18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Apre_0739 on replicon NC_013171
Organism: Anaerococcus prevotii DSM 20548



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013171  Apre_0739  YSIRK Gram-positive signal peptide  100 
 
 		 2035 aa  4030    Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0489  cell wall/surface repeat protein  28.51 
 
 		 1452 aa  72.8  0.00000000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0529115  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0409  hypothetical protein  32.82 
 
 		 527 aa  71.2  0.0000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.282348  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3753  hypothetical protein  34.07 
 
 		 340 aa  66.2  0.000000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.655031  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1767  putative autotransporter  41.27 
 
 		 1984 aa  65.1  0.00000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.209421 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2644  cell wall/surface repeat protein  27.07 
 
 		 2178 aa  60.1  0.0000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.615501  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3752  protein of unknown function DUF291  26.4 
 
 		 662 aa  54.3  0.00002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0101  hypothetical protein  23.62 
 
 		 1314 aa  52.4  0.00009  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.470357 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1913  hypothetical protein  29.76 
 
 		 1198 aa  52  0.0001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0476202  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11480  conserved repeat protein  24.53 
 
 		 1893 aa  50.8  0.0003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1411  sugar-binding domain protein  67.65 
 
 		 2126 aa  50.8  0.0003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.183423  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0924  lpxtg-motif cell wall anchor domain protein  38.05 
 
 		 1328 aa  48.9  0.001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0623  protein of unknown function DUF291  26.24 
 
 		 2205 aa  48.5  0.001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.578825  unclonable  0.00000000542423 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1119  G5 domain protein  34.34 
 
 		 1859 aa  48.1  0.002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.983019  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10020  hypothetical protein  31.58 
 
 		 527 aa  46.6  0.005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2406  hypothetical protein  32.46 
 
 		 485 aa  46.2  0.006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0542491  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0363  hypothetical protein  34.34 
 
 		 298 aa  46.2  0.007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1646  DNA-directed DNA polymerase  30 
 
 		 834 aa  46.2  0.007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.218783 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>