245 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VIBHAR_05144 on replicon NC_009784
Organism: Vibrio harveyi ATCC BAA-1116



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009784  VIBHAR_05144  hypothetical protein  100 
 
 
334 aa  690    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001269  protein BatA  85.33 
 
 
334 aa  588  1e-167  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.687935  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1106  hypothetical protein  64.98 
 
 
318 aa  441  1e-123  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0524  hypothetical protein  64.26 
 
 
320 aa  431  1e-119  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA3085  batB protein, putative  48.86 
 
 
328 aa  300  3e-80  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02705  von Willebrand factor, type A  45.96 
 
 
349 aa  296  3e-79  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1659  von Willebrand factor, type A  47.37 
 
 
343 aa  291  8e-78  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.863974  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1624  von Willebrand factor, type A  47.46 
 
 
330 aa  291  1e-77  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000050495 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2603  von Willebrand factor type A  53.54 
 
 
336 aa  289  4e-77  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1403  von Willebrand factor, type A  49.16 
 
 
338 aa  287  1e-76  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.520734  hitchhiker  0.0000232326 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3031  von Willebrand factor type A  51.76 
 
 
330 aa  286  2.9999999999999996e-76  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.239159  normal  0.0768499 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1456  von Willebrand factor, type A  48.48 
 
 
338 aa  286  4e-76  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000144994 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1468  von Willebrand factor, type A  48.48 
 
 
338 aa  285  5.999999999999999e-76  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00210714 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2860  von Willebrand factor type A  52.55 
 
 
339 aa  283  3.0000000000000004e-75  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.140424  normal  0.0110983 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2785  von Willebrand factor type A  51.69 
 
 
340 aa  283  3.0000000000000004e-75  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2464  von Willebrand factor, type A  51.69 
 
 
339 aa  283  3.0000000000000004e-75  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2765  von Willebrand factor type A  52.16 
 
 
339 aa  282  7.000000000000001e-75  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.644793  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3093  von Willebrand factor type A domain-containing protein  47.8 
 
 
338 aa  281  1e-74  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1593  von Willebrand factor type A  51.76 
 
 
340 aa  279  5e-74  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000650656 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2815  von Willebrand factor, type A  48.95 
 
 
327 aa  277  2e-73  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2681  von Willebrand factor, type A  53.28 
 
 
334 aa  274  1.0000000000000001e-72  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2430  von Willebrand factor, type A  52.42 
 
 
339 aa  272  6e-72  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.0141267 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2172  von Willebrand factor type A domain-containing protein  52.46 
 
 
327 aa  271  1e-71  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.0626942 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1525  von Willebrand factor, type A  51.37 
 
 
330 aa  270  4e-71  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0852  von Willebrand factor type A  45.57 
 
 
345 aa  269  5e-71  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.591496  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1744  BatB protein, putative  49.42 
 
 
341 aa  255  9e-67  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3211  von Willebrand factor, type A  42.01 
 
 
359 aa  249  5e-65  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.161906 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0073  von Willebrand factor, type A  42.04 
 
 
349 aa  247  2e-64  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2914  hypothetical protein  42.36 
 
 
344 aa  246  4e-64  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2768  hypothetical protein  42.14 
 
 
344 aa  246  4.9999999999999997e-64  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1948  von Willebrand factor, type A  49.38 
 
 
339 aa  244  9.999999999999999e-64  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1733  von Willebrand factor type A  43.06 
 
 
342 aa  243  1.9999999999999999e-63  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.818001  normal  0.561199 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02345  von Willebrand factor type A domain protein  41.64 
 
 
335 aa  235  6e-61  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24400  von Willebrand factor type A domain-containing protein  41.8 
 
 
340 aa  233  3e-60  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0690216  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_18800  von Willebrand factor, type A (VWA) domain protein  40.72 
 
 
335 aa  224  1e-57  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.00117552  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1561  von Willebrand factor type A  40.75 
 
 
358 aa  221  9.999999999999999e-57  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.604958 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3713  von Willebrand factor, type A  40.89 
 
 
358 aa  221  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.512513  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2029  von Willebrand factor type A domain-containing protein  40.89 
 
 
358 aa  220  3e-56  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.34439  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3762  von Willebrand factor type A domain protein  38.51 
 
 
352 aa  214  1.9999999999999998e-54  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1718  von Willebrand factor, type A  38.19 
 
 
352 aa  214  1.9999999999999998e-54  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.060135  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3232  von Willebrand factor type A  45.83 
 
 
334 aa  211  1e-53  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.34963  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1589  von Willebrand factor type A  41.44 
 
 
358 aa  211  1e-53  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.327037  hitchhiker  0.00013363 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2932  von Willebrand factor, type A  44.49 
 
 
334 aa  210  3e-53  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.922939  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3801  von Willebrand factor type A  38.26 
 
 
334 aa  202  7e-51  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.142641  normal  0.822741 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2067  hypothetical protein  44.49 
 
 
337 aa  201  9.999999999999999e-51  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2991  von Willebrand factor type A domain-containing protein  34.56 
 
 
364 aa  200  3e-50  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.603006  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2888  von Willebrand factor, type A  39.92 
 
 
340 aa  199  5e-50  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000306  protein BatA  34.38 
 
 
356 aa  199  5e-50  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2138  hypothetical protein  42.06 
 
 
337 aa  195  7e-49  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.401823  decreased coverage  0.00313955 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4532  hypothetical protein  37.85 
 
