227 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sden_1525 on replicon NC_007954
Organism: Shewanella denitrificans OS217



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007954  Sden_1525  von Willebrand factor, type A  100 
 
 		 330 aa  666    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2681  von Willebrand factor, type A  80.66 
 
 		 334 aa  468  1.0000000000000001e-131  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3093  von Willebrand factor type A domain-containing protein  75.77 
 
 		 338 aa  466  9.999999999999999e-131  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1403  von Willebrand factor, type A  72.33 
 
 		 338 aa  466  9.999999999999999e-131  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.520734  hitchhiker  0.0000232326 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1468  von Willebrand factor, type A  72.33 
 
 		 338 aa  465  9.999999999999999e-131  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00210714 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1456  von Willebrand factor, type A  72.33 
 
 		 338 aa  466  9.999999999999999e-131  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000144994 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1593  von Willebrand factor type A  74.4 
 
 		 340 aa  461  1e-129  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000650656 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2464  von Willebrand factor, type A  74.74 
 
 		 339 aa  463  1e-129  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2765  von Willebrand factor type A  73.72 
 
 		 339 aa  458  9.999999999999999e-129  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.644793  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2860  von Willebrand factor type A  74.4 
 
 		 339 aa  460  9.999999999999999e-129  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.140424  normal  0.0110983 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2785  von Willebrand factor type A  73.72 
 
 		 340 aa  458  9.999999999999999e-129  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2603  von Willebrand factor type A  68.55 
 
 		 336 aa  443  1e-123  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1624  von Willebrand factor, type A  71.28 
 
 		 330 aa  434  1e-120  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000050495 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3031  von Willebrand factor type A  69.9 
 
 		 330 aa  428  1e-119  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.239159  normal  0.0768499 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2172  von Willebrand factor type A domain-containing protein  69.51 
 
 		 327 aa  419  1e-116  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.0626942 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2430  von Willebrand factor, type A  70.92 
 
 		 339 aa  420  1e-116  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0141267 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02705  von Willebrand factor, type A  50 
 
 		 349 aa  318  7.999999999999999e-86  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1659  von Willebrand factor, type A  51.14 
 
 		 343 aa  318  9e-86  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.863974  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA3085  batB protein, putative  49.35 
 
 		 328 aa  294  1e-78  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001269  protein BatA  48.17 
 
 		 334 aa  290  2e-77  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.687935  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1106  hypothetical protein  47.92 
 
 		 318 aa  283  3.0000000000000004e-75  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3211  von Willebrand factor, type A  44.48 
 
 		 359 aa  278  1e-73  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.161906 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0524  hypothetical protein  44.55 
 
 		 320 aa  275  7e-73  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2815  von Willebrand factor, type A  53.53 
 
 		 327 aa  271  1e-71  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0852  von Willebrand factor type A  46.86 
 
 		 345 aa  271  1e-71  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.591496  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05144  hypothetical protein  51.37 
 
 		 334 aa  270  2e-71  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2029  von Willebrand factor type A domain-containing protein  46.82 
 
 		 358 aa  268  7e-71  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.34439  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3713  von Willebrand factor, type A  46.82 
 
 		 358 aa  268  7e-71  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.512513  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1561  von Willebrand factor type A  46.82 
 
 		 358 aa  268  1e-70  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.604958 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1733  von Willebrand factor type A  43.47 
 
 		 342 aa  265  1e-69  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.818001  normal  0.561199 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24400  von Willebrand factor type A domain-containing protein  46.69 
 
 		 340 aa  264  2e-69  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0690216  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1744  BatB protein, putative  47.62 
 
 		 341 aa  257  2e-67  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1948  von Willebrand factor, type A  50.21 
 
 		 339 aa  255  7e-67  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_18800  von Willebrand factor, type A (VWA) domain protein  45.13 
 
 		 335 aa  251  8.000000000000001e-66  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.00117552  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1589  von Willebrand factor type A  47.16 
 
 		 358 aa  248  7e-65  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.327037  hitchhiker  0.00013363 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3762  von Willebrand factor type A domain protein  43.18 
 
 		 352 aa  246  3e-64  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1718  von Willebrand factor, type A  42.9 
 
 		 352 aa  246  3e-64  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.060135  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2932  von Willebrand factor, type A  51.02 
 
 		 334 aa  243  3e-63  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.922939  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02345  von Willebrand factor type A domain protein  43.31 
 
 		 335 aa  240  2e-62  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2067  hypothetical protein  45.45 
 
 		 337 aa  237  3e-61  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2768  hypothetical protein  39.32 
 
 		 344 aa  234  1.0000000000000001e-60  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2914  hypothetical protein  39.32 
 
 		 344 aa  232  5e-60  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0073  von Willebrand factor, type A  38.86 
 
 		 349 aa  228  1e-58  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3232  von Willebrand factor type A  47.74 
 
 		 334 aa  223  3e-57  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.34963  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2991  von Willebrand factor type A domain-containing protein  34.76 
 
 		 364 aa  206  4e-52  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.603006  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3116  von Willebrand factor type A domain protein  40 
 
 		 328 aa  196  3e-49  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0524018  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2888  von Willebrand factor, type A  40.68 
 
 		 340 aa  196  4.0000000000000005e-49  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3801  von Willebrand factor type A  40 
 
 		 334 aa  192  9e-48  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.142641  normal  0.822741 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5138  von Willebrand factor type A  37.88 
 
 		 329 aa  189  5e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.585465 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1739  von Willebrand factor type A  39.2 
 
 		 328 aa  189  5.999999999999999e-47  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3055  von Willebrand factor type A  36.66 
 
