196 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_B4480 on replicon NC_007348
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007348  Reut_B4480  von Willebrand factor, type A  100 
 
 		 353 aa  689    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1646  von Willebrand factor, type A  77.97 
 
 		 354 aa  485  1e-136  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1241  von Willebrand factor type A  51.98 
 
 		 345 aa  314  1.9999999999999998e-84  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3247  von Willebrand factor, type A  52.82 
 
 		 354 aa  312  4.999999999999999e-84  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2317  von Willebrand factor type A  51.69 
 
 		 350 aa  278  8e-74  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3893  von Willebrand factor, type A  51.69 
 
 		 346 aa  278  1e-73  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.105671 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1061  von Willebrand factor, type A  50.9 
 
 		 355 aa  241  1e-62  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4476  von Willebrand factor, type A  41.97 
 
 		 358 aa  209  8e-53  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3038  von Willebrand factor type A  36.36 
 
 		 319 aa  177  3e-43  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1952  von Willebrand factor type A  32.86 
 
 		 315 aa  166  5e-40  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.159987  hitchhiker  0.00398429 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2634  von Willebrand factor type A  35.71 
 
 		 313 aa  157  3e-37  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2147  hypothetical protein  32.56 
 
 		 321 aa  155  7e-37  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.130278  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1797  von Willebrand factor type A  32.57 
 
 		 315 aa  155  1e-36  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.152806  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2300  hypothetical protein  35.47 
 
 		 320 aa  152  5.9999999999999996e-36  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00522588  hitchhiker  0.00113064 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22360  hypothetical protein  31.74 
 
 		 326 aa  151  2e-35  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0925694  normal  0.626592 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2406  von Willebrand factor type A  34.82 
 
 		 325 aa  148  1.0000000000000001e-34  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2080  von Willebrand factor type A  30.35 
 
 		 327 aa  148  2.0000000000000003e-34  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.829092  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1137  von Willebrand factor type A  32.13 
 
 		 319 aa  147  3e-34  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.178204  hitchhiker  0.0000350269 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1247  von Willebrand factor, type A  32.13 
 
 		 319 aa  147  4.0000000000000006e-34  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.513072 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1678  von Willebrand factor, type A  32.11 
 
 		 315 aa  145  1e-33  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.773902  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0616  von Willebrand factor type A  35.51 
 
 		 308 aa  144  2e-33  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.544287  normal  0.600223 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3659  hypothetical protein  30.98 
 
 		 335 aa  144  3e-33  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.542398  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2495  von Willebrand factor type A  30.35 
 
 		 316 aa  141  9.999999999999999e-33  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.142903  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2751  hypothetical protein  30.67 
 
 		 335 aa  138  1e-31  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.333251 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5131  von Willebrand factor type A  33.03 
 
 		 319 aa  136  4e-31  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.210447  normal  0.0623627 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1384  von Willebrand factor, type A  32.2 
 
 		 319 aa  135  9e-31  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.410804  hitchhiker  0.00717595 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3026  von Willebrand factor, type A  34.37 
 
 		 316 aa  134  1.9999999999999998e-30  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.443806 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4902  von Willebrand factor type A  35.29 
 
 		 319 aa  133  5e-30  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.745453  normal  0.578056 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2455  hypothetical protein  29.75 
 
 		 335 aa  133  6e-30  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.16032  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2500  hypothetical protein  29.75 
 
 		 335 aa  133  6e-30  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.672748  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2492  hypothetical protein  29.75 
 
 		 335 aa  133  6e-30  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.882923  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1316  von Willebrand factor type A  30.94 
 
 		 354 aa  130  4.0000000000000003e-29  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0667351  normal  0.163551 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2377  von Willebrand factor type A  32.02 
 
 		 315 aa  129  1.0000000000000001e-28  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000270697  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5503  von Willebrand factor, type A  28.99 
 
 		 315 aa  126  7e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0866133  normal  0.0446961 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3252  von Willebrand factor type A  34.08 
 
 		 316 aa  123  4e-27  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.152867  normal  0.990768 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11510  hypothetical protein  28.88 
 
 		 335 aa  122  9e-27  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.311165 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1317  von Willebrand factor type A  31.4 
 
 		 298 aa  121  1.9999999999999998e-26  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0738378  normal  0.207209 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2088  von Willebrand factor type A  31.9 
 
 		 318 aa  121  1.9999999999999998e-26  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1318  von Willebrand factor type A  32.82 
 
 		 318 aa  117  1.9999999999999998e-25  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.598912  normal  0.213186 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1680  von Willebrand factor type A  28.23 
 
 		 333 aa  117  3e-25  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.233991  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1641  von Willebrand factor type A  27.17 
 
 		 316 aa  115  1.0000000000000001e-24  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1806  hypothetical protein  30.77 
 
 		 316 aa  115  1.0000000000000001e-24  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.539334  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2206  BatA  27.98 
 
 		 317 aa  112  7.000000000000001e-24  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0553658  normal  0.0945164 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1481  von Willebrand factor type A  29.19 
 
 		 332 aa  112  9e-24  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.587986  normal  0.160763 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3037  hypothetical protein  26.9 
 
 		 351 aa  112  9e-24  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0719  von Willebrand factor, type A  27.17 
 
 		 334 aa  110  5e-23  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.887647  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02150  aerotolerance-related membrane protein  28.9 
 
 		 334 aa  105  1e-21  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6107  von Willebrand factor type A  30.79 
 
