239 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_5131 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009921  Franean1_5131  von Willebrand factor type A  100 
 
 
319 aa  622  1e-177  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.210447  normal  0.0623627 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1384  von Willebrand factor, type A  86.83 
 
 
319 aa  512  1e-144  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.410804  hitchhiker  0.00717595 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1797  von Willebrand factor type A  48.59 
 
 
315 aa  293  4e-78  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.152806  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1952  von Willebrand factor type A  48.59 
 
 
315 aa  274  1.0000000000000001e-72  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.159987  hitchhiker  0.00398429 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2088  von Willebrand factor type A  52.83 
 
 
318 aa  273  3e-72  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1247  von Willebrand factor, type A  50.83 
 
 
319 aa  266  2.9999999999999995e-70  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.513072 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1137  von Willebrand factor type A  50.83 
 
 
319 aa  266  2.9999999999999995e-70  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.178204  hitchhiker  0.0000350269 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1678  von Willebrand factor, type A  50.68 
 
 
315 aa  264  2e-69  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.773902  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2495  von Willebrand factor type A  46.06 
 
 
316 aa  261  1e-68  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.142903  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5503  von Willebrand factor, type A  46.71 
 
 
315 aa  254  1.0000000000000001e-66  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0866133  normal  0.0446961 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2300  hypothetical protein  44.1 
 
 
320 aa  245  6e-64  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00522588  hitchhiker  0.00113064 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2147  hypothetical protein  45.14 
 
 
321 aa  243  1.9999999999999999e-63  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.130278  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2751  hypothetical protein  45.3 
 
 
335 aa  242  7e-63  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.333251 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3659  hypothetical protein  44.95 
 
 
335 aa  239  4e-62  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.542398  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2455  hypothetical protein  45.61 
 
 
335 aa  238  1e-61  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.16032  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2500  hypothetical protein  45.61 
 
 
335 aa  238  1e-61  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.672748  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2492  hypothetical protein  45.61 
 
 
335 aa  238  1e-61  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.882923  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3026  von Willebrand factor, type A  48.74 
 
 
316 aa  236  6e-61  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.443806 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2377  von Willebrand factor type A  47.96 
 
 
315 aa  233  5e-60  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000270697  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11510  hypothetical protein  43.88 
 
 
335 aa  227  3e-58  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.311165 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3252  von Willebrand factor type A  48.74 
 
 
316 aa  221  1.9999999999999999e-56  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.152867  normal  0.990768 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2080  von Willebrand factor type A  39.81 
 
 
327 aa  212  5.999999999999999e-54  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.829092  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22360  hypothetical protein  42 
 
 
326 aa  207  3e-52  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0925694  normal  0.626592 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2406  von Willebrand factor type A  43.84 
 
 
325 aa  189  5e-47  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4902  von Willebrand factor type A  44.44 
 
 
319 aa  171  1e-41  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.745453  normal  0.578056 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2634  von Willebrand factor type A  39.29 
 
 
313 aa  149  4e-35  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3247  von Willebrand factor, type A  34.75 
 
 
354 aa  145  7.0000000000000006e-34  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4905  hypothetical protein  40.2 
 
 
317 aa  140  1.9999999999999998e-32  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.616891  normal  0.194429 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1241  von Willebrand factor type A  32.46 
 
 
345 aa  137  3.0000000000000003e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0616  von Willebrand factor type A  39.57 
 
 
308 aa  135  9e-31  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.544287  normal  0.600223 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3038  von Willebrand factor type A  33.46 
 
 
319 aa  131  1.0000000000000001e-29  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3893  von Willebrand factor, type A  35.37 
 
 
346 aa  129  8.000000000000001e-29  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.105671 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2317  von Willebrand factor type A  36.84 
 
 
350 aa  128  1.0000000000000001e-28  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4476  von Willebrand factor, type A  33.57 
 
 
358 aa  127  3e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1646  von Willebrand factor, type A  32.86 
 
 
354 aa  123  4e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1641  von Willebrand factor type A  26.77 
 
 
316 aa  118  9.999999999999999e-26  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1317  von Willebrand factor type A  33.33 
 
 
298 aa  116  5e-25  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0738378  normal  0.207209 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1318  von Willebrand factor type A  34.98 
 
 
318 aa  115  1.0000000000000001e-24  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.598912  normal  0.213186 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1481  von Willebrand factor type A  31.93 
 
 
332 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.587986  normal  0.160763 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1316  von Willebrand factor type A  32.52 
 
 
354 aa  114  2.0000000000000002e-24  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0667351  normal  0.163551 
 
 
-
 
NC_002950  PG1582  batA protein  32.71 
 
 
327 aa  111  2.0000000000000002e-23  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4480  von Willebrand factor, type A  32.89 
 
 
353 aa  110  2.0000000000000002e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3037  hypothetical protein  30.38 
 
 
351 aa  110  2.0000000000000002e-23  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1061  von Willebrand factor, type A  33.94 
 
 
355 aa  109  7.000000000000001e-23  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0796  von Willebrand factor type A  29.73 
 
 
328 aa  108  1e-22  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000000000131986  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0719  von Willebrand factor, type A  29.28 
 
 
334 aa  108  1e-22  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.887647  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0442  von Willebrand factor type A  35.37 
 
 
329 aa  104  2e-21  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.570722  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02150  aerotolerance-related membrane protein  29.08 
 
 
334 aa  103  3e-21  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2206  BatA  26.98 
 
