157 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sbal_2766 on replicon NC_009052
Organism: Shewanella baltica OS155



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011663  Sbal223_1592  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  97.11 
 
 		 692 aa  1163    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000228279 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3094  TPR domain-containing protein  67 
 
 		 679 aa  881    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1402  TPR repeat-containing protein  82.12 
 
 		 681 aa  733    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000103328 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1467  TPR repeat-containing protein  82.12 
 
 		 687 aa  733    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.510289  hitchhiker  0.00291188 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2682  TPR repeat-containing protein  51.54 
 
 		 701 aa  688    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1455  TPR repeat-containing protein  82.34 
 
 		 690 aa  741    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000000112359 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2766  TPR repeat-containing protein  100 
 
 		 690 aa  1388    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2465  TPR repeat-containing protein  78.64 
 
 		 663 aa  1005    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2786  TPR repeat-containing protein  93.71 
 
 		 693 aa  1116    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1623  TPR repeat-containing protein  50.43 
 
 		 644 aa  635    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000210321 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2861  TPR repeat-containing protein  95.98 
 
 		 692 aa  1147    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0393834 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1524  TPR repeat-containing protein  51.6 
 
 		 691 aa  609  1e-173  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3032  TPR repeat-containing protein  49.35 
 
 		 650 aa  606  9.999999999999999e-173  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.198571  normal  0.0885065 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2604  TPR repeat-containing protein  51.61 
 
 		 653 aa  592  1e-168  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2431  TPR repeat-containing protein  49.73 
 
 		 693 aa  563  1.0000000000000001e-159  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0167557 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2173  TPR domain-containing protein  44.51 
 
 		 701 aa  497  1e-139  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.081888 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1658  TPR repeat-containing protein  39.6 
 
 		 647 aa  381  1e-104  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.95456  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2816  TPR repeat-containing protein  36.22 
 
 		 657 aa  350  4e-95  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3163  TPR domain-containing protein  36.96 
 
 		 690 aa  316  8e-85  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.185864  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0072  TPR repeat-containing protein  34.07 
 
 		 664 aa  316  8e-85  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0523  hypothetical protein  39.78 
 
 		 619 aa  313  4.999999999999999e-84  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1743  TPR domain-containing protein  35.77 
 
 		 658 aa  305  2.0000000000000002e-81  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02706  TPR domain protein  32.96 
 
 		 667 aa  296  9e-79  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1107  hypothetical protein  37.92 
 
 		 646 aa  291  3e-77  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05143  hypothetical protein  38.43 
 
 		 601 aa  288  2e-76  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001268  TPR domain protein in aerotolerance operon  37.72 
 
 		 599 aa  288  2e-76  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1949  TPR repeat-containing protein  34.89 
 
 		 612 aa  241  2.9999999999999997e-62  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.931925  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3802  TPR repeat-containing protein  32.39 
 
 		 522 aa  234  4.0000000000000004e-60  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.292136  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02344  tetratricopeptide repeat domain protein  30.75 
 
 		 607 aa  229  1e-58  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA3086  TPR domain-containing protein  29.93 
 
 		 579 aa  229  2e-58  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.503806  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2139  hypothetical protein  33.73 
 
 		 530 aa  213  1e-53  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.488109  decreased coverage  0.00345429 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1717  TPR repeat-containing von Willebrand factor, type A  33.03 
 
 		 572 aa  212  2e-53  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5137  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  31.53 
 
 		 517 aa  207  7e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.398593  normal  0.644601 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1732  TPR repeat-containing protein  30.07 
 
 		 587 aa  206  9e-52  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.966886  normal  0.26357 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2887  tetratricopeptide TPR_4  31.25 
 
 		 544 aa  205  3e-51  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0337019  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3763  TPR domain protein  33.33 
 
 		 572 aa  204  6e-51  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.519367  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3714  TPR repeat-containing protein  30 
 
 		 572 aa  200  7.999999999999999e-50  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.325605  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3054  TPR repeat-containing protein  31.14 
 
 		 533 aa  200  7.999999999999999e-50  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.350986  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2028  TPR domain-containing protein  29.81 
 
 		 572 aa  198  3e-49  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0853  TPR repeat-containing protein  34.09 
 
 		 680 aa  190  7e-47  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1560  TPR repeat-containing protein  29.2 
 
 		 571 aa  188  3e-46  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.535158 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000305  TPR domain protein in aerotolerance operon  31.85 
 
 		 576 aa  186  1.0000000000000001e-45  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3212  hypothetical protein  31.81 
 
 		 578 aa  184  5.0000000000000004e-45  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.190926 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4531  hypothetical protein  30.28 
 
 		 531 aa  183  7e-45  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.536979  normal  0.0526442 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_18790  tetratricopeptide (TPR) repeat and VWA domain-containing protein  34.73 
 
 		 577 aa  179  2e-43  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.00254687  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1588  TPR repeat-containing protein  30.2 
 
 		 572 aa  173  1e-41  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00107949 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24390  TPR domain-containing protein  34.38 
 
 		 586 aa  171  3e-41  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00557521  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3231  TPR repeat-containing protein  31.46 
 
 		 612 aa  171  6e-41  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.439888  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2066  hypothetical protein  33.26 
 
 		 585 aa  168  4e-40  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2933  TPR repeat-containing protein  32.5 
 
