94 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_1206 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010511  M446_1206  TPR repeat-containing protein  100 
 
 
220 aa  438  9.999999999999999e-123  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5137  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  41.44 
 
 
517 aa  129  4.0000000000000003e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.398593  normal  0.644601 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2887  tetratricopeptide TPR_4  41.18 
 
 
544 aa  119  3e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0337019  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4531  hypothetical protein  37.02 
 
 
531 aa  113  2.0000000000000002e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.536979  normal  0.0526442 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2139  hypothetical protein  34.33 
 
 
530 aa  106  3e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.488109  decreased coverage  0.00345429 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3802  TPR repeat-containing protein  34.38 
 
 
522 aa  105  8e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.292136  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3714  TPR repeat-containing protein  32.42 
 
 
572 aa  92.8  4e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.325605  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2766  hypothetical protein  43.3 
 
 
278 aa  90.9  1e-17  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3054  TPR repeat-containing protein  35.06 
 
 
533 aa  91.3  1e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.350986  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2912  hypothetical protein  43.3 
 
 
293 aa  89.7  3e-17  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2028  TPR domain-containing protein  31.96 
 
 
572 aa  89.7  3e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_18790  tetratricopeptide (TPR) repeat and VWA domain-containing protein  31.7 
 
 
577 aa  87  2e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.00254687  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1560  TPR repeat-containing protein  28.57 
 
 
571 aa  87.4  2e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.535158 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3117  hypothetical protein  35.9 
 
 
503 aa  85.9  5e-16  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.10336  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3212  hypothetical protein  41.35 
 
 
578 aa  85.5  6e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.190926 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1717  TPR repeat-containing von Willebrand factor, type A  27.85 
 
 
572 aa  84  0.000000000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3763  TPR domain protein  27 
 
 
572 aa  82.4  0.000000000000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.519367  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA3086  TPR domain-containing protein  34.64 
 
 
579 aa  82  0.000000000000007  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.503806  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1623  TPR repeat-containing protein  31.67 
 
 
644 aa  81.6  0.000000000000009  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000210321 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1524  TPR repeat-containing protein  35.21 
 
 
691 aa  80.5  0.00000000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2467  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  46.59 
 
 
273 aa  75.9  0.0000000000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.724582 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1949  TPR repeat-containing protein  32.34 
 
 
612 aa  76.3  0.0000000000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.931925  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1388  TPR repeat-containing protein  40.43 
 
 
298 aa  75.9  0.0000000000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0606731  normal  0.0848814 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1658  TPR repeat-containing protein  36.8 
 
 
647 aa  75.1  0.0000000000008  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.95456  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2682  TPR repeat-containing protein  27.65 
 
 
701 aa  75.1  0.0000000000008  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1588  TPR repeat-containing protein  28.76 
 
 
572 aa  74.3  0.000000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00107949 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2465  TPR repeat-containing protein  37.7 
 
 
663 aa  74.3  0.000000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2933  TPR repeat-containing protein  30.41 
 
 
588 aa  74.3  0.000000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2173  TPR domain-containing protein  36.89 
 
 
701 aa  74.3  0.000000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.081888 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02706  TPR domain protein  35.79 
 
 
667 aa  73.9  0.000000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2604  TPR repeat-containing protein  46.15 
 
 
653 aa  73.9  0.000000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2786  TPR repeat-containing protein  38.32 
 
 
693 aa  73.6  0.000000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1740  hypothetical protein  30.46 
 
 
564 aa  72.8  0.000000000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1743  TPR domain-containing protein  31.65 
 
 
658 aa  72  0.000000000006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3032  TPR repeat-containing protein  33.08 
 
 
650 aa  71.2  0.00000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.198571  normal  0.0885065 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3231  TPR repeat-containing protein  44.83 
 
 
612 aa  69.7  0.00000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.439888  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3094  TPR domain-containing protein  34.96 
 
 
679 aa  70.1  0.00000000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02344  tetratricopeptide repeat domain protein  45.56 
 
 
607 aa  68.6  0.00000000007  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2766  TPR repeat-containing protein  35 
 
 
690 aa  68.6  0.00000000008  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2861  TPR repeat-containing protein  39.39 
 
 
692 aa  68.2  0.00000000009  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.0393834 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0568  von Willebrand factor, type A  30.33 
 
 
573 aa  67.8  0.0000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1592  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  39.8 
 
 
692 aa  67.8  0.0000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000228279 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0793  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  43.27 
 
 
312 aa  67.4  0.0000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.0444795 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1455  TPR repeat-containing protein  36.29 
 
 
690 aa  67  0.0000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  unclonable  0.000000000112359 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3385  von Willebrand factor, type A  29.61 
 
 
573 aa  67.4  0.0000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.465184 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1467  TPR repeat-containing protein  43.59 
 
 
687 aa  66.6  0.0000000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.510289  hitchhiker  0.00291188 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2431  TPR repeat-containing protein  31.45 
 
