213 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TDE1250 on replicon NC_002967
Organism: Treponema denticola ATCC 35405



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002967  TDE1250  batA protein, putative  100 
 
 
332 aa  667    Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.367863  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0173  von Willebrand factor type A domain protein  27.54 
 
 
333 aa  141  1.9999999999999998e-32  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.0526529  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1680  von Willebrand factor type A  36.82 
 
 
333 aa  133  3.9999999999999996e-30  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.233991  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0442  von Willebrand factor type A  32.08 
 
 
329 aa  128  2.0000000000000002e-28  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.570722  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2914  hypothetical protein  29.03 
 
 
344 aa  126  4.0000000000000003e-28  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1481  von Willebrand factor type A  34.35 
 
 
332 aa  127  4.0000000000000003e-28  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.587986  normal  0.160763 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2768  hypothetical protein  29.33 
 
 
344 aa  125  7e-28  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0796  von Willebrand factor type A  31.82 
 
 
328 aa  125  7e-28  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000000000131986  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2396  von Willebrand factor type A  31.18 
 
 
377 aa  125  1e-27  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.939741  normal  0.854107 
 
 
-
 
NC_002950  PG1582  batA protein  33.33 
 
 
327 aa  124  2e-27  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0524  hypothetical protein  27.73 
 
 
320 aa  121  1.9999999999999998e-26  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0719  von Willebrand factor, type A  31.74 
 
 
334 aa  121  1.9999999999999998e-26  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.887647  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001269  protein BatA  30.16 
 
 
334 aa  119  6e-26  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.687935  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05144  hypothetical protein  28.9 
 
 
334 aa  119  7e-26  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02150  aerotolerance-related membrane protein  31.71 
 
 
334 aa  119  9.999999999999999e-26  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1525  von Willebrand factor, type A  28.89 
 
 
330 aa  117  3e-25  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2681  von Willebrand factor, type A  30.49 
 
 
334 aa  117  3e-25  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0430  hypothetical protein  38.5 
 
 
336 aa  117  3e-25  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0242  von Willebrand factor type A  28.99 
 
 
336 aa  117  3.9999999999999997e-25  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0239154  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1624  von Willebrand factor, type A  29.08 
 
 
330 aa  115  8.999999999999998e-25  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000050495 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3093  von Willebrand factor type A domain-containing protein  27.27 
 
 
338 aa  114  2.0000000000000002e-24  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1106  hypothetical protein  27.61 
 
 
318 aa  114  2.0000000000000002e-24  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1593  von Willebrand factor type A  26.89 
 
 
340 aa  112  7.000000000000001e-24  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000650656 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3031  von Willebrand factor type A  28.16 
 
 
330 aa  112  8.000000000000001e-24  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.239159  normal  0.0768499 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2765  von Willebrand factor type A  26.52 
 
 
339 aa  112  8.000000000000001e-24  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.644793  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1403  von Willebrand factor, type A  26.12 
 
 
338 aa  112  9e-24  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.520734  hitchhiker  0.0000232326 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1123  von Willebrand factor type A  33.09 
 
 
373 aa  111  1.0000000000000001e-23  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2860  von Willebrand factor type A  26.52 
 
 
339 aa  112  1.0000000000000001e-23  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.140424  normal  0.0110983 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4901  hypothetical protein  30.67 
 
 
330 aa  111  1.0000000000000001e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.908989  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1468  von Willebrand factor, type A  26.12 
 
 
338 aa  111  2.0000000000000002e-23  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00210714 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1456  von Willebrand factor, type A  26.12 
 
 
338 aa  111  2.0000000000000002e-23  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000144994 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2785  von Willebrand factor type A  26.52 
 
 
340 aa  111  2.0000000000000002e-23  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3211  von Willebrand factor, type A  28.19 
 
 
359 aa  110  3e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.161906 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2430  von Willebrand factor, type A  28.57 
 
 
339 aa  110  3e-23  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.0141267 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2464  von Willebrand factor, type A  26.52 
 
 
339 aa  110  5e-23  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2319  von Willebrand factor type A  28.47 
 
 
331 aa  109  8.000000000000001e-23  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2603  von Willebrand factor type A  26.97 
 
 
336 aa  107  3e-22  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0522  von Willebrand factor type A  30.87 
 
 
346 aa  106  7e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1744  BatB protein, putative  28.46 
 
 
341 aa  106  7e-22  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2086  von Willebrand factor type A  26.64 
 
 
327 aa  105  1e-21  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2172  von Willebrand factor type A domain-containing protein  27.69 
 
 
327 aa  104  2e-21  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.0626942 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3846  von Willebrand factor type A  30.42 
 
 
339 aa  103  3e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.341342  normal  0.622551 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0852  von Willebrand factor type A  27.96 
 
 
345 aa  103  3e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.591496  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1733  von Willebrand factor type A  28.52 
 
 
342 aa  103  5e-21  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.818001  normal  0.561199 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2655  BatA-like protein, aerotolerance-related  31.02 
 
 
351 aa  102  7e-21  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA3085  batB protein, putative  27.03 
 
 
328 aa  102  1e-20  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0073  von Willebrand factor, type A  28.51 
 
 
349 aa  102  1e-20  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3801  von Willebrand factor type A  25.43 
 
 
334 aa  102  1e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.142641  normal  0.822741 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6107  von Willebrand factor type A  29.87 
 
 
359 aa  100  3e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2469  von Willebrand factor type A  28.06 
 
