181 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_B4476 on replicon NC_007348
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007348  Reut_B4476  von Willebrand factor, type A  100 
 
 
358 aa  710    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1241  von Willebrand factor type A  43.39 
 
 
345 aa  256  4e-67  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3247  von Willebrand factor, type A  43.66 
 
 
354 aa  254  1.0000000000000001e-66  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2317  von Willebrand factor type A  47.58 
 
 
350 aa  250  3e-65  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3893  von Willebrand factor, type A  45.09 
 
 
346 aa  236  4e-61  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.105671 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1061  von Willebrand factor, type A  49.7 
 
 
355 aa  232  6e-60  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1646  von Willebrand factor, type A  40.28 
 
 
354 aa  209  8e-53  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4480  von Willebrand factor, type A  41.34 
 
 
353 aa  187  3e-46  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1797  von Willebrand factor type A  33.24 
 
 
315 aa  146  7.0000000000000006e-34  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.152806  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5131  von Willebrand factor type A  33.94 
 
 
319 aa  137  3.0000000000000003e-31  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.210447  normal  0.0623627 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4902  von Willebrand factor type A  37 
 
 
319 aa  137  3.0000000000000003e-31  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.745453  normal  0.578056 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2495  von Willebrand factor type A  31.18 
 
 
316 aa  136  5e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.142903  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1952  von Willebrand factor type A  31.03 
 
 
315 aa  136  5e-31  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.159987  hitchhiker  0.00398429 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3038  von Willebrand factor type A  33.79 
 
 
319 aa  135  9.999999999999999e-31  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2080  von Willebrand factor type A  29.12 
 
 
327 aa  133  3.9999999999999996e-30  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.829092  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5503  von Willebrand factor, type A  31.63 
 
 
315 aa  132  6e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0866133  normal  0.0446961 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1678  von Willebrand factor, type A  30.96 
 
 
315 aa  131  2.0000000000000002e-29  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.773902  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1384  von Willebrand factor, type A  31.61 
 
 
319 aa  128  1.0000000000000001e-28  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.410804  hitchhiker  0.00717595 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2634  von Willebrand factor type A  34.91 
 
 
313 aa  129  1.0000000000000001e-28  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3659  hypothetical protein  30.57 
 
 
335 aa  128  2.0000000000000002e-28  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.542398  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1137  von Willebrand factor type A  31.52 
 
 
319 aa  127  2.0000000000000002e-28  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.178204  hitchhiker  0.0000350269 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2147  hypothetical protein  31.63 
 
 
321 aa  128  2.0000000000000002e-28  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.130278  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22360  hypothetical protein  31.97 
 
 
326 aa  123  5e-27  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0925694  normal  0.626592 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2455  hypothetical protein  30.19 
 
 
335 aa  122  9.999999999999999e-27  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.16032  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2500  hypothetical protein  30.19 
 
 
335 aa  122  9.999999999999999e-27  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.672748  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2492  hypothetical protein  30.19 
 
 
335 aa  122  9.999999999999999e-27  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.882923  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2751  hypothetical protein  32.96 
 
 
335 aa  120  3.9999999999999996e-26  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.333251 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1247  von Willebrand factor, type A  30.61 
 
 
319 aa  118  9.999999999999999e-26  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.513072 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2088  von Willebrand factor type A  32.55 
 
 
318 aa  116  6.9999999999999995e-25  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11510  hypothetical protein  29.62 
 
 
335 aa  115  1.0000000000000001e-24  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.311165 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2406  von Willebrand factor type A  33 
 
 
325 aa  114  3e-24  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4905  hypothetical protein  33.44 
 
 
317 aa  113  5e-24  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.616891  normal  0.194429 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2300  hypothetical protein  29.97 
 
 
320 aa  113  6e-24  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00522588  hitchhiker  0.00113064 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0616  von Willebrand factor type A  30.99 
 
 
308 aa  112  8.000000000000001e-24  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.544287  normal  0.600223 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3026  von Willebrand factor, type A  32.19 
 
 
316 aa  112  8.000000000000001e-24  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.443806 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1481  von Willebrand factor type A  26.71 
 
 
332 aa  108  2e-22  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.587986  normal  0.160763 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1316  von Willebrand factor type A  28.88 
 
 
354 aa  107  2e-22  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0667351  normal  0.163551 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2206  BatA  27.65 
 
 
317 aa  106  7e-22  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0553658  normal  0.0945164 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0719  von Willebrand factor, type A  27.22 
 
 
334 aa  103  5e-21  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.887647  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02150  aerotolerance-related membrane protein  29.48 
 
 
334 aa  101  2e-20  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3252  von Willebrand factor type A  32.48 
 
 
316 aa  100  3e-20  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.152867  normal  0.990768 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1317  von Willebrand factor type A  30.83 
 
 
298 aa  100  4e-20  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0738378  normal  0.207209 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1806  hypothetical protein  28.31 
 
 
316 aa  100  5e-20  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.539334  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3037  hypothetical protein  27 
 
 
351 aa  98.6  1e-19  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2377  von Willebrand factor type A  31.99 
 
 
315 aa  98.2  2e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000270697  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1680  von Willebrand factor type A  28.18 
 
 
333 aa  97.4  3e-19  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.233991  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0254  hypothetical protein  28.94 
 
 
313 aa  95.1  1e-18  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.155283 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0603  von Willebrand factor, type A  27.86 
 
 
316 aa  94.7  2e-18  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.623778  normal  0.0597521 
 
