147 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_A2887 on replicon NC_007347
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007347  Reut_A2887  tetratricopeptide TPR_4  100 
 
 		 544 aa  1080    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0337019  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4531  hypothetical protein  64.58 
 
 		 531 aa  606  9.999999999999999e-173  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.536979  normal  0.0526442 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3802  TPR repeat-containing protein  49.16 
 
 		 522 aa  465  9.999999999999999e-131  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.292136  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5137  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  47.3 
 
 		 517 aa  428  1e-118  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.398593  normal  0.644601 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2139  hypothetical protein  43.87 
 
 		 530 aa  387  1e-106  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.488109  decreased coverage  0.00345429 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3054  TPR repeat-containing protein  40.67 
 
 		 533 aa  336  5.999999999999999e-91  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.350986  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3117  hypothetical protein  35.64 
 
 		 503 aa  278  1e-73  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.10336  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000305  TPR domain protein in aerotolerance operon  30.12 
 
 		 576 aa  246  9.999999999999999e-64  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1743  TPR domain-containing protein  31.08 
 
 		 658 aa  229  1e-58  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0072  TPR repeat-containing protein  28.17 
 
 		 664 aa  220  5e-56  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3094  TPR domain-containing protein  30.67 
 
 		 679 aa  216  7e-55  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3555  von Willebrand factor, type A  31.38 
 
 		 573 aa  216  9e-55  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0568  von Willebrand factor, type A  32.24 
 
 		 573 aa  215  1.9999999999999998e-54  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3385  von Willebrand factor, type A  31.61 
 
 		 573 aa  214  2.9999999999999995e-54  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.465184 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2682  TPR repeat-containing protein  30.2 
 
 		 701 aa  213  4.9999999999999996e-54  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3763  TPR domain protein  31.34 
 
 		 572 aa  206  8e-52  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.519367  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1717  TPR repeat-containing von Willebrand factor, type A  30.46 
 
 		 572 aa  201  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1455  TPR repeat-containing protein  31.26 
 
 		 690 aa  197  4.0000000000000005e-49  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000000112359 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1740  hypothetical protein  25.61 
 
 		 564 aa  197  4.0000000000000005e-49  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1658  TPR repeat-containing protein  31.2 
 
 		 647 aa  196  1e-48  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.95456  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1623  TPR repeat-containing protein  28.17 
 
 		 644 aa  196  1e-48  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000210321 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1402  TPR repeat-containing protein  31.55 
 
 		 681 aa  194  5e-48  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000103328 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1467  TPR repeat-containing protein  31.55 
 
 		 687 aa  194  5e-48  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.510289  hitchhiker  0.00291188 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2766  TPR repeat-containing protein  32.54 
 
 		 690 aa  190  5e-47  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2465  TPR repeat-containing protein  31.48 
 
 		 663 aa  189  8e-47  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02706  TPR domain protein  30.06 
 
 		 667 aa  189  1e-46  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2861  TPR repeat-containing protein  32.55 
 
 		 692 aa  188  2e-46  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0393834 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3714  TPR repeat-containing protein  30.31 
 
 		 572 aa  187  3e-46  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.325605  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0523  hypothetical protein  27.87 
 
 		 619 aa  187  4e-46  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1524  TPR repeat-containing protein  33.96 
 
 		 691 aa  187  6e-46  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1592  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  32.26 
 
 		 692 aa  186  1.0000000000000001e-45  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000228279 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1560  TPR repeat-containing protein  30.31 
 
 		 571 aa  183  7e-45  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.535158 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2786  TPR repeat-containing protein  32.4 
 
 		 693 aa  183  8.000000000000001e-45  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2028  TPR domain-containing protein  30 
 
 		 572 aa  182  2e-44  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3163  TPR domain-containing protein  27.24 
 
 		 690 aa  181  2e-44  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.185864  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24390  TPR domain-containing protein  30.46 
 
 		 586 aa  176  9.999999999999999e-43  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00557521  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05143  hypothetical protein  29.14 
 
 		 601 aa  176  9.999999999999999e-43  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2173  TPR domain-containing protein  29.96 
 
 		 701 aa  172  1e-41  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.081888 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3212  hypothetical protein  29.76 
 
 		 578 aa  171  4e-41  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.190926 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1949  TPR repeat-containing protein  31.35 
 
 		 612 aa  168  2.9999999999999998e-40  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.931925  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA3086  TPR domain-containing protein  27.77 
 
 		 579 aa  167  4e-40  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.503806  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3032  TPR repeat-containing protein  29.34 
 
 		 650 aa  166  8e-40  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.198571  normal  0.0885065 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1588  TPR repeat-containing protein  30.14 
 
 		 572 aa  160  4e-38  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00107949 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02344  tetratricopeptide repeat domain protein  30.4 
 
 		 607 aa  160  5e-38  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2816  TPR repeat-containing protein  28.79 
 
 		 657 aa  160  6e-38  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2431  TPR repeat-containing protein  30.6 
 
 		 693 aa  160  8e-38  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0167557 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2604  TPR repeat-containing protein  29.04 
 
 		 653 aa  156  1e-36  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2933  TPR repeat-containing protein  28.79 
 
 		 588 aa  154  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2066  hypothetical protein  30.51 
 
 		 585 aa  154  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001268  TPR domain protein in aerotolerance operon  27.64 
 
 		 599 aa  153  8.999999999999999e-36  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1107  hypothetical protein  29.15 
 