 
325 aa  100  3e-20  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.597694 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2439  von Willebrand factor type A  29.71 
 
 
331 aa  100  3e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2932  von Willebrand factor, type A  29.29 
 
 
334 aa  100  3e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.922939  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2452  von Willebrand factor, type A  28.03 
 
 
344 aa  99.4  7e-20  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5138  von Willebrand factor type A  25.3 
 
 
329 aa  99  1e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.585465 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2292  von Willebrand factor type A  26.77 
 
 
325 aa  97.4  3e-19  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1561  von Willebrand factor type A  27.21 
 
 
358 aa  97.1  4e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.604958 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24400  von Willebrand factor type A domain-containing protein  29.88 
 
 
340 aa  96.3  7e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0690216  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3762  von Willebrand factor type A domain protein  29.65 
 
 
352 aa  95.9  8e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3556  von Willebrand factor, type A  29.55 
 
 
335 aa  95.9  8e-19  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.697589 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2815  von Willebrand factor, type A  30.35 
 
 
327 aa  95.1  1e-18  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2067  hypothetical protein  29.86 
 
 
337 aa  95.1  1e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1811  von Willebrand factor type A  28.03 
 
 
331 aa  94.4  2e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3386  von Willebrand factor, type A  29.15 
 
 
335 aa  94.4  3e-18  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.384724 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1589  von Willebrand factor type A  30.19 
 
 
358 aa  93.6  4e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.327037  hitchhiker  0.00013363 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2029  von Willebrand factor type A domain-containing protein  26.84 
 
 
358 aa  93.2  5e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.34439  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1718  von Willebrand factor, type A  29.2 
 
 
352 aa  93.2  5e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.060135  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1948  von Willebrand factor, type A  27.53 
 
 
339 aa  93.6  5e-18  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3055  von Willebrand factor type A  26.64 
 
 
324 aa  93.2  6e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0567  von Willebrand factor, type A  29.15 
 
 
335 aa  93.2  6e-18  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0648  von Willebrand factor, type A  29.87 
 
 
307 aa  92.4  9e-18  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3713  von Willebrand factor, type A  26.84 
 
 
358 aa  92.4  9e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.512513  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2888  von Willebrand factor, type A  22.3 
 
 
340 aa  92  1e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2138  hypothetical protein  30.99 
 
 
337 aa  91.7  1e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.401823  decreased coverage  0.00313955 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_18800  von Willebrand factor, type A (VWA) domain protein  27.98 
 
 
335 aa  92.4  1e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.00117552  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02705  von Willebrand factor, type A  25.75 
 
 
349 aa  90.9  3e-17  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000306  protein BatA  26.85 
 
 
356 aa  89.7  6e-17  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4532  hypothetical protein  23.73 
 
 
334 aa  89.7  7e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.143586 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0616  von Willebrand factor type A  32.06 
 
 
308 aa  88.6  1e-16  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.544287  normal  0.600223 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1659  von Willebrand factor, type A  25.2 
 
 
343 aa  86.7  5e-16  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.863974  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0865  von Willebrand factor type A  26.53 
 
 
339 aa  85.1  0.000000000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0877751  normal  0.04584 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0825  von Willebrand factor type A  26.53 
 
 
339 aa  85.5  0.000000000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.431264  normal  0.379491 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1482  von Willebrand factor type A  28.09 
 
 
344 aa  85.5  0.000000000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.428182  normal  0.250576 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1778  von Willebrand factor type A  30.74 
 
 
328 aa  84  0.000000000000003  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.357635  normal  0.258709 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3038  von Willebrand factor type A  28 
 
 
319 aa  84  0.000000000000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2634  von Willebrand factor type A  29.67 
 
 
313 aa  83.6  0.000000000000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1886  von Willebrand factor, type A  24.44 
 
 
329 aa  81.6  0.00000000000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3232  von Willebrand factor type A  27.67 
 
 
334 aa  82.4  0.00000000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.34963  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02345  von Willebrand factor type A domain protein  27.14 
 
 
335 aa  81.6  0.00000000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1007  von Willebrand factor type A  29.89 
 
 
324 aa  80.5  0.00000000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0193109  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0243  von Willebrand factor type A  26.77 
 
 
343 aa  80.9  0.00000000000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0131225  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0791  von Willebrand factor type A  30.27 
 
 
339 aa  80.9  0.00000000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.719983  normal  0.0260765 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1739  von Willebrand factor type A  24.59 
 
 
328 aa  80.1  0.00000000000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0459  von Willebrand factor type A  24.37 
 
 
320 aa  77.8  0.0000000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1137  von Willebrand factor type A  30.95 
 
 
319 aa  77.8  0.0000000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.178204  hitchhiker  0.0000350269 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4305  von Willebrand factor type A  29.47 
 
 
345 aa  77.4  0.0000000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0935346 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3116  von Willebrand factor type A domain protein  26.56 
 
 
328 aa  77.8  0.0000000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0524018  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02145  hypothetical protein  24.32 
 
 
346 aa  77  0.0000000000004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1583  batB protein  27.27 
 
 
339 aa  76.6  0.0000000000005  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1247  von Willebrand factor, type A  31.43 
 
 
319 aa  76.6  0.0000000000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.513072 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1952  von Willebrand factor type A  29.61 
 
 
315 aa  76.3  0.0000000000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.159987  hitchhiker  0.00398429 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>