225 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dshi_3116 on replicon NC_009952
Organism: Dinoroseobacter shibae DFL 12



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009952  Dshi_3116  von Willebrand factor type A domain protein  100 
 
 		 328 aa  645    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0524018  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3801  von Willebrand factor type A  44.07 
 
 		 334 aa  262  6e-69  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.142641  normal  0.822741 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2991  von Willebrand factor type A domain-containing protein  40.36 
 
 		 364 aa  259  6e-68  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.603006  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0567  von Willebrand factor, type A  40.43 
 
 		 335 aa  247  2e-64  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000306  protein BatA  39.34 
 
 		 356 aa  244  9.999999999999999e-64  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2888  von Willebrand factor, type A  44.68 
 
 		 340 aa  244  9.999999999999999e-64  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3386  von Willebrand factor, type A  39.81 
 
 		 335 aa  240  2e-62  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.384724 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3556  von Willebrand factor, type A  39.81 
 
 		 335 aa  240  2e-62  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.697589 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5138  von Willebrand factor type A  42.96 
 
 		 329 aa  240  2.9999999999999997e-62  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.585465 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2138  hypothetical protein  44.48 
 
 		 337 aa  237  2e-61  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.401823  decreased coverage  0.00313955 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4532  hypothetical protein  43.01 
 
 		 334 aa  234  1.0000000000000001e-60  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.143586 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3055  von Willebrand factor type A  43.71 
 
 		 324 aa  225  8e-58  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1739  von Willebrand factor type A  39.8 
 
 		 328 aa  221  9.999999999999999e-57  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA3085  batB protein, putative  43.13 
 
 		 328 aa  220  3e-56  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1204  von Willebrand factor type A  40.53 
 
 		 342 aa  209  4e-53  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0852  von Willebrand factor type A  40.12 
 
 		 345 aa  209  7e-53  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.591496  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1659  von Willebrand factor, type A  38.06 
 
 		 343 aa  208  1e-52  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.863974  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02705  von Willebrand factor, type A  37.77 
 
 		 349 aa  208  1e-52  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1456  von Willebrand factor, type A  39.93 
 
 		 338 aa  207  2e-52  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000144994 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2860  von Willebrand factor type A  39.49 
 
 		 339 aa  207  3e-52  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.140424  normal  0.0110983 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2765  von Willebrand factor type A  39.17 
 
 		 339 aa  206  4e-52  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.644793  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1468  von Willebrand factor, type A  40.49 
 
 		 338 aa  206  6e-52  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00210714 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2603  von Willebrand factor type A  42.64 
 
 		 336 aa  205  9e-52  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2785  von Willebrand factor type A  39.17 
 
 		 340 aa  205  9e-52  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1593  von Willebrand factor type A  39.29 
 
 		 340 aa  204  1e-51  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000650656 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3093  von Willebrand factor type A domain-containing protein  42.35 
 
 		 338 aa  203  3e-51  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1403  von Willebrand factor, type A  39.59 
 
 		 338 aa  203  3e-51  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.520734  hitchhiker  0.0000232326 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001269  protein BatA  36.48 
 
 		 334 aa  202  6e-51  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.687935  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02345  von Willebrand factor type A domain protein  39.81 
 
 		 335 aa  201  9.999999999999999e-51  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1106  hypothetical protein  37.46 
 
 		 318 aa  201  1.9999999999999998e-50  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0524  hypothetical protein  37.07 
 
 		 320 aa  199  3.9999999999999996e-50  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2464  von Willebrand factor, type A  39.12 
 
 		 339 aa  199  7e-50  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2914  hypothetical protein  36.88 
 
 		 344 aa  196  5.000000000000001e-49  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1624  von Willebrand factor, type A  39.61 
 
 		 330 aa  195  8.000000000000001e-49  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000050495 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1525  von Willebrand factor, type A  40 
 
 		 330 aa  195  8.000000000000001e-49  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2029  von Willebrand factor type A domain-containing protein  40.89 
 
 		 358 aa  195  1e-48  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.34439  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1744  BatB protein, putative  36.99 
 
 		 341 aa  194  1e-48  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3713  von Willebrand factor, type A  40.89 
 
 		 358 aa  195  1e-48  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.512513  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1561  von Willebrand factor type A  40.21 
 
 		 358 aa  194  2e-48  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.604958 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3031  von Willebrand factor type A  37.59 
 
 		 330 aa  193  3e-48  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.239159  normal  0.0768499 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2768  hypothetical protein  36.56 
 
 		 344 aa  192  6e-48  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0073  von Willebrand factor, type A  36.39 
 
 		 349 aa  192  6e-48  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1733  von Willebrand factor type A  38.52 
 
 		 342 aa  191  2e-47  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.818001  normal  0.561199 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3211  von Willebrand factor, type A  37.3 
 
 		 359 aa  189  5.999999999999999e-47  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.161906 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2430  von Willebrand factor, type A  40 
 
 		 339 aa  189  8e-47  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0141267 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05144  hypothetical protein  37.72 
 
 		 334 aa  186  3e-46  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2681  von Willebrand factor, type A  40.65 
 
 		 334 aa  186  3e-46  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2172  von Willebrand factor type A domain-containing protein  40.65 
 
 		 327 aa  186  6e-46  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.0626942 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3762  von Willebrand factor type A domain protein  36.93 
 
 		 352 aa  183  4.0000000000000006e-45  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24400  von Willebrand factor type A domain-containing protein  38.94 
 
 		 340 aa  181  1e-44  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0690216  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1718  von Willebrand factor, type A  36.25 
 
