235 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpha266_2451 on replicon NC_008639
Organism: Chlorobium phaeobacteroides DSM 266



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008639  Cpha266_2451  von Willebrand factor, type A  100 
 
 
337 aa  674    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0243  von Willebrand factor type A  48.82 
 
 
343 aa  309  2.9999999999999997e-83  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0131225  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2291  von Willebrand factor type A  52.17 
 
 
340 aa  288  1e-76  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2318  von Willebrand factor type A  41.09 
 
 
339 aa  233  3e-60  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1887  von Willebrand factor, type A  39.74 
 
 
334 aa  204  2e-51  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.615946  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2085  von Willebrand factor type A  38.24 
 
 
336 aa  169  8e-41  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02145  hypothetical protein  28.39 
 
 
346 aa  151  1e-35  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0906  von Willebrand factor type A  31.63 
 
 
345 aa  147  2.0000000000000003e-34  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.519509  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG1583  batB protein  32.92 
 
 
339 aa  145  1e-33  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1538  von Willebrand factor type A  29.37 
 
 
347 aa  141  9.999999999999999e-33  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.634535  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1482  von Willebrand factor type A  28.19 
 
 
344 aa  134  3e-30  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.428182  normal  0.250576 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0441  von Willebrand factor type A  38.24 
 
 
339 aa  131  1.0000000000000001e-29  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.126065  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2438  von Willebrand factor type A  34.04 
 
 
315 aa  113  4.0000000000000004e-24  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4901  hypothetical protein  29.9 
 
 
330 aa  110  4.0000000000000004e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.908989  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1812  von Willebrand factor type A  38.43 
 
 
318 aa  110  5e-23  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0720  von Willebrand factor, type A  28.33 
 
 
344 aa  108  1e-22  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.799777  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5483  von Willebrand factor type A  26.32 
 
 
320 aa  105  1e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6107  von Willebrand factor type A  32.46 
 
 
359 aa  104  2e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1122  von Willebrand factor type A  24.25 
 
 
335 aa  102  7e-21  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.51147  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2395  von Willebrand factor type A  29.77 
 
 
611 aa  102  1e-20  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.850853  normal  0.642372 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3846  von Willebrand factor type A  32.09 
 
 
339 aa  100  3e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.341342  normal  0.622551 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2319  von Willebrand factor type A  30.89 
 
 
331 aa  99.4  8e-20  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0523  von Willebrand factor type A  33.62 
 
 
344 aa  97.8  3e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2455  von Willebrand factor type A  27.84 
 
 
338 aa  97.4  3e-19  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2086  von Willebrand factor type A  27.68 
 
 
327 aa  97.1  4e-19  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1481  von Willebrand factor type A  28.33 
 
 
332 aa  96.3  7e-19  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.587986  normal  0.160763 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0657  von Willebrand factor, type A  26.25 
 
 
595 aa  92.8  8e-18  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.676457  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0442  von Willebrand factor type A  28.03 
 
 
329 aa  92.4  9e-18  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.570722  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1908  hypothetical protein  27.83 
 
 
319 aa  91.3  2e-17  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.137204 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0430  hypothetical protein  26.87 
 
 
336 aa  90.9  3e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1777  von Willebrand factor type A  29.36 
 
 
754 aa  90.1  5e-17  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.582496  normal  0.264323 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0099  von Willebrand factor, type A  26.4 
 
 
651 aa  90.1  5e-17  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0242  von Willebrand factor type A  30.74 
 
 
336 aa  90.1  5e-17  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0239154  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1582  batA protein  28.05 
 
 
327 aa  85.5  0.000000000000001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1220  von Willebrand factor, type A  26.4 
 
 
337 aa  85.5  0.000000000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.356622  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02150  aerotolerance-related membrane protein  25.23 
 
 
334 aa  83.6  0.000000000000004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1247  von Willebrand factor, type A  33.87 
 
 
319 aa  83.2  0.000000000000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.513072 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2655  BatA-like protein, aerotolerance-related  25.68 
 
 
351 aa  82.4  0.000000000000009  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001268  TPR domain protein in aerotolerance operon  27.34 
 
 
599 aa  82.4  0.00000000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2667  von Willebrand factor type A  28.32 
 
 
320 aa  81.3  0.00000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0137073  normal  0.240647 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1137  von Willebrand factor type A  33.47 
 
 
319 aa  81.3  0.00000000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.178204  hitchhiker  0.0000350269 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4900  von Willebrand factor type A  27.85 
 
 
337 aa  80.9  0.00000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0719  von Willebrand factor, type A  26.5 
 
 
334 aa  79.3  0.00000000000007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.887647  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2452  von Willebrand factor, type A  27.35 
 
 
344 aa  78.6  0.0000000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1107  hypothetical protein  26.54 
 
 
646 aa  77.8  0.0000000000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1743  TPR domain-containing protein  26.72 
 
 
658 aa  76.3  0.0000000000006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1949  TPR repeat-containing protein  27.83 
 
 
612 aa  76.3  0.0000000000007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.931925  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1658  TPR repeat-containing protein  26.69 
 
 
647 aa  75.1  0.000000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.95456  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000306  protein BatA  28.46 
 