 
334 aa  188  1e-46  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.143586 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3556  von Willebrand factor, type A  33.53 
 
 
335 aa  188  1e-46  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.697589 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5138  von Willebrand factor type A  40.98 
 
 
329 aa  187  2e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.585465 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3116  von Willebrand factor type A domain protein  37.72 
 
 
328 aa  187  2e-46  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0524018  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0567  von Willebrand factor, type A  33.43 
 
 
335 aa  187  2e-46  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3386  von Willebrand factor, type A  33.23 
 
 
335 aa  186  3e-46  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.384724 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3055  von Willebrand factor type A  32.91 
 
 
324 aa  183  3e-45  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1204  von Willebrand factor type A  38.72 
 
 
342 aa  180  4e-44  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1739  von Willebrand factor type A  36.15 
 
 
328 aa  176  5e-43  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0459  von Willebrand factor type A  35.29 
 
 
320 aa  169  5e-41  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1128  von Willebrand factor, type A  41.29 
 
 
282 aa  166  5.9999999999999996e-40  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0959166  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0825  von Willebrand factor type A  34.56 
 
 
339 aa  165  1.0000000000000001e-39  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.431264  normal  0.379491 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0865  von Willebrand factor type A  34.19 
 
 
339 aa  164  2.0000000000000002e-39  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0877751  normal  0.04584 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0719  von Willebrand factor, type A  35.55 
 
 
334 aa  164  2.0000000000000002e-39  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.887647  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2469  von Willebrand factor type A  37.16 
 
 
325 aa  162  6e-39  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.597694 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1007  von Willebrand factor type A  33.85 
 
 
324 aa  162  1e-38  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0193109  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0791  von Willebrand factor type A  34.56 
 
 
339 aa  159  6e-38  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.719983  normal  0.0260765 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1481  von Willebrand factor type A  33.23 
 
 
332 aa  157  2e-37  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.587986  normal  0.160763 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2396  von Willebrand factor type A  36.51 
 
 
377 aa  158  2e-37  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.939741  normal  0.854107 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02150  aerotolerance-related membrane protein  33.33 
 
 
334 aa  156  5.0000000000000005e-37  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1582  batA protein  38.02 
 
 
327 aa  155  7e-37  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4305  von Willebrand factor type A  34.87 
 
 
345 aa  153  4e-36  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0935346 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0442  von Willebrand factor type A  36.9 
 
 
329 aa  152  5.9999999999999996e-36  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.570722  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3278  von Willebrand factor domain-containing protein  40.3 
 
 
328 aa  151  1e-35  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.173273  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1386  von Willebrand factor type A  33.47 
 
 
329 aa  151  1e-35  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.796868  normal  0.0818214 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0430  hypothetical protein  37.66 
 
 
336 aa  150  2e-35  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_4011  von Willebrand factor, type A  40.3 
 
 
328 aa  150  4e-35  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.204351  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0648  von Willebrand factor, type A  31.84 
 
 
307 aa  149  5e-35  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1680  von Willebrand factor type A  32.78 
 
 
333 aa  149  8e-35  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.233991  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6107  von Willebrand factor type A  33.86 
 
 
359 aa  141  9.999999999999999e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0522  von Willebrand factor type A  38.46 
 
 
346 aa  138  1e-31  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4901  hypothetical protein  34.08 
 
 
330 aa  130  2.0000000000000002e-29  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.908989  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2086  von Willebrand factor type A  33.33 
 
 
327 aa  130  4.0000000000000003e-29  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0051  von Willebrand factor type A  34.48 
 
 
325 aa  130  5.0000000000000004e-29  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.901325  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1123  von Willebrand factor type A  33.33 
 
 
373 aa  129  9.000000000000001e-29  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2655  BatA-like protein, aerotolerance-related  35.32 
 
 
351 aa  125  7e-28  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0656  von Willebrand factor, type A  28.52 
 
 
309 aa  125  9e-28  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1811  von Willebrand factor type A  33.47 
 
 
331 aa  124  3e-27  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2439  von Willebrand factor type A  33.73 
 
 
331 aa  122  9.999999999999999e-27  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1250  batA protein, putative  28.9 
 
 
332 aa  120  3e-26  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.367863  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0796  von Willebrand factor type A  30.41 
 
 
328 aa  120  3e-26  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000000000131986  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2319  von Willebrand factor type A  32.78 
 
 
331 aa  118  9.999999999999999e-26  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3846  von Willebrand factor type A  33.82 
 
 
339 aa  117  1.9999999999999998e-25  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.341342  normal  0.622551 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1778  von Willebrand factor type A  34.38 
 
 
328 aa  117  3.9999999999999997e-25  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.357635  normal  0.258709 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0187  von Willebrand factor type A  28.24 
 
 
339 aa  117  3.9999999999999997e-25  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1482  von Willebrand factor type A  26.9 
 
 
344 aa  110  3e-23  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.428182  normal  0.250576 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2452  von Willebrand factor, type A  34.29 
 
 
344 aa  107  3e-22  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2206  BatA  33.2 
 
 
317 aa  107  4e-22  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0553658  normal  0.0945164 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0098  von Willebrand factor, type A  33.33 
 
 
363 aa  106  4e-22  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0254  hypothetical protein  29.01 
 
 
313 aa  107  4e-22  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.155283 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1641  von Willebrand factor type A  29.45 
 
 
316 aa  105  1e-21  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>