255 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpal_1806 on replicon NC_011832
Organism: Methanosphaerula palustris E1-9c



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011832  Mpal_1806  hypothetical protein  100 
 
 
316 aa  639    Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.539334  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0603  von Willebrand factor, type A  60.63 
 
 
316 aa  379  1e-104  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.623778  normal  0.0597521 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2206  BatA  58.1 
 
 
317 aa  370  1e-101  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0553658  normal  0.0945164 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0254  hypothetical protein  51.9 
 
 
313 aa  279  4e-74  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.155283 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1641  von Willebrand factor type A  45.54 
 
 
316 aa  269  4e-71  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0719  von Willebrand factor, type A  33.87 
 
 
334 aa  142  9.999999999999999e-33  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.887647  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0616  von Willebrand factor type A  33.86 
 
 
308 aa  135  9.999999999999999e-31  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.544287  normal  0.600223 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1680  von Willebrand factor type A  34.55 
 
 
333 aa  132  9e-30  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.233991  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1481  von Willebrand factor type A  35.17 
 
 
332 aa  130  4.0000000000000003e-29  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.587986  normal  0.160763 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02150  aerotolerance-related membrane protein  30.49 
 
 
334 aa  124  2e-27  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2768  hypothetical protein  29 
 
 
344 aa  120  3.9999999999999996e-26  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2914  hypothetical protein  29 
 
 
344 aa  119  7.999999999999999e-26  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0430  hypothetical protein  33.23 
 
 
336 aa  119  7.999999999999999e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1797  von Willebrand factor type A  31.99 
 
 
315 aa  117  1.9999999999999998e-25  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.152806  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG1582  batA protein  34.36 
 
 
327 aa  117  3e-25  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0796  von Willebrand factor type A  31.1 
 
 
328 aa  116  5e-25  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000000000131986  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA3085  batB protein, putative  34.68 
 
 
328 aa  114  2.0000000000000002e-24  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0442  von Willebrand factor type A  30.48 
 
 
329 aa  112  6e-24  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.570722  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3038  von Willebrand factor type A  29.68 
 
 
319 aa  111  1.0000000000000001e-23  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1952  von Willebrand factor type A  31.1 
 
 
315 aa  111  1.0000000000000001e-23  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.159987  hitchhiker  0.00398429 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1733  von Willebrand factor type A  33.19 
 
 
342 aa  110  3e-23  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.818001  normal  0.561199 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1123  von Willebrand factor type A  33.33 
 
 
373 aa  108  9.000000000000001e-23  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1468  von Willebrand factor, type A  29.58 
 
 
338 aa  107  2e-22  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00210714 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4901  hypothetical protein  31.63 
 
 
330 aa  107  3e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.908989  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2464  von Willebrand factor, type A  29.83 
 
 
339 aa  107  3e-22  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2785  von Willebrand factor type A  29.49 
 
 
340 aa  106  4e-22  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2860  von Willebrand factor type A  29.49 
 
 
339 aa  106  4e-22  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.140424  normal  0.0110983 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1593  von Willebrand factor type A  29.49 
 
 
340 aa  106  5e-22  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000650656 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1403  von Willebrand factor, type A  29.58 
 
 
338 aa  106  5e-22  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.520734  hitchhiker  0.0000232326 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1456  von Willebrand factor, type A  30.4 
 
 
338 aa  106  5e-22  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000144994 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3093  von Willebrand factor type A domain-containing protein  30 
 
 
338 aa  106  6e-22  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1659  von Willebrand factor, type A  29.9 
 
 
343 aa  106  7e-22  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.863974  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2765  von Willebrand factor type A  29.15 
 
 
339 aa  105  9e-22  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.644793  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3031  von Willebrand factor type A  28.81 
 
 
330 aa  105  1e-21  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.239159  normal  0.0768499 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2634  von Willebrand factor type A  36.36 
 
 
313 aa  104  2e-21  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0522  von Willebrand factor type A  28.09 
 
 
346 aa  103  3e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0648  von Willebrand factor, type A  29.34 
 
 
307 aa  103  5e-21  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1624  von Willebrand factor, type A  30.03 
 
 
330 aa  102  6e-21  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000050495 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2147  hypothetical protein  27.85 
 
 
321 aa  100  2e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.130278  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2495  von Willebrand factor type A  29.75 
 
 
316 aa  100  3e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.142903  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2603  von Willebrand factor type A  29.71 
 
 
336 aa  99.8  5e-20  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2655  BatA-like protein, aerotolerance-related  27.21 
 
 
351 aa  99  9e-20  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3211  von Willebrand factor, type A  31.76 
 
 
359 aa  98.6  1e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.161906 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02705  von Willebrand factor, type A  28.31 
 
 
349 aa  98.6  1e-19  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1106  hypothetical protein  27.62 
 
 
318 aa  99  1e-19  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3713  von Willebrand factor, type A  30.93 
 
 
358 aa  98.2  1e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.512513  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1007  von Willebrand factor type A  36.16 
 
 
324 aa  97.8  2e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0193109  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24400  von Willebrand factor type A domain-containing protein  30.84 
 
 
340 aa  97.8  2e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0690216  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1561  von Willebrand factor type A  30.93 
 
 
358 aa  97.4  2e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.604958 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2029  von Willebrand factor type A domain-containing protein  30.93 
 
