11 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_0987 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013440  Hoch_0987  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  100 
 
 		 305 aa  610  1e-173  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.40549  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5944  hypothetical protein  41.54 
 
 		 328 aa  49.7  0.00006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3560  PEGA domain protein  33.64 
 
 		 361 aa  46.6  0.0005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  decreased coverage  0.00097994  normal  0.106355 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1529  hypothetical protein  26.84 
 
 		 395 aa  46.2  0.0006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6756  hypothetical protein  28.57 
 
 		 342 aa  46.6  0.0006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0363  hypothetical protein  23.46 
 
 		 298 aa  44.7  0.002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2654  thioredoxin-related protein  30.17 
 
 		 370 aa  43.9  0.003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0534989  normal  0.540425 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1516  tetratricopeptide repeat family protein  29.21 
 
 		 561 aa  43.9  0.003  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0661  TPR repeat-containing methyltransferase  29.21 
 
 		 561 aa  43.9  0.003  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.25847  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1560  TPR repeat-containing protein  33.77 
 
 		 571 aa  43.9  0.003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.535158 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2508  TPR domain-containing protein  41.89 
 
 		 559 aa  43.1  0.005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.849467  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>