77 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dhaf_4160 on replicon NC_011830
Organism: Desulfitobacterium hafniense DCB-2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011830  Dhaf_4160  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  100 
 
 
326 aa  659    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4728  Ig domain protein group 2 domain protein  47.2 
 
 
640 aa  315  5e-85  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.0000000000565945  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1849  Ig domain protein group 2 domain protein  49.24 
 
 
600 aa  308  5.9999999999999995e-83  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000374979  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4476  Ig domain protein group 2 domain protein  49.13 
 
 
570 aa  251  1e-65  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4482  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  41.89 
 
 
795 aa  232  6e-60  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.0000000203992  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2155  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  36.45 
 
 
649 aa  207  2e-52  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000475992  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4481  Ig domain protein  38.89 
 
 
637 aa  184  2.0000000000000003e-45  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.174755  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3298  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  35.22 
 
 
706 aa  167  2e-40  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4484  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  32.76 
 
 
543 aa  159  5e-38  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000290327  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_12200  M6 family metalloprotease domain-containing protein  33.94 
 
 
1045 aa  149  6e-35  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0570513  normal  0.178376 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_05540  cell wall-binding protein  31.38 
 
 
962 aa  148  1.0000000000000001e-34  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2312  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  34.87 
 
 
769 aa  148  1.0000000000000001e-34  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000905322  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2674  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  34.27 
 
 
860 aa  145  1e-33  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.0000000467202  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1679  protease-like  33.11 
 
 
1037 aa  144  2e-33  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000116915 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0496  Immunoglobulin I-set domain protein  31.86 
 
 
1550 aa  137  3.0000000000000003e-31  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0179971  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1321  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  30.56 
 
 
749 aa  134  1.9999999999999998e-30  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2324  cell wall hydrolase/autolysin  31.51 
 
 
538 aa  133  3.9999999999999996e-30  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000122542  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4506  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  35.94 
 
 
619 aa  133  5e-30  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.417765  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0348  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  32.89 
 
 
847 aa  132  6.999999999999999e-30  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.022722 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4489  glycoside hydrolase family 18  35.55 
 
 
688 aa  132  9e-30  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00179307  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1937  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  33.45 
 
 
2884 aa  131  2.0000000000000002e-29  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_05530  cell wall-binding protein  30.15 
 
 
1312 aa  130  4.0000000000000003e-29  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0876125  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3546  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  33.22 
 
 
510 aa  129  8.000000000000001e-29  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.159957  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5281  Peptidase S53 propeptide  32.59 
 
 
976 aa  125  9e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3111  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  29.78 
 
 
885 aa  125  1e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.57258  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0390  Putative cell wall-binding domain-like protein  30.37 
 
 
442 aa  124  3e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.966504  normal  0.374671 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0787  VanW family protein  34.55 
 
 
600 aa  123  4e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5805  Peptidase S53 propeptide  31.34 
 
 
998 aa  123  5e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8728  PKD domain containing protein  29.49 
 
 
554 aa  122  6e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.228973 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0249  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  31.27 
 
 
464 aa  122  7e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.65229  normal  0.312319 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6412  Pyrrolo-quinoline quinone  30.24 
 
 
1192 aa  121  9.999999999999999e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.152468 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8457  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  30.92 
 
 
905 aa  122  9.999999999999999e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0037924 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0489  cell wall/surface repeat protein  32.71 
 
 
1452 aa  119  4.9999999999999996e-26  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0529115  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0505  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  28.71 
 
 
1412 aa  117  3e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0642654  normal  0.150071 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1699  protein of unknown function DUF1533  30.66 
 
 
1916 aa  116  5e-25  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7275  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  29.87 
 
 
624 aa  115  6.9999999999999995e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6568  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  31.08 
 
 
871 aa  113  4.0000000000000004e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0428  cell wall binding repeat 2-containing protein  35.53 
 
 
833 aa  111  1.0000000000000001e-23  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0259753  normal  0.43049 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0161  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  32.5 
 
