149 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrub_1316 on replicon NC_013946
Organism: Meiothermus ruber DSM 1279



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013946  Mrub_1316  von Willebrand factor type A  100 
 
 		 354 aa  699    Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0667351  normal  0.163551 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3037  hypothetical protein  60.33 
 
 		 351 aa  387  1e-106  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1247  von Willebrand factor, type A  32.14 
 
 		 319 aa  143  4e-33  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.513072 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1137  von Willebrand factor type A  31.85 
 
 		 319 aa  142  8e-33  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.178204  hitchhiker  0.0000350269 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1241  von Willebrand factor type A  32.97 
 
 		 345 aa  140  4.999999999999999e-32  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2080  von Willebrand factor type A  30.7 
 
 		 327 aa  136  6.0000000000000005e-31  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.829092  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2495  von Willebrand factor type A  30.57 
 
 		 316 aa  132  6.999999999999999e-30  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.142903  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3659  hypothetical protein  28.44 
 
 		 335 aa  130  4.0000000000000003e-29  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.542398  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2751  hypothetical protein  29.05 
 
 		 335 aa  129  9.000000000000001e-29  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.333251 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0616  von Willebrand factor type A  30.92 
 
 		 308 aa  127  4.0000000000000003e-28  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.544287  normal  0.600223 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2455  hypothetical protein  29.36 
 
 		 335 aa  126  6e-28  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.16032  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2500  hypothetical protein  29.36 
 
 		 335 aa  126  6e-28  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.672748  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2492  hypothetical protein  29.36 
 
 		 335 aa  126  6e-28  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.882923  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2147  hypothetical protein  30.25 
 
 		 321 aa  125  7e-28  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.130278  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2300  hypothetical protein  31.31 
 
 		 320 aa  125  8.000000000000001e-28  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00522588  hitchhiker  0.00113064 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1797  von Willebrand factor type A  29.23 
 
 		 315 aa  125  2e-27  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.152806  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2634  von Willebrand factor type A  30.45 
 
 		 313 aa  123  5e-27  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3038  von Willebrand factor type A  32.9 
 
 		 319 aa  122  7e-27  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1646  von Willebrand factor, type A  28.85 
 
 		 354 aa  122  9.999999999999999e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3247  von Willebrand factor, type A  28.28 
 
 		 354 aa  121  1.9999999999999998e-26  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1678  von Willebrand factor, type A  30.72 
 
 		 315 aa  120  3e-26  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.773902  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11510  hypothetical protein  28.79 
 
 		 335 aa  120  4.9999999999999996e-26  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.311165 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5131  von Willebrand factor type A  30.42 
 
 		 319 aa  119  7e-26  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.210447  normal  0.0623627 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5503  von Willebrand factor, type A  30.42 
 
 		 315 aa  114  2.0000000000000002e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0866133  normal  0.0446961 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22360  hypothetical protein  29.57 
 
 		 326 aa  114  3e-24  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0925694  normal  0.626592 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4902  von Willebrand factor type A  32.25 
 
 		 319 aa  113  4.0000000000000004e-24  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.745453  normal  0.578056 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3893  von Willebrand factor, type A  32.15 
 
 		 346 aa  112  1.0000000000000001e-23  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.105671 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3026  von Willebrand factor, type A  30.64 
 
 		 316 aa  111  2.0000000000000002e-23  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.443806 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2377  von Willebrand factor type A  30.79 
 
 		 315 aa  111  2.0000000000000002e-23  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000270697  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1952  von Willebrand factor type A  27.36 
 
 		 315 aa  110  3e-23  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.159987  hitchhiker  0.00398429 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4480  von Willebrand factor, type A  30.94 
 
 		 353 aa  110  4.0000000000000004e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1384  von Willebrand factor, type A  29.69 
 
 		 319 aa  110  4.0000000000000004e-23  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.410804  hitchhiker  0.00717595 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2406  von Willebrand factor type A  31.56 
 
 		 325 aa  106  5e-22  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4476  von Willebrand factor, type A  28.88 
 
 		 358 aa  104  2e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2317  von Willebrand factor type A  31.46 
 
 		 350 aa  103  5e-21  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1481  von Willebrand factor type A  28.7 
 
 		 332 aa  98.6  2e-19  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.587986  normal  0.160763 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2088  von Willebrand factor type A  27.52 
 
 		 318 aa  97.1  5e-19  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1318  von Willebrand factor type A  30.63 
 
 		 318 aa  96.7  6e-19  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.598912  normal  0.213186 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1061  von Willebrand factor, type A  28.52 
 
 		 355 aa  94.4  3e-18  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3252  von Willebrand factor type A  28.03 
 
 		 316 aa  92  1e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.152867  normal  0.990768 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0719  von Willebrand factor, type A  25.4 
 
 		 334 aa  89.4  9e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.887647  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02150  aerotolerance-related membrane protein  26.32 
 
 		 334 aa  85.1  0.000000000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4905  hypothetical protein  25 
 
 		 317 aa  84  0.000000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.616891  normal  0.194429 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2206  BatA  23.49 
 
 		 317 aa  81.3  0.00000000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0553658  normal  0.0945164 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1641  von Willebrand factor type A  24.43 
 
 		 316 aa  80.1  0.00000000000005  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1806  hypothetical protein  26.88 
 
 		 316 aa  77  0.0000000000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.539334  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1317  von Willebrand factor type A  24.61 
 
 		 298 aa  73.6  0.000000000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0738378  normal  0.207209 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0796  von Willebrand factor type A  26.96 
 
