229 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewmr4_1403 on replicon NC_008321
Organism: Shewanella sp. MR-4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008321  Shewmr4_1403  von Willebrand factor, type A  100 
 
 		 338 aa  686    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.520734  hitchhiker  0.0000232326 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1468  von Willebrand factor, type A  97.63 
 
 		 338 aa  649    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00210714 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1456  von Willebrand factor, type A  98.22 
 
 		 338 aa  677    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000144994 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3093  von Willebrand factor type A domain-containing protein  90.83 
 
 		 338 aa  606  9.999999999999999e-173  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2860  von Willebrand factor type A  87.61 
 
 		 339 aa  588  1e-167  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.140424  normal  0.0110983 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2785  von Willebrand factor type A  87.32 
 
 		 340 aa  587  1e-167  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1593  von Willebrand factor type A  87.32 
 
 		 340 aa  587  1e-166  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000650656 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2765  von Willebrand factor type A  87.02 
 
 		 339 aa  587  1e-166  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.644793  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2464  von Willebrand factor, type A  86.14 
 
 		 339 aa  583  1.0000000000000001e-165  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2603  von Willebrand factor type A  77.88 
 
 		 336 aa  500  1e-140  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1624  von Willebrand factor, type A  74.51 
 
 		 330 aa  474  1e-132  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000050495 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2681  von Willebrand factor, type A  78.72 
 
 		 334 aa  469  1.0000000000000001e-131  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3031  von Willebrand factor type A  73.86 
 
 		 330 aa  468  9.999999999999999e-131  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.239159  normal  0.0768499 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1525  von Willebrand factor, type A  74.74 
 
 		 330 aa  451  1.0000000000000001e-126  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2430  von Willebrand factor, type A  75.79 
 
 		 339 aa  451  1.0000000000000001e-126  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0141267 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2172  von Willebrand factor type A domain-containing protein  71.19 
 
 		 327 aa  424  1e-117  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.0626942 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02705  von Willebrand factor, type A  52.47 
 
 		 349 aa  332  6e-90  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1659  von Willebrand factor, type A  52.12 
 
 		 343 aa  318  7.999999999999999e-86  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.863974  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA3085  batB protein, putative  52.27 
 
 		 328 aa  304  2.0000000000000002e-81  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001269  protein BatA  49.02 
 
 		 334 aa  292  7e-78  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.687935  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0524  hypothetical protein  47.47 
 
 		 320 aa  290  3e-77  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05144  hypothetical protein  49.16 
 
 		 334 aa  288  8e-77  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2815  von Willebrand factor, type A  56.25 
 
 		 327 aa  285  9e-76  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1106  hypothetical protein  48.56 
 
 		 318 aa  282  5.000000000000001e-75  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0852  von Willebrand factor type A  47.8 
 
 		 345 aa  281  9e-75  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.591496  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3211  von Willebrand factor, type A  47.83 
 
 		 359 aa  280  2e-74  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.161906 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1744  BatB protein, putative  51.59 
 
 		 341 aa  271  8.000000000000001e-72  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1733  von Willebrand factor type A  47.69 
 
 		 342 aa  264  1e-69  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.818001  normal  0.561199 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1948  von Willebrand factor, type A  48.35 
 
 		 339 aa  258  7e-68  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24400  von Willebrand factor type A domain-containing protein  46.39 
 
 		 340 aa  258  1e-67  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0690216  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2932  von Willebrand factor, type A  52.82 
 
 		 334 aa  254  2.0000000000000002e-66  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.922939  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3713  von Willebrand factor, type A  44.85 
 
 		 358 aa  250  3e-65  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.512513  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2029  von Willebrand factor type A domain-containing protein  44.85 
 
 		 358 aa  249  4e-65  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.34439  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1718  von Willebrand factor, type A  45.02 
 
 		 352 aa  249  4e-65  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.060135  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1561  von Willebrand factor type A  44.52 
 
 		 358 aa  249  5e-65  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.604958 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02345  von Willebrand factor type A domain protein  43.27 
 
 		 335 aa  249  5e-65  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3762  von Willebrand factor type A domain protein  44.69 
 
 		 352 aa  248  1e-64  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_18800  von Willebrand factor, type A (VWA) domain protein  45.37 
 
 		 335 aa  246  4e-64  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.00117552  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2067  hypothetical protein  51.69 
 
 		 337 aa  243  3e-63  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2914  hypothetical protein  39.7 
 
 		 344 aa  240  2.9999999999999997e-62  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2768  hypothetical protein  39.39 
 
 		 344 aa  238  1e-61  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1589  von Willebrand factor type A  46.18 
 
 		 358 aa  238  1e-61  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.327037  hitchhiker  0.00013363 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3232  von Willebrand factor type A  47.74 
 
 		 334 aa  223  4.9999999999999996e-57  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.34963  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0073  von Willebrand factor, type A  44.9 
 
 		 349 aa  219  3.9999999999999997e-56  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2991  von Willebrand factor type A domain-containing protein  34.72 
 
 		 364 aa  209  5e-53  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.603006  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3116  von Willebrand factor type A domain protein  39.59 
 
 		 328 aa  203  3e-51  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0524018  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2888  von Willebrand factor, type A  41.2 
 
 		 340 aa  195  9e-49  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1007  von Willebrand factor type A  37.37 
 
 		 324 aa  189  5e-47  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0193109  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4532  hypothetical protein  39.25 
 
 		 334 aa  189  8e-47  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.143586 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0567  von Willebrand factor, type A  34.9 
 