 		 588 aa  166  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3117  hypothetical protein  28.93 
 
 		 503 aa  154  4e-36  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.10336  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3385  von Willebrand factor, type A  28.6 
 
 		 573 aa  152  1e-35  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.465184 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3555  von Willebrand factor, type A  28.39 
 
 		 573 aa  152  1e-35  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2767  hypothetical protein  40.51 
 
 		 310 aa  147  8.000000000000001e-34  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2913  hypothetical protein  40 
 
 		 310 aa  146  1e-33  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0568  von Willebrand factor, type A  28.21 
 
 		 573 aa  145  4e-33  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0657  von Willebrand factor, type A  24.57 
 
 		 595 aa  135  1.9999999999999998e-30  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.676457  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0099  von Willebrand factor, type A  25.83 
 
 		 651 aa  110  9.000000000000001e-23  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1740  hypothetical protein  25.84 
 
 		 564 aa  103  1e-20  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2395  von Willebrand factor type A  32.47 
 
 		 611 aa  102  3e-20  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.850853  normal  0.642372 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1205  hypothetical protein  37.35 
 
 		 304 aa  98.2  4e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0649  von Willebrand factor, type A  22.6 
 
 		 471 aa  91.7  5e-17  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1122  von Willebrand factor type A  28.76 
 
 		 335 aa  88.6  4e-16  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.51147  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1583  batB protein  33.66 
 
 		 339 aa  84.7  0.000000000000006  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1482  von Willebrand factor type A  26.02 
 
 		 344 aa  83.2  0.00000000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.428182  normal  0.250576 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5483  von Willebrand factor type A  25.7 
 
 		 320 aa  78.6  0.0000000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2318  von Willebrand factor type A  26.22 
 
 		 339 aa  77.8  0.0000000000006  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2912  hypothetical protein  41.18 
 
 		 293 aa  77.4  0.0000000000008  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1887  von Willebrand factor, type A  30.61 
 
 		 334 aa  77  0.000000000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.615946  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0243  von Willebrand factor type A  26.89 
 
 		 343 aa  73.2  0.00000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0131225  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1206  TPR repeat-containing protein  30.99 
 
 		 220 aa  73.2  0.00000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0906  von Willebrand factor type A  27.08 
 
 		 345 aa  72  0.00000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.519509  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0523  von Willebrand factor type A  28.67 
 
 		 344 aa  71.2  0.00000000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2455  von Willebrand factor type A  27.04 
 
 		 338 aa  70.1  0.0000000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2438  von Willebrand factor type A  34.38 
 
 		 315 aa  70.1  0.0000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1538  von Willebrand factor type A  24.91 
 
 		 347 aa  69.7  0.0000000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.634535  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0441  von Willebrand factor type A  34.48 
 
 		 339 aa  67.4  0.0000000008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.126065  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1777  von Willebrand factor type A  25.08 
 
 		 754 aa  67.4  0.0000000008  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.582496  normal  0.264323 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0430  hypothetical protein  32.68 
 
 		 336 aa  66.6  0.000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0052  von Willebrand factor type A  33.16 
 
 		 589 aa  67  0.000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.649054  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1481  von Willebrand factor type A  30.22 
 
 		 332 aa  66.2  0.000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.587986  normal  0.160763 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1680  von Willebrand factor type A  31.82 
 
 		 333 aa  65.9  0.000000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.233991  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02145  hypothetical protein  24.26 
 
 		 346 aa  63.9  0.000000009  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0720  von Willebrand factor, type A  25.7 
 
 		 344 aa  63.5  0.00000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.799777  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3846  von Willebrand factor type A  35.63 
 
 		 339 aa  61.6  0.00000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.341342  normal  0.622551 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0460  hypothetical protein  26.15 
 
 		 299 aa  61.6  0.00000005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1812  von Willebrand factor type A  34.58 
 
 		 318 aa  61.6  0.00000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1129  von Willebrand factor, type A  31.64 
 
 		 315 aa  60.1  0.0000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.2871  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6107  von Willebrand factor type A  26.56 
 
 		 359 aa  59.7  0.0000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0173  von Willebrand factor type A domain protein  28.78 
 
 		 333 aa  59.7  0.0000002  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.0526529  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1582  batA protein  37.38 
 
 		 327 aa  58.9  0.0000003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_4012  hypothetical protein  33.33 
 
 		 311 aa  58.9  0.0000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.523385  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0719  von Willebrand factor, type A  27.08 
 
 		 334 aa  58.5  0.0000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.887647  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0826  von Willebrand factor type A  29.5 
 
 		 307 aa  58.2  0.0000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.420191  normal  0.367588 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3026  von Willebrand factor, type A  29.36 
 
 		 316 aa  57.8  0.0000008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.443806 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0866  von Willebrand factor type A  29.5 
 
 		 307 aa  57.4  0.0000008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.258212  normal  0.0493979 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2451  von Willebrand factor, type A  24.64 
 
 		 337 aa  57.4  0.0000009  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2452  von Willebrand factor, type A  29.76 
 
 		 344 aa  56.6  0.000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0792  von Willebrand factor type A  29 
 
 		 307 aa  56.2  0.000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.026316 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0793  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  32.33 
 
 		 312 aa  56.6  0.000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0444795 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>