72 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_2088 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_2088  WD40 domain protein beta Propeller  100 
 
 		 714 aa  1406    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8843  WD40 domain protein beta Propeller  35.81 
 
 		 635 aa  265  3e-69  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8837  hypothetical protein  36.95 
 
 		 673 aa  263  6.999999999999999e-69  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0484  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  36.04 
 
 		 656 aa  256  1.0000000000000001e-66  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0645935  normal  0.306221 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7275  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  36.54 
 
 		 624 aa  245  1.9999999999999999e-63  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8288  Putative cell wall-binding domain-like protein  47.13 
 
 		 627 aa  221  3e-56  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.597938 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0274  hypothetical protein  43.23 
 
 		 661 aa  219  2e-55  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.598131  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5764  Periplasmic component of the Tol biopolymer transport system-like protein  37.11 
 
 		 635 aa  210  6e-53  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0700956  normal  0.065042 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0728  fibronectin type III domain-containing protein  33.75 
 
 		 678 aa  201  3e-50  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0514161  normal  0.0700786 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1805  Putative cell wall-binding domain-like protein  33.72 
 
 		 688 aa  200  7e-50  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.203584  normal  0.132766 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8838  Putative cell wall-binding domain-like protein  43.98 
 
 		 609 aa  199  1.0000000000000001e-49  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0216  cell wall binding repeat 2-containing protein  35.17 
 
 		 663 aa  191  4e-47  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0218  PKD domain containing protein  39.77 
 
 		 848 aa  186  1.0000000000000001e-45  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.904216  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6568  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  41.27 
 
 		 871 aa  183  9.000000000000001e-45  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6412  Pyrrolo-quinoline quinone  40.3 
 
 		 1192 aa  182  1e-44  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.152468 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0348  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  38.18 
 
 		 847 aa  177  5e-43  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.022722 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8727  PKD domain containing protein  38.21 
 
 		 589 aa  175  1.9999999999999998e-42  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.225168 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3612  fibronectin type III domain-containing protein  34.21 
 
 		 667 aa  175  1.9999999999999998e-42  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0390  Putative cell wall-binding domain-like protein  41.12 
 
 		 442 aa  170  1e-40  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.966504  normal  0.374671 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0217  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  40.31 
 
 		 684 aa  167  5e-40  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.952991  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0505  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  37.8 
 
 		 1412 aa  166  1.0000000000000001e-39  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0642654  normal  0.150071 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1679  protease-like  40.18 
 
 		 1037 aa  166  1.0000000000000001e-39  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000116915 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0249  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  36.16 
 
 		 464 aa  166  2.0000000000000002e-39  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.65229  normal  0.312319 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1461  cell wall binding repeat 2-containing protein  43.65 
 
 		 1073 aa  165  3e-39  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3526  PKD domain containing protein  36.22 
 
 		 682 aa  162  2e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.138368  normal  0.565533 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5281  Peptidase S53 propeptide  41.08 
 
 		 976 aa  162  2e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0507  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  35.14 
 
 		 600 aa  159  2e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.427414  normal  0.0746205 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3111  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  37.23 
 
 		 885 aa  154  5e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.57258  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3899  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  39.86 
 
 		 386 aa  154  5.9999999999999996e-36  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.030559 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8457  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  36.45 
 
 		 905 aa  150  6e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0037924 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8728  PKD domain containing protein  39.1 
 
 		 554 aa  142  1.9999999999999998e-32  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.228973 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3709  PKD domain containing protein  36.75 
 
 		 643 aa  140  8.999999999999999e-32  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.155925  normal  0.0144846 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5805  Peptidase S53 propeptide  35.08 
 
 		 998 aa  137  9e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2236  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  34.82 
 
 		 719 aa  137  9.999999999999999e-31  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0506  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  36.96 
 
 		 448 aa  133  1.0000000000000001e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.225372  normal  0.064309 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4489  glycoside hydrolase family 18  36.62 
 
 		 688 aa  131  5.0000000000000004e-29  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00179307  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3546  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  36.42 
 
 		 510 aa  125  2e-27  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.159957  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0370  Fibronectin type III domain protein  36.79 
 
 		 841 aa  120  7.999999999999999e-26  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.800383  normal  0.932394 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1849  Ig domain protein group 2 domain protein  29.55 
 
 		 600 aa  119  3e-25  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000374979  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4728  Ig domain protein group 2 domain protein  29.84 
 
 		 640 aa  118  3.9999999999999997e-25  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.0000000000565945  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4160  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  30.57 
 
 		 326 aa  117  7.999999999999999e-25  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3298  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  33.01 
 
 		 706 aa  116  2.0000000000000002e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0496  Immunoglobulin I-set domain protein  30.43 
 
 		 1550 aa  114  8.000000000000001e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0179971  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0489  cell wall/surface repeat protein  30.22 
 
 		 1452 aa  114  9e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0529115  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4476  Ig domain protein group 2 domain protein  29.8 
 
 		 570 aa  112  2.0000000000000002e-23  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4484  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  31.68 
 
 		 543 aa  112  3e-23  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000290327  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1937  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  30.96 
 
 		 2884 aa  109  1e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4506  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  35.42 
 
 		 619 aa  107  1e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.417765  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2312  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  30.55 
 
 		 769 aa  106  1e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000905322  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_05530  cell wall-binding protein  31.19 
 
 		 1312 aa  104  6e-21  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0876125  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2674  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  30 
 
 		 860 aa  103  1e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.0000000467202  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_05540  cell wall-binding protein  31.17 
 
 		 962 aa  98.2  4e-19  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0787  VanW family protein  26.29 
 
 		 600 aa  97.8  5e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2324  cell wall hydrolase/autolysin  28.89 
 
 		 538 aa  97.4  8e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000122542  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1783  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  38.85 
 
 		 600 aa  93.2  1e-17  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.925315  normal  0.683781 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_12200  M6 family metalloprotease domain-containing protein  29.51 
 
 		 1045 aa  93.2  2e-17  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0570513  normal  0.178376 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4482  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  25.53 
 
 		 795 aa  92.4  3e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.0000000203992  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2155  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  26.79 
 
 		 649 aa  90.9  7e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000475992  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4481  Ig domain protein  32.23 
 
 		 637 aa  87.8  6e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.174755  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1722  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  29.37 
 
 		 530 aa  87.4  7e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0357  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  31.31 
 
 		 1059 aa  86.3  0.000000000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3015  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  31.16 
 
 		 475 aa  85.1  0.000000000000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0353052 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0161  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  30.84 
 
 		 342 aa  77.4  0.0000000000009  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.635552 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1699  protein of unknown function DUF1533  31.23 
 
 		 1916 aa  75.5  0.000000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1321  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  24.83 
 
 		 749 aa  74.7  0.000000000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0428  cell wall binding repeat 2-containing protein  27.97 
 
 		 833 aa  69.3  0.0000000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0259753  normal  0.43049 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14600  cell wall-binding protein  31.39 
 
 		 297 aa  55.8  0.000003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.221702  normal  0.25424 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1487  cell wall binding repeat 2-containing protein  34.84 
 
 		 551 aa  52  0.00004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.470473  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0103  hypothetical protein  32.91 
 
 		 370 aa  48.5  0.0004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.471762  normal  0.0364426 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0405  PKD domain-containing protein  26.62 
 
 		 1141 aa  47  0.001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4483  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  34.91 
 
 		 1135 aa  45.8  0.002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000331239  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0203  WD40 domain-containing protein  33.61 
 
 		 427 aa  44.7  0.006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000381605  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>