 		 335 aa  186  7e-46  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2469  von Willebrand factor type A  38.03 
 
 		 325 aa  185  8e-46  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.597694 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3386  von Willebrand factor, type A  34.9 
 
 		 335 aa  184  1.0000000000000001e-45  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.384724 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0865  von Willebrand factor type A  35.08 
 
 		 339 aa  184  2.0000000000000003e-45  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0877751  normal  0.04584 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3556  von Willebrand factor, type A  34.9 
 
 		 335 aa  184  2.0000000000000003e-45  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.697589 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0825  von Willebrand factor type A  35.41 
 
 		 339 aa  184  2.0000000000000003e-45  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.431264  normal  0.379491 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3055  von Willebrand factor type A  37.46 
 
 		 324 aa  184  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5138  von Willebrand factor type A  37.37 
 
 		 329 aa  183  3e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.585465 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1739  von Willebrand factor type A  37.22 
 
 		 328 aa  183  3e-45  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3801  von Willebrand factor type A  38.11 
 
 		 334 aa  182  5.0000000000000004e-45  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.142641  normal  0.822741 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0459  von Willebrand factor type A  33.12 
 
 		 320 aa  179  4e-44  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2138  hypothetical protein  42.56 
 
 		 337 aa  180  4e-44  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.401823  decreased coverage  0.00313955 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0791  von Willebrand factor type A  37.11 
 
 		 339 aa  179  4.999999999999999e-44  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.719983  normal  0.0260765 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2396  von Willebrand factor type A  38.34 
 
 		 377 aa  175  9.999999999999999e-43  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.939741  normal  0.854107 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1386  von Willebrand factor type A  37.86 
 
 		 329 aa  172  1e-41  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.796868  normal  0.0818214 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1680  von Willebrand factor type A  38.1 
 
 		 333 aa  170  3e-41  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.233991  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000306  protein BatA  31.69 
 
 		 356 aa  170  4e-41  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1204  von Willebrand factor type A  34.78 
 
 		 342 aa  167  2e-40  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1582  batA protein  40.4 
 
 		 327 aa  167  2.9999999999999998e-40  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1128  von Willebrand factor, type A  38.91 
 
 		 282 aa  166  6.9999999999999995e-40  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0959166  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4305  von Willebrand factor type A  36.25 
 
 		 345 aa  165  8e-40  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0935346 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1481  von Willebrand factor type A  34.34 
 
 		 332 aa  165  9e-40  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.587986  normal  0.160763 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_4011  von Willebrand factor, type A  38.63 
 
 		 328 aa  164  2.0000000000000002e-39  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.204351  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3278  von Willebrand factor domain-containing protein  38.2 
 
 		 328 aa  162  7e-39  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.173273  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0442  von Willebrand factor type A  40.27 
 
 		 329 aa  159  9e-38  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.570722  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02150  aerotolerance-related membrane protein  33.68 
 
 		 334 aa  158  1e-37  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0719  von Willebrand factor, type A  32.36 
 
 		 334 aa  150  4e-35  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.887647  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0430  hypothetical protein  36.29 
 
 		 336 aa  149  7e-35  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1123  von Willebrand factor type A  38.91 
 
 		 373 aa  147  4.0000000000000006e-34  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0648  von Willebrand factor, type A  32.92 
 
 		 307 aa  145  1e-33  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0242  von Willebrand factor type A  36.61 
 
 		 336 aa  142  6e-33  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0239154  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3846  von Willebrand factor type A  32.74 
 
 		 339 aa  140  3e-32  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.341342  normal  0.622551 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4901  hypothetical protein  34.81 
 
 		 330 aa  139  6e-32  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.908989  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2086  von Willebrand factor type A  34.46 
 
 		 327 aa  137  2e-31  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1811  von Willebrand factor type A  37.45 
 
 		 331 aa  136  5e-31  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0796  von Willebrand factor type A  31.34 
 
 		 328 aa  135  8e-31  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000000000131986  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0522  von Willebrand factor type A  33.44 
 
 		 346 aa  135  9e-31  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0051  von Willebrand factor type A  37.96 
 
 		 325 aa  132  1.0000000000000001e-29  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.901325  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2319  von Willebrand factor type A  33.1 
 
 		 331 aa  130  3e-29  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6107  von Willebrand factor type A  31.13 
 
 		 359 aa  129  5.0000000000000004e-29  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2292  von Willebrand factor type A  35.5 
 
 		 325 aa  130  5.0000000000000004e-29  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2439  von Willebrand factor type A  35.91 
 
 		 331 aa  129  6e-29  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0098  von Willebrand factor, type A  34.69 
 
 		 363 aa  123  5e-27  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2452  von Willebrand factor, type A  30.94 
 
 		 344 aa  120  3.9999999999999996e-26  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1778  von Willebrand factor type A  35.44 
 
 		 328 aa  120  4.9999999999999996e-26  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.357635  normal  0.258709 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0656  von Willebrand factor, type A  27.5 
 
 		 309 aa  119  6e-26  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2655  BatA-like protein, aerotolerance-related  28.51 
 
 		 351 aa  116  6e-25  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1250  batA protein, putative  26.12 
 
 		 332 aa  113  5e-24  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.367863  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1482  von Willebrand factor type A  29.26 
 
 		 344 aa  113  5e-24  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.428182  normal  0.250576 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1886  von Willebrand factor, type A  29.68 
 
 		 329 aa  110  4.0000000000000004e-23  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1806  hypothetical protein  28.96 
 
 		 316 aa  107  4e-22  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.539334  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>