93 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dhaf_0489 on replicon NC_011830
Organism: Desulfitobacterium hafniense DCB-2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011830  Dhaf_0489  cell wall/surface repeat protein  100 
 
 
1452 aa  2888    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0529115  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1937  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  53.89 
 
 
2884 aa  608  9.999999999999999e-173  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0496  Immunoglobulin I-set domain protein  54.97 
 
 
1550 aa  353  2e-95  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0179971  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3298  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  38.17 
 
 
706 aa  186  2.0000000000000003e-45  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0787  VanW family protein  39.3 
 
 
600 aa  184  1e-44  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2312  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  34.63 
 
 
769 aa  158  8e-37  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000905322  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1849  Ig domain protein group 2 domain protein  34.85 
 
 
600 aa  157  1e-36  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000374979  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4489  glycoside hydrolase family 18  38.94 
 
 
688 aa  154  2e-35  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00179307  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4506  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  37.07 
 
 
619 aa  152  6e-35  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.417765  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4482  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  32.79 
 
 
795 aa  150  1.0000000000000001e-34  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.0000000203992  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3546  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  35.14 
 
 
510 aa  144  9.999999999999999e-33  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.159957  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4476  Ig domain protein group 2 domain protein  34.31 
 
 
570 aa  143  1.9999999999999998e-32  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4728  Ig domain protein group 2 domain protein  34.41 
 
 
640 aa  142  4.999999999999999e-32  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.0000000000565945  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4481  Ig domain protein  30.23 
 
 
637 aa  139  3.0000000000000003e-31  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.174755  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4303  LPXTG-motif cell wall anchor domain protein  45.14 
 
 
2122 aa  139  5e-31  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2674  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  33.55 
 
 
860 aa  137  1.9999999999999998e-30  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.0000000467202  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_05540  cell wall-binding protein  32.92 
 
 
962 aa  136  1.9999999999999998e-30  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7275  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  32.7 
 
 
624 aa  137  1.9999999999999998e-30  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5805  Peptidase S53 propeptide  34.26 
 
 
998 aa  135  7.999999999999999e-30  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6568  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  32.38 
 
 
871 aa  130  2.0000000000000002e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2644  cell wall/surface repeat protein  34.12 
 
 
2178 aa  129  4.0000000000000003e-28  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.615501  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4160  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  32.71 
 
 
326 aa  128  6e-28  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2324  cell wall hydrolase/autolysin  33.12 
 
 
538 aa  127  1e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000122542  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4484  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  33.33 
 
 
543 aa  125  7e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000290327  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_12200  M6 family metalloprotease domain-containing protein  31.72 
 
 
1045 aa  124  1.9999999999999998e-26  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0570513  normal  0.178376 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8728  PKD domain containing protein  33.64 
 
 
554 aa  124  1.9999999999999998e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.228973 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0505  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  32.79 
 
 
1412 aa  122  3.9999999999999996e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0642654  normal  0.150071 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1699  protein of unknown function DUF1533  32.28 
 
 
1916 aa  122  4.9999999999999996e-26  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3111  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  29.69 
 
 
885 aa  122  7e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.57258  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2155  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  31.77 
 
 
649 aa  120  9.999999999999999e-26  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000475992  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_05530  cell wall-binding protein  30.03 
 
 
1312 aa  120  3e-25  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0876125  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8457  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  29.94 
 
 
905 aa  116  2.0000000000000002e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0037924 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8837  hypothetical protein  27.09 
 
 
673 aa  115  4.0000000000000004e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1679  protease-like  32.04 
 
 
1037 aa  115  7.000000000000001e-24  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000116915 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5281  Peptidase S53 propeptide  31.73 
 
 
976 aa  114  1.0000000000000001e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2236  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  31.53 
 
 
719 aa  112  6e-23  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1805  Putative cell wall-binding domain-like protein  30.99 
 
 
688 aa  111  9.000000000000001e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.203584  normal  0.132766 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0249  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  30.51 
 
 
464 aa  109  3e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.65229  normal  0.312319 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8727  PKD domain containing protein  28.37 
 
 
589 aa  109  4e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.225168 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8838  Putative cell wall-binding domain-like protein  29.55 
 
 
609 aa  107  1e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1321  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  34.03 
 
 
749 aa  106  3e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1722  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  35.71 
 
 
530 aa  104  1e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0218  PKD domain containing protein  31.28 
 
 
848 aa  103  2e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.904216  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0348  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  30.61 
 
 
847 aa  103  3e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.022722 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6412  Pyrrolo-quinoline quinone  29.63 
 
 
1192 aa  102  5e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.152468 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3526  PKD domain containing protein  29.28 
 
 
682 aa  101  1e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.138368  normal  0.565533 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1783  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  31.02 
 
 
600 aa  101  1e-19  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.925315  normal  0.683781 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0370  Fibronectin type III domain protein  30.7 
 