 
-
 
NC_002950  PG1582  batA protein  28.24 
 
 
327 aa  93.6  5e-18  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1641  von Willebrand factor type A  27.22 
 
 
316 aa  93.2  6e-18  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1318  von Willebrand factor type A  32.5 
 
 
318 aa  92  1e-17  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.598912  normal  0.213186 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0796  von Willebrand factor type A  24.77 
 
 
328 aa  87.8  3e-16  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000000000131986  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1123  von Willebrand factor type A  29.03 
 
 
373 aa  86.7  6e-16  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0442  von Willebrand factor type A  28.79 
 
 
329 aa  84.7  0.000000000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.570722  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0430  hypothetical protein  27.11 
 
 
336 aa  84.7  0.000000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2396  von Willebrand factor type A  28.08 
 
 
377 aa  83.6  0.000000000000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.939741  normal  0.854107 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1106  hypothetical protein  26.8 
 
 
318 aa  82  0.00000000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2655  BatA-like protein, aerotolerance-related  25 
 
 
351 aa  80.1  0.00000000000006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3846  von Willebrand factor type A  24.85 
 
 
339 aa  78.2  0.0000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.341342  normal  0.622551 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4305  von Willebrand factor type A  30.08 
 
 
345 aa  78.2  0.0000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0935346 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1122  von Willebrand factor type A  23.86 
 
 
335 aa  78.6  0.0000000000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.51147  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0791  von Willebrand factor type A  30.08 
 
 
339 aa  75.5  0.000000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.719983  normal  0.0260765 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001269  protein BatA  27.9 
 
 
334 aa  74.7  0.000000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.687935  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1777  von Willebrand factor type A  25.44 
 
 
754 aa  73.9  0.000000000004  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.582496  normal  0.264323 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2914  hypothetical protein  27.51 
 
 
344 aa  73.2  0.000000000006  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0242  von Willebrand factor type A  25.91 
 
 
336 aa  73.2  0.000000000006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0239154  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3093  von Willebrand factor type A domain-containing protein  25.58 
 
 
338 aa  72.8  0.000000000008  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2768  hypothetical protein  27.51 
 
 
344 aa  72.8  0.000000000008  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1468  von Willebrand factor, type A  25.25 
 
 
338 aa  72  0.00000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00210714 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1456  von Willebrand factor, type A  25.25 
 
 
338 aa  72  0.00000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000144994 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0825  von Willebrand factor type A  29.02 
 
 
339 aa  72  0.00000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.431264  normal  0.379491 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2464  von Willebrand factor, type A  26.01 
 
 
339 aa  72  0.00000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02705  von Willebrand factor, type A  25.47 
 
 
349 aa  71.6  0.00000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0865  von Willebrand factor type A  29.02 
 
 
339 aa  71.6  0.00000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0877751  normal  0.04584 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3762  von Willebrand factor type A domain protein  27.54 
 
 
352 aa  70.9  0.00000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1659  von Willebrand factor, type A  25.43 
 
 
343 aa  70.1  0.00000000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.863974  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1403  von Willebrand factor, type A  24.92 
 
 
338 aa  70.1  0.00000000006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.520734  hitchhiker  0.0000232326 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1593  von Willebrand factor type A  25.68 
 
 
340 aa  69.3  0.00000000009  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000650656 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6107  von Willebrand factor type A  24.62 
 
 
359 aa  69.3  0.00000000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA3085  batB protein, putative  27.91 
 
 
328 aa  69.3  0.0000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1778  von Willebrand factor type A  27.27 
 
 
328 aa  68.6  0.0000000001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.357635  normal  0.258709 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0522  von Willebrand factor type A  24.62 
 
 
346 aa  69.3  0.0000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG1583  batB protein  26.97 
 
 
339 aa  68.6  0.0000000002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02145  hypothetical protein  26.95 
 
 
346 aa  68.6  0.0000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2765  von Willebrand factor type A  25.68 
 
 
339 aa  68.6  0.0000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.644793  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1718  von Willebrand factor, type A  27.51 
 
 
352 aa  67.4  0.0000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.060135  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05144  hypothetical protein  26.74 
 
 
334 aa  67.8  0.0000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2785  von Willebrand factor type A  25.34 
 
 
340 aa  67.4  0.0000000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2603  von Willebrand factor type A  24.91 
 
 
336 aa  67  0.0000000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2860  von Willebrand factor type A  25.34 
 
 
339 aa  67  0.0000000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.140424  normal  0.0110983 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1492  von Willebrand factor, type A  24.27 
 
 
892 aa  66.6  0.0000000006  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3031  von Willebrand factor type A  26.1 
 
 
330 aa  65.9  0.0000000009  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.239159  normal  0.0768499 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2067  hypothetical protein  28.74 
 
 
337 aa  65.9  0.000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4901  hypothetical protein  25 
 
 
330 aa  65.1  0.000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.908989  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2455  von Willebrand factor type A  23.51 
 
 
338 aa  64.7  0.000000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2932  von Willebrand factor, type A  29.25 
 
 
334 aa  64.3  0.000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.922939  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1948  von Willebrand factor, type A  26.57 
 
 
339 aa  63.5  0.000000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0524  hypothetical protein  26.97 
 
 
320 aa  63.5  0.000000006  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24400  von Willebrand factor type A domain-containing protein  28.74 
 
 
340 aa  63.5  0.000000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0690216  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1624  von Willebrand factor, type A  24.92 
 
 
330 aa  62.8  0.000000008  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000050495 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>