 
317 aa  101  1e-20  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0553658  normal  0.0945164 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1806  hypothetical protein  29.49 
 
 
316 aa  97.8  2e-19  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.539334  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0430  hypothetical protein  31.1 
 
 
336 aa  98.2  2e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1123  von Willebrand factor type A  32.64 
 
 
373 aa  95.1  1e-18  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1680  von Willebrand factor type A  28 
 
 
333 aa  92.8  6e-18  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.233991  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1583  batB protein  29.15 
 
 
339 aa  92.4  1e-17  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6107  von Willebrand factor type A  32.22 
 
 
359 aa  89.7  6e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02145  hypothetical protein  24.68 
 
 
346 aa  87.4  3e-16  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0603  von Willebrand factor, type A  29.37 
 
 
316 aa  86.3  6e-16  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.623778  normal  0.0597521 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1777  von Willebrand factor type A  30 
 
 
754 aa  86.3  7e-16  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.582496  normal  0.264323 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1122  von Willebrand factor type A  26.45 
 
 
335 aa  84.3  0.000000000000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.51147  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1733  von Willebrand factor type A  29.63 
 
 
342 aa  84.3  0.000000000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.818001  normal  0.561199 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2655  BatA-like protein, aerotolerance-related  33.05 
 
 
351 aa  83.6  0.000000000000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2396  von Willebrand factor type A  30.86 
 
 
377 aa  83.6  0.000000000000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.939741  normal  0.854107 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2914  hypothetical protein  31.03 
 
 
344 aa  82.8  0.000000000000006  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1538  von Willebrand factor type A  28.17 
 
 
347 aa  82.8  0.000000000000008  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.634535  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02345  von Willebrand factor type A domain protein  31.21 
 
 
335 aa  82  0.00000000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2768  hypothetical protein  30.65 
 
 
344 aa  81.3  0.00000000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4901  hypothetical protein  31.85 
 
 
330 aa  80.1  0.00000000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.908989  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0254  hypothetical protein  30.09 
 
 
313 aa  80.1  0.00000000000005  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.155283 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2667  von Willebrand factor type A  30.14 
 
 
320 aa  79.7  0.00000000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0137073  normal  0.240647 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1482  von Willebrand factor type A  22.11 
 
 
344 aa  79.3  0.00000000000007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.428182  normal  0.250576 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3846  von Willebrand factor type A  33.8 
 
 
339 aa  79.3  0.00000000000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.341342  normal  0.622551 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3232  von Willebrand factor type A  33.05 
 
 
334 aa  78.6  0.0000000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.34963  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2455  von Willebrand factor type A  25.45 
 
 
338 aa  78.2  0.0000000000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0522  von Willebrand factor type A  33.33 
 
 
346 aa  76.6  0.0000000000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2888  von Willebrand factor, type A  29.53 
 
 
340 aa  75.9  0.000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5483  von Willebrand factor type A  26.81 
 
 
320 aa  74.7  0.000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0906  von Willebrand factor type A  25.26 
 
 
345 aa  73.6  0.000000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.519509  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0852  von Willebrand factor type A  29.92 
 
 
345 aa  73.6  0.000000000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.591496  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0865  von Willebrand factor type A  32.82 
 
 
339 aa  73.2  0.000000000006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0877751  normal  0.04584 
 
 
-
 
NC_002977  MCA3085  batB protein, putative  31.49 
 
 
328 aa  72.8  0.000000000007  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0524  hypothetical protein  27.8 
 
 
320 aa  72.4  0.000000000008  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1778  von Willebrand factor type A  30.03 
 
 
328 aa  72  0.00000000001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.357635  normal  0.258709 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0825  von Willebrand factor type A  33.75 
 
 
339 aa  72  0.00000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.431264  normal  0.379491 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1744  BatB protein, putative  30.17 
 
 
341 aa  71.2  0.00000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1948  von Willebrand factor, type A  31.25 
 
 
339 aa  71.6  0.00000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3801  von Willebrand factor type A  28.69 
 
 
334 aa  70.5  0.00000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.142641  normal  0.822741 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3163  von Willebrand factor type A  34.57 
 
 
550 aa  70.1  0.00000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.181499  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0648  von Willebrand factor, type A  27.42 
 
 
307 aa  69.7  0.00000000007  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1492  von Willebrand factor, type A  30.69 
 
 
892 aa  69.3  0.00000000007  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02705  von Willebrand factor, type A  29.17 
 
 
349 aa  68.6  0.0000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0791  von Willebrand factor type A  35.19 
 
 
339 aa  68.9  0.0000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.719983  normal  0.0260765 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2291  von Willebrand factor type A  31 
 
 
340 aa  68.6  0.0000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1250  batA protein, putative  27.16 
 
 
332 aa  67.8  0.0000000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.367863  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2430  von Willebrand factor, type A  28.92 
 
 
339 aa  67.8  0.0000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.0141267 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05144  hypothetical protein  30.04 
 
 
334 aa  68.2  0.0000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1106  hypothetical protein  28.9 
 
 
318 aa  67.8  0.0000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1007  von Willebrand factor type A  30.95 
 
 
324 aa  67.4  0.0000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0193109  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0098  von Willebrand factor, type A  25.83 
 
 
363 aa  67.4  0.0000000003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1468  von Willebrand factor, type A  26.1 
 
 
338 aa  67.4  0.0000000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00210714 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1456  von Willebrand factor, type A  26.1 
 
 
338 aa  67.4  0.0000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000144994 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>