294 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Coch_1680 on replicon NC_013162
Organism: Capnocytophaga ochracea DSM 7271



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013162  Coch_1680  von Willebrand factor type A  100 
 
 
333 aa  682    Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.233991  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0719  von Willebrand factor, type A  58.98 
 
 
334 aa  405  1.0000000000000001e-112  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.887647  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02150  aerotolerance-related membrane protein  59.04 
 
 
334 aa  388  1e-107  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0430  hypothetical protein  52.42 
 
 
336 aa  322  8e-87  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1481  von Willebrand factor type A  52.52 
 
 
332 aa  321  9.999999999999999e-87  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.587986  normal  0.160763 
 
 
-
 
NC_002950  PG1582  batA protein  50.3 
 
 
327 aa  290  3e-77  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0442  von Willebrand factor type A  43.16 
 
 
329 aa  253  3e-66  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.570722  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4901  hypothetical protein  39.17 
 
 
330 aa  215  7e-55  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.908989  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0522  von Willebrand factor type A  41.5 
 
 
346 aa  204  2e-51  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6107  von Willebrand factor type A  35.21 
 
 
359 aa  202  7e-51  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3846  von Willebrand factor type A  37.43 
 
 
339 aa  198  1.0000000000000001e-49  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.341342  normal  0.622551 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2655  BatA-like protein, aerotolerance-related  34.62 
 
 
351 aa  197  2.0000000000000003e-49  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2439  von Willebrand factor type A  38.26 
 
 
331 aa  194  2e-48  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1811  von Willebrand factor type A  38.62 
 
 
331 aa  192  5e-48  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2914  hypothetical protein  35.17 
 
 
344 aa  179  4.999999999999999e-44  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2768  hypothetical protein  38.63 
 
 
344 aa  179  8e-44  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2396  von Willebrand factor type A  35.23 
 
 
377 aa  175  8e-43  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.939741  normal  0.854107 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0796  von Willebrand factor type A  33.33 
 
 
328 aa  174  9.999999999999999e-43  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000000000131986  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1403  von Willebrand factor, type A  38.43 
 
 
338 aa  173  2.9999999999999996e-42  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.520734  hitchhiker  0.0000232326 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2765  von Willebrand factor type A  38.04 
 
 
339 aa  172  5e-42  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.644793  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1593  von Willebrand factor type A  38.04 
 
 
340 aa  172  6.999999999999999e-42  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000650656 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2785  von Willebrand factor type A  38.04 
 
 
340 aa  172  7.999999999999999e-42  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2860  von Willebrand factor type A  38.04 
 
 
339 aa  172  9e-42  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.140424  normal  0.0110983 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2319  von Willebrand factor type A  38.53 
 
 
331 aa  171  1e-41  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1468  von Willebrand factor, type A  37.65 
 
 
338 aa  171  2e-41  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00210714 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1456  von Willebrand factor, type A  37.65 
 
 
338 aa  171  2e-41  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000144994 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2464  von Willebrand factor, type A  37.65 
 
 
339 aa  170  3e-41  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1123  von Willebrand factor type A  35.04 
 
 
373 aa  169  9e-41  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3093  von Willebrand factor type A domain-containing protein  36.08 
 
 
338 aa  167  2e-40  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA3085  batB protein, putative  33.87 
 
 
328 aa  166  4e-40  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2452  von Willebrand factor, type A  34.54 
 
 
344 aa  163  4.0000000000000004e-39  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3713  von Willebrand factor, type A  39.39 
 
 
358 aa  162  5.0000000000000005e-39  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.512513  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1561  von Willebrand factor type A  38.96 
 
 
358 aa  162  5.0000000000000005e-39  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.604958 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2029  von Willebrand factor type A domain-containing protein  39.39 
 
 
358 aa  162  6e-39  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.34439  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0852  von Willebrand factor type A  38.96 
 
 
345 aa  161  1e-38  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.591496  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3211  von Willebrand factor, type A  33.43 
 
 
359 aa  160  2e-38  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.161906 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2430  von Willebrand factor, type A  36.76 
 
 
339 aa  160  4e-38  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.0141267 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2086  von Willebrand factor type A  35.96 
 
 
327 aa  158  1e-37  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3031  von Willebrand factor type A  34.73 
 
 
330 aa  157  2e-37  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.239159  normal  0.0768499 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1948  von Willebrand factor, type A  36.59 
 
 
339 aa  157  3e-37  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2603  von Willebrand factor type A  34.42 
 
 
336 aa  156  4e-37  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2681  von Willebrand factor, type A  35.89 
 
 
334 aa  156  4e-37  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05144  hypothetical protein  34.21 
 
 
334 aa  155  1e-36  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1733  von Willebrand factor type A  32.98 
 
 
342 aa  153  2.9999999999999998e-36  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.818001  normal  0.561199 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1106  hypothetical protein  30.98 
 
 
318 aa  154  2.9999999999999998e-36  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0242  von Willebrand factor type A  35.27 
 
 
336 aa  154  2.9999999999999998e-36  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0239154  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0648  von Willebrand factor, type A  36.4 
 
 
307 aa  153  4e-36  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1624  von Willebrand factor, type A  34.5 
 
 
330 aa  152  5e-36  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000050495 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2932  von Willebrand factor, type A  38.01 
 
 
334 aa  151  1e-35  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.922939  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1525  von Willebrand factor, type A  33.47 
 
 
330 aa  151  2e-35  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1589  von Willebrand factor type A  38.39 
 
