213 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cag_1887 on replicon NC_007514
Organism: Chlorobium chlorochromatii CaD3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007514  Cag_1887  von Willebrand factor, type A  100 
 
 		 334 aa  675    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.615946  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0243  von Willebrand factor type A  47.48 
 
 		 343 aa  291  8e-78  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0131225  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2318  von Willebrand factor type A  38.92 
 
 		 339 aa  207  3e-52  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2451  von Willebrand factor, type A  39.74 
 
 		 337 aa  201  9.999999999999999e-51  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2291  von Willebrand factor type A  40.58 
 
 		 340 aa  193  4e-48  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2085  von Willebrand factor type A  38.87 
 
 		 336 aa  165  1.0000000000000001e-39  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02145  hypothetical protein  29.8 
 
 		 346 aa  141  1.9999999999999998e-32  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1482  von Willebrand factor type A  29.77 
 
 		 344 aa  139  7e-32  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.428182  normal  0.250576 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1538  von Willebrand factor type A  31.72 
 
 		 347 aa  137  2e-31  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.634535  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0906  von Willebrand factor type A  34.22 
 
 		 345 aa  137  3.0000000000000003e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.519509  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0720  von Willebrand factor, type A  31.28 
 
 		 344 aa  119  9e-26  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.799777  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1122  von Willebrand factor type A  25.49 
 
 		 335 aa  117  3.9999999999999997e-25  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.51147  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2438  von Willebrand factor type A  33.7 
 
 		 315 aa  115  1.0000000000000001e-24  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0441  von Willebrand factor type A  36.9 
 
 		 339 aa  115  1.0000000000000001e-24  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.126065  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1583  batB protein  32.64 
 
 		 339 aa  112  6e-24  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0523  von Willebrand factor type A  35.19 
 
 		 344 aa  110  3e-23  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001268  TPR domain protein in aerotolerance operon  29.97 
 
 		 599 aa  109  6e-23  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05143  hypothetical protein  28.72 
 
 		 601 aa  107  4e-22  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2455  von Willebrand factor type A  28.33 
 
 		 338 aa  106  6e-22  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1812  von Willebrand factor type A  33.7 
 
 		 318 aa  105  1e-21  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2395  von Willebrand factor type A  28.04 
 
 		 611 aa  99.8  6e-20  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.850853  normal  0.642372 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1658  TPR repeat-containing protein  33.33 
 
 		 647 aa  99.4  8e-20  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.95456  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0657  von Willebrand factor, type A  27.27 
 
 		 595 aa  94.7  2e-18  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.676457  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1107  hypothetical protein  29.68 
 
 		 646 aa  94  3e-18  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1908  hypothetical protein  29.46 
 
 		 319 aa  93.2  5e-18  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.137204 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0099  von Willebrand factor, type A  33.18 
 
 		 651 aa  92.8  7e-18  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2667  von Willebrand factor type A  30.56 
 
 		 320 aa  92.8  7e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0137073  normal  0.240647 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2681  von Willebrand factor, type A  35.63 
 
 		 334 aa  91.3  2e-17  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4900  von Willebrand factor type A  28.24 
 
 		 337 aa  90.9  3e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5483  von Willebrand factor type A  24.18 
 
 		 320 aa  88.2  2e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0172  von Willebrand factor type A domain protein  25.9 
 
 		 290 aa  88.2  2e-16  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.141772  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2464  von Willebrand factor, type A  33.91 
 
 		 339 aa  87  4e-16  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3093  von Willebrand factor type A domain-containing protein  33.91 
 
 		 338 aa  86.3  6e-16  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02705  von Willebrand factor, type A  34.66 
 
 		 349 aa  86.3  6e-16  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1468  von Willebrand factor, type A  33.33 
 
 		 338 aa  86.3  6e-16  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00210714 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1593  von Willebrand factor type A  33.91 
 
 		 340 aa  86.3  7e-16  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000650656 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1456  von Willebrand factor, type A  33.33 
 
 		 338 aa  86.3  7e-16  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000144994 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2765  von Willebrand factor type A  33.33 
 
 		 339 aa  85.9  9e-16  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.644793  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1403  von Willebrand factor, type A  33.33 
 
 		 338 aa  85.5  0.000000000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.520734  hitchhiker  0.0000232326 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2785  von Willebrand factor type A  33.33 
 
 		 340 aa  85.1  0.000000000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1525  von Willebrand factor, type A  34.48 
 
 		 330 aa  85.1  0.000000000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2860  von Willebrand factor type A  33.33 
 
 		 339 aa  85.1  0.000000000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.140424  normal  0.0110983 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3031  von Willebrand factor type A  32.18 
 
 		 330 aa  84.7  0.000000000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.239159  normal  0.0768499 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3094  TPR domain-containing protein  29.33 
 
 		 679 aa  84  0.000000000000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2682  TPR repeat-containing protein  28 
 
 		 701 aa  84  0.000000000000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0523  hypothetical protein  26.09 
 
 		 619 aa  83.6  0.000000000000004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6107  von Willebrand factor type A  30.47 
 
 		 359 aa  83.2  0.000000000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1251  batB protein, putative  27.35 
 
 		 322 aa  83.2  0.000000000000006  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.711324  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2139  hypothetical protein  30.92 
 
 		 530 aa  83.2  0.000000000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.488109  decreased coverage  0.00345429 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2430  von Willebrand factor, type A  32.95 
 
 		 339 aa  82.8  0.000000000000007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0141267 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0719  von Willebrand factor, type A  26.09 
 
