228 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_2300 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013235  Namu_2300  hypothetical protein  100 
 
 
320 aa  636    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00522588  hitchhiker  0.00113064 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2147  hypothetical protein  56.43 
 
 
321 aa  366  1e-100  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.130278  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22360  hypothetical protein  53.4 
 
 
326 aa  312  4.999999999999999e-84  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0925694  normal  0.626592 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2751  hypothetical protein  50.62 
 
 
335 aa  309  4e-83  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.333251 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2080  von Willebrand factor type A  49.54 
 
 
327 aa  309  5e-83  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.829092  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2455  hypothetical protein  50 
 
 
335 aa  293  2e-78  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.16032  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2500  hypothetical protein  50 
 
 
335 aa  293  2e-78  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.672748  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2492  hypothetical protein  50 
 
 
335 aa  293  2e-78  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.882923  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3659  hypothetical protein  47.53 
 
 
335 aa  291  9e-78  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.542398  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11510  hypothetical protein  48.77 
 
 
335 aa  288  1e-76  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.311165 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2406  von Willebrand factor type A  48.46 
 
 
325 aa  278  9e-74  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1797  von Willebrand factor type A  44.06 
 
 
315 aa  266  4e-70  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.152806  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2495  von Willebrand factor type A  44.58 
 
 
316 aa  265  8.999999999999999e-70  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.142903  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2088  von Willebrand factor type A  47.65 
 
 
318 aa  250  2e-65  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1137  von Willebrand factor type A  47.62 
 
 
319 aa  246  4.9999999999999997e-64  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.178204  hitchhiker  0.0000350269 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3026  von Willebrand factor, type A  46.39 
 
 
316 aa  246  4.9999999999999997e-64  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.443806 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5131  von Willebrand factor type A  45.33 
 
 
319 aa  244  1.9999999999999999e-63  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.210447  normal  0.0623627 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1247  von Willebrand factor, type A  46.6 
 
 
319 aa  241  1e-62  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.513072 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1384  von Willebrand factor, type A  43.96 
 
 
319 aa  233  3e-60  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.410804  hitchhiker  0.00717595 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5503  von Willebrand factor, type A  40.79 
 
 
315 aa  233  3e-60  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0866133  normal  0.0446961 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3252  von Willebrand factor type A  45.77 
 
 
316 aa  228  7e-59  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.152867  normal  0.990768 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1952  von Willebrand factor type A  40 
 
 
315 aa  227  2e-58  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.159987  hitchhiker  0.00398429 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1678  von Willebrand factor, type A  41.69 
 
 
315 aa  226  5.0000000000000005e-58  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.773902  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2377  von Willebrand factor type A  44.4 
 
 
315 aa  209  7e-53  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000270697  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4902  von Willebrand factor type A  41.97 
 
 
319 aa  169  6e-41  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.745453  normal  0.578056 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1241  von Willebrand factor type A  32.85 
 
 
345 aa  145  1e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2317  von Willebrand factor type A  38.36 
 
 
350 aa  144  2e-33  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3247  von Willebrand factor, type A  33.55 
 
 
354 aa  142  8e-33  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0616  von Willebrand factor type A  36.7 
 
 
308 aa  140  3e-32  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.544287  normal  0.600223 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4905  hypothetical protein  35.8 
 
 
317 aa  139  6e-32  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.616891  normal  0.194429 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4480  von Willebrand factor, type A  35.22 
 
 
353 aa  138  1e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3893  von Willebrand factor, type A  36.05 
 
 
346 aa  130  3e-29  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.105671 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3038  von Willebrand factor type A  33.33 
 
 
319 aa  130  4.0000000000000003e-29  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1646  von Willebrand factor, type A  33.03 
 
 
354 aa  128  1.0000000000000001e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1061  von Willebrand factor, type A  35.2 
 
 
355 aa  128  2.0000000000000002e-28  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2634  von Willebrand factor type A  34.07 
 
 
313 aa  126  4.0000000000000003e-28  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1316  von Willebrand factor type A  32.93 
 
 
354 aa  120  3e-26  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0667351  normal  0.163551 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3037  hypothetical protein  28.67 
 
 
351 aa  115  1.0000000000000001e-24  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1317  von Willebrand factor type A  30.29 
 
 
298 aa  112  9e-24  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0738378  normal  0.207209 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4476  von Willebrand factor, type A  30.2 
 
 
358 aa  111  2.0000000000000002e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1318  von Willebrand factor type A  35.46 
 
 
318 aa  110  3e-23  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.598912  normal  0.213186 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1806  hypothetical protein  29.68 
 
 
316 aa  99.4  7e-20  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.539334  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG1582  batA protein  29.25 
 
 
327 aa  99  1e-19  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1641  von Willebrand factor type A  25.62 
 
 
316 aa  95.1  1e-18  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG1583  batB protein  32.13 
 
 
339 aa  90.5  3e-17  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1538  von Willebrand factor type A  30.91 
 
 
347 aa  90.5  4e-17  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.634535  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2206  BatA  26.62 
 
 
317 aa  89.7  5e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0553658  normal  0.0945164 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1680  von Willebrand factor type A  26.4 
 
 
333 aa  88.6  1e-16  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.233991  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1123  von Willebrand factor type A  30.18 
 
 
373 aa  85.9  8e-16  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6107  von Willebrand factor type A  26.23 
 
