206 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_A1646 on replicon NC_007347
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007347  Reut_A1646  von Willebrand factor, type A  100 
 
 
354 aa  691    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4480  von Willebrand factor, type A  77.97 
 
 
353 aa  449  1e-125  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3247  von Willebrand factor, type A  51.13 
 
 
354 aa  302  6.000000000000001e-81  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1241  von Willebrand factor type A  51.12 
 
 
345 aa  298  7e-80  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2317  von Willebrand factor type A  53.37 
 
 
350 aa  272  8.000000000000001e-72  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3893  von Willebrand factor, type A  50.84 
 
 
346 aa  268  2e-70  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.105671 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1061  von Willebrand factor, type A  50.15 
 
 
355 aa  230  3e-59  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4476  von Willebrand factor, type A  40.28 
 
 
358 aa  210  3e-53  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3038  von Willebrand factor type A  36.36 
 
 
319 aa  184  2.0000000000000003e-45  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1952  von Willebrand factor type A  31.92 
 
 
315 aa  155  1e-36  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.159987  hitchhiker  0.00398429 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2634  von Willebrand factor type A  34.2 
 
 
313 aa  145  9e-34  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2147  hypothetical protein  30.91 
 
 
321 aa  144  2e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.130278  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2406  von Willebrand factor type A  34.41 
 
 
325 aa  142  9.999999999999999e-33  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1678  von Willebrand factor, type A  32.01 
 
 
315 aa  141  1.9999999999999998e-32  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.773902  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1137  von Willebrand factor type A  31.74 
 
 
319 aa  140  4.999999999999999e-32  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.178204  hitchhiker  0.0000350269 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2080  von Willebrand factor type A  30.95 
 
 
327 aa  139  7.999999999999999e-32  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.829092  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2495  von Willebrand factor type A  30.53 
 
 
316 aa  139  8.999999999999999e-32  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.142903  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1797  von Willebrand factor type A  30 
 
 
315 aa  139  8.999999999999999e-32  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.152806  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22360  hypothetical protein  30.75 
 
 
326 aa  138  2e-31  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0925694  normal  0.626592 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1247  von Willebrand factor, type A  31.44 
 
 
319 aa  136  5e-31  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.513072 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3659  hypothetical protein  31.09 
 
 
335 aa  135  9.999999999999999e-31  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.542398  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5131  von Willebrand factor type A  32.63 
 
 
319 aa  132  6.999999999999999e-30  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.210447  normal  0.0623627 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2300  hypothetical protein  32.45 
 
 
320 aa  132  1.0000000000000001e-29  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00522588  hitchhiker  0.00113064 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2751  hypothetical protein  29.72 
 
 
335 aa  129  6e-29  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.333251 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0616  von Willebrand factor type A  35.71 
 
 
308 aa  128  1.0000000000000001e-28  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.544287  normal  0.600223 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2455  hypothetical protein  29.05 
 
 
335 aa  127  2.0000000000000002e-28  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.16032  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2500  hypothetical protein  29.05 
 
 
335 aa  127  2.0000000000000002e-28  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.672748  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2492  hypothetical protein  29.05 
 
 
335 aa  127  2.0000000000000002e-28  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.882923  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1384  von Willebrand factor, type A  32.39 
 
 
319 aa  125  1e-27  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.410804  hitchhiker  0.00717595 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4902  von Willebrand factor type A  34.97 
 
 
319 aa  125  1e-27  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.745453  normal  0.578056 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1318  von Willebrand factor type A  32.44 
 
 
318 aa  122  9.999999999999999e-27  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.598912  normal  0.213186 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11510  hypothetical protein  28.79 
 
 
335 aa  122  9.999999999999999e-27  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.311165 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2377  von Willebrand factor type A  31.56 
 
 
315 aa  116  5e-25  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000270697  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1316  von Willebrand factor type A  28.73 
 
 
354 aa  115  1.0000000000000001e-24  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0667351  normal  0.163551 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5503  von Willebrand factor, type A  28.23 
 
 
315 aa  115  1.0000000000000001e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0866133  normal  0.0446961 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2088  von Willebrand factor type A  32.33 
 
 
318 aa  114  2.0000000000000002e-24  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1680  von Willebrand factor type A  27.95 
 
 
333 aa  114  2.0000000000000002e-24  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.233991  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1317  von Willebrand factor type A  29.79 
 
 
298 aa  114  2.0000000000000002e-24  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0738378  normal  0.207209 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3026  von Willebrand factor, type A  31.02 
 
 
316 aa  113  4.0000000000000004e-24  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.443806 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0719  von Willebrand factor, type A  27.03 
 
 
334 aa  112  1.0000000000000001e-23  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.887647  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1806  hypothetical protein  29.33 
 
 
316 aa  109  7.000000000000001e-23  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.539334  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1481  von Willebrand factor type A  27.79 
 
 
332 aa  108  1e-22  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.587986  normal  0.160763 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3037  hypothetical protein  27.2 
 
 
351 aa  107  2e-22  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02150  aerotolerance-related membrane protein  29.19 
 
 
334 aa  105  1e-21  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1641  von Willebrand factor type A  25.56 
 
 
316 aa  104  2e-21  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6107  von Willebrand factor type A  30.27 
 
 
359 aa  102  7e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3252  von Willebrand factor type A  30.34 
 
 
316 aa  100  3e-20  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.152867  normal  0.990768 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2206  BatA  27.88 
 
