266 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_3846 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013037  Dfer_3846  von Willebrand factor type A  100 
 
 
339 aa  695    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.341342  normal  0.622551 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6107  von Willebrand factor type A  45.63 
 
 
359 aa  320  1.9999999999999998e-86  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2655  BatA-like protein, aerotolerance-related  35.76 
 
 
351 aa  225  1e-57  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1481  von Willebrand factor type A  40.89 
 
 
332 aa  220  1.9999999999999999e-56  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.587986  normal  0.160763 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1680  von Willebrand factor type A  37.43 
 
 
333 aa  204  1e-51  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.233991  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0719  von Willebrand factor, type A  34.95 
 
 
334 aa  201  9.999999999999999e-51  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.887647  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02150  aerotolerance-related membrane protein  35.08 
 
 
334 aa  201  1.9999999999999998e-50  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1582  batA protein  38.81 
 
 
327 aa  197  2.0000000000000003e-49  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0430  hypothetical protein  38.46 
 
 
336 aa  192  5e-48  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4901  hypothetical protein  37.7 
 
 
330 aa  184  2.0000000000000003e-45  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.908989  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2319  von Willebrand factor type A  39.82 
 
 
331 aa  182  7e-45  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0442  von Willebrand factor type A  39.44 
 
 
329 aa  178  1e-43  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.570722  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0242  von Willebrand factor type A  41.07 
 
 
336 aa  175  8e-43  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0239154  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2086  von Willebrand factor type A  43.05 
 
 
327 aa  170  3e-41  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2452  von Willebrand factor, type A  34.94 
 
 
344 aa  169  9e-41  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1123  von Willebrand factor type A  37.02 
 
 
373 aa  166  6.9999999999999995e-40  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2292  von Willebrand factor type A  40.91 
 
 
325 aa  160  3e-38  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2914  hypothetical protein  34.77 
 
 
344 aa  158  1e-37  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2768  hypothetical protein  38.37 
 
 
344 aa  158  1e-37  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0796  von Willebrand factor type A  31.94 
 
 
328 aa  152  1e-35  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000000000131986  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1778  von Willebrand factor type A  35.11 
 
 
328 aa  149  5e-35  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.357635  normal  0.258709 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2396  von Willebrand factor type A  37.76 
 
 
377 aa  149  5e-35  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.939741  normal  0.854107 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1482  von Willebrand factor type A  33.33 
 
 
344 aa  148  1.0000000000000001e-34  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.428182  normal  0.250576 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1593  von Willebrand factor type A  35.9 
 
 
340 aa  146  5e-34  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000650656 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1561  von Willebrand factor type A  33.77 
 
 
358 aa  145  7.0000000000000006e-34  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.604958 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2785  von Willebrand factor type A  36.06 
 
 
340 aa  145  1e-33  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3093  von Willebrand factor type A domain-containing protein  34.67 
 
 
338 aa  144  2e-33  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2765  von Willebrand factor type A  36.06 
 
 
339 aa  144  2e-33  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.644793  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1468  von Willebrand factor, type A  34.06 
 
 
338 aa  144  3e-33  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00210714 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24400  von Willebrand factor type A domain-containing protein  36.02 
 
 
340 aa  143  3e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0690216  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3211  von Willebrand factor, type A  32.09 
 
 
359 aa  143  4e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.161906 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2860  von Willebrand factor type A  35.69 
 
 
339 aa  143  4e-33  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.140424  normal  0.0110983 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1886  von Willebrand factor, type A  35.4 
 
 
329 aa  143  5e-33  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3713  von Willebrand factor, type A  33.44 
 
 
358 aa  142  7e-33  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.512513  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1811  von Willebrand factor type A  33.94 
 
 
331 aa  142  9.999999999999999e-33  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1456  von Willebrand factor, type A  35.69 
 
 
338 aa  142  9.999999999999999e-33  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000144994 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2029  von Willebrand factor type A domain-containing protein  33.11 
 
 
358 aa  141  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.34439  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1403  von Willebrand factor, type A  33.65 
 
 
338 aa  141  1.9999999999999998e-32  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.520734  hitchhiker  0.0000232326 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0522  von Willebrand factor type A  34.06 
 
 
346 aa  139  7e-32  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1948  von Willebrand factor, type A  37.7 
 
 
339 aa  138  1e-31  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA3085  batB protein, putative  33.44 
 
 
328 aa  138  2e-31  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3762  von Willebrand factor type A domain protein  32.35 
 
 
352 aa  138  2e-31  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2464  von Willebrand factor, type A  35.55 
 
 
339 aa  137  2e-31  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2439  von Willebrand factor type A  36.82 
 
 
331 aa  137  4e-31  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02705  von Willebrand factor, type A  33.8 
 
 
349 aa  135  7.000000000000001e-31  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_18800  von Willebrand factor, type A (VWA) domain protein  32.79 
 
 
335 aa  135  9.999999999999999e-31  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.00117552  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2603  von Willebrand factor type A  36.05 
 
 
336 aa  135  9.999999999999999e-31  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5138  von Willebrand factor type A  32.26 
 
 
329 aa  134  1.9999999999999998e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.585465 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2681  von Willebrand factor, type A  36.05 
 
 
334 aa  134  3e-30  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2932  von Willebrand factor, type A  35.66 
 