 
358 aa  97.4  3e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.34439  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1678  von Willebrand factor, type A  30.94 
 
 
315 aa  97.1  3e-19  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.773902  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1744  BatB protein, putative  31.6 
 
 
341 aa  96.7  4e-19  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2888  von Willebrand factor, type A  30.17 
 
 
340 aa  96.7  5e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4532  hypothetical protein  31.23 
 
 
334 aa  95.5  1e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.143586 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0852  von Willebrand factor type A  29.17 
 
 
345 aa  95.1  1e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.591496  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1241  von Willebrand factor type A  28.39 
 
 
345 aa  95.5  1e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2319  von Willebrand factor type A  26.44 
 
 
331 aa  95.1  2e-18  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1247  von Willebrand factor, type A  31.11 
 
 
319 aa  94.7  2e-18  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.513072 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2300  hypothetical protein  30.06 
 
 
320 aa  94  3e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00522588  hitchhiker  0.00113064 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0524  hypothetical protein  27.78 
 
 
320 aa  94  3e-18  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2080  von Willebrand factor type A  28.32 
 
 
327 aa  93.6  4e-18  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.829092  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3055  von Willebrand factor type A  32.86 
 
 
324 aa  93.6  4e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3247  von Willebrand factor, type A  27.27 
 
 
354 aa  93.2  5e-18  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2067  hypothetical protein  32.86 
 
 
337 aa  92.8  7e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3116  von Willebrand factor type A domain protein  29.67 
 
 
328 aa  92.4  8e-18  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0524018  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1646  von Willebrand factor, type A  29.43 
 
 
354 aa  91.7  1e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3232  von Willebrand factor type A  32.33 
 
 
334 aa  91.7  1e-17  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.34963  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5131  von Willebrand factor type A  29.72 
 
 
319 aa  92.4  1e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.210447  normal  0.0623627 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2172  von Willebrand factor type A domain-containing protein  28.51 
 
 
327 aa  92  1e-17  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.0626942 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2932  von Willebrand factor, type A  35.1 
 
 
334 aa  92  1e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.922939  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1886  von Willebrand factor, type A  30.63 
 
 
329 aa  91.3  2e-17  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1589  von Willebrand factor type A  34.47 
 
 
358 aa  91.3  2e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.327037  hitchhiker  0.00013363 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1525  von Willebrand factor, type A  28.14 
 
 
330 aa  91.3  2e-17  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2430  von Willebrand factor, type A  30.83 
 
 
339 aa  90.9  3e-17  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.0141267 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4480  von Willebrand factor, type A  29.68 
 
 
353 aa  89.7  5e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0242  von Willebrand factor type A  29.65 
 
 
336 aa  90.1  5e-17  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0239154  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1384  von Willebrand factor, type A  33.2 
 
 
319 aa  89.7  5e-17  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.410804  hitchhiker  0.00717595 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_18800  von Willebrand factor, type A (VWA) domain protein  30.58 
 
 
335 aa  89.7  6e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.00117552  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05144  hypothetical protein  29.82 
 
 
334 aa  89.4  7e-17  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0012  YD repeat protein  30.43 
 
 
3027 aa  89.4  8e-17  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2396  von Willebrand factor type A  29.92 
 
 
377 aa  89  1e-16  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.939741  normal  0.854107 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001269  protein BatA  27.82 
 
 
334 aa  87.8  2e-16  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.687935  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02345  von Willebrand factor type A domain protein  29.02 
 
 
335 aa  87.4  3e-16  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1017  von Willebrand factor type A; type II secretion system protein  31.37 
 
 
643 aa  87.4  3e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2317  von Willebrand factor type A  28.19 
 
 
350 aa  87  4e-16  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2681  von Willebrand factor, type A  28.08 
 
 
334 aa  86.7  5e-16  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1318  von Willebrand factor type A  30.22 
 
 
318 aa  86.3  6e-16  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.598912  normal  0.213186 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1386  von Willebrand factor type A  34.16 
 
 
329 aa  86.3  7e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.796868  normal  0.0818214 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1137  von Willebrand factor type A  29.63 
 
 
319 aa  86.3  7e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.178204  hitchhiker  0.0000350269 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6107  von Willebrand factor type A  26.98 
 
 
359 aa  85.9  7e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5138  von Willebrand factor type A  29.2 
 
 
329 aa  85.5  0.000000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.585465 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3801  von Willebrand factor type A  30.12 
 
 
334 aa  85.5  0.000000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.142641  normal  0.822741 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1718  von Willebrand factor, type A  31.6 
 
 
352 aa  85.1  0.000000000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.060135  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2138  hypothetical protein  32.93 
 
 
337 aa  84.3  0.000000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.401823  decreased coverage  0.00313955 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3762  von Willebrand factor type A domain protein  31.4 
 
 
352 aa  84  0.000000000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1811  von Willebrand factor type A  31.89 
 
 
331 aa  84  0.000000000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3846  von Willebrand factor type A  29.18 
 
 
339 aa  83.6  0.000000000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.341342  normal  0.622551 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1948  von Willebrand factor, type A  29.08 
 
 
339 aa  83.6  0.000000000000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4476  von Willebrand factor, type A  29.67 
 
 
358 aa  83.2  0.000000000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3893  von Willebrand factor, type A  26.58 
 
 
346 aa  83.2  0.000000000000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.105671 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>