199 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Suden_0649 on replicon NC_007575
Organism: Sulfurimonas denitrificans DSM 1251



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007575  Suden_0649  von Willebrand factor, type A  100 
 
 		 471 aa  942    Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0657  von Willebrand factor, type A  27.83 
 
 		 595 aa  143  8e-33  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.676457  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3032  TPR repeat-containing protein  26.22 
 
 		 650 aa  123  7e-27  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.198571  normal  0.0885065 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2682  TPR repeat-containing protein  25.84 
 
 		 701 aa  110  5e-23  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1743  TPR domain-containing protein  25.79 
 
 		 658 aa  108  2e-22  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1623  TPR repeat-containing protein  22.57 
 
 		 644 aa  108  2e-22  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000210321 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2816  TPR repeat-containing protein  25.65 
 
 		 657 aa  105  1e-21  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0523  hypothetical protein  23.5 
 
 		 619 aa  100  6e-20  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2431  TPR repeat-containing protein  24.55 
 
 		 693 aa  98.6  2e-19  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0167557 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1455  TPR repeat-containing protein  23.43 
 
 		 690 aa  95.5  2e-18  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000000112359 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1122  von Willebrand factor type A  30.6 
 
 		 335 aa  94  5e-18  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.51147  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02344  tetratricopeptide repeat domain protein  22.65 
 
 		 607 aa  94  6e-18  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2395  von Willebrand factor type A  28.35 
 
 		 611 aa  92.8  1e-17  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.850853  normal  0.642372 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5137  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  24.31 
 
 		 517 aa  92.8  1e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.398593  normal  0.644601 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3163  TPR domain-containing protein  29.91 
 
 		 690 aa  92.4  2e-17  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.185864  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3094  TPR domain-containing protein  22.7 
 
 		 679 aa  92.4  2e-17  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1732  TPR repeat-containing protein  22.47 
 
 		 587 aa  91.3  3e-17  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.966886  normal  0.26357 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2604  TPR repeat-containing protein  24.36 
 
 		 653 aa  90.9  5e-17  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0906  von Willebrand factor type A  30.26 
 
 		 345 aa  89.7  1e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.519509  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1107  hypothetical protein  23.81 
 
 		 646 aa  88.6  2e-16  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05143  hypothetical protein  22.93 
 
 		 601 aa  89  2e-16  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1949  TPR repeat-containing protein  20.57 
 
 		 612 aa  87.4  5e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.931925  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001268  TPR domain protein in aerotolerance operon  22.94 
 
 		 599 aa  86.7  9e-16  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2173  TPR domain-containing protein  20.45 
 
 		 701 aa  85.1  0.000000000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.081888 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0072  TPR repeat-containing protein  22.51 
 
 		 664 aa  84.3  0.000000000000004  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3231  TPR repeat-containing protein  22.44 
 
 		 612 aa  84  0.000000000000006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.439888  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3802  TPR repeat-containing protein  22.43 
 
 		 522 aa  83.6  0.000000000000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.292136  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1592  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  21.61 
 
 		 692 aa  83.2  0.00000000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000228279 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2861  TPR repeat-containing protein  21.36 
 
 		 692 aa  82  0.00000000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0393834 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2887  tetratricopeptide TPR_4  23.36 
 
 		 544 aa  81.6  0.00000000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0337019  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2766  TPR repeat-containing protein  21.36 
 
 		 690 aa  81.6  0.00000000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1524  TPR repeat-containing protein  25.46 
 
 		 691 aa  80.9  0.00000000000005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1658  TPR repeat-containing protein  22.06 
 
 		 647 aa  80.5  0.00000000000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.95456  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02706  TPR domain protein  25.22 
 
 		 667 aa  79.3  0.0000000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1402  TPR repeat-containing protein  23.44 
 
 		 681 aa  78.6  0.0000000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000103328 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1467  TPR repeat-containing protein  23.44 
 
 		 687 aa  78.6  0.0000000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.510289  hitchhiker  0.00291188 
 
 
-
 
NC_002950  PG1583  batB protein  25.23 
 
 		 339 aa  78.2  0.0000000000003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0523  von Willebrand factor type A  29.11 
 
 		 344 aa  78.2  0.0000000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5483  von Willebrand factor type A  28.63 
 
 		 320 aa  77  0.0000000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0720  von Willebrand factor, type A  29.05 
 
 		 344 aa  76.6  0.0000000000009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.799777  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1777  von Willebrand factor type A  22.54 
 
 		 754 aa  75.9  0.000000000001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.582496  normal  0.264323 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2455  von Willebrand factor type A  26.1 
 
 		 338 aa  75.9  0.000000000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4900  von Willebrand factor type A  28.52 
 
 		 337 aa  76.3  0.000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3054  TPR repeat-containing protein  26.24 
 
 		 533 aa  75.1  0.000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.350986  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2786  TPR repeat-containing protein  22.27 
 
 		 693 aa  74.7  0.000000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2465  TPR repeat-containing protein  19.9 
 
 		 663 aa  74.3  0.000000000005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2139  hypothetical protein  22.91 
 
 		 530 aa  73.9  0.000000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.488109  decreased coverage  0.00345429 
 
 
-
 
NC_002977  MCA3086  TPR domain-containing protein  21.25 
 
 		 579 aa  72  0.00000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.503806  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2318  von Willebrand factor type A  23.86 
 
 		 339 aa  72  0.00000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2655  BatA-like protein, aerotolerance-related  27.31 
 
