282 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmar_0442 on replicon NC_013501
Organism: Rhodothermus marinus DSM 4252



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013501  Rmar_0442  von Willebrand factor type A  100 
 
 
329 aa  642    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.570722  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1481  von Willebrand factor type A  47.35 
 
 
332 aa  300  3e-80  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.587986  normal  0.160763 
 
 
-
 
NC_002950  PG1582  batA protein  49.85 
 
 
327 aa  284  2.0000000000000002e-75  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0430  hypothetical protein  45.87 
 
 
336 aa  260  2e-68  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4901  hypothetical protein  45.83 
 
 
330 aa  249  4e-65  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.908989  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1680  von Willebrand factor type A  43.61 
 
 
333 aa  248  1e-64  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.233991  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0719  von Willebrand factor, type A  41.09 
 
 
334 aa  247  2e-64  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.887647  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02150  aerotolerance-related membrane protein  41.49 
 
 
334 aa  235  6e-61  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2655  BatA-like protein, aerotolerance-related  34.14 
 
 
351 aa  201  1.9999999999999998e-50  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0796  von Willebrand factor type A  34.56 
 
 
328 aa  197  2.0000000000000003e-49  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000000000131986  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2439  von Willebrand factor type A  46.59 
 
 
331 aa  195  9e-49  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2452  von Willebrand factor, type A  43.81 
 
 
344 aa  192  7e-48  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0522  von Willebrand factor type A  42.86 
 
 
346 aa  191  1e-47  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6107  von Willebrand factor type A  36.6 
 
 
359 aa  191  2e-47  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1811  von Willebrand factor type A  45.45 
 
 
331 aa  190  2e-47  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2319  von Willebrand factor type A  40.08 
 
 
331 aa  183  4.0000000000000006e-45  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1123  von Willebrand factor type A  42.4 
 
 
373 aa  181  1e-44  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2086  von Willebrand factor type A  41.38 
 
 
327 aa  180  2.9999999999999997e-44  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA3085  batB protein, putative  42.42 
 
 
328 aa  178  9e-44  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2396  von Willebrand factor type A  40.94 
 
 
377 aa  178  1e-43  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.939741  normal  0.854107 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3846  von Willebrand factor type A  37.5 
 
 
339 aa  175  9e-43  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.341342  normal  0.622551 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0242  von Willebrand factor type A  41.02 
 
 
336 aa  170  4e-41  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0239154  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2914  hypothetical protein  40.23 
 
 
344 aa  166  4e-40  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2768  hypothetical protein  39.85 
 
 
344 aa  164  1.0000000000000001e-39  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1659  von Willebrand factor, type A  43.1 
 
 
343 aa  162  1e-38  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.863974  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0852  von Willebrand factor type A  37.92 
 
 
345 aa  161  2e-38  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.591496  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0648  von Willebrand factor, type A  35.77 
 
 
307 aa  160  2e-38  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1403  von Willebrand factor, type A  38.52 
 
 
338 aa  160  2e-38  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.520734  hitchhiker  0.0000232326 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3211  von Willebrand factor, type A  39.3 
 
 
359 aa  159  5e-38  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.161906 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2029  von Willebrand factor type A domain-containing protein  40.76 
 
 
358 aa  157  2e-37  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.34439  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1561  von Willebrand factor type A  40.34 
 
 
358 aa  157  2e-37  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.604958 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3713  von Willebrand factor, type A  40.76 
 
 
358 aa  157  2e-37  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.512513  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1468  von Willebrand factor, type A  37.74 
 
 
338 aa  157  2e-37  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00210714 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1456  von Willebrand factor, type A  37.74 
 
 
338 aa  157  2e-37  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000144994 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1733  von Willebrand factor type A  37.24 
 
 
342 aa  156  4e-37  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.818001  normal  0.561199 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3093  von Willebrand factor type A domain-containing protein  36.74 
 
 
338 aa  156  4e-37  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2765  von Willebrand factor type A  38.98 
 
 
339 aa  156  5.0000000000000005e-37  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.644793  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05144  hypothetical protein  36.9 
 
 
334 aa  156  5.0000000000000005e-37  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3031  von Willebrand factor type A  36.29 
 
 
330 aa  156  5.0000000000000005e-37  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.239159  normal  0.0768499 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2464  von Willebrand factor, type A  38.98 
 
 
339 aa  156  5.0000000000000005e-37  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1593  von Willebrand factor type A  38.98 
 
 
340 aa  155  6e-37  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000650656 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2785  von Willebrand factor type A  38.98 
 
 
340 aa  155  6e-37  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02705  von Willebrand factor, type A  39.15 
 
 
349 aa  156  6e-37  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2932  von Willebrand factor, type A  41.35 
 
 
334 aa  155  7e-37  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.922939  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2860  von Willebrand factor type A  37.8 
 
 
339 aa  155  7e-37  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.140424  normal  0.0110983 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2681  von Willebrand factor, type A  41.67 
 
 
334 aa  155  7e-37  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2603  von Willebrand factor type A  39.85 
 
 
336 aa  155  7e-37  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1624  von Willebrand factor, type A  36.69 
 
 
330 aa  154  2e-36  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000050495 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3762  von Willebrand factor type A domain protein  40.71 
 
 
352 aa  154  2e-36  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1589  von Willebrand factor type A  42.2 
 
 
358 aa  152  5e-36  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.327037  hitchhiker  0.00013363 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2430  von Willebrand factor, type A  41.46 
 