 
693 aa  66.6  0.0000000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.0167557 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1402  TPR repeat-containing protein  43.59 
 
 
681 aa  66.6  0.0000000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000103328 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3555  von Willebrand factor, type A  29.63 
 
 
573 aa  65.1  0.0000000008  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0523  hypothetical protein  30.39 
 
 
619 aa  65.1  0.0000000009  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05143  hypothetical protein  32.32 
 
 
601 aa  64.7  0.000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0072  TPR repeat-containing protein  33.33 
 
 
664 aa  62.8  0.000000004  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3163  TPR domain-containing protein  41.89 
 
 
690 aa  62  0.000000007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.185864  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001268  TPR domain protein in aerotolerance operon  31.96 
 
 
599 aa  61.6  0.000000008  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0867  TPR repeat-containing protein  44.32 
 
 
312 aa  61.6  0.000000009  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.225271  normal  0.0510852 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0827  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  44.32 
 
 
312 aa  61.2  0.00000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.257865  normal  0.362947 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1009  TPR repeat-containing protein  41.74 
 
 
301 aa  60.8  0.00000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1107  hypothetical protein  28.93 
 
 
646 aa  56.6  0.0000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3049  TPR repeat-containing protein  32.99 
 
 
591 aa  56.2  0.0000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000157665  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000305  TPR domain protein in aerotolerance operon  27.5 
 
 
576 aa  55.5  0.0000007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24390  TPR domain-containing protein  36.97 
 
 
586 aa  54.3  0.000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00557521  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4303  TPR repeat-containing protein  45.78 
 
 
306 aa  53.9  0.000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.341118  normal  0.0662026 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0461  hypothetical protein  43.68 
 
 
224 aa  53.1  0.000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2834  serine/threonine protein kinase with TPR repeats  34.15 
 
 
439 aa  52.4  0.000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.950152 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3289  serine/threonine protein kinase with TPR repeats  34.15 
 
 
439 aa  51.2  0.00001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1130  hypothetical protein  28.67 
 
 
203 aa  50.1  0.00003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.489621  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0637  TPR repeat-containing protein  41.67 
 
 
4489 aa  50.1  0.00003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0191  TPR repeat-containing protein  26.96 
 
 
250 aa  48.9  0.00005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.641193  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1172  TPR repeat-containing protein  32.31 
 
 
4079 aa  47  0.0002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1361  TPR repeat-containing protein  33.33 
 
 
1276 aa  47.4  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1732  TPR repeat-containing protein  27.66 
 
 
587 aa  46.2  0.0003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.966886  normal  0.26357 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1787  TPR repeat-containing protein  23.85 
 
 
543 aa  46.6  0.0003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.662156  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1256  TPR repeat-containing protein  30.95 
 
 
573 aa  45.8  0.0005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  decreased coverage  0.00857901  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2066  hypothetical protein  29.67 
 
 
585 aa  45.8  0.0005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2934  tetratricopeptide TPR_2  32.63 
 
 
135 aa  45.4  0.0006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.000000970662  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2816  TPR repeat-containing protein  27.55 
 
 
657 aa  45.4  0.0007  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0362  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  28.07 
 
 
149 aa  44.7  0.001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1342  TPR repeat-containing protein  27.55 
 
 
391 aa  44.7  0.001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2653  tetratricopeptide TPR_2  34.67 
 
 
328 aa  44.3  0.002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1841  TPR repeat-containing protein  54.05 
 
 
3035 aa  43.9  0.002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2403  tetratricopeptide TPR_4  37.84 
 
 
267 aa  43.9  0.002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.0000143988  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2941  hypothetical protein  28.15 
 
 
560 aa  43.5  0.003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.000171884  normal  0.0147454 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_4013  hypothetical protein  29.34 
 
 
198 aa  43.1  0.003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.573909  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3643  TPR domain-containing protein  24.14 
 
 
1979 aa  43.1  0.003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1840  TPR repeat-containing protein  36.26 
 
 
3560 aa  43.1  0.004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0853  TPR repeat-containing protein  38.38 
 
 
680 aa  42.7  0.004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2604  TPR repeat-containing protein  27.17 
 
 
927 aa  42.4  0.005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.010408  normal  0.426767 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3996  tetratricopeptide TPR_2  30.86 
 
 
1694 aa  42.4  0.005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.271204  normal  0.601264 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0492  TPR repeat-containing protein  35.06 
 
 
477 aa  42.4  0.006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.337722  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1387  TPR repeat-containing protein  36.25 
 
 
333 aa  42.4  0.006  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.316988  normal  0.93517 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0301  TPR repeat-containing protein  29.27 
 
 
1827 aa  42  0.007  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2893  O-linked N-acetylglucosamine transferase  39.71 
 
 
397 aa  41.6  0.008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.272299 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4031  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  37.29 
 
 
477 aa  41.6  0.009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.636683  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0121  TPR repeat-containing protein  38.46 
 
 
732 aa  41.6  0.009  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.261868  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>