279 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ping_2816 on replicon NC_008709
Organism: Psychromonas ingrahamii 37



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008709  Ping_2816  TPR repeat-containing protein  100 
 
 		 657 aa  1322    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1623  TPR repeat-containing protein  37.08 
 
 		 644 aa  370  1e-101  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000210321 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1658  TPR repeat-containing protein  37.84 
 
 		 647 aa  361  3e-98  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.95456  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3032  TPR repeat-containing protein  36.2 
 
 		 650 aa  332  1e-89  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.198571  normal  0.0885065 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2682  TPR repeat-containing protein  34.41 
 
 		 701 aa  327  5e-88  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2465  TPR repeat-containing protein  35.98 
 
 		 663 aa  320  5e-86  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1743  TPR domain-containing protein  35.38 
 
 		 658 aa  319  1e-85  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2766  TPR repeat-containing protein  35.1 
 
 		 690 aa  314  3.9999999999999997e-84  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2861  TPR repeat-containing protein  35.24 
 
 		 692 aa  313  5.999999999999999e-84  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0393834 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2431  TPR repeat-containing protein  35.29 
 
 		 693 aa  308  2.0000000000000002e-82  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0167557 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1592  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  33.84 
 
 		 692 aa  308  3e-82  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000228279 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3094  TPR domain-containing protein  33.62 
 
 		 679 aa  304  3.0000000000000004e-81  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2786  TPR repeat-containing protein  35.15 
 
 		 693 aa  296  9e-79  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1107  hypothetical protein  33.33 
 
 		 646 aa  293  1e-77  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1402  TPR repeat-containing protein  33.76 
 
 		 681 aa  280  7e-74  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000103328 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2604  TPR repeat-containing protein  35.43 
 
 		 653 aa  278  3e-73  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1524  TPR repeat-containing protein  34.77 
 
 		 691 aa  276  9e-73  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1467  TPR repeat-containing protein  33.76 
 
 		 687 aa  275  1.0000000000000001e-72  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.510289  hitchhiker  0.00291188 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3163  TPR domain-containing protein  34.74 
 
 		 690 aa  274  3e-72  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.185864  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0072  TPR repeat-containing protein  30.7 
 
 		 664 aa  275  3e-72  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2173  TPR domain-containing protein  30.92 
 
 		 701 aa  275  3e-72  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.081888 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02344  tetratricopeptide repeat domain protein  30.73 
 
 		 607 aa  273  6e-72  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0523  hypothetical protein  36.26 
 
 		 619 aa  267  5e-70  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05143  hypothetical protein  36.59 
 
 		 601 aa  265  2e-69  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001268  TPR domain protein in aerotolerance operon  35.48 
 
 		 599 aa  265  3e-69  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1455  TPR repeat-containing protein  37.82 
 
 		 690 aa  257  5e-67  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000000112359 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1949  TPR repeat-containing protein  32.65 
 
 		 612 aa  242  2e-62  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.931925  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02706  TPR domain protein  42.23 
 
 		 667 aa  229  1e-58  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA3086  TPR domain-containing protein  28.67 
 
 		 579 aa  218  2e-55  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.503806  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3231  TPR repeat-containing protein  27.2 
 
 		 612 aa  209  1e-52  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.439888  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3802  TPR repeat-containing protein  31.4 
 
 		 522 aa  200  6e-50  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.292136  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1732  TPR repeat-containing protein  26.76 
 
 		 587 aa  197  5.000000000000001e-49  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.966886  normal  0.26357 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3763  TPR domain protein  30.93 
 
 		 572 aa  181  2.9999999999999997e-44  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.519367  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1717  TPR repeat-containing von Willebrand factor, type A  28.96 
 
 		 572 aa  181  5.999999999999999e-44  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5137  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  28.75 
 
 		 517 aa  178  2e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.398593  normal  0.644601 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1560  TPR repeat-containing protein  29.98 
 
 		 571 aa  177  4e-43  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.535158 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3714  TPR repeat-containing protein  28.35 
 
 		 572 aa  173  6.999999999999999e-42  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.325605  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2933  TPR repeat-containing protein  27.7 
 
 		 588 aa  172  1e-41  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2028  TPR domain-containing protein  28.16 
 
 		 572 aa  171  3e-41  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2139  hypothetical protein  28.54 
 
 		 530 aa  171  3e-41  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.488109  decreased coverage  0.00345429 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_18790  tetratricopeptide (TPR) repeat and VWA domain-containing protein  30.05 
 
 		 577 aa  166  9e-40  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.00254687  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3054  TPR repeat-containing protein  29.71 
 
 		 533 aa  166  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.350986  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2887  tetratricopeptide TPR_4  28.02 
 
 		 544 aa  165  2.0000000000000002e-39  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0337019  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0853  TPR repeat-containing protein  26.08 
 
 		 680 aa  161  4e-38  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3212  hypothetical protein  27.22 
 
 		 578 aa  159  2e-37  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.190926 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1588  TPR repeat-containing protein  29.89 
 
 		 572 aa  157  7e-37  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00107949 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2066  hypothetical protein  29.54 
 
 		 585 aa  150  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24390  TPR domain-containing protein  30.63 
 
 		 586 aa  147  5e-34  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00557521  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3117  hypothetical protein  25.49 
 
 		 503 aa  147  8.000000000000001e-34  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.10336  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000305  TPR domain protein in aerotolerance operon  24.91 
 
