235 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Patl_1659 on replicon NC_008228
Organism: Pseudoalteromonas atlantica T6c



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008228  Patl_1659  von Willebrand factor, type A  100 
 
 		 343 aa  692    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.863974  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02705  von Willebrand factor, type A  66.47 
 
 		 349 aa  456  1e-127  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2785  von Willebrand factor type A  56.9 
 
 		 340 aa  336  3.9999999999999995e-91  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2860  von Willebrand factor type A  56.57 
 
 		 339 aa  335  5.999999999999999e-91  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.140424  normal  0.0110983 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2765  von Willebrand factor type A  56.57 
 
 		 339 aa  335  7.999999999999999e-91  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.644793  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3031  von Willebrand factor type A  54.27 
 
 		 330 aa  334  1e-90  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.239159  normal  0.0768499 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1593  von Willebrand factor type A  56.23 
 
 		 340 aa  332  6e-90  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000650656 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2464  von Willebrand factor, type A  55.89 
 
 		 339 aa  329  4e-89  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA3085  batB protein, putative  53.7 
 
 		 328 aa  327  2.0000000000000001e-88  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1468  von Willebrand factor, type A  54.55 
 
 		 338 aa  327  2.0000000000000001e-88  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00210714 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1403  von Willebrand factor, type A  54.55 
 
 		 338 aa  326  3e-88  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.520734  hitchhiker  0.0000232326 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1624  von Willebrand factor, type A  53.92 
 
 		 330 aa  324  1e-87  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000050495 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1456  von Willebrand factor, type A  53.87 
 
 		 338 aa  323  2e-87  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000144994 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3093  von Willebrand factor type A domain-containing protein  57.53 
 
 		 338 aa  320  1.9999999999999998e-86  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2603  von Willebrand factor type A  51.5 
 
 		 336 aa  315  9e-85  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1744  BatB protein, putative  51.35 
 
 		 341 aa  314  9.999999999999999e-85  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1525  von Willebrand factor, type A  55.94 
 
 		 330 aa  310  2e-83  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2172  von Willebrand factor type A domain-containing protein  51.59 
 
 		 327 aa  309  4e-83  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.0626942 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2430  von Willebrand factor, type A  56.11 
 
 		 339 aa  306  3e-82  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0141267 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2681  von Willebrand factor, type A  56.25 
 
 		 334 aa  303  3.0000000000000004e-81  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1106  hypothetical protein  48.26 
 
 		 318 aa  303  4.0000000000000003e-81  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0524  hypothetical protein  46.25 
 
 		 320 aa  301  1e-80  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001269  protein BatA  48.7 
 
 		 334 aa  300  3e-80  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.687935  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1733  von Willebrand factor type A  48.92 
 
 		 342 aa  291  1e-77  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.818001  normal  0.561199 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3211  von Willebrand factor, type A  47.87 
 
 		 359 aa  283  3.0000000000000004e-75  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.161906 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05144  hypothetical protein  47.59 
 
 		 334 aa  282  5.000000000000001e-75  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0852  von Willebrand factor type A  46.56 
 
 		 345 aa  272  7e-72  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.591496  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1948  von Willebrand factor, type A  54.32 
 
 		 339 aa  271  1e-71  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24400  von Willebrand factor type A domain-containing protein  47.37 
 
 		 340 aa  269  5e-71  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0690216  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1718  von Willebrand factor, type A  45.51 
 
 		 352 aa  258  1e-67  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.060135  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1561  von Willebrand factor type A  46.41 
 
 		 358 aa  256  3e-67  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.604958 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2932  von Willebrand factor, type A  46.95 
 
 		 334 aa  256  4e-67  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.922939  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_18800  von Willebrand factor, type A (VWA) domain protein  45.74 
 
 		 335 aa  255  6e-67  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.00117552  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3713  von Willebrand factor, type A  46.73 
 
 		 358 aa  255  7e-67  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.512513  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2029  von Willebrand factor type A domain-containing protein  46.73 
 
 		 358 aa  254  1.0000000000000001e-66  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.34439  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3762  von Willebrand factor type A domain protein  45.19 
 
 		 352 aa  253  3e-66  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2815  von Willebrand factor, type A  45.54 
 
 		 327 aa  249  7e-65  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2067  hypothetical protein  46.79 
 
 		 337 aa  248  8e-65  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2914  hypothetical protein  41.56 
 
 		 344 aa  246  4e-64  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02345  von Willebrand factor type A domain protein  43.03 
 
 		 335 aa  246  4e-64  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2768  hypothetical protein  41.25 
 
 		 344 aa  245  9.999999999999999e-64  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1589  von Willebrand factor type A  45.72 
 
 		 358 aa  241  1e-62  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.327037  hitchhiker  0.00013363 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0073  von Willebrand factor, type A  43.41 
 
 		 349 aa  238  2e-61  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3232  von Willebrand factor type A  44.73 
 
 		 334 aa  226  6e-58  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.34963  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2991  von Willebrand factor type A domain-containing protein  34.86 
 
 		 364 aa  207  2e-52  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.603006  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3116  von Willebrand factor type A domain protein  38.93 
 
 		 328 aa  205  1e-51  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0524018  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3055  von Willebrand factor type A  40.06 
 
 		 324 aa  204  2e-51  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3801  von Willebrand factor type A  35.65 
 
 		 334 aa  198  1.0000000000000001e-49  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.142641  normal  0.822741 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000306  protein BatA  35.12 
 
 		 356 aa  193  3e-48  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2888  von Willebrand factor, type A  38.75 
 
