206 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewmr7_0568 on replicon NC_008322
Organism: Shewanella sp. MR-7



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008321  Shewmr4_3385  von Willebrand factor, type A  97.38 
 
 		 573 aa  1077    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.465184 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0568  von Willebrand factor, type A  100 
 
 		 573 aa  1161    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3555  von Willebrand factor, type A  96.51 
 
 		 573 aa  1066    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000305  TPR domain protein in aerotolerance operon  53.68 
 
 		 576 aa  596  1e-169  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2887  tetratricopeptide TPR_4  31.21 
 
 		 544 aa  241  2.9999999999999997e-62  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0337019  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4531  hypothetical protein  31.91 
 
 		 531 aa  221  1.9999999999999999e-56  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.536979  normal  0.0526442 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2139  hypothetical protein  32.24 
 
 		 530 aa  220  7e-56  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.488109  decreased coverage  0.00345429 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3117  hypothetical protein  29.24 
 
 		 503 aa  213  4.9999999999999996e-54  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.10336  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3802  TPR repeat-containing protein  29.86 
 
 		 522 aa  213  7.999999999999999e-54  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.292136  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3054  TPR repeat-containing protein  28.3 
 
 		 533 aa  201  3.9999999999999996e-50  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.350986  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5137  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  28.27 
 
 		 517 aa  183  1e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.398593  normal  0.644601 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1658  TPR repeat-containing protein  30.25 
 
 		 647 aa  178  2e-43  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.95456  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1743  TPR domain-containing protein  28.43 
 
 		 658 aa  166  1.0000000000000001e-39  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1740  hypothetical protein  27.84 
 
 		 564 aa  159  1e-37  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3094  TPR domain-containing protein  28.36 
 
 		 679 aa  157  5.0000000000000005e-37  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0072  TPR repeat-containing protein  26.98 
 
 		 664 aa  155  2e-36  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2682  TPR repeat-containing protein  28.52 
 
 		 701 aa  155  2.9999999999999998e-36  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02344  tetratricopeptide repeat domain protein  30.5 
 
 		 607 aa  153  7e-36  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2028  TPR domain-containing protein  29.05 
 
 		 572 aa  150  6e-35  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1717  TPR repeat-containing von Willebrand factor, type A  29.77 
 
 		 572 aa  149  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3714  TPR repeat-containing protein  30.22 
 
 		 572 aa  148  3e-34  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.325605  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02706  TPR domain protein  27.45 
 
 		 667 aa  146  1e-33  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_18790  tetratricopeptide (TPR) repeat and VWA domain-containing protein  29.79 
 
 		 577 aa  145  2e-33  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.00254687  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2816  TPR repeat-containing protein  26.03 
 
 		 657 aa  145  2e-33  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1949  TPR repeat-containing protein  29.35 
 
 		 612 aa  145  2e-33  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.931925  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0523  hypothetical protein  25.05 
 
 		 619 aa  143  8e-33  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3763  TPR domain protein  30.17 
 
 		 572 aa  141  3e-32  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.519367  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3163  TPR domain-containing protein  27.7 
 
 		 690 aa  140  4.999999999999999e-32  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.185864  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1560  TPR repeat-containing protein  29.43 
 
 		 571 aa  137  4e-31  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.535158 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1623  TPR repeat-containing protein  27.76 
 
 		 644 aa  137  5e-31  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000210321 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1107  hypothetical protein  28.26 
 
 		 646 aa  136  8e-31  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2766  TPR repeat-containing protein  28.72 
 
 		 690 aa  135  1.9999999999999998e-30  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1455  TPR repeat-containing protein  28.99 
 
 		 690 aa  135  3e-30  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000000112359 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1205  hypothetical protein  35.74 
 
 		 304 aa  133  1.0000000000000001e-29  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2861  TPR repeat-containing protein  28.51 
 
 		 692 aa  132  2.0000000000000002e-29  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0393834 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3231  TPR repeat-containing protein  31.53 
 
 		 612 aa  131  3e-29  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.439888  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2786  TPR repeat-containing protein  28.87 
 
 		 693 aa  130  5.0000000000000004e-29  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1402  TPR repeat-containing protein  28.57 
 
 		 681 aa  130  8.000000000000001e-29  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000103328 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1467  TPR repeat-containing protein  28.57 
 
 		 687 aa  130  8.000000000000001e-29  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.510289  hitchhiker  0.00291188 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2173  TPR domain-containing protein  29.13 
 
 		 701 aa  130  9.000000000000001e-29  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.081888 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1588  TPR repeat-containing protein  28.98 
 
 		 572 aa  129  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00107949 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2465  TPR repeat-containing protein  29.18 
 
 		 663 aa  129  2.0000000000000002e-28  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2933  TPR repeat-containing protein  27.92 
 
 		 588 aa  129  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1592  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  28.09 
 
 		 692 aa  128  3e-28  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000228279 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001268  TPR domain protein in aerotolerance operon  28.19 
 
 		 599 aa  127  4.0000000000000003e-28  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0853  TPR repeat-containing protein  28.89 
 
 		 680 aa  127  5e-28  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2913  hypothetical protein  28.66 
 
 		 310 aa  124  4e-27  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA3086  TPR domain-containing protein  26.3 
 
 		 579 aa  122  9.999999999999999e-27  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.503806  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2767  hypothetical protein  28.35 
 
 		 310 aa  122  9.999999999999999e-27  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3212  hypothetical protein  27.35 
 
