238 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmar_1641 on replicon NC_010085
Organism: Nitrosopumilus maritimus SCM1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010085  Nmar_1641  von Willebrand factor type A  100 
 
 
316 aa  633  1e-180  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2206  BatA  49.33 
 
 
317 aa  277  1e-73  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0553658  normal  0.0945164 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1806  hypothetical protein  45.54 
 
 
316 aa  260  3e-68  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.539334  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0603  von Willebrand factor, type A  45.05 
 
 
316 aa  258  7e-68  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.623778  normal  0.0597521 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0254  hypothetical protein  42.03 
 
 
313 aa  216  5e-55  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.155283 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1952  von Willebrand factor type A  30.21 
 
 
315 aa  125  9e-28  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.159987  hitchhiker  0.00398429 
 
 
-
 
NC_002950  PG1582  batA protein  35 
 
 
327 aa  123  5e-27  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2768  hypothetical protein  34.11 
 
 
344 aa  120  1.9999999999999998e-26  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2914  hypothetical protein  34.11 
 
 
344 aa  120  3e-26  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0616  von Willebrand factor type A  29.66 
 
 
308 aa  117  3e-25  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.544287  normal  0.600223 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1680  von Willebrand factor type A  31.48 
 
 
333 aa  117  3e-25  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.233991  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0796  von Willebrand factor type A  33.69 
 
 
328 aa  115  1.0000000000000001e-24  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000000000131986  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2655  BatA-like protein, aerotolerance-related  32.76 
 
 
351 aa  113  4.0000000000000004e-24  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2495  von Willebrand factor type A  28.76 
 
 
316 aa  113  5e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.142903  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2319  von Willebrand factor type A  34.65 
 
 
331 aa  113  5e-24  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0719  von Willebrand factor, type A  29.18 
 
 
334 aa  112  6e-24  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.887647  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3038  von Willebrand factor type A  30.74 
 
 
319 aa  111  2.0000000000000002e-23  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5131  von Willebrand factor type A  26.6 
 
 
319 aa  110  3e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.210447  normal  0.0623627 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1481  von Willebrand factor type A  34.17 
 
 
332 aa  110  4.0000000000000004e-23  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.587986  normal  0.160763 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1384  von Willebrand factor, type A  28.46 
 
 
319 aa  109  5e-23  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.410804  hitchhiker  0.00717595 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02150  aerotolerance-related membrane protein  29.52 
 
 
334 aa  109  8.000000000000001e-23  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1137  von Willebrand factor type A  25.89 
 
 
319 aa  108  2e-22  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.178204  hitchhiker  0.0000350269 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1123  von Willebrand factor type A  30.45 
 
 
373 aa  106  7e-22  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1247  von Willebrand factor, type A  25.18 
 
 
319 aa  105  7e-22  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.513072 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001269  protein BatA  30 
 
 
334 aa  105  8e-22  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.687935  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4901  hypothetical protein  31.21 
 
 
330 aa  105  9e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.908989  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0442  von Willebrand factor type A  28.38 
 
 
329 aa  105  1e-21  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.570722  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1797  von Willebrand factor type A  27.85 
 
 
315 aa  103  3e-21  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.152806  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0430  hypothetical protein  30.71 
 
 
336 aa  102  8e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1678  von Willebrand factor, type A  28.57 
 
 
315 aa  100  2e-20  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.773902  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5503  von Willebrand factor, type A  28 
 
 
315 aa  97.8  2e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0866133  normal  0.0446961 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2634  von Willebrand factor type A  33.97 
 
 
313 aa  97.4  3e-19  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2396  von Willebrand factor type A  32.55 
 
 
377 aa  96.7  5e-19  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.939741  normal  0.854107 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2147  hypothetical protein  25.17 
 
 
321 aa  95.9  8e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.130278  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3055  von Willebrand factor type A  28.18 
 
 
324 aa  95.5  1e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2377  von Willebrand factor type A  25.26 
 
 
315 aa  95.1  1e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000270697  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0522  von Willebrand factor type A  28.16 
 
 
346 aa  94.7  2e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05144  hypothetical protein  29.62 
 
 
334 aa  94.7  2e-18  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1733  von Willebrand factor type A  32.38 
 
 
342 aa  94.4  2e-18  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.818001  normal  0.561199 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22360  hypothetical protein  27 
 
 
326 aa  94  3e-18  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0925694  normal  0.626592 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1106  hypothetical protein  28.62 
 
 
318 aa  90.9  2e-17  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1241  von Willebrand factor type A  26.92 
 
 
345 aa  90.9  3e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1659  von Willebrand factor, type A  28.82 
 
 
343 aa  90.9  3e-17  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.863974  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3659  hypothetical protein  25.51 
 
 
335 aa  90.5  3e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.542398  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1482  von Willebrand factor type A  29.18 
 
 
344 aa  90.5  4e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.428182  normal  0.250576 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1646  von Willebrand factor, type A  25.56 
 
 
354 aa  89.7  5e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2455  hypothetical protein  24.83 
 
 
335 aa  89.7  5e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.16032  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2500  hypothetical protein  24.83 
 
 
335 aa  89.7  5e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.672748  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2492  hypothetical protein  24.83 
 
 
335 aa  89.7  5e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.882923  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1744  BatB protein, putative  30.74 
 
 
341 aa  89.4  7e-17  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3801  von Willebrand factor type A  31.39 
 