 
841 aa  101  1e-19  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.800383  normal  0.932394 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2088  WD40 domain protein beta Propeller  30.22 
 
 
714 aa  101  1e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0390  Putative cell wall-binding domain-like protein  30.33 
 
 
442 aa  99.8  3e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.966504  normal  0.374671 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1461  cell wall binding repeat 2-containing protein  30.87 
 
 
1073 aa  99.4  5e-19  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0484  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  26.95 
 
 
656 aa  97.4  2e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0645935  normal  0.306221 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0274  hypothetical protein  26.22 
 
 
661 aa  96.7  3e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.598131  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0506  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  30.89 
 
 
448 aa  95.1  9e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.225372  normal  0.064309 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3015  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  29.96 
 
 
475 aa  94.7  1e-17  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0353052 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0728  fibronectin type III domain-containing protein  28.99 
 
 
678 aa  94.4  1e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0514161  normal  0.0700786 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5764  Periplasmic component of the Tol biopolymer transport system-like protein  28.96 
 
 
635 aa  92.4  5e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0700956  normal  0.065042 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0507  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  28.25 
 
 
600 aa  92  7e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.427414  normal  0.0746205 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8843  WD40 domain protein beta Propeller  29.29 
 
 
635 aa  92  8e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3899  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  28.44 
 
 
386 aa  92  8e-17  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.030559 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0217  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  28.4 
 
 
684 aa  89  7e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.952991  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11480  conserved repeat protein  32.35 
 
 
1893 aa  85.1  0.000000000000009  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1487  cell wall binding repeat 2-containing protein  30.41 
 
 
551 aa  84.3  0.00000000000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.470473  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0739  YSIRK Gram-positive signal peptide  28.73 
 
 
2035 aa  83.2  0.00000000000004  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8288  Putative cell wall-binding domain-like protein  24.94 
 
 
627 aa  82.8  0.00000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.597938 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0216  cell wall binding repeat 2-containing protein  27.86 
 
 
663 aa  82.4  0.00000000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3709  PKD domain containing protein  28.53 
 
 
643 aa  79.7  0.0000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.155925  normal  0.0144846 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0428  cell wall binding repeat 2-containing protein  33.84 
 
 
833 aa  79.3  0.0000000000005  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0259753  normal  0.43049 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14600  cell wall-binding protein  31.25 
 
 
297 aa  76.6  0.000000000003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.221702  normal  0.25424 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0357  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  29.91 
 
 
1059 aa  73.2  0.00000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4483  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  29.9 
 
 
1135 aa  73.2  0.00000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000331239  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0161  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  31.17 
 
 
342 aa  71.2  0.0000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.635552 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3612  fibronectin type III domain-containing protein  28.07 
 
 
667 aa  66.6  0.000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00410  conserved repeat protein  45.45 
 
 
1406 aa  60.1  0.0000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0351044  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2240  hypothetical protein  33.56 
 
 
221 aa  57.4  0.000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0422  cell wall/surface repeat protein  27.38 
 
 
1729 aa  57.4  0.000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00920532  hitchhiker  0.0000607429 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0266  cell wall/surface repeat protein  30.11 
 
 
1350 aa  55.8  0.000006  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal  0.808645 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0103  hypothetical protein  31.31 
 
 
370 aa  54.7  0.00001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.471762  normal  0.0364426 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0821  cell wall-binding domain-containing protein  27.78 
 
 
330 aa  51.2  0.0001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.672337  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1779  hypothetical protein  28.57 
 
 
411 aa  50.1  0.0003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.362511  normal  0.842634 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2434  cell wall/surface repeat protein  38.83 
 
 
2207 aa  50.1  0.0004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0471  BNR domain-containing protein  33.65 
 
 
543 aa  50.1  0.0004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1411  sugar-binding domain protein  30.56 
 
 
2126 aa  49.3  0.0005  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.183423  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0459  LPXTG-motif cell wall anchor domain protein  29.66 
 
 
1070 aa  49.3  0.0006  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0781  putative lipoprotein  25.38 
 
 
415 aa  48.9  0.0007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25520  conserved repeat protein  39.74 
 
 
613 aa  47.4  0.002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0620  hypothetical protein  25 
 
 
333 aa  46.6  0.004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.227693  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4650  putative lipoprotein  23.39 
 
 
415 aa  45.4  0.007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00382445  unclonable  9.97545e-26 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0548  hypothetical protein  25.81 
 
 
398 aa  45.4  0.007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0298  hypothetical protein  34.66 
 
 
1457 aa  45.8  0.007  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.00924887  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0720  putative lipoprotein  25.28 
 
 
415 aa  45.4  0.008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0276  transcriptional regulator, ArsR family protein  22.5 
 
 
430 aa  45.1  0.01  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0186  transcriptional regulator, ArsR family protein  22.5 
 
 
430 aa  45.1  0.01  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>