More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_1646 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_1646  DNA-directed DNA polymerase  100 
 
 		 834 aa  1643    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.218783 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1444  DNA polymerase IV  49.32 
 
 		 466 aa  337  7.999999999999999e-91  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.754501  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2975  DNA polymerase IV  55.21 
 
 		 443 aa  323  7e-87  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.949481  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5052  DNA-directed DNA polymerase  53.37 
 
 		 448 aa  318  3e-85  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4326  DNA-directed DNA polymerase  51.64 
 
 		 463 aa  316  9.999999999999999e-85  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.49996  normal  0.088504 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13630  DNA repair nucleotidyltransferase/DNA polymerase  46.17 
 
 		 458 aa  298  2e-79  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.106068  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20590  DNA repair nucleotidyltransferase/DNA polymerase  46.4 
 
 		 489 aa  280  9e-74  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0145  DNA-directed DNA polymerase  45.45 
 
 		 399 aa  278  4e-73  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0301883  normal  0.226149 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5353  DNA polymerase IV  44.13 
 
 		 378 aa  274  6e-72  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.198836  normal  0.299038 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0159  DNA-directed DNA polymerase  44.63 
 
 		 418 aa  271  2.9999999999999997e-71  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0148  DNA-directed DNA polymerase  44.63 
 
 		 418 aa  270  8e-71  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0141  DNA-directed DNA polymerase  44.08 
 
 		 418 aa  269  1e-70  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2280  DNA-directed DNA polymerase  42.3 
 
 		 378 aa  268  2e-70  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.924608  hitchhiker  0.0000031101 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2654  DNA polymerase IV  42.3 
 
 		 378 aa  268  2e-70  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3160  DNA-directed DNA polymerase  42.7 
 
 		 359 aa  268  4e-70  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0076  DNA-directed DNA polymerase  47.73 
 
 		 577 aa  266  8e-70  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5155  DNA polymerase IV  41.78 
 
 		 363 aa  264  4.999999999999999e-69  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.702969 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4922  DNA-directed DNA polymerase  45.07 
 
 		 410 aa  263  8e-69  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0212665 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3374  DNA polymerase IV  42.78 
 
 		 385 aa  261  3e-68  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2775  DNA-directed DNA polymerase  44.72 
 
 		 355 aa  261  3e-68  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3462  DNA-directed DNA polymerase  44.1 
 
 		 419 aa  261  3e-68  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00370364 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3597  DNA-directed DNA polymerase  41.24 
 
 		 380 aa  258  3e-67  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.456033 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0732  DNA-directed DNA polymerase  44.17 
 
 		 363 aa  258  3e-67  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.833353  normal  0.0993965 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0883  DNA-directed DNA polymerase  39.14 
 
 		 360 aa  258  4e-67  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1185  DNA-directed DNA polymerase  42.78 
 
 		 381 aa  258  4e-67  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.129375  normal  1 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6078  DNA polymerase IV  41.36 
 
 		 365 aa  257  8e-67  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5784  DNA-directed DNA polymerase  42.9 
 
 		 430 aa  254  4.0000000000000004e-66  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.108507  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1867  DNA-directed DNA polymerase  42.31 
 
 		 356 aa  254  5.000000000000001e-66  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3236  DNA-directed DNA polymerase  43.71 
 
 		 419 aa  253  8.000000000000001e-66  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.516429  decreased coverage  0.00986036 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7175  DNA-directed DNA polymerase  38.46 
 
 		 371 aa  253  1e-65  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3265  DNA polymerase IV  42.74 
 
 		 354 aa  251  3e-65  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1432  DNA-directed DNA polymerase  42.42 
 
 		 374 aa  251  5e-65  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.517371  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2656  DNA polymerase IV  41.64 
 
 		 378 aa  249  1e-64  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3277  DNA-directed DNA polymerase  45.22 
 
 		 402 aa  245  1.9999999999999999e-63  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3636  DNA polymerase IV  41.41 
 
 		 396 aa  246  1.9999999999999999e-63  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.892851 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25070  DNA repair nucleotidyltransferase/DNA polymerase  42.17 
 
 		 415 aa  245  3e-63  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.487274  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1859  DNA polymerase IV  43.79 
 
 		 392 aa  245  3e-63  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08990  DNA-directed DNA polymerase  39.57 
 
 		 385 aa  244  3.9999999999999997e-63  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11570  DNA polymerase IV  43.33 
 
 		 463 aa  244  5e-63  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2317  DNA-directed DNA polymerase  40.85 
 
 		 426 aa  244  5e-63  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0318  DNA-directed DNA polymerase  38.76 
 
 		 372 aa  243  7e-63  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.154893 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1393  DNA-directed DNA polymerase  44.41 
 
 		 410 aa  243  7.999999999999999e-63  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0677634  normal  0.0363654 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1272  DNA-directed DNA polymerase  41.03 
 
 		 359 aa  243  1e-62  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2635  DNA-directed DNA polymerase  42.5 
 
 		 466 aa  243  1e-62  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.959569  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3129  damage-inducible protein DinP  40.21 
 
 		 399 aa  242  2.9999999999999997e-62  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2331  DNA-directed DNA polymerase  37.79 
 
 		 408 aa  241  2.9999999999999997e-62  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.632571  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5112  DNA-directed DNA polymerase  43.1 
 
 		 420 aa  241  5e-62  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.360047  normal  0.490555 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2856  DNA-directed DNA polymerase  42.17 
 
 		 406 aa  240  6.999999999999999e-62  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.107741  normal  0.171619 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2023  DNA-directed DNA polymerase  37.94 
 
