156 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_8843 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_8843  WD40 domain protein beta Propeller  100 
 
 		 635 aa  1263    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8837  hypothetical protein  39.29 
 
 		 673 aa  310  5.9999999999999995e-83  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7275  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  37.6 
 
 		 624 aa  279  1e-73  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0484  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  36.9 
 
 		 656 aa  258  2e-67  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0645935  normal  0.306221 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2088  WD40 domain protein beta Propeller  36.31 
 
 		 714 aa  242  1e-62  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8288  Putative cell wall-binding domain-like protein  47.77 
 
 		 627 aa  209  1e-52  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.597938 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0274  hypothetical protein  41.92 
 
 		 661 aa  205  2e-51  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.598131  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1805  Putative cell wall-binding domain-like protein  36.57 
 
 		 688 aa  200  7e-50  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.203584  normal  0.132766 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0216  cell wall binding repeat 2-containing protein  34.93 
 
 		 663 aa  199  1.0000000000000001e-49  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0728  fibronectin type III domain-containing protein  33.39 
 
 		 678 aa  197  5.000000000000001e-49  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0514161  normal  0.0700786 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1679  protease-like  43.3 
 
 		 1037 aa  188  3e-46  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000116915 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1461  cell wall binding repeat 2-containing protein  44.95 
 
 		 1073 aa  187  7e-46  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5764  Periplasmic component of the Tol biopolymer transport system-like protein  35.41 
 
 		 635 aa  186  1.0000000000000001e-45  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0700956  normal  0.065042 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3899  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  41.34 
 
 		 386 aa  176  1.9999999999999998e-42  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.030559 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0505  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  39.18 
 
 		 1412 aa  175  1.9999999999999998e-42  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0642654  normal  0.150071 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5281  Peptidase S53 propeptide  41.48 
 
 		 976 aa  174  6.999999999999999e-42  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0348  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  41.69 
 
 		 847 aa  173  7.999999999999999e-42  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.022722 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6568  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  40.56 
 
 		 871 aa  172  1e-41  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0218  PKD domain containing protein  38.57 
 
 		 848 aa  170  9e-41  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.904216  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3111  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  38.94 
 
 		 885 aa  169  2e-40  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.57258  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5805  Peptidase S53 propeptide  40 
 
 		 998 aa  167  5e-40  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8728  PKD domain containing protein  40.99 
 
 		 554 aa  167  5e-40  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.228973 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3612  fibronectin type III domain-containing protein  36.25 
 
 		 667 aa  164  4.0000000000000004e-39  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0390  Putative cell wall-binding domain-like protein  39.29 
 
 		 442 aa  164  7e-39  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.966504  normal  0.374671 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8457  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  39.16 
 
 		 905 aa  163  8.000000000000001e-39  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0037924 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3709  PKD domain containing protein  41.46 
 
 		 643 aa  162  2e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.155925  normal  0.0144846 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8838  Putative cell wall-binding domain-like protein  38.61 
 
 		 609 aa  159  1e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6412  Pyrrolo-quinoline quinone  37.35 
 
 		 1192 aa  157  5.0000000000000005e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.152468 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3526  PKD domain containing protein  38.66 
 
 		 682 aa  148  3e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.138368  normal  0.565533 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8727  PKD domain containing protein  33.87 
 
 		 589 aa  142  9.999999999999999e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.225168 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3546  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  39.38 
 
 		 510 aa  142  1.9999999999999998e-32  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.159957  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0217  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  36.53 
 
 		 684 aa  142  3e-32  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.952991  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0249  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  37.76 
 
 		 464 aa  140  7.999999999999999e-32  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.65229  normal  0.312319 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2236  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  33.87 
 
 		 719 aa  134  5e-30  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0506  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  37.2 
 
 		 448 aa  132  3e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.225372  normal  0.064309 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0370  Fibronectin type III domain protein  36.62 
 
 		 841 aa  123  9.999999999999999e-27  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.800383  normal  0.932394 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2312  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  33.97 
 
 		 769 aa  122  1.9999999999999998e-26  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000905322  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3298  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  31.49 
 
 		 706 aa  122  1.9999999999999998e-26  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4506  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  34.34 
 
 		 619 aa  121  4.9999999999999996e-26  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.417765  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0507  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  33.06 
 
 		 600 aa  117  6e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.427414  normal  0.0746205 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1937  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  32.42 
 
 		 2884 aa  113  1.0000000000000001e-23  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0496  Immunoglobulin I-set domain protein  30.82 
 
 		 1550 aa  110  7.000000000000001e-23  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0179971  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2674  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  31.83 
 
 		 860 aa  110  9.000000000000001e-23  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.0000000467202  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4484  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  31.45 
 
 		 543 aa  108  3e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000290327  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4160  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  28.53 
 
 		 326 aa  107  9e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1849  Ig domain protein group 2 domain protein  28.7 
 
 		 600 aa  105  3e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000374979  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4489  glycoside hydrolase family 18  33.75 
 
 		 688 aa  104  4e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00179307  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_12200  M6 family metalloprotease domain-containing protein  34.44 
 
 		 1045 aa  101  4e-20  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0570513  normal  0.178376 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_05530  cell wall-binding protein  31.58 
 
 		 1312 aa  100  1e-19  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0876125  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4728  Ig domain protein group 2 domain protein  29.45 
 