 		 334 aa  82  0.00000000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.887647  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1582  batA protein  30.65 
 
 		 327 aa  80.5  0.00000000000003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1220  von Willebrand factor, type A  30 
 
 		 337 aa  80.5  0.00000000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.356622  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1624  von Willebrand factor, type A  32.18 
 
 		 330 aa  80.5  0.00000000000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000050495 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1623  TPR repeat-containing protein  29.23 
 
 		 644 aa  80.1  0.00000000000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000210321 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1743  TPR domain-containing protein  27.08 
 
 		 658 aa  80.1  0.00000000000006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3163  TPR domain-containing protein  26.15 
 
 		 690 aa  79  0.0000000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.185864  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2465  TPR repeat-containing protein  31.51 
 
 		 663 aa  79  0.0000000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2655  BatA-like protein, aerotolerance-related  26.87 
 
 		 351 aa  78.2  0.0000000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1455  TPR repeat-containing protein  30.73 
 
 		 690 aa  77.8  0.0000000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000000112359 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0052  von Willebrand factor type A  30.69 
 
 		 589 aa  77.4  0.0000000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.649054  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3231  TPR repeat-containing protein  27.86 
 
 		 612 aa  77.8  0.0000000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.439888  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1592  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  30.49 
 
 		 692 aa  77  0.0000000000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000228279 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1777  von Willebrand factor type A  26.86 
 
 		 754 aa  77.4  0.0000000000004  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.582496  normal  0.264323 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2861  TPR repeat-containing protein  31 
 
 		 692 aa  77  0.0000000000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0393834 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1659  von Willebrand factor, type A  31.05 
 
 		 343 aa  76.6  0.0000000000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.863974  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2766  TPR repeat-containing protein  30.49 
 
 		 690 aa  76.6  0.0000000000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3846  von Willebrand factor type A  33.33 
 
 		 339 aa  77  0.0000000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.341342  normal  0.622551 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2914  hypothetical protein  32.57 
 
 		 344 aa  76.6  0.0000000000006  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2768  hypothetical protein  32.57 
 
 		 344 aa  76.6  0.0000000000006  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2786  TPR repeat-containing protein  31 
 
 		 693 aa  76.3  0.0000000000007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2603  von Willebrand factor type A  31.61 
 
 		 336 aa  75.9  0.0000000000009  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1402  TPR repeat-containing protein  30.29 
 
 		 681 aa  75.9  0.0000000000009  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000103328 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1467  TPR repeat-containing protein  30.29 
 
 		 687 aa  75.9  0.0000000000009  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.510289  hitchhiker  0.00291188 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4901  hypothetical protein  26.91 
 
 		 330 aa  75.9  0.0000000000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.908989  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2816  TPR repeat-containing protein  28.94 
 
 		 657 aa  75.5  0.000000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2604  TPR repeat-containing protein  29.09 
 
 		 653 aa  74.3  0.000000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3032  TPR repeat-containing protein  30.09 
 
 		 650 aa  75.1  0.000000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.198571  normal  0.0885065 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1481  von Willebrand factor type A  30.68 
 
 		 332 aa  74.7  0.000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.587986  normal  0.160763 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1733  von Willebrand factor type A  30.39 
 
 		 342 aa  73.9  0.000000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.818001  normal  0.561199 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1123  von Willebrand factor type A  27.39 
 
 		 373 aa  73.2  0.000000000006  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA3085  batB protein, putative  32.63 
 
 		 328 aa  72.8  0.000000000008  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5137  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  30.5 
 
 		 517 aa  72.8  0.000000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.398593  normal  0.644601 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0442  von Willebrand factor type A  28.74 
 
 		 329 aa  72.8  0.000000000009  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.570722  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1250  batA protein, putative  28.15 
 
 		 332 aa  72  0.00000000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.367863  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3212  hypothetical protein  27.05 
 
 		 578 aa  72  0.00000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.190926 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_18790  tetratricopeptide (TPR) repeat and VWA domain-containing protein  28.71 
 
 		 577 aa  72  0.00000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.00254687  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2172  von Willebrand factor type A domain-containing protein  29.35 
 
 		 327 aa  72  0.00000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.0626942 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1560  TPR repeat-containing protein  25 
 
 		 571 aa  71.6  0.00000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.535158 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02150  aerotolerance-related membrane protein  26.18 
 
 		 334 aa  71.6  0.00000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2431  TPR repeat-containing protein  31.05 
 
 		 693 aa  71.6  0.00000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0167557 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02344  tetratricopeptide repeat domain protein  26.32 
 
 		 607 aa  70.9  0.00000000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3555  von Willebrand factor, type A  27.95 
 
 		 573 aa  70.9  0.00000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2173  TPR domain-containing protein  25.72 
 
 		 701 aa  70.9  0.00000000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.081888 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3116  von Willebrand factor type A domain protein  28.1 
 
 		 328 aa  70.5  0.00000000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0524018  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3385  von Willebrand factor, type A  27.95 
 
 		 573 aa  70.1  0.00000000005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.465184 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0073  von Willebrand factor, type A  30.73 
 
 		 349 aa  69.7  0.00000000006  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3054  TPR repeat-containing protein  27.68 
 
 		 533 aa  69.7  0.00000000007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.350986  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000305  TPR domain protein in aerotolerance operon  26.92 
 
 		 576 aa  69.7  0.00000000007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0568  von Willebrand factor, type A  30.91 
 
 		 573 aa  68.9  0.0000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>