 		 351 aa  71.2  0.00000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1482  von Willebrand factor type A  21.91 
 
 		 344 aa  70.9  0.00000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.428182  normal  0.250576 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_18790  tetratricopeptide (TPR) repeat and VWA domain-containing protein  29.32 
 
 		 577 aa  70.9  0.00000000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.00254687  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2438  von Willebrand factor type A  27.38 
 
 		 315 aa  70.5  0.00000000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02145  hypothetical protein  25.46 
 
 		 346 aa  68.2  0.0000000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1717  TPR repeat-containing von Willebrand factor, type A  20.77 
 
 		 572 aa  67.8  0.0000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1887  von Willebrand factor, type A  26.82 
 
 		 334 aa  67.4  0.0000000005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.615946  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4531  hypothetical protein  26.75 
 
 		 531 aa  67.4  0.0000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.536979  normal  0.0526442 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1733  von Willebrand factor type A  24.05 
 
 		 342 aa  66.2  0.000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.818001  normal  0.561199 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0242  von Willebrand factor type A  26.81 
 
 		 336 aa  65.9  0.000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0239154  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0099  von Willebrand factor, type A  20.89 
 
 		 651 aa  64.7  0.000000003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1560  TPR repeat-containing protein  23.83 
 
 		 571 aa  65.1  0.000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.535158 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6107  von Willebrand factor type A  30.73 
 
 		 359 aa  65.1  0.000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2028  TPR domain-containing protein  23.36 
 
 		 572 aa  64.7  0.000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3714  TPR repeat-containing protein  23.36 
 
 		 572 aa  64.7  0.000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.325605  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2667  von Willebrand factor type A  24.58 
 
 		 320 aa  64.7  0.000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0137073  normal  0.240647 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2085  von Willebrand factor type A  28.7 
 
 		 336 aa  64.3  0.000000005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24390  TPR domain-containing protein  20.57 
 
 		 586 aa  63.5  0.000000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00557521  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0796  von Willebrand factor type A  26.13 
 
 		 328 aa  62.8  0.00000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000000000131986  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3846  von Willebrand factor type A  29.92 
 
 		 339 aa  62.4  0.00000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.341342  normal  0.622551 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0441  von Willebrand factor type A  30.08 
 
 		 339 aa  62  0.00000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.126065  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1123  von Willebrand factor type A  24.3 
 
 		 373 aa  62.4  0.00000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1538  von Willebrand factor type A  25.98 
 
 		 347 aa  62  0.00000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.634535  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0719  von Willebrand factor, type A  22.63 
 
 		 334 aa  62  0.00000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.887647  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1106  hypothetical protein  25.19 
 
 		 318 aa  62  0.00000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3093  von Willebrand factor type A domain-containing protein  22.59 
 
 		 338 aa  61.2  0.00000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0852  von Willebrand factor type A  26.44 
 
 		 345 aa  60.8  0.00000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.591496  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1739  von Willebrand factor type A  30.43 
 
 		 328 aa  60.5  0.00000006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4901  hypothetical protein  21.45 
 
 		 330 aa  60.5  0.00000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.908989  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2464  von Willebrand factor, type A  23.05 
 
 		 339 aa  60.1  0.00000008  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1588  TPR repeat-containing protein  24.72 
 
 		 572 aa  59.7  0.0000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00107949 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2860  von Willebrand factor type A  22.3 
 
 		 339 aa  59.7  0.0000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.140424  normal  0.0110983 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2765  von Willebrand factor type A  21.93 
 
 		 339 aa  59.3  0.0000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.644793  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1247  von Willebrand factor, type A  24.2 
 
 		 319 aa  59.3  0.0000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.513072 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2933  TPR repeat-containing protein  21.84 
 
 		 588 aa  59.3  0.0000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2785  von Willebrand factor type A  22.3 
 
 		 340 aa  60.1  0.0000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1137  von Willebrand factor type A  24.07 
 
 		 319 aa  58.9  0.0000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.178204  hitchhiker  0.0000350269 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3211  von Willebrand factor, type A  27.61 
 
 		 359 aa  58.9  0.0000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.161906 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2080  von Willebrand factor type A  23.1 
 
 		 327 aa  58.5  0.0000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.829092  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1593  von Willebrand factor type A  22.3 
 
 		 340 aa  58.9  0.0000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000650656 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2681  von Willebrand factor, type A  24.21 
 
 		 334 aa  59.3  0.0000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02345  von Willebrand factor type A domain protein  26.22 
 
 		 335 aa  58.9  0.0000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1250  batA protein, putative  26.18 
 
 		 332 aa  58.5  0.0000003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.367863  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2319  von Willebrand factor type A  29.1 
 
 		 331 aa  58.5  0.0000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0853  TPR repeat-containing protein  22.11 
 
 		 680 aa  58.2  0.0000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3763  TPR domain protein  20.6 
 
 		 572 aa  57.8  0.0000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.519367  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1797  von Willebrand factor type A  22.63 
 
 		 315 aa  58.2  0.0000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.152806  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0243  von Willebrand factor type A  26.67 
 
 		 343 aa  57.4  0.0000005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0131225  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1481  von Willebrand factor type A  22.05 
 
 		 332 aa  57.4  0.0000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.587986  normal  0.160763 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1624  von Willebrand factor, type A  20.96 
 
 		 330 aa  57.4  0.0000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000050495 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1525  von Willebrand factor, type A  25.99 
 
 		 330 aa  57  0.0000006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>