 		 640 aa  97.4  7e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.0000000000565945  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_05540  cell wall-binding protein  32.65 
 
 		 962 aa  97.4  7e-19  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4481  Ig domain protein  31.8 
 
 		 637 aa  97.4  7e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.174755  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4476  Ig domain protein group 2 domain protein  30.38 
 
 		 570 aa  97.1  9e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2155  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  28.03 
 
 		 649 aa  96.7  1e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000475992  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2324  cell wall hydrolase/autolysin  28.48 
 
 		 538 aa  97.1  1e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000122542  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4482  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  31.32 
 
 		 795 aa  93.6  9e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.0000000203992  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1783  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  34.95 
 
 		 600 aa  86.7  0.000000000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.925315  normal  0.683781 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0489  cell wall/surface repeat protein  29.29 
 
 		 1452 aa  86.3  0.000000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0529115  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1722  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  28.93 
 
 		 530 aa  80.5  0.00000000000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0787  VanW family protein  27.05 
 
 		 600 aa  79.7  0.0000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0161  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  34.74 
 
 		 342 aa  75.9  0.000000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.635552 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3015  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  33.5 
 
 		 475 aa  76.3  0.000000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0353052 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0357  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  31.35 
 
 		 1059 aa  71.2  0.00000000006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0428  cell wall binding repeat 2-containing protein  28.06 
 
 		 833 aa  59.3  0.0000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0259753  normal  0.43049 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1487  cell wall binding repeat 2-containing protein  37.65 
 
 		 551 aa  56.6  0.000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.470473  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0103  hypothetical protein  34.72 
 
 		 370 aa  55.8  0.000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.471762  normal  0.0364426 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1699  protein of unknown function DUF1533  27.53 
 
 		 1916 aa  55.8  0.000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1627  hypothetical protein  34.86 
 
 		 615 aa  54.7  0.000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14600  cell wall-binding protein  32.17 
 
 		 297 aa  54.3  0.000007  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.221702  normal  0.25424 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1321  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  24.41 
 
 		 749 aa  53.1  0.00001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1133  TolB-like  27.57 
 
 		 430 aa  52  0.00003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.166843  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2206  translocation protein TolB  27.59 
 
 		 427 aa  51.6  0.00004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00281817 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1253  TolB periplasmic receptor  26.85 
 
 		 430 aa  51.2  0.00005  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0142198  normal  0.831456 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0759  translocation protein TolB  30.94 
 
 		 430 aa  51.2  0.00005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.397862  normal  0.413932 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3920  translocation protein TolB  30.22 
 
 		 430 aa  51.2  0.00006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0501302 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2455  translocation protein TolB  24.62 
 
 		 430 aa  51.2  0.00006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.328002  normal  0.860267 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1585  WD40 domain protein beta Propeller  26.06 
 
 		 437 aa  50.4  0.00009  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.637887  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3582  Tol-Pal system beta propeller repeat protein TolB  27.44 
 
 		 407 aa  50.4  0.00009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4427  translocation protein TolB  26.67 
 
 		 441 aa  50.1  0.0001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.500534 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1211  translocation protein TolB  28.57 
 
 		 462 aa  50.4  0.0001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.896355  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1346  translocation protein TolB  26.67 
 
 		 421 aa  49.3  0.0002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0684  translocation protein TolB  33.7 
 
 		 434 aa  49.7  0.0002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.672983  normal  0.603997 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0728  translocation protein TolB  33.7 
 
 		 434 aa  49.7  0.0002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  hitchhiker  0.00650912  normal  0.160751 
 
 
-
 
NC_002620  TC0888  translocation protein TolB  31.33 
 
 		 426 aa  48.9  0.0003  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0795  translocation protein TolB  32.38 
 
 		 450 aa  48.5  0.0003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2365  translocation protein TolB  28.99 
 
 		 441 aa  48.9  0.0003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0776  peptidase S9B dipeptidylpeptidase IV subunit  25.18 
 
 		 395 aa  48.9  0.0003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.605794  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6283  Acylaminoacyl-peptidase  36.78 
 
 		 641 aa  48.9  0.0003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0745769  normal  0.0863607 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2081  translocation protein TolB  35 
 
 		 433 aa  48.5  0.0004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1577  serine/threonine protein kinase  23.81 
 
 		 969 aa  48.5  0.0004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.713812 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2661  translocation protein TolB  35 
 
 		 431 aa  48.5  0.0004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.622452  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3203  translocation protein TolB  35 
 
 		 430 aa  48.1  0.0004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.95129  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3241  translocation protein TolB  35 
 
 		 430 aa  48.1  0.0004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.786429  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1949  translocation protein TolB  35 
 
 		 433 aa  48.5  0.0004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0747  Tol-Pal system beta propeller repeat protein TolB  22.97 
 
 		 444 aa  48.5  0.0004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  unclonable  0.00000000000257607  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03155  Acylaminoacyl-peptidase  28.57 
 
 		 685 aa  48.1  0.0004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0735  translocation protein TolB  28.88 
 
 		 432 aa  48.1  0.0005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.9087  normal  0.380909 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3256  translocation protein TolB  35 
 
 		 463 aa  48.1  0.0005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0827  translocation protein TolB  35 
 
 		 463 aa  48.1  0.0005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5227  Tol-Pal system beta propeller repeat protein TolB  24.55 
 
 		 446 aa  47.8  0.0005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.175544  normal  0.115662 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>