-36  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.0000000203992  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4481  Ig domain protein  34.72 
 
 
637 aa  152  1e-35  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.174755  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0489  cell wall/surface repeat protein  38.94 
 
 
1452 aa  151  4e-35  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0529115  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_05530  cell wall-binding protein  34.7 
 
 
1312 aa  148  3e-34  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0876125  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2155  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  34.65 
 
 
649 aa  147  6e-34  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000475992  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4160  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  35.55 
 
 
326 aa  145  3e-33  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21810  chitinase  32.55 
 
 
374 aa  144  8e-33  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2324  cell wall hydrolase/autolysin  34.85 
 
 
538 aa  142  1.9999999999999998e-32  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000122542  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0390  Putative cell wall-binding domain-like protein  37.85 
 
 
442 aa  141  3.9999999999999997e-32  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.966504  normal  0.374671 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0196  glycoside hydrolase family 18  29.55 
 
 
358 aa  140  7e-32  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0348  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  36.79 
 
 
847 aa  140  1e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.022722 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0505  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  40.07 
 
 
1412 aa  139  1e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0642654  normal  0.150071 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3111  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  34.76 
 
 
885 aa  137  9e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.57258  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1461  cell wall binding repeat 2-containing protein  40.3 
 
 
1073 aa  136  1.9999999999999998e-30  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_05540  cell wall-binding protein  31.8 
 
 
962 aa  134  3.9999999999999996e-30  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7275  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  34.87 
 
 
624 aa  134  5e-30  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1699  protein of unknown function DUF1533  34.84 
 
 
1916 aa  133  9e-30  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8457  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  33.54 
 
 
905 aa  133  9e-30  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0037924 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1392  glycoside hydrolase family 18  31.46 
 
 
415 aa  132  2.0000000000000002e-29  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.282919  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_12200  M6 family metalloprotease domain-containing protein  33.7 
 
 
1045 aa  129  1.0000000000000001e-28  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0570513  normal  0.178376 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6568  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  35.97 
 
 
871 aa  129  2.0000000000000002e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0218  PKD domain containing protein  33.82 
 
 
848 aa  128  3e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.904216  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5805  Peptidase S53 propeptide  34.64 
 
 
998 aa  127  5e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2901  glycoside hydrolase family 18  32.1 
 
 
420 aa  126  1e-27  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1679  protease-like  37.63 
 
 
1037 aa  125  2e-27  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000116915 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3546  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  37.21 
 
 
510 aa  124  5e-27  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.159957  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1167  glycoside hydrolase family protein  31.46 
 
 
418 aa  123  9e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0000303009  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0787  VanW family protein  31.21 
 
 
600 aa  123  9.999999999999999e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0728  fibronectin type III domain-containing protein  32.71 
 
 
678 aa  121  3.9999999999999996e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0514161  normal  0.0700786 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2088  WD40 domain protein beta Propeller  35.11 
 
 
714 aa  121  4.9999999999999996e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5281  Peptidase S53 propeptide  36.27 
 
 
976 aa  120  6e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0506  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  37.01 
 
 
448 aa  120  6e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.225372  normal  0.064309 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8838  Putative cell wall-binding domain-like protein  31.35 
 
 
609 aa  119  1.9999999999999998e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6412  Pyrrolo-quinoline quinone  33.87 
 
 
1192 aa  118  3e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.152468 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1871  glycosyl hydrolase-like protein  28.4 
 
 
451 aa  118  3e-25  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.00112913  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1321  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  30.84 
 
 
749 aa  118  3.9999999999999997e-25  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0249  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  33.87 
 
 
464 aa  117  5e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.65229  normal  0.312319 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1378  glycoside hydrolase family 18  30.8 
 
 
647 aa  115  3e-24  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.112456  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0223  Peptidoglycan-binding lysin domain protein  29.96 
 
 
470 aa  114  5e-24  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0072  glycoside hydrolase family 18  29.04 
 
 
384 aa  114  7.000000000000001e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000514122  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1805  Putative cell wall-binding domain-like protein  34.92 
 
 
688 aa  114  7.000000000000001e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.203584  normal  0.132766 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4725  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  28.73 
 
 
433 aa  114  8.000000000000001e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0217  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  34.19 
 
 
684 aa  113  1.0000000000000001e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.952991  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8843  WD40 domain protein beta Propeller  33.12 
 
 
635 aa  111  6e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3526  PKD domain containing protein  31.98 
 
 
682 aa  110  8.000000000000001e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.138368  normal  0.565533 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0236  glycoside hydrolase family protein  27.24 
 
