225 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_2080 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014158  Tpau_2080  von Willebrand factor type A  100 
 
 		 327 aa  651    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.829092  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2406  von Willebrand factor type A  61.37 
 
 		 325 aa  363  2e-99  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2455  hypothetical protein  53.7 
 
 		 335 aa  329  5.0000000000000004e-89  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.16032  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2500  hypothetical protein  53.7 
 
 		 335 aa  329  5.0000000000000004e-89  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.672748  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2492  hypothetical protein  53.7 
 
 		 335 aa  329  5.0000000000000004e-89  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.882923  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2751  hypothetical protein  50.93 
 
 		 335 aa  327  2.0000000000000001e-88  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.333251 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3659  hypothetical protein  50.31 
 
 		 335 aa  325  8.000000000000001e-88  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.542398  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11510  hypothetical protein  51.23 
 
 		 335 aa  318  7e-86  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.311165 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22360  hypothetical protein  51.85 
 
 		 326 aa  309  4e-83  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0925694  normal  0.626592 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2147  hypothetical protein  49.69 
 
 		 321 aa  298  9e-80  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.130278  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2300  hypothetical protein  49.54 
 
 		 320 aa  289  5.0000000000000004e-77  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00522588  hitchhiker  0.00113064 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2495  von Willebrand factor type A  40.85 
 
 		 316 aa  208  1e-52  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.142903  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1797  von Willebrand factor type A  37.27 
 
 		 315 aa  206  3e-52  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.152806  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1137  von Willebrand factor type A  41.88 
 
 		 319 aa  207  3e-52  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.178204  hitchhiker  0.0000350269 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3026  von Willebrand factor, type A  42.71 
 
 		 316 aa  206  5e-52  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.443806 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1247  von Willebrand factor, type A  41.23 
 
 		 319 aa  203  3e-51  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.513072 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1952  von Willebrand factor type A  34.21 
 
 		 315 aa  201  1.9999999999999998e-50  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.159987  hitchhiker  0.00398429 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5131  von Willebrand factor type A  41.46 
 
 		 319 aa  199  5e-50  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.210447  normal  0.0623627 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2088  von Willebrand factor type A  41.22 
 
 		 318 aa  194  3e-48  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3252  von Willebrand factor type A  43.4 
 
 		 316 aa  192  5e-48  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.152867  normal  0.990768 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1678  von Willebrand factor, type A  35.57 
 
 		 315 aa  191  1e-47  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.773902  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5503  von Willebrand factor, type A  35.95 
 
 		 315 aa  186  5e-46  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0866133  normal  0.0446961 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1384  von Willebrand factor, type A  40.06 
 
 		 319 aa  186  6e-46  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.410804  hitchhiker  0.00717595 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2377  von Willebrand factor type A  41.02 
 
 		 315 aa  182  1e-44  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000270697  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4902  von Willebrand factor type A  38.43 
 
 		 319 aa  152  8e-36  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.745453  normal  0.578056 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3247  von Willebrand factor, type A  32.9 
 
 		 354 aa  147  2.0000000000000003e-34  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2317  von Willebrand factor type A  34.47 
 
 		 350 aa  140  1.9999999999999998e-32  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2634  von Willebrand factor type A  34.27 
 
 		 313 aa  140  3e-32  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1241  von Willebrand factor type A  29.15 
 
 		 345 aa  137  2e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3038  von Willebrand factor type A  34.56 
 
 		 319 aa  136  4e-31  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3893  von Willebrand factor, type A  31.88 
 
 		 346 aa  135  9.999999999999999e-31  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.105671 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0616  von Willebrand factor type A  35.35 
 
 		 308 aa  130  4.0000000000000003e-29  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.544287  normal  0.600223 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4480  von Willebrand factor, type A  30.07 
 
 		 353 aa  124  2e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1646  von Willebrand factor, type A  30.67 
 
 		 354 aa  122  9e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1318  von Willebrand factor type A  37.1 
 
 		 318 aa  119  4.9999999999999996e-26  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.598912  normal  0.213186 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1061  von Willebrand factor, type A  31.87 
 
 		 355 aa  116  6e-25  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3037  hypothetical protein  29.24 
 
 		 351 aa  114  2.0000000000000002e-24  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1316  von Willebrand factor type A  31.8 
 
 		 354 aa  113  3e-24  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0667351  normal  0.163551 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4476  von Willebrand factor, type A  28.9 
 
 		 358 aa  112  6e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1680  von Willebrand factor type A  29.64 
 
 		 333 aa  102  8e-21  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.233991  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1582  batA protein  34.29 
 
 		 327 aa  102  1e-20  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4905  hypothetical protein  33.33 
 
 		 317 aa  100  3e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.616891  normal  0.194429 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1317  von Willebrand factor type A  29.15 
 
 		 298 aa  99.4  7e-20  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0738378  normal  0.207209 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0719  von Willebrand factor, type A  27.83 
 
 		 334 aa  92  1e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.887647  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1806  hypothetical protein  29.13 
 
 		 316 aa  91.7  2e-17  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.539334  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02150  aerotolerance-related membrane protein  29.29 
 
 		 334 aa  91.7  2e-17  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1481  von Willebrand factor type A  28.08 
 
 		 332 aa  89.4  7e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.587986  normal  0.160763 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0442  von Willebrand factor type A  30.07 
 
 		 329 aa  87  3e-16  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.570722  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6107  von Willebrand factor type A  28.78 
 
 		 359 aa  87.4  3e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0603  von Willebrand factor, type A  28.48 
 
