252 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GM21_2438 on replicon NC_012918
Organism: Geobacter sp. M21



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012918  GM21_2438  von Willebrand factor type A  100 
 
 		 315 aa  602  1.0000000000000001e-171  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1812  von Willebrand factor type A  88.99 
 
 		 318 aa  437  1e-121  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1538  von Willebrand factor type A  34.59 
 
 		 347 aa  146  4.0000000000000006e-34  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.634535  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02145  hypothetical protein  31.27 
 
 		 346 aa  146  5e-34  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2395  von Willebrand factor type A  36.03 
 
 		 611 aa  133  3.9999999999999996e-30  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.850853  normal  0.642372 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0720  von Willebrand factor, type A  37.13 
 
 		 344 aa  133  3.9999999999999996e-30  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.799777  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0243  von Willebrand factor type A  40.28 
 
 		 343 aa  131  1.0000000000000001e-29  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0131225  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1482  von Willebrand factor type A  29.21 
 
 		 344 aa  128  1.0000000000000001e-28  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.428182  normal  0.250576 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2451  von Willebrand factor, type A  34.15 
 
 		 337 aa  125  8.000000000000001e-28  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1122  von Willebrand factor type A  30.31 
 
 		 335 aa  122  9.999999999999999e-27  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.51147  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1887  von Willebrand factor, type A  36.28 
 
 		 334 aa  120  3e-26  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.615946  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3846  von Willebrand factor type A  31.58 
 
 		 339 aa  120  3e-26  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.341342  normal  0.622551 
 
 
-
 
NC_002950  PG1583  batB protein  34.47 
 
 		 339 aa  119  7.999999999999999e-26  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0441  von Willebrand factor type A  35.92 
 
 		 339 aa  119  7.999999999999999e-26  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.126065  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2318  von Willebrand factor type A  37.29 
 
 		 339 aa  117  1.9999999999999998e-25  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0906  von Willebrand factor type A  32.38 
 
 		 345 aa  118  1.9999999999999998e-25  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.519509  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2455  von Willebrand factor type A  27.17 
 
 		 338 aa  114  2.0000000000000002e-24  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2291  von Willebrand factor type A  37.65 
 
 		 340 aa  112  7.000000000000001e-24  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0523  von Willebrand factor type A  39.46 
 
 		 344 aa  108  1e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5483  von Willebrand factor type A  29.71 
 
 		 320 aa  107  3e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0242  von Willebrand factor type A  35.96 
 
 		 336 aa  101  2e-20  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0239154  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1908  hypothetical protein  29.8 
 
 		 319 aa  101  2e-20  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.137204 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2085  von Willebrand factor type A  36.02 
 
 		 336 aa  100  3e-20  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6107  von Willebrand factor type A  31.84 
 
 		 359 aa  100  5e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1481  von Willebrand factor type A  30.51 
 
 		 332 aa  96.7  5e-19  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.587986  normal  0.160763 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2086  von Willebrand factor type A  37.87 
 
 		 327 aa  96.7  5e-19  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1220  von Willebrand factor, type A  31.91 
 
 		 337 aa  96.3  6e-19  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.356622  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2667  von Willebrand factor type A  29.06 
 
 		 320 aa  95.9  7e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0137073  normal  0.240647 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2655  BatA-like protein, aerotolerance-related  25.35 
 
 		 351 aa  95.5  1e-18  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2452  von Willebrand factor, type A  33.15 
 
 		 344 aa  95.1  1e-18  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4901  hypothetical protein  35.56 
 
 		 330 aa  95.5  1e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.908989  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0442  von Willebrand factor type A  28.73 
 
 		 329 aa  93.6  4e-18  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.570722  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4900  von Willebrand factor type A  31.11 
 
 		 337 aa  91.7  1e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2319  von Willebrand factor type A  32.54 
 
 		 331 aa  90.5  4e-17  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05143  hypothetical protein  26.71 
 
 		 601 aa  89.7  6e-17  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1582  batA protein  29.77 
 
 		 327 aa  88.6  1e-16  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001268  TPR domain protein in aerotolerance operon  28.74 
 
 		 599 aa  88.2  2e-16  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0649  von Willebrand factor, type A  26.06 
 
 		 471 aa  88.2  2e-16  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1250  batA protein, putative  28.12 
 
 		 332 aa  87.4  3e-16  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.367863  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1107  hypothetical protein  29.9 
 
 		 646 aa  84  0.000000000000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0173  von Willebrand factor type A domain protein  23.42 
 
 		 333 aa  83.2  0.000000000000005  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.0526529  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3054  TPR repeat-containing protein  29.84 
 
 		 533 aa  82.4  0.000000000000008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.350986  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0099  von Willebrand factor, type A  33.47 
 
 		 651 aa  81.6  0.00000000000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0052  von Willebrand factor type A  38 
 
 		 589 aa  82  0.00000000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.649054  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000305  TPR domain protein in aerotolerance operon  32.63 
 
 		 576 aa  81.6  0.00000000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2914  hypothetical protein  30.57 
 
 		 344 aa  81.3  0.00000000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2768  hypothetical protein  30.57 
 
 		 344 aa  81.3  0.00000000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1658  TPR repeat-containing protein  30.97 
 
 		 647 aa  81.3  0.00000000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.95456  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0430  hypothetical protein  30.77 
 
 		 336 aa  81.3  0.00000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1777  von Willebrand factor type A  30.13 
 
 		 754 aa  80.9  0.00000000000003  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.582496  normal  0.264323 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4532  hypothetical protein  29.92 
 