 		 352 aa  181  2e-44  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.060135  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1589  von Willebrand factor type A  40.21 
 
 		 358 aa  180  2e-44  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.327037  hitchhiker  0.00013363 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_18800  von Willebrand factor, type A (VWA) domain protein  36.91 
 
 		 335 aa  171  1e-41  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.00117552  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3232  von Willebrand factor type A  41.3 
 
 		 334 aa  171  1e-41  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.34963  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2932  von Willebrand factor, type A  40.17 
 
 		 334 aa  169  6e-41  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.922939  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1948  von Willebrand factor, type A  40.16 
 
 		 339 aa  169  8e-41  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2067  hypothetical protein  41.59 
 
 		 337 aa  167  2.9999999999999998e-40  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2815  von Willebrand factor, type A  35.95 
 
 		 327 aa  164  2.0000000000000002e-39  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0648  von Willebrand factor, type A  34.91 
 
 		 307 aa  145  7.0000000000000006e-34  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1007  von Willebrand factor type A  34.72 
 
 		 324 aa  145  1e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0193109  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2469  von Willebrand factor type A  35.53 
 
 		 325 aa  142  7e-33  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.597694 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1481  von Willebrand factor type A  30.77 
 
 		 332 aa  138  1e-31  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.587986  normal  0.160763 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3278  von Willebrand factor domain-containing protein  38.39 
 
 		 328 aa  136  5e-31  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.173273  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1128  von Willebrand factor, type A  38.38 
 
 		 282 aa  136  5e-31  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0959166  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_4011  von Willebrand factor, type A  37.91 
 
 		 328 aa  134  1.9999999999999998e-30  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.204351  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0791  von Willebrand factor type A  31.87 
 
 		 339 aa  132  7.999999999999999e-30  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.719983  normal  0.0260765 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1123  von Willebrand factor type A  33.72 
 
 		 373 aa  129  7.000000000000001e-29  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0459  von Willebrand factor type A  32.93 
 
 		 320 aa  129  1.0000000000000001e-28  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0825  von Willebrand factor type A  31.56 
 
 		 339 aa  128  1.0000000000000001e-28  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.431264  normal  0.379491 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2396  von Willebrand factor type A  32.81 
 
 		 377 aa  128  1.0000000000000001e-28  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.939741  normal  0.854107 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0865  von Willebrand factor type A  31.25 
 
 		 339 aa  127  3e-28  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0877751  normal  0.04584 
 
 
-
 
NC_002950  PG1582  batA protein  33.47 
 
 		 327 aa  125  9e-28  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0430  hypothetical protein  34.69 
 
 		 336 aa  125  9e-28  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1386  von Willebrand factor type A  34.42 
 
 		 329 aa  124  2e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.796868  normal  0.0818214 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0442  von Willebrand factor type A  34.93 
 
 		 329 aa  122  8e-27  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.570722  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1680  von Willebrand factor type A  28.89 
 
 		 333 aa  121  9.999999999999999e-27  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.233991  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4901  hypothetical protein  31.6 
 
 		 330 aa  122  9.999999999999999e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.908989  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2655  BatA-like protein, aerotolerance-related  32.88 
 
 		 351 aa  119  6e-26  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6107  von Willebrand factor type A  31.25 
 
 		 359 aa  119  6e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4305  von Willebrand factor type A  33.19 
 
 		 345 aa  117  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0935346 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02150  aerotolerance-related membrane protein  31.15 
 
 		 334 aa  116  5e-25  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0522  von Willebrand factor type A  36.82 
 
 		 346 aa  115  1.0000000000000001e-24  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0719  von Willebrand factor, type A  27.68 
 
 		 334 aa  115  1.0000000000000001e-24  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.887647  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3846  von Willebrand factor type A  30.82 
 
 		 339 aa  114  2.0000000000000002e-24  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.341342  normal  0.622551 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0656  von Willebrand factor, type A  30.36 
 
 		 309 aa  111  2.0000000000000002e-23  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2086  von Willebrand factor type A  39.27 
 
 		 327 aa  111  2.0000000000000002e-23  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2439  von Willebrand factor type A  35.25 
 
 		 331 aa  106  5e-22  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0051  von Willebrand factor type A  37.14 
 
 		 325 aa  106  7e-22  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.901325  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2319  von Willebrand factor type A  33.33 
 
 		 331 aa  105  7e-22  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0796  von Willebrand factor type A  26.51 
 
 		 328 aa  105  1e-21  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000000000131986  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0242  von Willebrand factor type A  34.07 
 
 		 336 aa  104  2e-21  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0239154  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1811  von Willebrand factor type A  34.84 
 
 		 331 aa  104  2e-21  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2292  von Willebrand factor type A  33.48 
 
 		 325 aa  97.4  3e-19  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0173  von Willebrand factor type A domain protein  25.26 
 
 		 333 aa  96.7  5e-19  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.0526529  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2452  von Willebrand factor, type A  29.87 
 
 		 344 aa  95.1  2e-18  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0187  von Willebrand factor type A  31.68 
 
 		 339 aa  94  3e-18  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1806  hypothetical protein  27.06 
 
 		 316 aa  92.8  6e-18  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.539334  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02145  hypothetical protein  29.6 
 
 		 346 aa  91.3  2e-17  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1122  von Willebrand factor type A  23.95 
 
 		 335 aa  90.5  4e-17  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.51147  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1886  von Willebrand factor, type A  29.45 
 
 		 329 aa  87.4  3e-16  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>