15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_6451 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013440  Hoch_6451  Tetratricopeptide TPR_4  100 
 
 		 282 aa  554  1e-157  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0363  hypothetical protein  34 
 
 		 298 aa  50.8  0.00003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0987  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  30.51 
 
 		 305 aa  49.7  0.00005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.40549  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3774  PEGA domain-containing protein  33.93 
 
 		 317 aa  49.7  0.00006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3877  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  29.9 
 
 		 378 aa  49.3  0.00007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.410686 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1818  PEGA domain protein  32.81 
 
 		 592 aa  48.1  0.0002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.679089 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3560  PEGA domain protein  27.83 
 
 		 361 aa  46.2  0.0006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  decreased coverage  0.00097994  normal  0.106355 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0999  serine/threonine kinase protein  39.22 
 
 		 896 aa  45.1  0.001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2682  TPR repeat-containing protein  25.58 
 
 		 701 aa  44.3  0.002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6549  diguanylate cyclase  29.06 
 
 		 546 aa  44.3  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.530699 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0957  TPR repeat-containing protein  32.31 
 
 		 161 aa  43.5  0.004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000843973  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0410  hypothetical protein  29.92 
 
 		 222 aa  42.4  0.008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000196847  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2766  TPR repeat-containing protein  31.71 
 
 		 690 aa  42.4  0.008  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2958  transcriptional regulator, SARP family  32.39 
 
 		 964 aa  42.4  0.009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.500488  hitchhiker  0.00113225 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0678  extracellular ligand-binding receptor  47.06 
 
 		 1073 aa  42  0.01  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>