23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_0363 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013440  Hoch_0363  hypothetical protein  100 
 
 		 298 aa  592  1e-168  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3774  PEGA domain-containing protein  38.05 
 
 		 317 aa  79  0.00000000000008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4210  collagen adhesion protein  36.99 
 
 		 2179 aa  52.8  0.000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.950826  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3706  PEGA domain protein  32.18 
 
 		 338 aa  51.6  0.00001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.425846  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1336  hypothetical protein  37.18 
 
 		 627 aa  50.8  0.00003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1095  collagen adhesion protein  38.96 
 
 		 2272 aa  49.3  0.00008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2654  thioredoxin-related protein  35.29 
 
 		 370 aa  48.9  0.0001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0534989  normal  0.540425 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3789  PEGA domain protein  29.89 
 
 		 338 aa  48.9  0.0001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  hitchhiker  0.000518163  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2933  TPR repeat-containing protein  31.95 
 
 		 588 aa  47.8  0.0002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0739  YSIRK Gram-positive signal peptide  31.78 
 
 		 2035 aa  47.8  0.0002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1818  PEGA domain protein  28.07 
 
 		 592 aa  47.4  0.0003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.679089 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0987  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  23.36 
 
 		 305 aa  47.4  0.0003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.40549  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4054  sporulation domain-containing protein  31.13 
 
 		 538 aa  46.2  0.0007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7167  TPR repeat-containing protein  26.47 
 
 		 362 aa  45.8  0.0008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0222903  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6451  Tetratricopeptide TPR_4  33.33 
 
 		 282 aa  45.4  0.001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3648  TPR repeat-containing protein  30.38 
 
 		 334 aa  45.4  0.001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0366403  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1129  TPR repeat-containing protein  36.21 
 
 		 473 aa  44.3  0.002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1313  TPR repeat-containing protein  36.21 
 
 		 473 aa  44.7  0.002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.010382  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3877  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  28.83 
 
 		 378 aa  44.7  0.002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.410686 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0498  hypothetical protein  33.33 
 
 		 368 aa  43.9  0.003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2383  TPR repeat-containing protein  32.69 
 
 		 1421 aa  43.9  0.003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.823331 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5103  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  32.88 
 
 		 337 aa  43.9  0.003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2386  serine/threonine protein kinase with TPR repeats  32.91 
 
 		 679 aa  43.5  0.004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.348328 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>