 		 578 aa  122  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.190926 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3032  TPR repeat-containing protein  27.88 
 
 		 650 aa  122  1.9999999999999998e-26  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.198571  normal  0.0885065 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05143  hypothetical protein  27.09 
 
 		 601 aa  119  9.999999999999999e-26  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24390  TPR domain-containing protein  26.43 
 
 		 586 aa  114  4.0000000000000004e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00557521  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2066  hypothetical protein  27.26 
 
 		 585 aa  107  6e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2431  TPR repeat-containing protein  29.02 
 
 		 693 aa  105  3e-21  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0167557 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1524  TPR repeat-containing protein  29.31 
 
 		 691 aa  101  4e-20  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2604  TPR repeat-containing protein  28.39 
 
 		 653 aa  92.8  1e-17  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1482  von Willebrand factor type A  31.46 
 
 		 344 aa  85.1  0.000000000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.428182  normal  0.250576 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2085  von Willebrand factor type A  26.54 
 
 		 336 aa  80.9  0.00000000000005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2318  von Willebrand factor type A  27.23 
 
 		 339 aa  78.2  0.0000000000004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3846  von Willebrand factor type A  25.91 
 
 		 339 aa  78.2  0.0000000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.341342  normal  0.622551 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1122  von Willebrand factor type A  32.35 
 
 		 335 aa  78.2  0.0000000000004  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.51147  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1732  TPR repeat-containing protein  26.04 
 
 		 587 aa  77.8  0.0000000000006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.966886  normal  0.26357 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2452  von Willebrand factor, type A  29.74 
 
 		 344 aa  77  0.0000000000008  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4900  von Willebrand factor type A  29.73 
 
 		 337 aa  75.1  0.000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2495  von Willebrand factor type A  27.41 
 
 		 316 aa  75.1  0.000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.142903  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1583  batB protein  33.57 
 
 		 339 aa  73.2  0.00000000001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0243  von Willebrand factor type A  27.04 
 
 		 343 aa  72  0.00000000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0131225  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0906  von Willebrand factor type A  37.93 
 
 		 345 aa  71.6  0.00000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.519509  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000306  protein BatA  25.67 
 
 		 356 aa  71.2  0.00000000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0523  von Willebrand factor type A  30.19 
 
 		 344 aa  71.6  0.00000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2395  von Willebrand factor type A  36.11 
 
 		 611 aa  71.6  0.00000000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.850853  normal  0.642372 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5483  von Willebrand factor type A  23.61 
 
 		 320 aa  70.1  0.0000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1481  von Willebrand factor type A  25.75 
 
 		 332 aa  69.7  0.0000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.587986  normal  0.160763 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1887  von Willebrand factor, type A  29.19 
 
 		 334 aa  69.3  0.0000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.615946  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1206  TPR repeat-containing protein  30.33 
 
 		 220 aa  68.6  0.0000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2455  von Willebrand factor type A  28.85 
 
 		 338 aa  68.2  0.0000000004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2451  von Willebrand factor, type A  25.9 
 
 		 337 aa  67.8  0.0000000005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3026  von Willebrand factor, type A  27.27 
 
 		 316 aa  67.4  0.0000000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.443806 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001269  protein BatA  24.04 
 
 		 334 aa  67.4  0.0000000008  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.687935  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0099  von Willebrand factor, type A  33.78 
 
 		 651 aa  67  0.0000000008  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2147  hypothetical protein  26.45 
 
 		 321 aa  67  0.0000000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.130278  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0442  von Willebrand factor type A  27.12 
 
 		 329 aa  66.6  0.000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.570722  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0441  von Willebrand factor type A  29.08 
 
 		 339 aa  65.9  0.000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.126065  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6107  von Willebrand factor type A  25.44 
 
 		 359 aa  65.1  0.000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2300  hypothetical protein  23.18 
 
 		 320 aa  64.7  0.000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00522588  hitchhiker  0.00113064 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0656  von Willebrand factor, type A  26.01 
 
 		 309 aa  65.1  0.000000004  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0430  hypothetical protein  25.33 
 
 		 336 aa  65.1  0.000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1106  hypothetical protein  25.16 
 
 		 318 aa  64.7  0.000000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1812  von Willebrand factor type A  32.81 
 
 		 318 aa  64.3  0.000000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1777  von Willebrand factor type A  27.43 
 
 		 754 aa  63.9  0.000000007  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.582496  normal  0.264323 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02145  hypothetical protein  25.15 
 
 		 346 aa  63.5  0.000000009  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1247  von Willebrand factor, type A  27.13 
 
 		 319 aa  63.2  0.00000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.513072 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0657  von Willebrand factor, type A  23 
 
 		 595 aa  62.4  0.00000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.676457  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3386  von Willebrand factor, type A  26.69 
 
 		 335 aa  62.8  0.00000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.384724 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1538  von Willebrand factor type A  27.41 
 
 		 347 aa  62.4  0.00000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.634535  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1137  von Willebrand factor type A  26.91 
 
 		 319 aa  62.8  0.00000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.178204  hitchhiker  0.0000350269 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0720  von Willebrand factor, type A  29.73 
 
 		 344 aa  62.4  0.00000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.799777  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2438  von Willebrand factor type A  33.33 
 
 		 315 aa  62  0.00000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0719  von Willebrand factor, type A  25.48 
 
 		 334 aa  62  0.00000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.887647  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>