 		 316 aa  85.5  0.000000000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.623778  normal  0.0597521 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02345  von Willebrand factor type A domain protein  31.13 
 
 		 335 aa  85.1  0.000000000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2206  BatA  26.67 
 
 		 317 aa  84.7  0.000000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0553658  normal  0.0945164 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0524  hypothetical protein  32.93 
 
 		 320 aa  84.7  0.000000000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1641  von Willebrand factor type A  25.24 
 
 		 316 aa  84.3  0.000000000000003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4901  hypothetical protein  28.24 
 
 		 330 aa  82  0.00000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.908989  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1538  von Willebrand factor type A  30.28 
 
 		 347 aa  80.5  0.00000000000004  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.634535  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2396  von Willebrand factor type A  28.06 
 
 		 377 aa  78.6  0.0000000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.939741  normal  0.854107 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1122  von Willebrand factor type A  26.13 
 
 		 335 aa  78.6  0.0000000000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.51147  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0430  hypothetical protein  32.06 
 
 		 336 aa  77.4  0.0000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0073  von Willebrand factor, type A  32.47 
 
 		 349 aa  76.3  0.0000000000006  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02145  hypothetical protein  26.15 
 
 		 346 aa  76.3  0.0000000000006  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2655  BatA-like protein, aerotolerance-related  26.25 
 
 		 351 aa  75.1  0.000000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1583  batB protein  26.8 
 
 		 339 aa  73.6  0.000000000005  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05144  hypothetical protein  29.88 
 
 		 334 aa  72.8  0.000000000008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001269  protein BatA  26.28 
 
 		 334 aa  72.4  0.00000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.687935  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0906  von Willebrand factor type A  30.55 
 
 		 345 aa  70.9  0.00000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.519509  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3232  von Willebrand factor type A  31.69 
 
 		 334 aa  69.7  0.00000000007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.34963  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1123  von Willebrand factor type A  30.58 
 
 		 373 aa  69.3  0.00000000008  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2319  von Willebrand factor type A  28.68 
 
 		 331 aa  68.9  0.0000000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0865  von Willebrand factor type A  28.15 
 
 		 339 aa  68.9  0.0000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0877751  normal  0.04584 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0825  von Willebrand factor type A  28.15 
 
 		 339 aa  68.6  0.0000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.431264  normal  0.379491 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0796  von Willebrand factor type A  24.58 
 
 		 328 aa  68.2  0.0000000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000000000131986  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0648  von Willebrand factor, type A  30.47 
 
 		 307 aa  68.2  0.0000000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0791  von Willebrand factor type A  29.06 
 
 		 339 aa  68.6  0.0000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.719983  normal  0.0260765 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1106  hypothetical protein  28.33 
 
 		 318 aa  68.2  0.0000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4305  von Willebrand factor type A  30.04 
 
 		 345 aa  68.2  0.0000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0935346 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1250  batA protein, putative  26.42 
 
 		 332 aa  67.4  0.0000000003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.367863  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2455  von Willebrand factor type A  26.35 
 
 		 338 aa  67.4  0.0000000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2768  hypothetical protein  29.41 
 
 		 344 aa  65.9  0.0000000008  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1007  von Willebrand factor type A  28.81 
 
 		 324 aa  65.5  0.000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0193109  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0523  von Willebrand factor type A  32.99 
 
 		 344 aa  65.1  0.000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2914  hypothetical protein  29.41 
 
 		 344 aa  65.1  0.000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1908  hypothetical protein  27.81 
 
 		 319 aa  65.1  0.000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.137204 
 
 
-
 
NC_002977  MCA3085  batB protein, putative  28.98 
 
 		 328 aa  64.3  0.000000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1778  von Willebrand factor type A  28.78 
 
 		 328 aa  63.5  0.000000005  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.357635  normal  0.258709 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3054  TPR repeat-containing protein  31.29 
 
 		 533 aa  63.2  0.000000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.350986  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2469  von Willebrand factor type A  28.69 
 
 		 325 aa  63.2  0.000000006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.597694 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3846  von Willebrand factor type A  26.81 
 
 		 339 aa  62.4  0.000000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.341342  normal  0.622551 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1128  von Willebrand factor, type A  30.13 
 
 		 282 aa  61.6  0.00000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0959166  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0522  von Willebrand factor type A  27.18 
 
 		 346 aa  60.5  0.00000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0254  hypothetical protein  27.87 
 
 		 313 aa  60.5  0.00000004  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.155283 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1492  von Willebrand factor, type A  29.13 
 
 		 892 aa  59.7  0.00000006  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1386  von Willebrand factor type A  28.07 
 
 		 329 aa  60.1  0.00000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.796868  normal  0.0818214 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1777  von Willebrand factor type A  31.52 
 
 		 754 aa  59.7  0.00000007  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.582496  normal  0.264323 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0852  von Willebrand factor type A  29.53 
 
 		 345 aa  59.7  0.00000007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.591496  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0649  von Willebrand factor, type A  23.1 
 
 		 471 aa  58.5  0.0000001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3116  von Willebrand factor type A domain protein  28.62 
 
 		 328 aa  58.5  0.0000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0524018  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000306  protein BatA  29.06 
 
 		 356 aa  58.5  0.0000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1482  von Willebrand factor type A  22.57 
 
 		 344 aa  58.2  0.0000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.428182  normal  0.250576 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2451  von Willebrand factor, type A  30.5 
 
 		 337 aa  57.4  0.0000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>