 
359 aa  85.1  0.000000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0796  von Willebrand factor type A  25.15 
 
 
328 aa  85.5  0.000000000000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000000000131986  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0719  von Willebrand factor, type A  27.53 
 
 
334 aa  82.4  0.000000000000009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.887647  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02145  hypothetical protein  25.69 
 
 
346 aa  81.6  0.00000000000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1481  von Willebrand factor type A  25.93 
 
 
332 aa  81.3  0.00000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.587986  normal  0.160763 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000306  protein BatA  31.05 
 
 
356 aa  79.7  0.00000000000006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0603  von Willebrand factor, type A  26.6 
 
 
316 aa  79  0.0000000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.623778  normal  0.0597521 
 
 
-
 
NC_002977  MCA3085  batB protein, putative  30.34 
 
 
328 aa  78.2  0.0000000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02150  aerotolerance-related membrane protein  25.32 
 
 
334 aa  78.2  0.0000000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0522  von Willebrand factor type A  29.09 
 
 
346 aa  77.8  0.0000000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1733  von Willebrand factor type A  28.27 
 
 
342 aa  77.4  0.0000000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.818001  normal  0.561199 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0523  von Willebrand factor type A  31.44 
 
 
344 aa  76.3  0.0000000000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0442  von Willebrand factor type A  30.89 
 
 
329 aa  76.3  0.0000000000007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.570722  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1482  von Willebrand factor type A  27.85 
 
 
344 aa  76.3  0.0000000000007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.428182  normal  0.250576 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02345  von Willebrand factor type A domain protein  30.38 
 
 
335 aa  75.9  0.0000000000008  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0791  von Willebrand factor type A  30.88 
 
 
339 aa  74.3  0.000000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.719983  normal  0.0260765 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0852  von Willebrand factor type A  30.04 
 
 
345 aa  74.3  0.000000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.591496  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0865  von Willebrand factor type A  30.22 
 
 
339 aa  72  0.00000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0877751  normal  0.04584 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02705  von Willebrand factor, type A  30.58 
 
 
349 aa  71.2  0.00000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0825  von Willebrand factor type A  30.58 
 
 
339 aa  71.2  0.00000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.431264  normal  0.379491 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1778  von Willebrand factor type A  27.33 
 
 
328 aa  70.1  0.00000000005  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.357635  normal  0.258709 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2655  BatA-like protein, aerotolerance-related  25 
 
 
351 aa  69.3  0.00000000007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3232  von Willebrand factor type A  32.78 
 
 
334 aa  69.3  0.00000000007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.34963  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1122  von Willebrand factor type A  23.27 
 
 
335 aa  68.9  0.0000000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.51147  normal 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0524  hypothetical protein  28.86 
 
 
320 aa  68.9  0.0000000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0242  von Willebrand factor type A  30.24 
 
 
336 aa  68.6  0.0000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0239154  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2914  hypothetical protein  26.26 
 
 
344 aa  67.8  0.0000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0430  hypothetical protein  28.38 
 
 
336 aa  67.8  0.0000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2768  hypothetical protein  26.26 
 
 
344 aa  67.8  0.0000000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0073  von Willebrand factor, type A  29.55 
 
 
349 aa  67.4  0.0000000003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2396  von Willebrand factor type A  27.17 
 
 
377 aa  67.4  0.0000000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.939741  normal  0.854107 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0648  von Willebrand factor, type A  25.63 
 
 
307 aa  67  0.0000000005  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05144  hypothetical protein  29.66 
 
 
334 aa  67  0.0000000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3031  von Willebrand factor type A  29.03 
 
 
330 aa  66.2  0.0000000006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.239159  normal  0.0768499 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1250  batA protein, putative  26.02 
 
 
332 aa  65.1  0.000000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.367863  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4901  hypothetical protein  29.77 
 
 
330 aa  65.1  0.000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.908989  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000305  TPR domain protein in aerotolerance operon  23.51 
 
 
576 aa  65.5  0.000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4305  von Willebrand factor type A  28.76 
 
 
345 aa  64.3  0.000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0935346 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3386  von Willebrand factor, type A  26.32 
 
 
335 aa  64.3  0.000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.384724 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0254  hypothetical protein  27.32 
 
 
313 aa  64.7  0.000000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.155283 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3054  TPR repeat-containing protein  29.8 
 
 
533 aa  65.1  0.000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.350986  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001269  protein BatA  26.1 
 
 
334 aa  64.7  0.000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.687935  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2603  von Willebrand factor type A  30.6 
 
 
336 aa  63.9  0.000000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1659  von Willebrand factor, type A  30.66 
 
 
343 aa  63.9  0.000000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.863974  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0243  von Willebrand factor type A  29.33 
 
 
343 aa  63.5  0.000000005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0131225  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1106  hypothetical protein  27.15 
 
 
318 aa  63.5  0.000000005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3093  von Willebrand factor type A domain-containing protein  30.43 
 
 
338 aa  63.2  0.000000006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1017  von Willebrand factor type A; type II secretion system protein  25.62 
 
 
643 aa  63.2  0.000000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1777  von Willebrand factor type A  28.57 
 
 
754 aa  62.8  0.000000008  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.582496  normal  0.264323 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1007  von Willebrand factor type A  30.67 
 
 
324 aa  62.4  0.000000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0193109  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1492  von Willebrand factor, type A  26.85 
 
 
892 aa  62.4  0.00000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>