211 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHU_1908 on replicon NC_008255
Organism: Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008255  CHU_1908  hypothetical protein  100 
 
 		 319 aa  652    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.137204 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5483  von Willebrand factor type A  34.39 
 
 		 320 aa  153  2.9999999999999998e-36  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2667  von Willebrand factor type A  29.1 
 
 		 320 aa  132  7.999999999999999e-30  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0137073  normal  0.240647 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02145  hypothetical protein  28.57 
 
 		 346 aa  122  9e-27  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1538  von Willebrand factor type A  31.9 
 
 		 347 aa  119  4.9999999999999996e-26  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.634535  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1122  von Willebrand factor type A  29.63 
 
 		 335 aa  113  4.0000000000000004e-24  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.51147  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0906  von Willebrand factor type A  30.36 
 
 		 345 aa  107  2e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.519509  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0720  von Willebrand factor, type A  30.41 
 
 		 344 aa  96.3  6e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.799777  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2318  von Willebrand factor type A  31.52 
 
 		 339 aa  95.5  9e-19  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0243  von Willebrand factor type A  30.47 
 
 		 343 aa  95.1  2e-18  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0131225  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1482  von Willebrand factor type A  26.43 
 
 		 344 aa  90.5  4e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.428182  normal  0.250576 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2085  von Willebrand factor type A  25.88 
 
 		 336 aa  90.1  5e-17  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2395  von Willebrand factor type A  29.61 
 
 		 611 aa  89.4  8e-17  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.850853  normal  0.642372 
 
 
-
 
NC_002950  PG1582  batA protein  31.28 
 
 		 327 aa  87.8  2e-16  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2438  von Willebrand factor type A  29.8 
 
 		 315 aa  87.8  2e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2291  von Willebrand factor type A  28.21 
 
 		 340 aa  88.2  2e-16  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1887  von Willebrand factor, type A  29.06 
 
 		 334 aa  85.1  0.000000000000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.615946  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2451  von Willebrand factor, type A  28.57 
 
 		 337 aa  83.6  0.000000000000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0441  von Willebrand factor type A  26.56 
 
 		 339 aa  83.2  0.000000000000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.126065  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2455  von Willebrand factor type A  26.99 
 
 		 338 aa  79.7  0.00000000000006  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1583  batB protein  26.46 
 
 		 339 aa  79.3  0.00000000000007  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4900  von Willebrand factor type A  22.94 
 
 		 337 aa  79  0.0000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0523  von Willebrand factor type A  26.32 
 
 		 344 aa  77.8  0.0000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1812  von Willebrand factor type A  35.38 
 
 		 318 aa  76.3  0.0000000000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0442  von Willebrand factor type A  24.37 
 
 		 329 aa  75.5  0.000000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.570722  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0099  von Willebrand factor, type A  26.84 
 
 		 651 aa  74.3  0.000000000003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1481  von Willebrand factor type A  27.75 
 
 		 332 aa  73.2  0.000000000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.587986  normal  0.160763 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1777  von Willebrand factor type A  30.41 
 
 		 754 aa  71.6  0.00000000001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.582496  normal  0.264323 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0719  von Willebrand factor, type A  25.64 
 
 		 334 aa  71.6  0.00000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.887647  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1250  batA protein, putative  25.57 
 
 		 332 aa  69.7  0.00000000006  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.367863  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3802  TPR repeat-containing protein  22.73 
 
 		 522 aa  69.3  0.00000000008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.292136  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3054  TPR repeat-containing protein  31.16 
 
 		 533 aa  68.6  0.0000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.350986  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6107  von Willebrand factor type A  24.72 
 
 		 359 aa  68.2  0.0000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2914  hypothetical protein  25.57 
 
 		 344 aa  66.6  0.0000000005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2768  hypothetical protein  25.57 
 
 		 344 aa  66.6  0.0000000005  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5137  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  24.01 
 
 		 517 aa  66.6  0.0000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.398593  normal  0.644601 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3846  von Willebrand factor type A  35.09 
 
 		 339 aa  66.6  0.0000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.341342  normal  0.622551 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0710  von Willebrand factor type A domain protein  28.57 
 
 		 371 aa  66.6  0.0000000006  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.283279 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1123  von Willebrand factor type A  26.14 
 
 		 373 aa  66.2  0.0000000007  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2319  von Willebrand factor type A  25.88 
 
 		 331 aa  65.5  0.000000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1623  TPR repeat-containing protein  26.4 
 
 		 644 aa  65.1  0.000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000210321 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2080  von Willebrand factor type A  27.81 
 
 		 327 aa  64.7  0.000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.829092  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2147  hypothetical protein  30.1 
 
 		 321 aa  64.7  0.000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.130278  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1743  TPR domain-containing protein  25.23 
 
 		 658 aa  63.9  0.000000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05143  hypothetical protein  25.82 
 
 		 601 aa  63.2  0.000000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2655  BatA-like protein, aerotolerance-related  26.29 
 
 		 351 aa  63.5  0.000000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1733  von Willebrand factor type A  26.04 
 
 		 342 aa  63.2  0.000000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.818001  normal  0.561199 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2086  von Willebrand factor type A  27.57 
 
 		 327 aa  63.2  0.000000006  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4901  hypothetical protein  30.12 
 
 		 330 aa  62.8  0.000000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.908989  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22360  hypothetical protein  21.81 
 
 		 326 aa  62.4  0.000000009  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0925694  normal  0.626592 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02150  aerotolerance-related membrane protein  24.7 
 