 
334 aa  133  3.9999999999999996e-30  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.922939  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02345  von Willebrand factor type A domain protein  33.23 
 
 
335 aa  132  6e-30  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1106  hypothetical protein  31.17 
 
 
318 aa  132  6e-30  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1589  von Willebrand factor type A  33.78 
 
 
358 aa  132  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.327037  hitchhiker  0.00013363 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1525  von Willebrand factor, type A  36.21 
 
 
330 aa  132  1.0000000000000001e-29  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0524  hypothetical protein  30.3 
 
 
320 aa  131  2.0000000000000002e-29  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3232  von Willebrand factor type A  35.39 
 
 
334 aa  131  2.0000000000000002e-29  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.34963  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2067  hypothetical protein  37.23 
 
 
337 aa  131  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1718  von Willebrand factor, type A  31.05 
 
 
352 aa  130  3e-29  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.060135  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1659  von Willebrand factor, type A  34.65 
 
 
343 aa  130  3e-29  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.863974  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0852  von Willebrand factor type A  34.68 
 
 
345 aa  130  3e-29  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.591496  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG1583  batB protein  34.23 
 
 
339 aa  128  2.0000000000000002e-28  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3055  von Willebrand factor type A  36.48 
 
 
324 aa  125  8.000000000000001e-28  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1733  von Willebrand factor type A  30.77 
 
 
342 aa  125  1e-27  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.818001  normal  0.561199 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0073  von Willebrand factor, type A  29.45 
 
 
349 aa  124  2e-27  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02145  hypothetical protein  28.06 
 
 
346 aa  123  5e-27  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1744  BatB protein, putative  32.93 
 
 
341 aa  122  7e-27  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3556  von Willebrand factor, type A  28.27 
 
 
335 aa  122  8e-27  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.697589 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1624  von Willebrand factor, type A  33.71 
 
 
330 aa  122  9e-27  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000050495 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3386  von Willebrand factor, type A  27.96 
 
 
335 aa  121  9.999999999999999e-27  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.384724 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05144  hypothetical protein  31.91 
 
 
334 aa  121  1.9999999999999998e-26  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0567  von Willebrand factor, type A  27.96 
 
 
335 aa  121  1.9999999999999998e-26  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2172  von Willebrand factor type A domain-containing protein  33.77 
 
 
327 aa  121  1.9999999999999998e-26  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.0626942 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2430  von Willebrand factor, type A  35.06 
 
 
339 aa  120  3e-26  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.0141267 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001269  protein BatA  28.15 
 
 
334 aa  120  3e-26  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.687935  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2888  von Willebrand factor, type A  29.12 
 
 
340 aa  120  3.9999999999999996e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3801  von Willebrand factor type A  28.41 
 
 
334 aa  120  3.9999999999999996e-26  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.142641  normal  0.822741 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0906  von Willebrand factor type A  30.85 
 
 
345 aa  119  6e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.519509  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4532  hypothetical protein  28.74 
 
 
334 aa  119  6e-26  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.143586 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3031  von Willebrand factor type A  32.62 
 
 
330 aa  119  6e-26  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.239159  normal  0.0768499 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0173  von Willebrand factor type A domain protein  27.13 
 
 
333 aa  118  1.9999999999999998e-25  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.0526529  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2815  von Willebrand factor, type A  33.62 
 
 
327 aa  117  1.9999999999999998e-25  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2469  von Willebrand factor type A  34.3 
 
 
325 aa  117  3.9999999999999997e-25  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.597694 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3116  von Willebrand factor type A domain protein  31.6 
 
 
328 aa  115  1.0000000000000001e-24  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0524018  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0459  von Willebrand factor type A  34.13 
 
 
320 aa  115  1.0000000000000001e-24  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2991  von Willebrand factor type A domain-containing protein  27.15 
 
 
364 aa  114  2.0000000000000002e-24  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.603006  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1812  von Willebrand factor type A  41.18 
 
 
318 aa  114  2.0000000000000002e-24  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1250  batA protein, putative  29.67 
 
 
332 aa  112  1.0000000000000001e-23  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.367863  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2206  BatA  29.7 
 
 
317 aa  112  1.0000000000000001e-23  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0553658  normal  0.0945164 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2138  hypothetical protein  31.69 
 
 
337 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.401823  decreased coverage  0.00313955 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000306  protein BatA  25.67 
 
 
356 aa  110  3e-23  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1007  von Willebrand factor type A  33.93 
 
 
324 aa  110  3e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0193109  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1739  von Willebrand factor type A  31.02 
 
 
328 aa  110  5e-23  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2438  von Willebrand factor type A  41.54 
 
 
315 aa  109  6e-23  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1386  von Willebrand factor type A  33.63 
 
 
329 aa  108  2e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.796868  normal  0.0818214 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0648  von Willebrand factor, type A  29.88 
 
 
307 aa  107  3e-22  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4305  von Willebrand factor type A  33.47 
 
 
345 aa  103  3e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0935346 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1538  von Willebrand factor type A  33.74 
 
 
347 aa  103  5e-21  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.634535  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1204  von Willebrand factor type A  28.7 
 
 
342 aa  103  5e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1128  von Willebrand factor, type A  32.59 
 
 
282 aa  102  7e-21  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0959166  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5483  von Willebrand factor type A  29.08 
 
 
320 aa  102  1e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>