54 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcSMS35_1767 on replicon NC_010498
Organism: Escherichia coli SMS-3-5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009800  EcHS_A1488  autotransporter (AT) family porin  41.87 
 
 
1951 aa  1094    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1767  putative autotransporter  100 
 
 
1984 aa  3931    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.209421 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3785  porin autotransporter  49.9 
 
 
1941 aa  1720    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3676  BigA  40.44 
 
 
1940 aa  1166    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2240  Autotransporter beta- domain protein  68.83 
 
 
1107 aa  818    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.400804  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3678  BigA  41.29 
 
 
1982 aa  1154    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3847  porin, autotransporter  50 
 
 
1923 aa  1712    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2244  conserved hypothetical protein  32.32 
 
 
852 aa  246  1.9999999999999999e-63  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.518929  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3354  outer membrane autotransporter barrel domain protein  25.19 
 
 
2216 aa  83.6  0.00000000000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0013  Autotransporter beta- domain protein  24.57 
 
 
2276 aa  82  0.0000000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3436  outer membrane autotransporter barrel domain protein  23.73 
 
 
2114 aa  77.4  0.000000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.292491  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0746  Autotransporter beta- domain protein  24.95 
 
 
2091 aa  76.6  0.000000000005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3710  outer membrane autotransporter barrel domain protein  23.69 
 
 
2270 aa  72.8  0.00000000007  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.799117  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0966  outer membrane autotransporter barrel domain protein  25.24 
 
 
2844 aa  68.6  0.000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2454  ShdA  50.43 
 
 
3322 aa  67.8  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0739  YSIRK Gram-positive signal peptide  40.91 
 
 
2035 aa  67  0.000000004  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0755  outer membrane autotransporter barrel domain protein  24.19 
 
 
2786 aa  66.2  0.000000006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2417  outer membrane autotransporter barrel domain protein  23.98 
 
 
2655 aa  66.2  0.000000007  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1729  outer membrane autotransporter barrel domain protein  22.8 
 
 
2237 aa  63.9  0.00000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.737065  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2359  outer membrane autotransporter barrel domain protein  22.8 
 
 
2267 aa  63.5  0.00000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0983  outer membrane autotransporter barrel domain protein  22.2 
 
 
2309 aa  63.5  0.00000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4100  outer membrane autotransporter barrel domain protein  23.03 
 
 
2225 aa  62.8  0.00000006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1913  hypothetical protein  41.54 
 
 
1198 aa  61.6  0.0000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0476202  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2659  outer membrane autotransporter barrel domain protein  22.8 
 
 
2407 aa  60.1  0.0000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2332  outer membrane autotransporter barrel domain protein  21.82 
 
 
2435 aa  58.5  0.000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2133  outer membrane autotransporter barrel domain protein  21.83 
 
 
2305 aa  58.5  0.000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.837933  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26910  hypothetical protein  38.36 
 
 
423 aa  58.5  0.000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1533  outer membrane autotransporter barrel domain protein  22.3 
 
 
1251 aa  57.8  0.000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1591  outer membrane autotransporter barrel domain protein  20.52 
 
 
2739 aa  57.8  0.000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013518  Sterm_4191  outer membrane autotransporter barrel domain protein  22.22 
 
 
2310 aa  57.8  0.000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1780  outer membrane autotransporter barrel domain protein  22.57 
 
 
2065 aa  57.4  0.000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3802  outer membrane autotransporter  29.78 
 
 
2083 aa  57  0.000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1941  outer membrane autotransporter barrel domain protein  24.2 
 
 
2263 aa  56.6  0.000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1739  outer membrane autotransporter barrel domain protein  19.94 
 
 
2596 aa  55.8  0.000008  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3724  outer membrane autotransporter barrel domain protein  23.27 
 
 
2370 aa  54.7  0.00002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0728  outer membrane autotransporter barrel domain protein  22.11 
 
 
1256 aa  54.3  0.00002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.23429  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0331  hypothetical protein  21.66 
 
 
2656 aa  54.3  0.00002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1374  outer membrane autotransporter barrel domain protein  23.56 
 
 
2751 aa  53.9  0.00003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0326  outer membrane autotransporter barrel domain protein  23.74 
 
 
2123 aa  53.5  0.00004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.372271  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3240  outer membrane autotransporter barrel domain protein  22.55 
 
 
2760 aa  53.5  0.00004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1720  outer membrane autotransporter barrel domain protein  24.33 
 
 
2309 aa  50.8  0.0003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.92642  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0561  outer membrane autotransporter barrel domain protein  22.88 
 
 
2280 aa  50.4  0.0003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0512  outer membrane autotransporter barrel domain protein  22.05 
 
 
2210 aa  50.4  0.0004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1424  LysR family transcriptional regulator  29.29 
 
 
439 aa  49.7  0.0005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3437  outer membrane autotransporter barrel domain protein  21.12 
 
 
2321 aa  49.7  0.0006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3391  outer membrane autotransporter barrel domain protein  24.33 
 
 
2788 aa  49.7  0.0006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5425  serine/threonine protein kinase  30.19 
 
 
760 aa  49.3  0.0008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.026993  normal  0.70686 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2468  outer membrane autotransporter barrel domain protein  18.92 
 
 
2437 aa  49.3  0.0008  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3371  outer membrane autotransporter barrel domain protein  22.54 
 
 
2245 aa  48.5  0.001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.638586  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0988  outer membrane autotransporter barrel domain protein  25.62 
 
 
2270 aa  48.1  0.002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0317  outer membrane autotransporter barrel domain protein  23.26 
 
 
2756 aa  48.1  0.002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1645  hypothetical protein  59.46 
 
 
320 aa  48.1  0.002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.0388574 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2447  chitin-binding domain 3 protein  46.43 
 
 
389 aa  47.4  0.003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.0284927 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2446  outer membrane autotransporter barrel domain protein  23.14 
 
 
2800 aa  45.8  0.009  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>