 		 334 aa  62.4  0.00000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2887  tetratricopeptide TPR_4  23.66 
 
 		 544 aa  62.4  0.00000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0337019  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0242  von Willebrand factor type A  29.66 
 
 		 336 aa  62  0.00000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0239154  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3094  TPR domain-containing protein  27.07 
 
 		 679 aa  61.2  0.00000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0796  von Willebrand factor type A  25.94 
 
 		 328 aa  61.2  0.00000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000000000131986  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0430  hypothetical protein  23.26 
 
 		 336 aa  61.2  0.00000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0072  TPR repeat-containing protein  26.47 
 
 		 664 aa  60.8  0.00000003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0657  von Willebrand factor, type A  27.19 
 
 		 595 aa  60.5  0.00000003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.676457  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0523  hypothetical protein  25.38 
 
 		 619 aa  60.8  0.00000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1107  hypothetical protein  25.98 
 
 		 646 aa  60.5  0.00000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1658  TPR repeat-containing protein  23.44 
 
 		 647 aa  60.1  0.00000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.95456  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1680  von Willebrand factor type A  27.52 
 
 		 333 aa  60.1  0.00000005  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.233991  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001268  TPR domain protein in aerotolerance operon  27.78 
 
 		 599 aa  60.1  0.00000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_18980  von Willebrand factor type A-like protein  24.54 
 
 		 331 aa  59.7  0.00000007  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.136451  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35740  von Willebrand factor type A-like protein  28.99 
 
 		 341 aa  59.7  0.00000007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.496633  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1524  TPR repeat-containing protein  27.6 
 
 		 691 aa  58.9  0.0000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2682  TPR repeat-containing protein  31.34 
 
 		 701 aa  58.5  0.0000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2452  von Willebrand factor, type A  21.22 
 
 		 344 aa  58.9  0.0000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1949  TPR repeat-containing protein  27.09 
 
 		 612 aa  58.5  0.0000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.931925  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2431  TPR repeat-containing protein  29.65 
 
 		 693 aa  58.9  0.0000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0167557 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3026  von Willebrand factor, type A  26.92 
 
 		 316 aa  58.5  0.0000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.443806 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5138  von Willebrand factor type A  22.18 
 
 		 329 aa  57.8  0.0000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.585465 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0649  von Willebrand factor, type A  24.9 
 
 		 471 aa  57.8  0.0000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000305  TPR domain protein in aerotolerance operon  25 
 
 		 576 aa  58.5  0.0000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1948  von Willebrand factor, type A  23.7 
 
 		 339 aa  57.8  0.0000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3801  von Willebrand factor type A  23.68 
 
 		 334 aa  58.2  0.0000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.142641  normal  0.822741 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1386  von Willebrand factor type A  24.58 
 
 		 329 aa  57.8  0.0000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.796868  normal  0.0818214 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3163  TPR domain-containing protein  26.28 
 
 		 690 aa  57  0.0000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.185864  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1952  von Willebrand factor type A  23.35 
 
 		 315 aa  57  0.0000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.159987  hitchhiker  0.00398429 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0052  von Willebrand factor type A  22.45 
 
 		 589 aa  57  0.0000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.649054  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2139  hypothetical protein  22.35 
 
 		 530 aa  57  0.0000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.488109  decreased coverage  0.00345429 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5503  von Willebrand factor, type A  26.27 
 
 		 315 aa  57  0.0000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0866133  normal  0.0446961 
 
 
-
 
NC_002977  MCA3085  batB protein, putative  25.11 
 
 		 328 aa  56.6  0.0000005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2681  von Willebrand factor, type A  22.08 
 
 		 334 aa  57  0.0000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1455  TPR repeat-containing protein  29.2 
 
 		 690 aa  56.6  0.0000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000000112359 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0173  von Willebrand factor type A domain protein  31.82 
 
 		 333 aa  56.6  0.0000006  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.0526529  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3386  von Willebrand factor, type A  28.36 
 
 		 335 aa  56.6  0.0000006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.384724 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3031  von Willebrand factor type A  23.7 
 
 		 330 aa  56.2  0.0000008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.239159  normal  0.0768499 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3093  von Willebrand factor type A domain-containing protein  23 
 
 		 338 aa  55.5  0.000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5131  von Willebrand factor type A  24.14 
 
 		 319 aa  55.8  0.000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.210447  normal  0.0623627 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1402  TPR repeat-containing protein  29.2 
 
 		 681 aa  55.5  0.000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000103328 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1467  TPR repeat-containing protein  29.2 
 
 		 687 aa  55.5  0.000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.510289  hitchhiker  0.00291188 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2634  von Willebrand factor type A  25.85 
 
 		 313 aa  55.1  0.000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3556  von Willebrand factor, type A  27.86 
 
 		 335 aa  55.8  0.000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.697589 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0825  von Willebrand factor type A  24.08 
 
 		 339 aa  55.8  0.000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.431264  normal  0.379491 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02344  tetratricopeptide repeat domain protein  22.1 
 
 		 607 aa  55.1  0.000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1624  von Willebrand factor, type A  23.19 
 
 		 330 aa  55.8  0.000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000050495 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0865  von Willebrand factor type A  24.08 
 
 		 339 aa  55.5  0.000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0877751  normal  0.04584 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3211  von Willebrand factor, type A  22.97 
 
 		 359 aa  54.7  0.000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.161906 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4531  hypothetical protein  24.22 
 
 		 531 aa  54.3  0.000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.536979  normal  0.0526442 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>