 
334 aa  89.4  8e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.142641  normal  0.822741 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2751  hypothetical protein  24.83 
 
 
335 aa  89  1e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.333251 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3247  von Willebrand factor, type A  25.91 
 
 
354 aa  88.6  1e-16  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1318  von Willebrand factor type A  28.57 
 
 
318 aa  88.6  1e-16  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.598912  normal  0.213186 
 
 
-
 
NC_002977  MCA3085  batB protein, putative  26.64 
 
 
328 aa  87.8  2e-16  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6107  von Willebrand factor type A  27.74 
 
 
359 aa  87.8  2e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0648  von Willebrand factor, type A  29.25 
 
 
307 aa  87.4  3e-16  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1948  von Willebrand factor, type A  31.65 
 
 
339 aa  86.7  5e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02705  von Willebrand factor, type A  28.05 
 
 
349 aa  86.7  5e-16  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3026  von Willebrand factor, type A  25.25 
 
 
316 aa  86.3  6e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.443806 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3232  von Willebrand factor type A  30.43 
 
 
334 aa  85.9  8e-16  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.34963  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3893  von Willebrand factor, type A  26.9 
 
 
346 aa  85.9  9e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.105671 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11510  hypothetical protein  24.23 
 
 
335 aa  85.9  9e-16  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.311165 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2300  hypothetical protein  25.75 
 
 
320 aa  85.1  0.000000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00522588  hitchhiker  0.00113064 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4480  von Willebrand factor, type A  26.37 
 
 
353 aa  85.5  0.000000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2138  hypothetical protein  29.6 
 
 
337 aa  85.5  0.000000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.401823  decreased coverage  0.00313955 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0852  von Willebrand factor type A  28.23 
 
 
345 aa  85.5  0.000000000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.591496  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2888  von Willebrand factor, type A  26.59 
 
 
340 aa  84.7  0.000000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4476  von Willebrand factor, type A  26.51 
 
 
358 aa  84.7  0.000000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2603  von Willebrand factor type A  29.52 
 
 
336 aa  84.7  0.000000000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2317  von Willebrand factor type A  28.03 
 
 
350 aa  84.3  0.000000000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2464  von Willebrand factor, type A  26.42 
 
 
339 aa  84.3  0.000000000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2080  von Willebrand factor type A  25.24 
 
 
327 aa  84.3  0.000000000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.829092  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0524  hypothetical protein  27.96 
 
 
320 aa  84  0.000000000000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0073  von Willebrand factor, type A  33.33 
 
 
349 aa  83.6  0.000000000000004  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1593  von Willebrand factor type A  28.63 
 
 
340 aa  83.2  0.000000000000005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000650656 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1007  von Willebrand factor type A  28.76 
 
 
324 aa  83.2  0.000000000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0193109  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2765  von Willebrand factor type A  28.63 
 
 
339 aa  83.2  0.000000000000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.644793  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2430  von Willebrand factor, type A  28.45 
 
 
339 aa  82.8  0.000000000000006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.0141267 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3031  von Willebrand factor type A  28.32 
 
 
330 aa  82.8  0.000000000000006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.239159  normal  0.0768499 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4532  hypothetical protein  25.99 
 
 
334 aa  82.8  0.000000000000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.143586 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3846  von Willebrand factor type A  28.32 
 
 
339 aa  81.6  0.00000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.341342  normal  0.622551 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2860  von Willebrand factor type A  28.22 
 
 
339 aa  82.4  0.00000000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.140424  normal  0.0110983 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2785  von Willebrand factor type A  28.22 
 
 
340 aa  82  0.00000000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1456  von Willebrand factor, type A  25.56 
 
 
338 aa  80.9  0.00000000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000144994 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0242  von Willebrand factor type A  29.55 
 
 
336 aa  80.9  0.00000000000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0239154  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02345  von Willebrand factor type A domain protein  31.34 
 
 
335 aa  80.9  0.00000000000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1403  von Willebrand factor, type A  25.19 
 
 
338 aa  80.1  0.00000000000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.520734  hitchhiker  0.0000232326 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1468  von Willebrand factor, type A  25.56 
 
 
338 aa  80.5  0.00000000000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00210714 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3211  von Willebrand factor, type A  27.66 
 
 
359 aa  78.6  0.0000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.161906 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2452  von Willebrand factor, type A  25.08 
 
 
344 aa  78.6  0.0000000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2815  von Willebrand factor, type A  29.08 
 
 
327 aa  78.6  0.0000000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1624  von Willebrand factor, type A  27.93 
 
 
330 aa  79  0.0000000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000050495 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3093  von Willebrand factor type A domain-containing protein  26.97 
 
 
338 aa  77.8  0.0000000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2681  von Willebrand factor, type A  28.69 
 
 
334 aa  77.8  0.0000000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0523  von Willebrand factor type A  27.6 
 
 
344 aa  77.8  0.0000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_18800  von Willebrand factor, type A (VWA) domain protein  28.81 
 
 
335 aa  77.4  0.0000000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.00117552  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1061  von Willebrand factor, type A  27.05 
 
 
355 aa  77.4  0.0000000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5138  von Willebrand factor type A  29.17 
 
 
329 aa  77  0.0000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.585465 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2406  von Willebrand factor type A  25.7 
 
 
325 aa  76.6  0.0000000000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>