 		 340 aa  192  1e-47  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1739  von Willebrand factor type A  42.17 
 
 		 328 aa  190  2e-47  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0567  von Willebrand factor, type A  34.13 
 
 		 335 aa  184  3e-45  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4532  hypothetical protein  37.25 
 
 		 334 aa  183  4.0000000000000006e-45  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.143586 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3556  von Willebrand factor, type A  34.13 
 
 		 335 aa  183  4.0000000000000006e-45  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.697589 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3386  von Willebrand factor, type A  33.83 
 
 		 335 aa  182  8.000000000000001e-45  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.384724 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0825  von Willebrand factor type A  37.03 
 
 		 339 aa  179  7e-44  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.431264  normal  0.379491 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0791  von Willebrand factor type A  36.48 
 
 		 339 aa  178  1e-43  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.719983  normal  0.0260765 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1007  von Willebrand factor type A  40.08 
 
 		 324 aa  178  1e-43  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0193109  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0865  von Willebrand factor type A  37.03 
 
 		 339 aa  178  1e-43  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0877751  normal  0.04584 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2138  hypothetical protein  34.12 
 
 		 337 aa  176  5e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.401823  decreased coverage  0.00313955 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5138  von Willebrand factor type A  34.86 
 
 		 329 aa  176  6e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.585465 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1204  von Willebrand factor type A  33.55 
 
 		 342 aa  173  2.9999999999999996e-42  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4305  von Willebrand factor type A  36.79 
 
 		 345 aa  173  2.9999999999999996e-42  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0935346 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1386  von Willebrand factor type A  40.62 
 
 		 329 aa  171  2e-41  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.796868  normal  0.0818214 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2396  von Willebrand factor type A  36.95 
 
 		 377 aa  171  2e-41  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.939741  normal  0.854107 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0459  von Willebrand factor type A  34.15 
 
 		 320 aa  170  3e-41  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2469  von Willebrand factor type A  38.85 
 
 		 325 aa  169  9e-41  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.597694 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0442  von Willebrand factor type A  43.1 
 
 		 329 aa  162  5.0000000000000005e-39  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.570722  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_4011  von Willebrand factor, type A  37.33 
 
 		 328 aa  161  1e-38  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.204351  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1481  von Willebrand factor type A  40.71 
 
 		 332 aa  159  6e-38  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.587986  normal  0.160763 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1128  von Willebrand factor, type A  37.86 
 
 		 282 aa  159  6e-38  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0959166  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3278  von Willebrand factor domain-containing protein  36.87 
 
 		 328 aa  159  8e-38  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.173273  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1582  batA protein  35.29 
 
 		 327 aa  156  4e-37  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02150  aerotolerance-related membrane protein  32.03 
 
 		 334 aa  152  8e-36  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0522  von Willebrand factor type A  36.51 
 
 		 346 aa  147  3e-34  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0648  von Willebrand factor, type A  33.18 
 
 		 307 aa  145  7.0000000000000006e-34  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0430  hypothetical protein  32.93 
 
 		 336 aa  142  9.999999999999999e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1680  von Willebrand factor type A  34.01 
 
 		 333 aa  140  1.9999999999999998e-32  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.233991  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0719  von Willebrand factor, type A  31.06 
 
 		 334 aa  140  3.9999999999999997e-32  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.887647  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1123  von Willebrand factor type A  33.46 
 
 		 373 aa  135  9.999999999999999e-31  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0051  von Willebrand factor type A  37.67 
 
 		 325 aa  135  9.999999999999999e-31  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.901325  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2086  von Willebrand factor type A  37.31 
 
 		 327 aa  132  7.999999999999999e-30  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3846  von Willebrand factor type A  34.48 
 
 		 339 aa  129  5.0000000000000004e-29  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.341342  normal  0.622551 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2439  von Willebrand factor type A  36.61 
 
 		 331 aa  129  6e-29  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1811  von Willebrand factor type A  35.74 
 
 		 331 aa  128  1.0000000000000001e-28  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2655  BatA-like protein, aerotolerance-related  31.6 
 
 		 351 aa  125  1e-27  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6107  von Willebrand factor type A  32.73 
 
 		 359 aa  123  4e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0796  von Willebrand factor type A  28.44 
 
 		 328 aa  123  4e-27  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000000000131986  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0242  von Willebrand factor type A  34.2 
 
 		 336 aa  122  6e-27  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0239154  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4901  hypothetical protein  31.74 
 
 		 330 aa  122  8e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.908989  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2292  von Willebrand factor type A  35.09 
 
 		 325 aa  120  3e-26  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0656  von Willebrand factor, type A  28.38 
 
 		 309 aa  120  4.9999999999999996e-26  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2319  von Willebrand factor type A  33.19 
 
 		 331 aa  117  1.9999999999999998e-25  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2452  von Willebrand factor, type A  29.45 
 
 		 344 aa  116  6e-25  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1778  von Willebrand factor type A  30.5 
 
 		 328 aa  116  6.9999999999999995e-25  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.357635  normal  0.258709 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0098  von Willebrand factor, type A  29.15 
 
 		 363 aa  110  3e-23  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1583  batB protein  33.82 
 
 		 339 aa  109  9.000000000000001e-23  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1806  hypothetical protein  29.9 
 
 		 316 aa  105  9e-22  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.539334  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2206  BatA  33.33 
 
 		 317 aa  105  1e-21  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0553658  normal  0.0945164 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0254  hypothetical protein  31 
 
 		 313 aa  100  5e-20  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.155283 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>