 		 359 aa  101  2e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0442  von Willebrand factor type A  30.21 
 
 		 329 aa  101  2e-20  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.570722  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1582  batA protein  31.02 
 
 		 327 aa  100  5e-20  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0796  von Willebrand factor type A  26.73 
 
 		 328 aa  96.3  8e-19  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000000000131986  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0254  hypothetical protein  28.66 
 
 		 313 aa  94.7  2e-18  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.155283 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4905  hypothetical protein  31.38 
 
 		 317 aa  93.6  5e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.616891  normal  0.194429 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0430  hypothetical protein  28.81 
 
 		 336 aa  92  1e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0603  von Willebrand factor, type A  27.01 
 
 		 316 aa  91.3  2e-17  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.623778  normal  0.0597521 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1123  von Willebrand factor type A  27.36 
 
 		 373 aa  85.5  0.000000000000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2655  BatA-like protein, aerotolerance-related  26.06 
 
 		 351 aa  84.7  0.000000000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0522  von Willebrand factor type A  28.13 
 
 		 346 aa  77  0.0000000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02705  von Willebrand factor, type A  27.22 
 
 		 349 aa  76.3  0.0000000000008  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0524  hypothetical protein  24.85 
 
 		 320 aa  71.2  0.00000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001269  protein BatA  25.15 
 
 		 334 aa  71.2  0.00000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.687935  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1811  von Willebrand factor type A  29.62 
 
 		 331 aa  70.5  0.00000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2603  von Willebrand factor type A  26.82 
 
 		 336 aa  70.5  0.00000000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1106  hypothetical protein  25.37 
 
 		 318 aa  69.3  0.00000000009  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1492  von Willebrand factor, type A  26.14 
 
 		 892 aa  68.2  0.0000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2439  von Willebrand factor type A  27.27 
 
 		 331 aa  68.6  0.0000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1525  von Willebrand factor, type A  27.27 
 
 		 330 aa  67.4  0.0000000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4901  hypothetical protein  25.6 
 
 		 330 aa  67.4  0.0000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.908989  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3846  von Willebrand factor type A  26.94 
 
 		 339 aa  66.6  0.0000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.341342  normal  0.622551 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1403  von Willebrand factor, type A  26.97 
 
 		 338 aa  64.7  0.000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.520734  hitchhiker  0.0000232326 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0242  von Willebrand factor type A  28.63 
 
 		 336 aa  65.1  0.000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0239154  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0523  von Willebrand factor type A  29.29 
 
 		 344 aa  65.1  0.000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1593  von Willebrand factor type A  26.79 
 
 		 340 aa  64.3  0.000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000650656 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3762  von Willebrand factor type A domain protein  26.11 
 
 		 352 aa  63.9  0.000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1744  BatB protein, putative  37.4 
 
 		 341 aa  63.9  0.000000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2464  von Willebrand factor, type A  26.79 
 
 		 339 aa  63.9  0.000000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2785  von Willebrand factor type A  26.42 
 
 		 340 aa  63.9  0.000000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2860  von Willebrand factor type A  26.42 
 
 		 339 aa  63.2  0.000000006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.140424  normal  0.0110983 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02145  hypothetical protein  25.56 
 
 		 346 aa  63.2  0.000000006  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1468  von Willebrand factor, type A  26.59 
 
 		 338 aa  63.2  0.000000007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00210714 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1456  von Willebrand factor, type A  26.59 
 
 		 338 aa  63.2  0.000000007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000144994 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2765  von Willebrand factor type A  26.42 
 
 		 339 aa  62.8  0.000000008  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.644793  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2292  von Willebrand factor type A  26.74 
 
 		 325 aa  62  0.00000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3031  von Willebrand factor type A  24.6 
 
 		 330 aa  61.6  0.00000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.239159  normal  0.0768499 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05144  hypothetical protein  26.59 
 
 		 334 aa  61.6  0.00000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1718  von Willebrand factor, type A  36.26 
 
 		 352 aa  60.8  0.00000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.060135  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2319  von Willebrand factor type A  26.37 
 
 		 331 aa  60.5  0.00000004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2430  von Willebrand factor, type A  27.44 
 
 		 339 aa  60.5  0.00000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0141267 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2067  hypothetical protein  41.67 
 
 		 337 aa  60.8  0.00000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3211  von Willebrand factor, type A  25.44 
 
 		 359 aa  60.5  0.00000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.161906 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2681  von Willebrand factor, type A  26.04 
 
 		 334 aa  60.1  0.00000006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1583  batB protein  24.42 
 
 		 339 aa  59.7  0.00000007  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1017  von Willebrand factor type A; type II secretion system protein  26.8 
 
 		 643 aa  59.7  0.00000007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3093  von Willebrand factor type A domain-containing protein  26.22 
 
 		 338 aa  59.7  0.00000007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1482  von Willebrand factor type A  30.97 
 
 		 344 aa  59.7  0.00000007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.428182  normal  0.250576 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0073  von Willebrand factor, type A  23.62 
 
 		 349 aa  59.7  0.00000008  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1624  von Willebrand factor, type A  31.67 
 
 		 330 aa  59.3  0.00000009  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000050495 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24400  von Willebrand factor type A domain-containing protein  40.48 
 
 		 340 aa  59.3  0.0000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0690216  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0852  von Willebrand factor type A  27.66 
 
 		 345 aa  58.9  0.0000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.591496  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2029  von Willebrand factor type A domain-containing protein  37.38 
 
 		 358 aa  58.2  0.0000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.34439  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>