238 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SO_3093 on replicon NC_004347
Organism: Shewanella oneidensis MR-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_004347  SO_3093  von Willebrand factor type A domain-containing protein  100 
 
 
338 aa  686    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1456  von Willebrand factor, type A  91.42 
 
 
338 aa  612  9.999999999999999e-175  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000144994 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1403  von Willebrand factor, type A  90.83 
 
 
338 aa  608  1e-173  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.520734  hitchhiker  0.0000232326 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1468  von Willebrand factor, type A  90.83 
 
 
338 aa  608  1e-173  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00210714 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2860  von Willebrand factor type A  86.43 
 
 
339 aa  581  1.0000000000000001e-165  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.140424  normal  0.0110983 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1593  von Willebrand factor type A  86.73 
 
 
340 aa  582  1.0000000000000001e-165  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000650656 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2765  von Willebrand factor type A  85.84 
 
 
339 aa  579  1e-164  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.644793  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2785  von Willebrand factor type A  85.55 
 
 
340 aa  577  1.0000000000000001e-163  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2464  von Willebrand factor, type A  84.96 
 
 
339 aa  574  1.0000000000000001e-163  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2603  von Willebrand factor type A  77.26 
 
 
336 aa  501  1e-141  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2681  von Willebrand factor, type A  78.01 
 
 
334 aa  472  1e-132  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1624  von Willebrand factor, type A  74.18 
 
 
330 aa  471  1e-132  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000050495 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3031  von Willebrand factor type A  73.2 
 
 
330 aa  468  1.0000000000000001e-131  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.239159  normal  0.0768499 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1525  von Willebrand factor, type A  75.77 
 
 
330 aa  454  1e-127  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2430  von Willebrand factor, type A  74.39 
 
 
339 aa  446  1.0000000000000001e-124  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.0141267 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2172  von Willebrand factor type A domain-containing protein  73.78 
 
 
327 aa  427  1e-118  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.0626942 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02705  von Willebrand factor, type A  52.37 
 
 
349 aa  333  3e-90  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1659  von Willebrand factor, type A  49.51 
 
 
343 aa  310  2.9999999999999997e-83  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.863974  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA3085  batB protein, putative  51.95 
 
 
328 aa  306  2.0000000000000002e-82  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001269  protein BatA  48.2 
 
 
334 aa  291  1e-77  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.687935  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0524  hypothetical protein  47.4 
 
 
320 aa  285  7e-76  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2815  von Willebrand factor, type A  55.83 
 
 
327 aa  284  1.0000000000000001e-75  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05144  hypothetical protein  47.8 
 
 
334 aa  282  6.000000000000001e-75  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1106  hypothetical protein  48.09 
 
 
318 aa  281  1e-74  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0852  von Willebrand factor type A  46.86 
 
 
345 aa  275  1.0000000000000001e-72  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.591496  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1744  BatB protein, putative  50.4 
 
 
341 aa  268  8e-71  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3211  von Willebrand factor, type A  45.34 
 
 
359 aa  267  2e-70  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.161906 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1733  von Willebrand factor type A  46.49 
 
 
342 aa  266  4e-70  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.818001  normal  0.561199 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24400  von Willebrand factor type A domain-containing protein  48.02 
 
 
340 aa  256  5e-67  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0690216  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2932  von Willebrand factor, type A  53.23 
 
 
334 aa  254  1.0000000000000001e-66  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.922939  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1948  von Willebrand factor, type A  49.79 
 
 
339 aa  253  3e-66  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3713  von Willebrand factor, type A  45.67 
 
 
358 aa  249  3e-65  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.512513  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2029  von Willebrand factor type A domain-containing protein  45.51 
 
 
358 aa  249  5e-65  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.34439  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02345  von Willebrand factor type A domain protein  44.23 
 
 
335 aa  249  6e-65  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1561  von Willebrand factor type A  45.33 
 
 
358 aa  249  7e-65  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.604958 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3762  von Willebrand factor type A domain protein  44.69 
 
 
352 aa  244  1.9999999999999999e-63  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2067  hypothetical protein  52.12 
 
 
337 aa  244  1.9999999999999999e-63  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1718  von Willebrand factor, type A  44.37 
 
 
352 aa  243  3e-63  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.060135  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_18800  von Willebrand factor, type A (VWA) domain protein  43.73 
 
 
335 aa  242  6e-63  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.00117552  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2914  hypothetical protein  38.64 
 
 
344 aa  241  2e-62  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2768  hypothetical protein  38.64 
 
 
344 aa  239  4e-62  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1589  von Willebrand factor type A  46.86 
 
 
358 aa  238  1e-61  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.327037  hitchhiker  0.00013363 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3232  von Willebrand factor type A  47.74 
 
 
334 aa  225  7e-58  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.34963  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0073  von Willebrand factor, type A  39.42 
 
 
349 aa  220  3e-56  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2991  von Willebrand factor type A domain-containing protein  35.28 
 
 
364 aa  211  2e-53  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.603006  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3116  von Willebrand factor type A domain protein  42.35 
 
 
328 aa  204  2e-51  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0524018  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2888  von Willebrand factor, type A  40.96 
 
 
340 aa  199  7.999999999999999e-50  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5138  von Willebrand factor type A  38.08 
 
 
329 aa  194  2e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.585465 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1007  von Willebrand factor type A  39.93 
 
 
324 aa  192  8e-48  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0193109  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0567  von Willebrand factor, type A  35.48 
 
 
335 aa  190  4e-47  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3556  von Willebrand factor, type A  35.48 
 
