198 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_1386 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010511  M446_1386  von Willebrand factor type A  100 
 
 
329 aa  614  1e-175  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.796868  normal  0.0818214 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1007  von Willebrand factor type A  87.37 
 
 
324 aa  488  1e-137  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0193109  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0825  von Willebrand factor type A  70.13 
 
 
339 aa  393  1e-108  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.431264  normal  0.379491 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0865  von Willebrand factor type A  69.81 
 
 
339 aa  391  1e-108  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0877751  normal  0.04584 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0791  von Willebrand factor type A  69.81 
 
 
339 aa  390  1e-107  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.719983  normal  0.0260765 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4305  von Willebrand factor type A  67.59 
 
 
345 aa  354  1e-96  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0935346 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0459  von Willebrand factor type A  51.25 
 
 
320 aa  253  2.0000000000000002e-66  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2469  von Willebrand factor type A  50.34 
 
 
325 aa  246  4.9999999999999997e-64  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.597694 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_4011  von Willebrand factor, type A  49.65 
 
 
328 aa  219  3e-56  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.204351  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3278  von Willebrand factor domain-containing protein  50.18 
 
 
328 aa  218  2e-55  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.173273  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1128  von Willebrand factor, type A  52.25 
 
 
282 aa  210  2e-53  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0959166  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2914  hypothetical protein  36.84 
 
 
344 aa  205  7e-52  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2768  hypothetical protein  36.53 
 
 
344 aa  202  7e-51  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA3085  batB protein, putative  41.04 
 
 
328 aa  200  3.9999999999999996e-50  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02705  von Willebrand factor, type A  37.79 
 
 
349 aa  195  7e-49  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0073  von Willebrand factor, type A  35.71 
 
 
349 aa  194  1e-48  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2860  von Willebrand factor type A  38.3 
 
 
339 aa  194  2e-48  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.140424  normal  0.0110983 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2603  von Willebrand factor type A  37.87 
 
 
336 aa  194  2e-48  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2785  von Willebrand factor type A  37.94 
 
 
340 aa  193  4e-48  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2765  von Willebrand factor type A  37.59 
 
 
339 aa  192  6e-48  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.644793  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1593  von Willebrand factor type A  37.59 
 
 
340 aa  190  2.9999999999999997e-47  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000650656 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2464  von Willebrand factor, type A  37.59 
 
 
339 aa  190  4e-47  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0852  von Willebrand factor type A  41.77 
 
 
345 aa  189  5e-47  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.591496  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3093  von Willebrand factor type A domain-containing protein  37.73 
 
 
338 aa  187  2e-46  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1403  von Willebrand factor, type A  36.88 
 
 
338 aa  187  2e-46  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.520734  hitchhiker  0.0000232326 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1468  von Willebrand factor, type A  36.52 
 
 
338 aa  186  4e-46  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00210714 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1456  von Willebrand factor, type A  36.86 
 
 
338 aa  186  5e-46  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000144994 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3211  von Willebrand factor, type A  39.34 
 
 
359 aa  185  9e-46  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.161906 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2430  von Willebrand factor, type A  41.88 
 
 
339 aa  184  2.0000000000000003e-45  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.0141267 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_18800  von Willebrand factor, type A (VWA) domain protein  40.63 
 
 
335 aa  183  3e-45  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.00117552  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02345  von Willebrand factor type A domain protein  38.23 
 
 
335 aa  183  3e-45  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1659  von Willebrand factor, type A  37.98 
 
 
343 aa  183  5.0000000000000004e-45  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.863974  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2681  von Willebrand factor, type A  37.74 
 
 
334 aa  181  1e-44  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2172  von Willebrand factor type A domain-containing protein  34.36 
 
 
327 aa  179  4e-44  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.0626942 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1744  BatB protein, putative  37.15 
 
 
341 aa  179  5.999999999999999e-44  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1733  von Willebrand factor type A  36.5 
 
 
342 aa  177  2e-43  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.818001  normal  0.561199 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3031  von Willebrand factor type A  35.49 
 
 
330 aa  176  6e-43  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.239159  normal  0.0768499 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1624  von Willebrand factor, type A  34.42 
 
 
330 aa  174  1.9999999999999998e-42  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000050495 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2029  von Willebrand factor type A domain-containing protein  37.24 
 
 
358 aa  172  5e-42  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.34439  normal 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1106  hypothetical protein  33.33 
 
 
318 aa  172  9e-42  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0524  hypothetical protein  36.24 
 
 
320 aa  171  1e-41  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1561  von Willebrand factor type A  36.9 
 
 
358 aa  171  1e-41  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.604958 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3232  von Willebrand factor type A  42.4 
 
 
334 aa  171  1e-41  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.34963  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3713  von Willebrand factor, type A  37.24 
 
 
358 aa  172  1e-41  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.512513  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1525  von Willebrand factor, type A  34.62 
 
 
330 aa  169  8e-41  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24400  von Willebrand factor type A domain-containing protein  38.57 
 
 
340 aa  167  2e-40  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0690216  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1948  von Willebrand factor, type A  38.68 
 
 
339 aa  167  2e-40  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001269  protein BatA  31.82 
 
 
334 aa  167  2e-40  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.687935  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3762  von Willebrand factor type A domain protein  37.66 
 
 
352 aa  165  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1718  von Willebrand factor, type A  37.67 
 