 		 334 aa  80.9  0.00000000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.143586 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02150  aerotolerance-related membrane protein  26.15 
 
 		 334 aa  80.9  0.00000000000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1137  von Willebrand factor type A  33.21 
 
 		 319 aa  80.9  0.00000000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.178204  hitchhiker  0.0000350269 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1778  von Willebrand factor type A  28.51 
 
 		 328 aa  80.5  0.00000000000004  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.357635  normal  0.258709 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5137  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  27.6 
 
 		 517 aa  80.1  0.00000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.398593  normal  0.644601 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1886  von Willebrand factor, type A  30.99 
 
 		 329 aa  79.7  0.00000000000007  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000306  protein BatA  30.52 
 
 		 356 aa  79.3  0.00000000000008  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2292  von Willebrand factor type A  30.81 
 
 		 325 aa  79  0.00000000000009  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3801  von Willebrand factor type A  29.45 
 
 		 334 aa  78.6  0.0000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.142641  normal  0.822741 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2888  von Willebrand factor, type A  29.67 
 
 		 340 aa  79  0.0000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0657  von Willebrand factor, type A  28.03 
 
 		 595 aa  79  0.0000000000001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.676457  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1123  von Willebrand factor type A  29.64 
 
 		 373 aa  79  0.0000000000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1247  von Willebrand factor, type A  32.46 
 
 		 319 aa  78.6  0.0000000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.513072 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0523  hypothetical protein  25.12 
 
 		 619 aa  78.2  0.0000000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0796  von Willebrand factor type A  23.95 
 
 		 328 aa  77.8  0.0000000000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000000000131986  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2173  TPR domain-containing protein  33.33 
 
 		 701 aa  77.4  0.0000000000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.081888 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2396  von Willebrand factor type A  29.73 
 
 		 377 aa  76.3  0.0000000000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.939741  normal  0.854107 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2861  TPR repeat-containing protein  32.99 
 
 		 692 aa  76.3  0.0000000000007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0393834 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1592  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  32.99 
 
 		 692 aa  76.3  0.0000000000007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000228279 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2682  TPR repeat-containing protein  28.27 
 
 		 701 aa  75.9  0.0000000000008  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2766  TPR repeat-containing protein  32.99 
 
 		 690 aa  75.9  0.0000000000008  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2465  TPR repeat-containing protein  32.83 
 
 		 663 aa  75.9  0.0000000000008  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3094  TPR domain-containing protein  28.34 
 
 		 679 aa  75.5  0.000000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2786  TPR repeat-containing protein  32.99 
 
 		 693 aa  75.5  0.000000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1561  von Willebrand factor type A  32 
 
 		 358 aa  75.5  0.000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.604958 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1455  TPR repeat-containing protein  29.44 
 
 		 690 aa  75.5  0.000000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000000112359 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1949  TPR repeat-containing protein  31.86 
 
 		 612 aa  75.1  0.000000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.931925  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2029  von Willebrand factor type A domain-containing protein  32 
 
 		 358 aa  74.7  0.000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.34439  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3713  von Willebrand factor, type A  32 
 
 		 358 aa  74.7  0.000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.512513  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1680  von Willebrand factor type A  29.01 
 
 		 333 aa  74.7  0.000000000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.233991  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0719  von Willebrand factor, type A  26.5 
 
 		 334 aa  74.3  0.000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.887647  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1743  TPR domain-containing protein  26.94 
 
 		 658 aa  73.9  0.000000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2431  TPR repeat-containing protein  31.17 
 
 		 693 aa  73.6  0.000000000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0167557 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1402  TPR repeat-containing protein  29.44 
 
 		 681 aa  73.2  0.000000000005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000103328 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1467  TPR repeat-containing protein  29.44 
 
 		 687 aa  73.2  0.000000000005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.510289  hitchhiker  0.00291188 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1128  von Willebrand factor, type A  32.49 
 
 		 282 aa  73.6  0.000000000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0959166  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3116  von Willebrand factor type A domain protein  27.1 
 
 		 328 aa  73.2  0.000000000006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0524018  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0072  TPR repeat-containing protein  26.79 
 
 		 664 aa  72.8  0.000000000007  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1524  TPR repeat-containing protein  29.01 
 
 		 691 aa  72.8  0.000000000007  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3032  TPR repeat-containing protein  30.48 
 
 		 650 aa  72.4  0.000000000009  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.198571  normal  0.0885065 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2439  von Willebrand factor type A  32.81 
 
 		 331 aa  72  0.00000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2604  TPR repeat-containing protein  29.26 
 
 		 653 aa  71.6  0.00000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3211  von Willebrand factor, type A  29.66 
 
 		 359 aa  70.9  0.00000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.161906 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0172  von Willebrand factor type A domain protein  23.41 
 
 		 290 aa  70.9  0.00000000003  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.141772  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1744  BatB protein, putative  31.63 
 
 		 341 aa  70.1  0.00000000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02345  von Willebrand factor type A domain protein  32.19 
 
 		 335 aa  70.1  0.00000000005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0567  von Willebrand factor, type A  31.07 
 
 		 335 aa  70.1  0.00000000005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02706  TPR domain protein  28.4 
 
 		 667 aa  69.7  0.00000000005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3556  von Willebrand factor, type A  31.07 
 
 		 335 aa  69.7  0.00000000006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.697589 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1106  hypothetical protein  27.7 
 
 		 318 aa  69.3  0.00000000007  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>