 
335 aa  188  1e-46  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.697589 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2469  von Willebrand factor type A  38.06 
 
 
325 aa  186  5e-46  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.597694 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3386  von Willebrand factor, type A  34.9 
 
 
335 aa  185  1.0000000000000001e-45  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.384724 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4532  hypothetical protein  38.46 
 
 
334 aa  184  2.0000000000000003e-45  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.143586 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3801  von Willebrand factor type A  38.82 
 
 
334 aa  184  2.0000000000000003e-45  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.142641  normal  0.822741 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1739  von Willebrand factor type A  37.6 
 
 
328 aa  182  6e-45  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2138  hypothetical protein  40.86 
 
 
337 aa  182  1e-44  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.401823  decreased coverage  0.00313955 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0791  von Willebrand factor type A  36.62 
 
 
339 aa  181  2e-44  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.719983  normal  0.0260765 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0825  von Willebrand factor type A  37.05 
 
 
339 aa  180  4e-44  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.431264  normal  0.379491 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3055  von Willebrand factor type A  36.81 
 
 
324 aa  179  5.999999999999999e-44  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0865  von Willebrand factor type A  36.69 
 
 
339 aa  179  9e-44  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0877751  normal  0.04584 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0459  von Willebrand factor type A  35.45 
 
 
320 aa  177  2e-43  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2396  von Willebrand factor type A  38.74 
 
 
377 aa  174  9.999999999999999e-43  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.939741  normal  0.854107 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000306  protein BatA  31.9 
 
 
356 aa  174  1.9999999999999998e-42  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1386  von Willebrand factor type A  37.86 
 
 
329 aa  173  5e-42  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.796868  normal  0.0818214 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4305  von Willebrand factor type A  37.08 
 
 
345 aa  171  2e-41  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0935346 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1204  von Willebrand factor type A  34.29 
 
 
342 aa  167  2e-40  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1128  von Willebrand factor, type A  39.37 
 
 
282 aa  166  4e-40  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0959166  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_4011  von Willebrand factor, type A  39.48 
 
 
328 aa  166  5.9999999999999996e-40  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.204351  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1481  von Willebrand factor type A  34.34 
 
 
332 aa  165  9e-40  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.587986  normal  0.160763 
 
 
-
 
NC_002950  PG1582  batA protein  39.43 
 
 
327 aa  164  2.0000000000000002e-39  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3278  von Willebrand factor domain-containing protein  39.06 
 
 
328 aa  164  2.0000000000000002e-39  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.173273  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1680  von Willebrand factor type A  35.71 
 
 
333 aa  164  2.0000000000000002e-39  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.233991  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0442  von Willebrand factor type A  38.94 
 
 
329 aa  155  1e-36  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.570722  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02150  aerotolerance-related membrane protein  33.6 
 
 
334 aa  151  1e-35  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0648  von Willebrand factor, type A  33.33 
 
 
307 aa  150  2e-35  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1123  von Willebrand factor type A  35.28 
 
 
373 aa  149  6e-35  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0430  hypothetical protein  34.32 
 
 
336 aa  147  2.0000000000000003e-34  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0719  von Willebrand factor, type A  31.05 
 
 
334 aa  147  2.0000000000000003e-34  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.887647  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3846  von Willebrand factor type A  33.02 
 
 
339 aa  142  8e-33  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.341342  normal  0.622551 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2086  von Willebrand factor type A  35.44 
 
 
327 aa  138  1e-31  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0242  von Willebrand factor type A  35.43 
 
 
336 aa  137  2e-31  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0239154  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4901  hypothetical protein  34.25 
 
 
330 aa  137  2e-31  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.908989  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0522  von Willebrand factor type A  31.63 
 
 
346 aa  136  7.000000000000001e-31  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0796  von Willebrand factor type A  31.34 
 
 
328 aa  135  9.999999999999999e-31  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000000000131986  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1811  von Willebrand factor type A  37.04 
 
 
331 aa  133  3.9999999999999996e-30  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0051  von Willebrand factor type A  37.21 
 
 
325 aa  129  5.0000000000000004e-29  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.901325  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2319  von Willebrand factor type A  32.86 
 
 
331 aa  128  1.0000000000000001e-28  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0098  von Willebrand factor, type A  35.92 
 
 
363 aa  128  1.0000000000000001e-28  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2292  von Willebrand factor type A  34.63 
 
 
325 aa  126  4.0000000000000003e-28  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6107  von Willebrand factor type A  30.62 
 
 
359 aa  126  4.0000000000000003e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2439  von Willebrand factor type A  35.8 
 
 
331 aa  126  6e-28  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0656  von Willebrand factor, type A  26.43 
 
 
309 aa  119  7e-26  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1778  von Willebrand factor type A  34.47 
 
 
328 aa  117  3.9999999999999997e-25  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.357635  normal  0.258709 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2655  BatA-like protein, aerotolerance-related  27.03 
 
 
351 aa  116  6e-25  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1250  batA protein, putative  27.27 
 
 
332 aa  115  1.0000000000000001e-24  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.367863  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1886  von Willebrand factor, type A  29.33 
 
 
329 aa  110  3e-23  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2452  von Willebrand factor, type A  30.03 
 
 
344 aa  110  3e-23  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1482  von Willebrand factor type A  28.21 
 
 
344 aa  109  5e-23  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.428182  normal  0.250576 
 
 
-
 
NC_002950  PG1583  batB protein  30.24 
 
 
339 aa  108  2e-22  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>