 		 328 aa  72.4  0.00000000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000000000131986  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1680  von Willebrand factor type A  24.64 
 
 		 333 aa  72  0.00000000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.233991  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1582  batA protein  26.62 
 
 		 327 aa  70.9  0.00000000003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0442  von Willebrand factor type A  27.05 
 
 		 329 aa  71.2  0.00000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.570722  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0430  hypothetical protein  27.68 
 
 		 336 aa  70.9  0.00000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000305  TPR domain protein in aerotolerance operon  28.21 
 
 		 576 aa  67.8  0.0000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0603  von Willebrand factor, type A  21.94 
 
 		 316 aa  67.8  0.0000000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.623778  normal  0.0597521 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0254  hypothetical protein  23.99 
 
 		 313 aa  65.1  0.000000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.155283 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2396  von Willebrand factor type A  27.62 
 
 		 377 aa  64.7  0.000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.939741  normal  0.854107 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1777  von Willebrand factor type A  27.11 
 
 		 754 aa  63.9  0.000000004  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.582496  normal  0.264323 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3054  TPR repeat-containing protein  29.33 
 
 		 533 aa  62  0.00000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.350986  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4900  von Willebrand factor type A  29.01 
 
 		 337 aa  62  0.00000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4901  hypothetical protein  24.63 
 
 		 330 aa  60.5  0.00000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.908989  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1123  von Willebrand factor type A  26.32 
 
 		 373 aa  60.5  0.00000004  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1482  von Willebrand factor type A  26.34 
 
 		 344 aa  58.2  0.0000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.428182  normal  0.250576 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6107  von Willebrand factor type A  28.77 
 
 		 359 aa  57.8  0.0000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5138  von Willebrand factor type A  26.67 
 
 		 329 aa  57.4  0.0000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.585465 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0657  von Willebrand factor, type A  34 
 
 		 595 aa  56.2  0.0000008  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.676457  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3846  von Willebrand factor type A  27.04 
 
 		 339 aa  55.8  0.000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.341342  normal  0.622551 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0173  von Willebrand factor type A domain protein  22.51 
 
 		 333 aa  55.1  0.000002  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.0526529  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1538  von Willebrand factor type A  34.3 
 
 		 347 aa  54.3  0.000003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.634535  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02145  hypothetical protein  31.2 
 
 		 346 aa  52.8  0.000008  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1122  von Willebrand factor type A  23.66 
 
 		 335 aa  53.1  0.000008  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.51147  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1583  batB protein  30.25 
 
 		 339 aa  52.8  0.000009  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1754  von Willebrand factor, type A  38.96 
 
 		 327 aa  52.8  0.000009  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.294878  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3801  von Willebrand factor type A  26.52 
 
 		 334 aa  52.4  0.00001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.142641  normal  0.822741 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0523  hypothetical protein  29.26 
 
 		 619 aa  52.8  0.00001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0648  von Willebrand factor, type A  22.71 
 
 		 307 aa  52  0.00002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1658  TPR repeat-containing protein  31.41 
 
 		 647 aa  51.2  0.00003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.95456  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2438  von Willebrand factor type A  39.18 
 
 		 315 aa  51.2  0.00003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4305  von Willebrand factor type A  24.6 
 
 		 345 aa  50.8  0.00003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0935346 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1811  von Willebrand factor type A  26.77 
 
 		 331 aa  50.8  0.00003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA3085  batB protein, putative  28.08 
 
 		 328 aa  50.4  0.00005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3093  von Willebrand factor type A domain-containing protein  25.38 
 
 		 338 aa  50.1  0.00005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0242  von Willebrand factor type A  29.38 
 
 		 336 aa  50.4  0.00005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0239154  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0250  hypothetical protein  35.56 
 
 		 634 aa  50.1  0.00006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.615952  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0098  von Willebrand factor, type A  25 
 
 		 363 aa  49.7  0.00009  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0099  von Willebrand factor, type A  25.17 
 
 		 651 aa  48.9  0.0001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2455  von Willebrand factor type A  21.43 
 
 		 338 aa  48.9  0.0001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2318  von Willebrand factor type A  24.92 
 
 		 339 aa  48.9  0.0001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001268  TPR domain protein in aerotolerance operon  25 
 
 		 599 aa  49.3  0.0001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1890  hypothetical protein  31.51 
 
 		 644 aa  48.1  0.0002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.543078 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1733  von Willebrand factor type A  24.44 
 
 		 342 aa  48.1  0.0002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.818001  normal  0.561199 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2319  von Willebrand factor type A  33.58 
 
 		 331 aa  48.5  0.0002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0523  von Willebrand factor type A  32.19 
 
 		 344 aa  47.8  0.0003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3278  von Willebrand factor domain-containing protein  28.69 
 
 		 328 aa  47.8  0.0003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.173273  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0051  von Willebrand factor type A  26.24 
 
 		 325 aa  47.8  0.0003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.901325  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2785  von Willebrand factor type A  25.76 
 
 		 340 aa  47.4  0.0003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0012  YD repeat protein  35.44 
 
 		 3027 aa  47.4  0.0004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2682  TPR repeat-containing protein  29.22 
 
 		 701 aa  47.4  0.0004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2816  TPR repeat-containing protein  29.03 
 
 		 657 aa  47.4  0.0004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0044  von Willebrand factor type A  28.12 
 
 		 606 aa  47.4  0.0004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1732  TPR repeat-containing protein  27.91 
 
 		 587 aa  47  0.0005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.966886  normal  0.26357 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>