 		 421 aa  239  1e-61  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.137176  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03139  DNA polymerase IV  42.58 
 
 		 369 aa  239  2e-61  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1400  DNA polymerase IV  41.71 
 
 		 449 aa  239  2e-61  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.193285  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1560  DNA-directed DNA polymerase  41.55 
 
 		 408 aa  238  3e-61  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1566  DNA polymerase IV  41.36 
 
 		 369 aa  238  3e-61  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0682981  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2160  DNA polymerase IV  42.09 
 
 		 408 aa  238  3e-61  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.916632  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5935  DNA polymerase IV  42.09 
 
 		 383 aa  238  4e-61  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0630772  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2179  DNA polymerase IV  41.81 
 
 		 405 aa  238  4e-61  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.288104  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0068  DNA polymerase IV  41.71 
 
 		 417 aa  238  4e-61  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.91502  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0473  DNA-directed DNA polymerase  38.48 
 
 		 375 aa  238  5.0000000000000005e-61  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2663  DNA-directed DNA polymerase  37.74 
 
 		 358 aa  237  6e-61  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0579235  normal  0.454418 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5685  DNA polymerase IV  41.69 
 
 		 424 aa  237  6e-61  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00273553 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0963  DNA polymerase IV  38.87 
 
 		 395 aa  236  1.0000000000000001e-60  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5448  DNA polymerase IV  41.53 
 
 		 379 aa  236  1.0000000000000001e-60  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2142  DNA polymerase IV  41.93 
 
 		 361 aa  236  1.0000000000000001e-60  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2097  DNA-directed DNA polymerase  41.64 
 
 		 373 aa  235  2.0000000000000002e-60  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1559  DNA-directed DNA polymerase  39.64 
 
 		 408 aa  236  2.0000000000000002e-60  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.195396  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1096  DNA-directed DNA polymerase  40.06 
 
 		 424 aa  234  4.0000000000000004e-60  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4788  DNA-directed DNA polymerase  40.39 
 
 		 402 aa  234  4.0000000000000004e-60  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.182226  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2675  DNA polymerase IV  43.06 
 
 		 406 aa  234  5e-60  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3083  DNA polymerase IV  43.06 
 
 		 400 aa  234  6e-60  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0662  DNA-directed DNA polymerase  39.54 
 
 		 353 aa  234  6e-60  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2236  DNA polymerase IV  43.06 
 
 		 400 aa  234  6e-60  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.783166  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1508  DNA polymerase IV  43.06 
 
 		 400 aa  234  6e-60  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.408147  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1727  DNA polymerase IV  43.06 
 
 		 404 aa  234  7.000000000000001e-60  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2751  DNA polymerase IV  43.06 
 
 		 404 aa  234  7.000000000000001e-60  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2619  DNA polymerase IV  43.06 
 
 		 403 aa  233  9e-60  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3002  DNA-directed DNA polymerase  41.23 
 
 		 449 aa  233  1e-59  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0144  DNA-directed DNA polymerase  38.27 
 
 		 354 aa  233  1e-59  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1122  DNA polymerase IV  43.08 
 
 		 413 aa  233  1e-59  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.36327  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3115  DNA polymerase IV  41.67 
 
 		 452 aa  232  2e-59  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.259823  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1563  DNA-directed DNA polymerase  40.56 
 
 		 371 aa  232  2e-59  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.233621  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1923  DNA-directed DNA polymerase  39.78 
 
 		 369 aa  232  2e-59  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  unclonable  0.000000000722148  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3394  DNA polymerase IV  42.35 
 
 		 364 aa  231  4e-59  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.320161  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5890  DNA-directed DNA polymerase  40.62 
 
 		 409 aa  231  4e-59  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.315723  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3155  DNA polymerase IV  41.39 
 
 		 452 aa  231  4e-59  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.945689  normal  0.349155 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0756  DNA polymerase IV  41.81 
 
 		 376 aa  231  5e-59  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3095  DNA polymerase IV  41.39 
 
 		 454 aa  231  5e-59  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0455  DNA polymerase IV  41.55 
 
 		 356 aa  231  5e-59  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22910  DNA repair nucleotidyltransferase/DNA polymerase  40.17 
 
 		 414 aa  230  7e-59  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0450607 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5438  DNA polymerase IV  43.81 
 
 		 407 aa  230  9e-59  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.151264  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1726  DNA polymerase IV  38.31 
 
 		 364 aa  229  1e-58  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.503643  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2071  DNA-directed DNA polymerase  42.62 
 
 		 348 aa  230  1e-58  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.485173  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0882  DNA-directed DNA polymerase  39.45 
 
 		 417 aa  230  1e-58  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2940  DNA-directed DNA polymerase  41.93 
 
 		 422 aa  229  2e-58  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000325025  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1538  DNA polymerase IV  38.07 
 
 		 359 aa  228  3e-58  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.142291  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1063  DNA-directed DNA polymerase  39.32 
 
 		 413 aa  228  3e-58  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.435169  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3213  DNA-directed DNA polymerase  44.23 
 
 		 407 aa  228  4e-58  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0704877  normal  0.021461 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1818  DNA polymerase IV  37.29 
 
 		 359 aa  228  5.0000000000000005e-58  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.432608  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1640  DNA-directed DNA polymerase  38.31 
 
 		 360 aa  227  6e-58  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.582821 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0937  DNA-directed DNA polymerase  39.63 
 
 		 436 aa  227  8e-58  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0738  DNA-directed DNA polymerase  39.55 
 
 		 425 aa  226  1e-57  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.59258  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>