 
427 aa  110  9.000000000000001e-23  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.946452  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8728  PKD domain containing protein  39.62 
 
 
554 aa  108  4e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.228973 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0242  glycoside hydrolase family 18  27.57 
 
 
484 aa  108  5e-22  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.0000000747076  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0274  hypothetical protein  33.21 
 
 
661 aa  107  9e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.598131  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3709  PKD domain containing protein  34.7 
 
 
643 aa  106  1e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.155925  normal  0.0144846 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0484  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  31.95 
 
 
656 aa  105  2e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0645935  normal  0.306221 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1783  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  33.97 
 
 
600 aa  105  2e-21  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.925315  normal  0.683781 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0216  cell wall binding repeat 2-containing protein  33.13 
 
 
663 aa  103  8e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8727  PKD domain containing protein  33.79 
 
 
589 aa  103  1e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.225168 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8837  hypothetical protein  32.16 
 
 
673 aa  103  1e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2895  glycoside hydrolase family protein  26.17 
 
 
583 aa  103  1e-20  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.22791  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0014  glycoside hydrolase family 18  29.63 
 
 
428 aa  103  1e-20  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0307  glycoside hydrolase family protein  25.94 
 
 
426 aa  102  2e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.8234  normal  0.0394761 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0424  glycoside hydrolase family protein  28.25 
 
 
793 aa  102  3e-20  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.553023  normal  0.723978 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0017  glycoside hydrolase family 18  29.22 
 
 
428 aa  102  3e-20  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000350058  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21670  Inactive glysosyl hydrolase family 18  25.28 
 
 
316 aa  101  5e-20  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.057245  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0161  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  31.21 
 
 
342 aa  101  6e-20  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.635552 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4483  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  28.88 
 
 
1135 aa  101  6e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000331239  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0507  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  31.94 
 
 
600 aa  100  8e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.427414  normal  0.0746205 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2159  glycoside hydrolase family protein  28.15 
 
 
307 aa  100  8e-20  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3364  glycosyl hydrolase  29.26 
 
 
430 aa  100  1e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000727099  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1652  peptidoglycan-binding LysM  30.26 
 
 
423 aa  99.8  1e-19  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0437623  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3618  glycosyl hydrolase, family 18  29.26 
 
 
430 aa  100  1e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000703851 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3294  glycoside hydrolase family protein  29.92 
 
 
430 aa  99.4  2e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000717596  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0489  glycoside hydrolase family 18  26.51 
 
 
579 aa  99.8  2e-19  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.101404 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3715  glycosyl hydrolase, family 18  29.26 
 
 
430 aa  99.4  2e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00419568  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1600  glycosyl hydrolase, family 18  29.26 
 
 
430 aa  99.4  2e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000035031  hitchhiker  0.0000741808 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3314  glycosyl hydrolase  28.89 
 
 
430 aa  99  3e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000190011  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2245  glycoside hydrolase family 18  29.84 
 
 
430 aa  98.6  3e-19  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3402  glycosy hydrolase family protein  28.89 
 
 
430 aa  98.6  4e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0158491  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3668  glycosy hydrolase family protein  28.89 
 
 
430 aa  98.6  4e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0200729  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3627  glycosy hydrolase family protein  29.53 
 
 
430 aa  98.2  5e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.266855  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0428  cell wall binding repeat 2-containing protein  29.23 
 
 
833 aa  98.2  5e-19  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0259753  normal  0.43049 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5764  Periplasmic component of the Tol biopolymer transport system-like protein  36.04 
 
 
635 aa  97.4  8e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0700956  normal  0.065042 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8288  Putative cell wall-binding domain-like protein  29.88 
 
 
627 aa  97.4  8e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.597938 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2256  glycoside hydrolase family protein  27.93 
 
 
430 aa  97.1  1e-18  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00349057  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0370  Fibronectin type III domain protein  34.9 
 
 
841 aa  95.9  2e-18  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.800383  normal  0.932394 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0063  glycoside hydrolase family protein  29.46 
 
 
312 aa  95.1  3e-18  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00787456 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3431  polysaccharide deacetylase/glycosyl transferase, group 2 family protein  27.76 
 
 
1115 aa  94.7  4e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1800  peptidoglycan-binding LysM  25.42 
 
 
503 aa  93.2  1e-17  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.199953  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0258  glycoside hydrolase family 18  26.07 
 
 
390 aa  93.2  1e-17  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.210601  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1815  polysaccharide deacetylase/glycosyl transferase, group 2 family protein  27.4 
 
 
1115 aa  93.6  1e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.259825 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3015  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  31.3 
 
 
475 aa  92.8  2e-17  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0353052 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>