 
339 aa  152  5.9999999999999996e-36  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.0141267 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24400  von Willebrand factor type A domain-containing protein  40.08 
 
 
340 aa  152  7e-36  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0690216  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2292  von Willebrand factor type A  41.49 
 
 
325 aa  151  1e-35  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1718  von Willebrand factor, type A  39 
 
 
352 aa  151  1e-35  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.060135  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2067  hypothetical protein  42.41 
 
 
337 aa  150  2e-35  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0073  von Willebrand factor, type A  39.82 
 
 
349 aa  150  3e-35  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02345  von Willebrand factor type A domain protein  37.5 
 
 
335 aa  149  6e-35  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1482  von Willebrand factor type A  30.16 
 
 
344 aa  149  7e-35  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.428182  normal  0.250576 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1778  von Willebrand factor type A  36.59 
 
 
328 aa  149  7e-35  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.357635  normal  0.258709 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1525  von Willebrand factor, type A  35.63 
 
 
330 aa  148  1.0000000000000001e-34  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1106  hypothetical protein  34.78 
 
 
318 aa  146  4.0000000000000006e-34  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001269  protein BatA  36.24 
 
 
334 aa  145  1e-33  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.687935  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1948  von Willebrand factor, type A  37.92 
 
 
339 aa  144  1e-33  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_18800  von Willebrand factor, type A (VWA) domain protein  40.25 
 
 
335 aa  144  2e-33  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.00117552  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2172  von Willebrand factor type A domain-containing protein  37.14 
 
 
327 aa  144  3e-33  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.0626942 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1886  von Willebrand factor, type A  37.5 
 
 
329 aa  143  4e-33  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1583  batB protein  35.42 
 
 
339 aa  142  8e-33  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3232  von Willebrand factor type A  38.49 
 
 
334 aa  140  3e-32  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.34963  normal 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0524  hypothetical protein  36.4 
 
 
320 aa  138  1e-31  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2206  BatA  30.79 
 
 
317 aa  135  7.000000000000001e-31  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0553658  normal  0.0945164 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02145  hypothetical protein  29.23 
 
 
346 aa  135  8e-31  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1744  BatB protein, putative  39.32 
 
 
341 aa  135  9.999999999999999e-31  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4532  hypothetical protein  34.9 
 
 
334 aa  135  9.999999999999999e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.143586 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0656  von Willebrand factor, type A  31.94 
 
 
309 aa  134  1.9999999999999998e-30  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1128  von Willebrand factor, type A  37.44 
 
 
282 aa  134  1.9999999999999998e-30  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0959166  normal 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0173  von Willebrand factor type A domain protein  30 
 
 
333 aa  134  1.9999999999999998e-30  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.0526529  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2888  von Willebrand factor, type A  34.51 
 
 
340 aa  133  5e-30  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_4011  von Willebrand factor, type A  34.85 
 
 
328 aa  132  9e-30  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.204351  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1250  batA protein, putative  32.08 
 
 
332 aa  132  1.0000000000000001e-29  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.367863  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3278  von Willebrand factor domain-containing protein  34.47 
 
 
328 aa  130  2.0000000000000002e-29  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.173273  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2815  von Willebrand factor, type A  35.51 
 
 
327 aa  131  2.0000000000000002e-29  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0051  von Willebrand factor type A  39.29 
 
 
325 aa  129  5.0000000000000004e-29  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.901325  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1007  von Willebrand factor type A  36.77 
 
 
324 aa  125  8.000000000000001e-28  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0193109  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2469  von Willebrand factor type A  34.59 
 
 
325 aa  125  9e-28  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.597694 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2138  hypothetical protein  34.57 
 
 
337 aa  125  9e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.401823  decreased coverage  0.00313955 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000306  protein BatA  29.28 
 
 
356 aa  125  1e-27  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3801  von Willebrand factor type A  33.07 
 
 
334 aa  124  2e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.142641  normal  0.822741 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1739  von Willebrand factor type A  33.6 
 
 
328 aa  123  3e-27  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1386  von Willebrand factor type A  36.32 
 
 
329 aa  124  3e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.796868  normal  0.0818214 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3055  von Willebrand factor type A  34.02 
 
 
324 aa  123  4e-27  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0603  von Willebrand factor, type A  31.33 
 
 
316 aa  122  7e-27  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.623778  normal  0.0597521 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3116  von Willebrand factor type A domain protein  33.59 
 
 
328 aa  122  8e-27  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0524018  normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5138  von Willebrand factor type A  34.51 
 
 
329 aa  121  1.9999999999999998e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.585465 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0459  von Willebrand factor type A  32.69 
 
 
320 aa  119  4.9999999999999996e-26  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0791  von Willebrand factor type A  35.05 
 
 
339 aa  119  9e-26  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.719983  normal  0.0260765 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0825  von Willebrand factor type A  33.76 
 
 
339 aa  117  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.431264  normal  0.379491 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0865  von Willebrand factor type A  33.76 
 
 
339 aa  117  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0877751  normal  0.04584 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1806  hypothetical protein  31.51 
 
 
316 aa  117  1.9999999999999998e-25  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.539334  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1538  von Willebrand factor type A  28.57 
 
 
347 aa  116  5e-25  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.634535  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1641  von Willebrand factor type A  28.53 
 
 
316 aa  115  1.0000000000000001e-24  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>