 		 646 aa  149  1.0000000000000001e-34  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_18790  tetratricopeptide (TPR) repeat and VWA domain-containing protein  31.3 
 
 		 577 aa  148  3e-34  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.00254687  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3231  TPR repeat-containing protein  33.47 
 
 		 612 aa  142  9.999999999999999e-33  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.439888  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1205  hypothetical protein  38.18 
 
 		 304 aa  142  1.9999999999999998e-32  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1732  TPR repeat-containing protein  24.49 
 
 		 587 aa  137  4e-31  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.966886  normal  0.26357 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0853  TPR repeat-containing protein  32.26 
 
 		 680 aa  129  1.0000000000000001e-28  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2767  hypothetical protein  27.71 
 
 		 310 aa  121  3.9999999999999996e-26  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1206  TPR repeat-containing protein  41.18 
 
 		 220 aa  119  9.999999999999999e-26  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2913  hypothetical protein  27.71 
 
 		 310 aa  119  1.9999999999999998e-25  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1122  von Willebrand factor type A  28.41 
 
 		 335 aa  94  6e-18  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.51147  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2395  von Willebrand factor type A  30.52 
 
 		 611 aa  93.6  9e-18  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.850853  normal  0.642372 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0657  von Willebrand factor, type A  22.2 
 
 		 595 aa  87.8  5e-16  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.676457  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0649  von Willebrand factor, type A  23.78 
 
 		 471 aa  81.3  0.00000000000004  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2912  hypothetical protein  36.09 
 
 		 293 aa  77.4  0.0000000000007  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5483  von Willebrand factor type A  25.71 
 
 		 320 aa  76.6  0.000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0906  von Willebrand factor type A  25.59 
 
 		 345 aa  76.6  0.000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.519509  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2766  hypothetical protein  40.38 
 
 		 278 aa  76.3  0.000000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0099  von Willebrand factor, type A  26.25 
 
 		 651 aa  74.7  0.000000000004  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2667  von Willebrand factor type A  26.98 
 
 		 320 aa  74.3  0.000000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0137073  normal  0.240647 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1482  von Willebrand factor type A  25.08 
 
 		 344 aa  71.2  0.00000000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.428182  normal  0.250576 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2455  von Willebrand factor type A  26.32 
 
 		 338 aa  69.3  0.0000000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0523  von Willebrand factor type A  28.53 
 
 		 344 aa  67  0.0000000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0720  von Willebrand factor, type A  26.16 
 
 		 344 aa  64.3  0.000000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.799777  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1538  von Willebrand factor type A  25.5 
 
 		 347 aa  64.3  0.000000005  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.634535  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2467  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  38.83 
 
 		 273 aa  63.9  0.000000007  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.724582 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1908  hypothetical protein  23.42 
 
 		 319 aa  63.2  0.00000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.137204 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0052  von Willebrand factor type A  30.05 
 
 		 589 aa  62.8  0.00000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.649054  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0243  von Willebrand factor type A  34.48 
 
 		 343 aa  62.8  0.00000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0131225  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2147  hypothetical protein  33.33 
 
 		 321 aa  62  0.00000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.130278  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0441  von Willebrand factor type A  36.73 
 
 		 339 aa  61.2  0.00000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.126065  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02145  hypothetical protein  22.68 
 
 		 346 aa  61.6  0.00000004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1797  von Willebrand factor type A  28.04 
 
 		 315 aa  61.6  0.00000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.152806  normal  1 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0173  von Willebrand factor type A domain protein  29.86 
 
 		 333 aa  60.8  0.00000005  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.0526529  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2438  von Willebrand factor type A  28.63 
 
 		 315 aa  60.5  0.00000008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2318  von Willebrand factor type A  27.44 
 
 		 339 aa  60.5  0.00000009  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0073  von Willebrand factor, type A  28.01 
 
 		 349 aa  59.7  0.0000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2406  von Willebrand factor type A  28.09 
 
 		 325 aa  59.7  0.0000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1318  von Willebrand factor type A  29.67 
 
 		 318 aa  59.3  0.0000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.598912  normal  0.213186 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4900  von Willebrand factor type A  25.28 
 
 		 337 aa  59.3  0.0000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2080  von Willebrand factor type A  30.27 
 
 		 327 aa  58.5  0.0000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.829092  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1952  von Willebrand factor type A  23.49 
 
 		 315 aa  57.8  0.0000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.159987  hitchhiker  0.00398429 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3659  hypothetical protein  25.71 
 
 		 335 aa  57  0.0000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.542398  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1582  batA protein  30.63 
 
 		 327 aa  56.6  0.000001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2141  TPR repeat-containing protein  31.36 
 
 		 268 aa  54.7  0.000004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2451  von Willebrand factor, type A  26.67 
 
 		 337 aa  54.3  0.000005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1220  von Willebrand factor, type A  25.46 
 
 		 337 aa  53.1  0.00001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.356622  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2751  hypothetical protein  25.32 
 
 		 335 aa  53.1  0.00001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.333251 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2495  von Willebrand factor type A  28.3 
 
 		 316 aa  53.5  0.00001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.142903  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0796  von Willebrand factor type A  26.32 
 
 		 328 aa  53.1  0.00001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000000000131986  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5503  von Willebrand factor, type A  27.98 
 
 		 315 aa  53.1  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0866133  normal  0.0446961 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>