241 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_3801 on replicon NC_009620
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009620  Smed_3801  von Willebrand factor type A  100 
 
 		 334 aa  677    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.142641  normal  0.822741 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2888  von Willebrand factor, type A  63.07 
 
 		 340 aa  407  1.0000000000000001e-112  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5138  von Willebrand factor type A  66.79 
 
 		 329 aa  384  1e-105  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.585465 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4532  hypothetical protein  58.9 
 
 		 334 aa  378  1e-104  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.143586 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2138  hypothetical protein  50 
 
 		 337 aa  305  8.000000000000001e-82  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.401823  decreased coverage  0.00313955 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3055  von Willebrand factor type A  46.05 
 
 		 324 aa  271  1e-71  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2991  von Willebrand factor type A domain-containing protein  39.04 
 
 		 364 aa  264  2e-69  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.603006  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3116  von Willebrand factor type A domain protein  44.29 
 
 		 328 aa  258  8e-68  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0524018  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1204  von Willebrand factor type A  46.69 
 
 		 342 aa  244  9.999999999999999e-64  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0567  von Willebrand factor, type A  38.61 
 
 		 335 aa  238  1e-61  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3556  von Willebrand factor, type A  37.78 
 
 		 335 aa  233  3e-60  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.697589 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3386  von Willebrand factor, type A  38.1 
 
 		 335 aa  233  5e-60  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.384724 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000306  protein BatA  37.24 
 
 		 356 aa  227  2e-58  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA3085  batB protein, putative  40.57 
 
 		 328 aa  212  5.999999999999999e-54  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1106  hypothetical protein  37.38 
 
 		 318 aa  209  5e-53  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0852  von Willebrand factor type A  39.2 
 
 		 345 aa  207  2e-52  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.591496  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1739  von Willebrand factor type A  38.41 
 
 		 328 aa  206  3e-52  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0524  hypothetical protein  36.83 
 
 		 320 aa  206  6e-52  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02345  von Willebrand factor type A domain protein  38.44 
 
 		 335 aa  205  1e-51  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001269  protein BatA  38.39 
 
 		 334 aa  201  9.999999999999999e-51  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.687935  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02705  von Willebrand factor, type A  36.05 
 
 		 349 aa  196  3e-49  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05144  hypothetical protein  40.08 
 
 		 334 aa  197  3e-49  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1659  von Willebrand factor, type A  36.1 
 
 		 343 aa  196  6e-49  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.863974  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1744  BatB protein, putative  37.12 
 
 		 341 aa  194  2e-48  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2914  hypothetical protein  35.74 
 
 		 344 aa  192  7e-48  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1525  von Willebrand factor, type A  40 
 
 		 330 aa  192  8e-48  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2768  hypothetical protein  35.74 
 
 		 344 aa  191  1e-47  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3093  von Willebrand factor type A domain-containing protein  38.82 
 
 		 338 aa  184  2.0000000000000003e-45  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2785  von Willebrand factor type A  38.43 
 
 		 340 aa  184  2.0000000000000003e-45  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2860  von Willebrand factor type A  38.43 
 
 		 339 aa  184  2.0000000000000003e-45  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.140424  normal  0.0110983 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2464  von Willebrand factor, type A  38.43 
 
 		 339 aa  184  2.0000000000000003e-45  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2765  von Willebrand factor type A  38.04 
 
 		 339 aa  183  4.0000000000000006e-45  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.644793  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1403  von Willebrand factor, type A  38.11 
 
 		 338 aa  182  5.0000000000000004e-45  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.520734  hitchhiker  0.0000232326 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3031  von Willebrand factor type A  37.94 
 
 		 330 aa  182  5.0000000000000004e-45  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.239159  normal  0.0768499 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2603  von Willebrand factor type A  37.7 
 
 		 336 aa  182  1e-44  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1593  von Willebrand factor type A  38.04 
 
 		 340 aa  181  1e-44  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000650656 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1468  von Willebrand factor, type A  38.1 
 
 		 338 aa  181  1e-44  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00210714 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1456  von Willebrand factor, type A  33.77 
 
 		 338 aa  181  1e-44  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000144994 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2172  von Willebrand factor type A domain-containing protein  39.43 
 
 		 327 aa  178  1e-43  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.0626942 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3211  von Willebrand factor, type A  35.03 
 
 		 359 aa  176  4e-43  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.161906 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1948  von Willebrand factor, type A  41.94 
 
 		 339 aa  176  4e-43  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1624  von Willebrand factor, type A  35.27 
 
 		 330 aa  175  9.999999999999999e-43  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000050495 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2681  von Willebrand factor, type A  38.06 
 
 		 334 aa  173  2.9999999999999996e-42  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24400  von Willebrand factor type A domain-containing protein  35.71 
 
 		 340 aa  173  2.9999999999999996e-42  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0690216  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3232  von Willebrand factor type A  37.67 
 
 		 334 aa  173  3.9999999999999995e-42  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.34963  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1561  von Willebrand factor type A  36.88 
 
 		 358 aa  173  3.9999999999999995e-42  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.604958 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3713  von Willebrand factor, type A  36.54 
 
 		 358 aa  172  7.999999999999999e-42  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.512513  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2029  von Willebrand factor type A domain-containing protein  36.54 
 
 		 358 aa  172  9e-42  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.34439  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1733  von Willebrand factor type A  34.8 
 
 		 342 aa  169  4e-41  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.818001  normal  0.561199 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2430  von Willebrand factor, type A  36.8 
 