 		 576 aa  144  6e-33  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0657  von Willebrand factor, type A  25.33 
 
 		 595 aa  138  3.0000000000000003e-31  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.676457  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3555  von Willebrand factor, type A  25.77 
 
 		 573 aa  131  3e-29  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3385  von Willebrand factor, type A  24.95 
 
 		 573 aa  129  2.0000000000000002e-28  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.465184 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0568  von Willebrand factor, type A  25.51 
 
 		 573 aa  127  7e-28  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2767  hypothetical protein  37.2 
 
 		 310 aa  125  2e-27  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4531  hypothetical protein  25.66 
 
 		 531 aa  126  2e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.536979  normal  0.0526442 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2913  hypothetical protein  36.71 
 
 		 310 aa  124  4e-27  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0649  von Willebrand factor, type A  26.34 
 
 		 471 aa  112  2.0000000000000002e-23  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2395  von Willebrand factor type A  28.74 
 
 		 611 aa  112  2.0000000000000002e-23  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.850853  normal  0.642372 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0906  von Willebrand factor type A  32.07 
 
 		 345 aa  97.4  7e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.519509  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1122  von Willebrand factor type A  26.63 
 
 		 335 aa  86.7  0.000000000000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.51147  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5536  collagen adhesion protein  52.53 
 
 		 3392 aa  85.1  0.000000000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0099  von Willebrand factor, type A  25.45 
 
 		 651 aa  85.1  0.000000000000004  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1482  von Willebrand factor type A  25.94 
 
 		 344 aa  84.7  0.000000000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.428182  normal  0.250576 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5637  1A family penicillin-binding protein  47.37 
 
 		 794 aa  84.7  0.000000000000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.751111  normal  0.833891 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0720  von Willebrand factor, type A  29.9 
 
 		 344 aa  82.4  0.00000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.799777  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5487  cell wall anchor domain-containing protein  38.89 
 
 		 3242 aa  81.6  0.00000000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1740  hypothetical protein  29.86 
 
 		 564 aa  79.3  0.0000000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5483  von Willebrand factor type A  28.63 
 
 		 320 aa  79  0.0000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1481  von Willebrand factor type A  28.77 
 
 		 332 aa  78.6  0.0000000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.587986  normal  0.160763 
 
 
-
 
NC_002950  PG1583  batB protein  30.99 
 
 		 339 aa  78.2  0.0000000000005  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2318  von Willebrand factor type A  26.1 
 
 		 339 aa  77.4  0.0000000000007  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02145  hypothetical protein  28.07 
 
 		 346 aa  73.9  0.000000000007  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1205  hypothetical protein  27.84 
 
 		 304 aa  73.6  0.00000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1887  von Willebrand factor, type A  29.76 
 
 		 334 aa  72  0.00000000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.615946  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1538  von Willebrand factor type A  29.35 
 
 		 347 aa  71.2  0.00000000006  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.634535  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2923  cell wall surface anchor family protein  41.49 
 
 		 746 aa  68.9  0.0000000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0441  von Willebrand factor type A  42.31 
 
 		 339 aa  67  0.000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.126065  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0430  hypothetical protein  27.45 
 
 		 336 aa  66.6  0.000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2291  von Willebrand factor type A  30.45 
 
 		 340 aa  65.9  0.000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0052  von Willebrand factor type A  26.8 
 
 		 589 aa  65.1  0.000000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.649054  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1582  batA protein  26.27 
 
 		 327 aa  64.3  0.000000006  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0173  von Willebrand factor type A domain protein  27.47 
 
 		 333 aa  63.9  0.000000009  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.0526529  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0719  von Willebrand factor, type A  25.96 
 
 		 334 aa  63.2  0.00000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.887647  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1388  TPR repeat-containing protein  20.65 
 
 		 298 aa  62.8  0.00000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0606731  normal  0.0848814 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0442  von Willebrand factor type A  30.41 
 
 		 329 aa  62.8  0.00000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.570722  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1777  von Willebrand factor type A  25.19 
 
 		 754 aa  62  0.00000003  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.582496  normal  0.264323 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1680  von Willebrand factor type A  32.5 
 
 		 333 aa  60.8  0.00000007  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.233991  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2667  von Willebrand factor type A  27.64 
 
 		 320 aa  60.8  0.00000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0137073  normal  0.240647 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2655  BatA-like protein, aerotolerance-related  33.06 
 
 		 351 aa  60.8  0.00000008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3846  von Willebrand factor type A  25.93 
 
 		 339 aa  60.8  0.00000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.341342  normal  0.622551 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0523  von Willebrand factor type A  28.39 
 
 		 344 aa  60.1  0.0000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4901  hypothetical protein  25.36 
 
 		 330 aa  58.5  0.0000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.908989  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0243  von Willebrand factor type A  24.79 
 
 		 343 aa  57  0.000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0131225  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2451  von Willebrand factor, type A  26.79 
 
 		 337 aa  56.6  0.000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4303  TPR repeat-containing protein  21.28 
 
 		 306 aa  56.2  0.000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.341118  normal  0.0662026 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2626  TPR repeat-containing protein  49.09 
 
 		 169 aa  56.2  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2438  von Willebrand factor type A  28.11 
 
 		 315 aa  56.6  0.000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2455  von Willebrand factor type A  28.96 
 
 		 338 aa  56.2  0.000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1483  TPR repeat-containing protein  30.4 
 
 		 221 aa  55.1  0.000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>