 
356 aa  75.5  0.000000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02344  tetratricopeptide repeat domain protein  27.71 
 
 
607 aa  73.2  0.000000000006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0567  von Willebrand factor, type A  30.27 
 
 
335 aa  72.4  0.00000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3556  von Willebrand factor, type A  30.27 
 
 
335 aa  72.4  0.00000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.697589 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2431  TPR repeat-containing protein  28.76 
 
 
693 aa  71.2  0.00000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.0167557 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05143  hypothetical protein  25 
 
 
601 aa  70.1  0.00000000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3386  von Willebrand factor, type A  29.73 
 
 
335 aa  70.1  0.00000000005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.384724 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2080  von Willebrand factor type A  30.5 
 
 
327 aa  69.7  0.00000000006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.829092  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2147  hypothetical protein  28.72 
 
 
321 aa  69.7  0.00000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.130278  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2396  von Willebrand factor type A  27.27 
 
 
377 aa  69.7  0.00000000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.939741  normal  0.854107 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2206  BatA  25.86 
 
 
317 aa  69.7  0.00000000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0553658  normal  0.0945164 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000305  TPR domain protein in aerotolerance operon  29.76 
 
 
576 aa  69.7  0.00000000006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3555  von Willebrand factor, type A  26.78 
 
 
573 aa  69.7  0.00000000008  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2913  hypothetical protein  25.23 
 
 
310 aa  68.6  0.0000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2914  hypothetical protein  23.4 
 
 
344 aa  68.6  0.0000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2768  hypothetical protein  23.4 
 
 
344 aa  68.9  0.0000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1123  von Willebrand factor type A  25.81 
 
 
373 aa  68.6  0.0000000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3385  von Willebrand factor, type A  26.78 
 
 
573 aa  68.2  0.0000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.465184 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2430  von Willebrand factor, type A  27.72 
 
 
339 aa  67.8  0.0000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.0141267 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1680  von Willebrand factor type A  23.2 
 
 
333 aa  67.8  0.0000000003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.233991  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2439  von Willebrand factor type A  27.38 
 
 
331 aa  67.4  0.0000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2767  hypothetical protein  25.23 
 
 
310 aa  67.4  0.0000000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA3085  batB protein, putative  27.57 
 
 
328 aa  67  0.0000000005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0568  von Willebrand factor, type A  25.52 
 
 
573 aa  67  0.0000000005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1525  von Willebrand factor, type A  26.07 
 
 
330 aa  66.6  0.0000000006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5503  von Willebrand factor, type A  32.11 
 
 
315 aa  66.6  0.0000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0866133  normal  0.0446961 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02705  von Willebrand factor, type A  27.43 
 
 
349 aa  66.2  0.0000000008  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4905  hypothetical protein  30.59 
 
 
317 aa  65.5  0.000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.616891  normal  0.194429 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0522  von Willebrand factor type A  25.29 
 
 
346 aa  65.1  0.000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2292  von Willebrand factor type A  27.53 
 
 
325 aa  64.7  0.000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1560  TPR repeat-containing protein  25 
 
 
571 aa  64.7  0.000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.535158 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2604  TPR repeat-containing protein  26.07 
 
 
653 aa  64.7  0.000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0073  von Willebrand factor, type A  24.69 
 
 
349 aa  65.1  0.000000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2066  hypothetical protein  27.03 
 
 
585 aa  64.7  0.000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24390  TPR domain-containing protein  25.97 
 
 
586 aa  64.7  0.000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00557521  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2406  von Willebrand factor type A  29.43 
 
 
325 aa  64.3  0.000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2464  von Willebrand factor, type A  26.26 
 
 
339 aa  63.9  0.000000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1886  von Willebrand factor, type A  28.44 
 
 
329 aa  63.9  0.000000004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1811  von Willebrand factor type A  26.62 
 
 
331 aa  63.9  0.000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2469  von Willebrand factor type A  30.27 
 
 
325 aa  63.5  0.000000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.597694 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3116  von Willebrand factor type A domain protein  25.97 
 
 
328 aa  63.5  0.000000005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0524018  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2455  hypothetical protein  29.88 
 
 
335 aa  63.5  0.000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.16032  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1624  von Willebrand factor, type A  25.48 
 
 
330 aa  63.5  0.000000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000050495 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2172  von Willebrand factor type A domain-containing protein  26.57 
 
 
327 aa  63.5  0.000000005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.0626942 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2500  hypothetical protein  29.88 
 
 
335 aa  63.5  0.000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.672748  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2492  hypothetical protein  29.88 
 
 
335 aa  63.5  0.000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.882923  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2603  von Willebrand factor type A  24.26 
 
 
336 aa  63.2  0.000000006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2765  von Willebrand factor type A  27.07 
 
 
339 aa  63.2  0.000000006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.644793  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0052  von Willebrand factor type A  26.6 
 
 
589 aa  62.8  0.000000007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.649054  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3032  TPR repeat-containing protein  25.41 
 
 
650 aa  62.8  0.000000009  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.198571  normal  0.0885065 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2860  von Willebrand factor type A  26.52 
 
 
339 aa  62.4  0.00000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.140424  normal  0.0110983 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2681  von Willebrand factor, type A  26.09 
 
 
334 aa  62.4  0.00000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>