 
342 aa  111  1.0000000000000001e-23  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.635552 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8727  PKD domain containing protein  30.04 
 
 
589 aa  111  2.0000000000000002e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.225168 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1722  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  30.48 
 
 
530 aa  110  4.0000000000000004e-23  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1461  cell wall binding repeat 2-containing protein  30.54 
 
 
1073 aa  109  8.000000000000001e-23  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8843  WD40 domain protein beta Propeller  27.88 
 
 
635 aa  107  3e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3015  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  29.23 
 
 
475 aa  106  5e-22  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0353052 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0274  hypothetical protein  30.97 
 
 
661 aa  105  1e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.598131  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3899  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  28.57 
 
 
386 aa  103  6e-21  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.030559 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3709  PKD domain containing protein  29.94 
 
 
643 aa  101  2e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.155925  normal  0.0144846 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0506  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  31.14 
 
 
448 aa  100  3e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.225372  normal  0.064309 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0507  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  31.02 
 
 
600 aa  100  4e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.427414  normal  0.0746205 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0218  PKD domain containing protein  28.57 
 
 
848 aa  99  9e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.904216  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0217  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  30.99 
 
 
684 aa  98.2  2e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.952991  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3526  PKD domain containing protein  30.25 
 
 
682 aa  97.8  2e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.138368  normal  0.565533 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1783  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  30.03 
 
 
600 aa  97.4  3e-19  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.925315  normal  0.683781 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0728  fibronectin type III domain-containing protein  29.31 
 
 
678 aa  97.4  3e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0514161  normal  0.0700786 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2088  WD40 domain protein beta Propeller  29.81 
 
 
714 aa  95.1  1e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4483  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  30.57 
 
 
1135 aa  94.4  2e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000331239  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0357  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  32.46 
 
 
1059 aa  90.9  2e-17  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1805  Putative cell wall-binding domain-like protein  27.97 
 
 
688 aa  87.4  3e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.203584  normal  0.132766 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8838  Putative cell wall-binding domain-like protein  28.08 
 
 
609 aa  86.3  7e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0370  Fibronectin type III domain protein  25.88 
 
 
841 aa  85.5  0.000000000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.800383  normal  0.932394 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0103  hypothetical protein  29.82 
 
 
370 aa  85.5  0.000000000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.471762  normal  0.0364426 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8837  hypothetical protein  28.43 
 
 
673 aa  82.8  0.000000000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14600  cell wall-binding protein  34.35 
 
 
297 aa  82.8  0.000000000000008  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.221702  normal  0.25424 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0484  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  28.1 
 
 
656 aa  80.9  0.00000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0645935  normal  0.306221 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2236  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  24.31 
 
 
719 aa  79.7  0.00000000000006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8288  Putative cell wall-binding domain-like protein  25.95 
 
 
627 aa  79.7  0.00000000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.597938 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1487  cell wall binding repeat 2-containing protein  35.08 
 
 
551 aa  78.6  0.0000000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.470473  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0216  cell wall binding repeat 2-containing protein  26.96 
 
 
663 aa  77.4  0.0000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3612  fibronectin type III domain-containing protein  27.18 
 
 
667 aa  74.7  0.000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5764  Periplasmic component of the Tol biopolymer transport system-like protein  27.92 
 
 
635 aa  73.2  0.000000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0700956  normal  0.065042 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0821  cell wall-binding domain-containing protein  30.7 
 
 
330 aa  58.2  0.0000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.672337  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0405  PKD domain-containing protein  37.97 
 
 
1141 aa  51.2  0.00002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0187  hypothetical protein  31.78 
 
 
672 aa  48.9  0.0001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1318  hypothetical protein  30.22 
 
 
664 aa  47  0.0004  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0186  transcriptional regulator, ArsR family protein  25.53 
 
 
430 aa  47  0.0005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0276  transcriptional regulator, ArsR family protein  25.53 
 
 
430 aa  47  0.0005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1779  hypothetical protein  26.09 
 
 
411 aa  43.9  0.004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.362511  normal  0.842634 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>