 
317 aa  100  6e-20  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0553658  normal  0.0945164 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1123  von Willebrand factor type A  30.03 
 
 
373 aa  97.1  4e-19  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0603  von Willebrand factor, type A  28.69 
 
 
316 aa  94.4  2e-18  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.623778  normal  0.0597521 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0442  von Willebrand factor type A  29.94 
 
 
329 aa  94.7  2e-18  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.570722  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1582  batA protein  30.13 
 
 
327 aa  93.2  5e-18  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0796  von Willebrand factor type A  24.59 
 
 
328 aa  93.2  6e-18  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000000000131986  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2655  BatA-like protein, aerotolerance-related  23.94 
 
 
351 aa  92.4  1e-17  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0254  hypothetical protein  28.25 
 
 
313 aa  92  1e-17  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.155283 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4905  hypothetical protein  30.97 
 
 
317 aa  91.3  2e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.616891  normal  0.194429 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0430  hypothetical protein  28.42 
 
 
336 aa  88.6  1e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0073  von Willebrand factor, type A  26.63 
 
 
349 aa  79.3  0.00000000000009  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02705  von Willebrand factor, type A  26.76 
 
 
349 aa  75.1  0.000000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0523  von Willebrand factor type A  31.64 
 
 
344 aa  74.3  0.000000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1106  hypothetical protein  26.67 
 
 
318 aa  74.3  0.000000000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3846  von Willebrand factor type A  27.51 
 
 
339 aa  72  0.00000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.341342  normal  0.622551 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0524  hypothetical protein  25.98 
 
 
320 aa  72  0.00000000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1017  von Willebrand factor type A; type II secretion system protein  29.88 
 
 
643 aa  71.6  0.00000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2439  von Willebrand factor type A  28.52 
 
 
331 aa  71.6  0.00000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001269  protein BatA  25.45 
 
 
334 aa  71.6  0.00000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.687935  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2603  von Willebrand factor type A  28.29 
 
 
336 aa  69.7  0.00000000008  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0522  von Willebrand factor type A  27.89 
 
 
346 aa  69.3  0.0000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1525  von Willebrand factor, type A  28.15 
 
 
330 aa  68.9  0.0000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1778  von Willebrand factor type A  28.24 
 
 
328 aa  68.9  0.0000000001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.357635  normal  0.258709 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1811  von Willebrand factor type A  27.78 
 
 
331 aa  68.9  0.0000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02145  hypothetical protein  23.88 
 
 
346 aa  68.2  0.0000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2319  von Willebrand factor type A  26.45 
 
 
331 aa  68.2  0.0000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1744  BatB protein, putative  28.97 
 
 
341 aa  67.8  0.0000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0852  von Willebrand factor type A  28.22 
 
 
345 aa  67.4  0.0000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.591496  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1250  batA protein, putative  24.48 
 
 
332 aa  67  0.0000000005  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.367863  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1482  von Willebrand factor type A  25 
 
 
344 aa  65.9  0.0000000009  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.428182  normal  0.250576 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05144  hypothetical protein  27.24 
 
 
334 aa  65.5  0.000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3762  von Willebrand factor type A domain protein  25.91 
 
 
352 aa  64.7  0.000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1403  von Willebrand factor, type A  28.79 
 
 
338 aa  64.3  0.000000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.520734  hitchhiker  0.0000232326 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4305  von Willebrand factor type A  29.88 
 
 
345 aa  64.3  0.000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0935346 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2464  von Willebrand factor, type A  27.76 
 
 
339 aa  64.3  0.000000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1593  von Willebrand factor type A  27.76 
 
 
340 aa  64.3  0.000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000650656 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2765  von Willebrand factor type A  27.38 
 
 
339 aa  63.9  0.000000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.644793  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2785  von Willebrand factor type A  27.38 
 
 
340 aa  63.5  0.000000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1718  von Willebrand factor, type A  37.65 
 
 
352 aa  63.5  0.000000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.060135  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3031  von Willebrand factor type A  26.2 
 
 
330 aa  63.2  0.000000006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.239159  normal  0.0768499 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2681  von Willebrand factor, type A  27.97 
 
 
334 aa  63.2  0.000000007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2860  von Willebrand factor type A  27.38 
 
 
339 aa  62.8  0.000000008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.140424  normal  0.0110983 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1456  von Willebrand factor, type A  28.41 
 
 
338 aa  62.8  0.000000009  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000144994 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2029  von Willebrand factor type A domain-containing protein  42.86 
 
 
358 aa  62.4  0.00000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.34439  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3093  von Willebrand factor type A domain-containing protein  28.41 
 
 
338 aa  62  0.00000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1468  von Willebrand factor, type A  28.52 
 
 
338 aa  62.8  0.00000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00210714 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1777  von Willebrand factor type A  31.55 
 
 
754 aa  62.4  0.00000001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.582496  normal  0.264323 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1561  von Willebrand factor type A  42.86 
 
 
358 aa  62  0.00000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.604958 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3713  von Willebrand factor, type A  42.86 
 
 
358 aa  62.4  0.00000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.512513  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3232  von Willebrand factor type A  28.68 
 
 
334 aa  62.4  0.00000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.34963  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2815  von Willebrand factor, type A  37.78 
 
 
327 aa  61.6  0.00000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2430  von Willebrand factor, type A  28.26 
 
 
339 aa  61.6  0.00000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.0141267 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1492  von Willebrand factor, type A  24.9 
 
 
892 aa  60.8  0.00000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>