 
352 aa  162  6e-39  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.060135  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05144  hypothetical protein  32.96 
 
 
334 aa  160  2e-38  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4532  hypothetical protein  37.68 
 
 
334 aa  158  1e-37  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.143586 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2932  von Willebrand factor, type A  39.13 
 
 
334 aa  158  1e-37  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.922939  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000306  protein BatA  34.1 
 
 
356 aa  156  4e-37  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2067  hypothetical protein  38.91 
 
 
337 aa  156  6e-37  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1589  von Willebrand factor type A  37.24 
 
 
358 aa  154  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.327037  hitchhiker  0.00013363 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0567  von Willebrand factor, type A  33.23 
 
 
335 aa  152  5.9999999999999996e-36  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3386  von Willebrand factor, type A  32.63 
 
 
335 aa  147  3e-34  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.384724 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3055  von Willebrand factor type A  37.25 
 
 
324 aa  147  3e-34  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3556  von Willebrand factor, type A  32.63 
 
 
335 aa  146  4.0000000000000006e-34  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.697589 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5138  von Willebrand factor type A  37.66 
 
 
329 aa  144  2e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.585465 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3801  von Willebrand factor type A  35.43 
 
 
334 aa  142  7e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.142641  normal  0.822741 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2888  von Willebrand factor, type A  36.05 
 
 
340 aa  140  1.9999999999999998e-32  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2815  von Willebrand factor, type A  32.17 
 
 
327 aa  140  1.9999999999999998e-32  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0648  von Willebrand factor, type A  31.3 
 
 
307 aa  139  6e-32  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2396  von Willebrand factor type A  37.05 
 
 
377 aa  135  6.0000000000000005e-31  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.939741  normal  0.854107 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2138  hypothetical protein  38.04 
 
 
337 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.401823  decreased coverage  0.00313955 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1204  von Willebrand factor type A  37.38 
 
 
342 aa  132  6e-30  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3116  von Willebrand factor type A domain protein  32.82 
 
 
328 aa  131  2.0000000000000002e-29  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0524018  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG1582  batA protein  34.8 
 
 
327 aa  130  3e-29  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2991  von Willebrand factor type A domain-containing protein  28.2 
 
 
364 aa  130  3e-29  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.603006  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0051  von Willebrand factor type A  38.99 
 
 
325 aa  125  1e-27  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.901325  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0719  von Willebrand factor, type A  32.17 
 
 
334 aa  125  1e-27  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.887647  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0442  von Willebrand factor type A  36.32 
 
 
329 aa  124  2e-27  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.570722  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1481  von Willebrand factor type A  31.33 
 
 
332 aa  124  2e-27  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.587986  normal  0.160763 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1123  von Willebrand factor type A  35.93 
 
 
373 aa  122  9.999999999999999e-27  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1680  von Willebrand factor type A  29.83 
 
 
333 aa  120  1.9999999999999998e-26  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.233991  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2292  von Willebrand factor type A  34.46 
 
 
325 aa  119  9.999999999999999e-26  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2452  von Willebrand factor, type A  32.55 
 
 
344 aa  118  9.999999999999999e-26  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0522  von Willebrand factor type A  37.07 
 
 
346 aa  117  1.9999999999999998e-25  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0430  hypothetical protein  30.49 
 
 
336 aa  116  6e-25  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0242  von Willebrand factor type A  31.47 
 
 
336 aa  115  1.0000000000000001e-24  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0239154  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0656  von Willebrand factor, type A  28.36 
 
 
309 aa  115  1.0000000000000001e-24  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4901  hypothetical protein  34.27 
 
 
330 aa  115  1.0000000000000001e-24  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.908989  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1739  von Willebrand factor type A  29.82 
 
 
328 aa  114  3e-24  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2655  BatA-like protein, aerotolerance-related  31.67 
 
 
351 aa  113  5e-24  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6107  von Willebrand factor type A  32.59 
 
 
359 aa  112  6e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02150  aerotolerance-related membrane protein  28.98 
 
 
334 aa  111  1.0000000000000001e-23  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2319  von Willebrand factor type A  30.62 
 
 
331 aa  111  2.0000000000000002e-23  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2086  von Willebrand factor type A  35.27 
 
 
327 aa  110  4.0000000000000004e-23  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0796  von Willebrand factor type A  28.57 
 
 
328 aa  105  1e-21  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000000000131986  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1886  von Willebrand factor, type A  31.94 
 
 
329 aa  103  5e-21  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3846  von Willebrand factor type A  30.14 
 
 
339 aa  102  7e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.341342  normal  0.622551 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1778  von Willebrand factor type A  31.68 
 
 
328 aa  100  3e-20  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.357635  normal  0.258709 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0098  von Willebrand factor, type A  27.36 
 
 
363 aa  98.6  1e-19  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0254  hypothetical protein  34.4 
 
 
313 aa  99  1e-19  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.155283 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0173  von Willebrand factor type A domain protein  27.18 
 
 
333 aa  98.2  2e-19  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.0526529  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1811  von Willebrand factor type A  35.37 
 
 
331 aa  97.1  4e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2439  von Willebrand factor type A  35.37 
 
 
331 aa  93.6  4e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2206  BatA  30.32 
 
 
317 aa  90.5  4e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0553658  normal  0.0945164 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>