 		 339 aa  169  6e-41  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0141267 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0073  von Willebrand factor, type A  34.75 
 
 		 349 aa  166  6.9999999999999995e-40  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1589  von Willebrand factor type A  37.33 
 
 		 358 aa  160  3e-38  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.327037  hitchhiker  0.00013363 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2067  hypothetical protein  38.89 
 
 		 337 aa  159  7e-38  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_18800  von Willebrand factor, type A (VWA) domain protein  35.33 
 
 		 335 aa  157  2e-37  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.00117552  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3762  von Willebrand factor type A domain protein  33.97 
 
 		 352 aa  155  7e-37  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1718  von Willebrand factor, type A  33.65 
 
 		 352 aa  155  9e-37  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.060135  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2932  von Willebrand factor, type A  38.08 
 
 		 334 aa  155  1e-36  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.922939  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1007  von Willebrand factor type A  37.65 
 
 		 324 aa  150  2e-35  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0193109  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2815  von Willebrand factor, type A  33.2 
 
 		 327 aa  146  6e-34  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1386  von Willebrand factor type A  35.98 
 
 		 329 aa  135  9e-31  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.796868  normal  0.0818214 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0791  von Willebrand factor type A  32.05 
 
 		 339 aa  134  1.9999999999999998e-30  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.719983  normal  0.0260765 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0865  von Willebrand factor type A  32.48 
 
 		 339 aa  134  1.9999999999999998e-30  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0877751  normal  0.04584 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0825  von Willebrand factor type A  34.22 
 
 		 339 aa  134  3e-30  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.431264  normal  0.379491 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2469  von Willebrand factor type A  32.57 
 
 		 325 aa  133  5e-30  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.597694 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0648  von Willebrand factor, type A  31.2 
 
 		 307 aa  132  7.999999999999999e-30  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1481  von Willebrand factor type A  31.71 
 
 		 332 aa  131  2.0000000000000002e-29  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.587986  normal  0.160763 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0459  von Willebrand factor type A  34 
 
 		 320 aa  129  6e-29  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4901  hypothetical protein  31.53 
 
 		 330 aa  125  1e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.908989  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2396  von Willebrand factor type A  31.66 
 
 		 377 aa  125  1e-27  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.939741  normal  0.854107 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4305  von Willebrand factor type A  33.48 
 
 		 345 aa  124  2e-27  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0935346 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2319  von Willebrand factor type A  30 
 
 		 331 aa  123  3e-27  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3278  von Willebrand factor domain-containing protein  36.92 
 
 		 328 aa  124  3e-27  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.173273  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_4011  von Willebrand factor, type A  36.92 
 
 		 328 aa  124  3e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.204351  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02150  aerotolerance-related membrane protein  28.24 
 
 		 334 aa  123  4e-27  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1582  batA protein  31.6 
 
 		 327 aa  121  1.9999999999999998e-26  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1128  von Willebrand factor, type A  37.95 
 
 		 282 aa  121  1.9999999999999998e-26  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0959166  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2086  von Willebrand factor type A  33.73 
 
 		 327 aa  121  1.9999999999999998e-26  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0442  von Willebrand factor type A  34.21 
 
 		 329 aa  120  3.9999999999999996e-26  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.570722  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0656  von Willebrand factor, type A  31.33 
 
 		 309 aa  119  7.999999999999999e-26  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2439  von Willebrand factor type A  34.32 
 
 		 331 aa  118  9.999999999999999e-26  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1680  von Willebrand factor type A  31.84 
 
 		 333 aa  117  1.9999999999999998e-25  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.233991  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0719  von Willebrand factor, type A  27.86 
 
 		 334 aa  117  3e-25  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.887647  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1811  von Willebrand factor type A  33.47 
 
 		 331 aa  115  8.999999999999998e-25  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0430  hypothetical protein  31.36 
 
 		 336 aa  114  2.0000000000000002e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3846  von Willebrand factor type A  27.41 
 
 		 339 aa  113  4.0000000000000004e-24  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.341342  normal  0.622551 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6107  von Willebrand factor type A  29.81 
 
 		 359 aa  112  9e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0522  von Willebrand factor type A  32.81 
 
 		 346 aa  112  1.0000000000000001e-23  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0242  von Willebrand factor type A  32 
 
 		 336 aa  110  3e-23  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0239154  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1778  von Willebrand factor type A  31.33 
 
 		 328 aa  109  6e-23  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.357635  normal  0.258709 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2292  von Willebrand factor type A  31.34 
 
 		 325 aa  109  8.000000000000001e-23  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2655  BatA-like protein, aerotolerance-related  25.58 
 
 		 351 aa  107  3e-22  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2452  von Willebrand factor, type A  29.43 
 
 		 344 aa  107  3e-22  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1123  von Willebrand factor type A  30.17 
 
 		 373 aa  107  3e-22  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0098  von Willebrand factor, type A  29.55 
 
 		 363 aa  104  2e-21  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1250  batA protein, putative  25.43 
 
 		 332 aa  102  1e-20  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.367863  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0187  von Willebrand factor type A  31.76 
 
 		 339 aa  99.8  7e-20  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0796  von Willebrand factor type A  24.83 
 
 		 328 aa  97.4  3e-19  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000000000131986  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1886  von Willebrand factor, type A  27.4 
 
 		 329 aa  94.4  3e-18  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1641  von Willebrand factor type A  28.18 
 
 		 316 aa  92  1e-17  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2206  BatA  26.21 
 
 		 317 aa  88.6  1e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0553658  normal  0.0945164 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>