 
358 aa  150  2e-35  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.327037  hitchhiker  0.00013363 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2067  hypothetical protein  36.61 
 
 
337 aa  150  2e-35  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24400  von Willebrand factor type A domain-containing protein  36.16 
 
 
340 aa  151  2e-35  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0690216  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1744  BatB protein, putative  35.89 
 
 
341 aa  150  3e-35  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02705  von Willebrand factor, type A  34.8 
 
 
349 aa  150  3e-35  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001269  protein BatA  32.21 
 
 
334 aa  150  4e-35  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.687935  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3232  von Willebrand factor type A  32.41 
 
 
334 aa  149  5e-35  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.34963  normal 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0524  hypothetical protein  30.49 
 
 
320 aa  147  2.0000000000000003e-34  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02345  von Willebrand factor type A domain protein  33.13 
 
 
335 aa  147  2.0000000000000003e-34  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1806  hypothetical protein  34.34 
 
 
316 aa  146  4.0000000000000006e-34  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.539334  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_18800  von Willebrand factor, type A (VWA) domain protein  36.16 
 
 
335 aa  145  8.000000000000001e-34  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.00117552  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1778  von Willebrand factor type A  33.54 
 
 
328 aa  144  2e-33  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.357635  normal  0.258709 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2172  von Willebrand factor type A domain-containing protein  33.33 
 
 
327 aa  144  2e-33  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.0626942 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2292  von Willebrand factor type A  36.13 
 
 
325 aa  143  4e-33  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3762  von Willebrand factor type A domain protein  35.09 
 
 
352 aa  142  6e-33  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1659  von Willebrand factor, type A  34 
 
 
343 aa  142  9.999999999999999e-33  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.863974  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2469  von Willebrand factor type A  36.56 
 
 
325 aa  140  1.9999999999999998e-32  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.597694 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0073  von Willebrand factor, type A  32.93 
 
 
349 aa  140  1.9999999999999998e-32  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1718  von Willebrand factor, type A  34.51 
 
 
352 aa  140  3e-32  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.060135  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1482  von Willebrand factor type A  32.21 
 
 
344 aa  140  3.9999999999999997e-32  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.428182  normal  0.250576 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1250  batA protein, putative  35.78 
 
 
332 aa  137  4e-31  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.367863  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0173  von Willebrand factor type A domain protein  28.78 
 
 
333 aa  134  3e-30  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.0526529  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0603  von Willebrand factor, type A  32.12 
 
 
316 aa  132  6e-30  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.623778  normal  0.0597521 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_4011  von Willebrand factor, type A  35.07 
 
 
328 aa  132  1.0000000000000001e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.204351  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2206  BatA  34.71 
 
 
317 aa  130  4.0000000000000003e-29  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0553658  normal  0.0945164 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3278  von Willebrand factor domain-containing protein  34.6 
 
 
328 aa  129  6e-29  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.173273  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0459  von Willebrand factor type A  32.9 
 
 
320 aa  129  6e-29  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG1583  batB protein  31.6 
 
 
339 aa  128  1.0000000000000001e-28  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0616  von Willebrand factor type A  30.47 
 
 
308 aa  127  3e-28  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.544287  normal  0.600223 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0254  hypothetical protein  35.75 
 
 
313 aa  127  3e-28  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.155283 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1641  von Willebrand factor type A  31.58 
 
 
316 aa  125  1e-27  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3116  von Willebrand factor type A domain protein  31.4 
 
 
328 aa  125  1e-27  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0524018  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02145  hypothetical protein  28.62 
 
 
346 aa  125  1e-27  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2815  von Willebrand factor, type A  33.33 
 
 
327 aa  125  1e-27  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1128  von Willebrand factor, type A  33.33 
 
 
282 aa  124  2e-27  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0959166  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1007  von Willebrand factor type A  33.04 
 
 
324 aa  124  3e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0193109  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1797  von Willebrand factor type A  29.2 
 
 
315 aa  123  4e-27  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.152806  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1886  von Willebrand factor, type A  34.58 
 
 
329 aa  122  6e-27  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3801  von Willebrand factor type A  32.18 
 
 
334 aa  122  9.999999999999999e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.142641  normal  0.822741 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2888  von Willebrand factor, type A  31.8 
 
 
340 aa  121  1.9999999999999998e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0656  von Willebrand factor, type A  30.07 
 
 
309 aa  121  1.9999999999999998e-26  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4532  hypothetical protein  29.41 
 
 
334 aa  121  1.9999999999999998e-26  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.143586 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3055  von Willebrand factor type A  32.58 
 
 
324 aa  120  3e-26  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2138  hypothetical protein  31.8 
 
 
337 aa  120  3.9999999999999996e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.401823  decreased coverage  0.00313955 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1386  von Willebrand factor type A  32.47 
 
 
329 aa  119  6e-26  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.796868  normal  0.0818214 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5138  von Willebrand factor type A  33.19 
 
 
329 aa  119  9e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.585465 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3038  von Willebrand factor type A  31.51 
 
 
319 aa  118  9.999999999999999e-26  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0865  von Willebrand factor type A  32.65 
 
 
339 aa  117  3.9999999999999997e-25  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0877751  normal  0.04584 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0825  von Willebrand factor type A  32.65 
 
 
339 aa  117  3.9999999999999997e-25  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.431264  normal  0.379491 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4305  von Willebrand factor type A  32.1 
 
 
345 aa  116  5e-25  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0935346 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>