 		 324 aa  186  6e-46  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0567  von Willebrand factor, type A  34.22 
 
 		 335 aa  182  5.0000000000000004e-45  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4532  hypothetical protein  37.64 
 
 		 334 aa  182  6e-45  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.143586 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3556  von Willebrand factor, type A  33.63 
 
 		 335 aa  181  1e-44  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.697589 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3386  von Willebrand factor, type A  33.63 
 
 		 335 aa  180  2.9999999999999997e-44  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.384724 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1007  von Willebrand factor type A  36.02 
 
 		 324 aa  176  3e-43  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0193109  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2469  von Willebrand factor type A  38.65 
 
 		 325 aa  175  9.999999999999999e-43  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.597694 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2138  hypothetical protein  39.69 
 
 		 337 aa  175  9.999999999999999e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.401823  decreased coverage  0.00313955 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0459  von Willebrand factor type A  33.23 
 
 		 320 aa  174  1.9999999999999998e-42  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0865  von Willebrand factor type A  35.02 
 
 		 339 aa  171  1e-41  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0877751  normal  0.04584 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0825  von Willebrand factor type A  34.31 
 
 		 339 aa  171  2e-41  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.431264  normal  0.379491 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0791  von Willebrand factor type A  33.12 
 
 		 339 aa  169  4e-41  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.719983  normal  0.0260765 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000306  protein BatA  32.84 
 
 		 356 aa  168  1e-40  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1204  von Willebrand factor type A  31.58 
 
 		 342 aa  167  2.9999999999999998e-40  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2396  von Willebrand factor type A  36.22 
 
 		 377 aa  166  6.9999999999999995e-40  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.939741  normal  0.854107 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1481  von Willebrand factor type A  34.98 
 
 		 332 aa  163  4.0000000000000004e-39  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.587986  normal  0.160763 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1386  von Willebrand factor type A  34.98 
 
 		 329 aa  163  4.0000000000000004e-39  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.796868  normal  0.0818214 
 
 
-
 
NC_002950  PG1582  batA protein  38.89 
 
 		 327 aa  161  1e-38  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4305  von Willebrand factor type A  34.58 
 
 		 345 aa  160  3e-38  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0935346 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_4011  von Willebrand factor, type A  33.56 
 
 		 328 aa  155  9e-37  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.204351  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02150  aerotolerance-related membrane protein  30.86 
 
 		 334 aa  153  4e-36  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3278  von Willebrand factor domain-containing protein  33.22 
 
 		 328 aa  152  5.9999999999999996e-36  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.173273  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1128  von Willebrand factor, type A  34.72 
 
 		 282 aa  152  8.999999999999999e-36  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0959166  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0442  von Willebrand factor type A  35.29 
 
 		 329 aa  151  2e-35  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.570722  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1680  von Willebrand factor type A  33.33 
 
 		 333 aa  150  4e-35  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.233991  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0719  von Willebrand factor, type A  30.93 
 
 		 334 aa  145  1e-33  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.887647  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1123  von Willebrand factor type A  34.72 
 
 		 373 aa  143  5e-33  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0648  von Willebrand factor, type A  32.18 
 
 		 307 aa  142  6e-33  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0430  hypothetical protein  33.07 
 
 		 336 aa  138  1e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0242  von Willebrand factor type A  38.36 
 
 		 336 aa  137  4e-31  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0239154  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0796  von Willebrand factor type A  31.63 
 
 		 328 aa  134  1.9999999999999998e-30  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000000000131986  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0522  von Willebrand factor type A  35.47 
 
 		 346 aa  131  1.0000000000000001e-29  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4901  hypothetical protein  31.77 
 
 		 330 aa  129  6e-29  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.908989  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0051  von Willebrand factor type A  37.96 
 
 		 325 aa  128  1.0000000000000001e-28  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.901325  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2292  von Willebrand factor type A  34.2 
 
 		 325 aa  128  2.0000000000000002e-28  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3846  von Willebrand factor type A  36 
 
 		 339 aa  127  3e-28  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.341342  normal  0.622551 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6107  von Willebrand factor type A  34.03 
 
 		 359 aa  127  4.0000000000000003e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1811  von Willebrand factor type A  35 
 
 		 331 aa  126  7e-28  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2319  von Willebrand factor type A  34.12 
 
 		 331 aa  122  8e-27  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2086  von Willebrand factor type A  33.85 
 
 		 327 aa  121  1.9999999999999998e-26  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2439  von Willebrand factor type A  35.27 
 
 		 331 aa  120  3.9999999999999996e-26  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0656  von Willebrand factor, type A  27 
 
 		 309 aa  119  9e-26  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1250  batA protein, putative  28.89 
 
 		 332 aa  117  1.9999999999999998e-25  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.367863  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0098  von Willebrand factor, type A  33.19 
 
 		 363 aa  117  1.9999999999999998e-25  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1778  von Willebrand factor type A  33.2 
 
 		 328 aa  116  6.9999999999999995e-25  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.357635  normal  0.258709 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2655  BatA-like protein, aerotolerance-related  28.14 
 
 		 351 aa  115  1.0000000000000001e-24  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1583  batB protein  32.73 
 
 		 339 aa  112  6e-24  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2452  von Willebrand factor, type A  32.22 
 
 		 344 aa  110  3e-23  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1886  von Willebrand factor, type A  31.79 
 
 		 329 aa  106  7e-22  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1482  von Willebrand factor type A  28.91 
 
 		 344 aa  100  4e-20  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.428182  normal  0.250576 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>