156 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewmr4_1402 on replicon NC_008321
Organism: Shewanella sp. MR-4



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011663  Sbal223_1592  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  68.9 
 
 		 692 aa  855    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000228279 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3094  TPR domain-containing protein  83.19 
 
 		 679 aa  1060    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1402  TPR repeat-containing protein  100 
 
 		 681 aa  1363    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000103328 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1467  TPR repeat-containing protein  97.38 
 
 		 687 aa  1113    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.510289  hitchhiker  0.00291188 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2682  TPR repeat-containing protein  52.97 
 
 		 701 aa  678    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1455  TPR repeat-containing protein  93.91 
 
 		 690 aa  1054    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000000112359 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2766  TPR repeat-containing protein  69.67 
 
 		 690 aa  867    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2465  TPR repeat-containing protein  69.01 
 
 		 663 aa  848    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2786  TPR repeat-containing protein  70.19 
 
 		 693 aa  843    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1623  TPR repeat-containing protein  51.76 
 
 		 644 aa  654    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000210321 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2861  TPR repeat-containing protein  69.97 
 
 		 692 aa  867    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0393834 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3032  TPR repeat-containing protein  52.79 
 
 		 650 aa  631  1e-179  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.198571  normal  0.0885065 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1524  TPR repeat-containing protein  53.4 
 
 		 691 aa  602  1.0000000000000001e-171  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2604  TPR repeat-containing protein  53.22 
 
 		 653 aa  592  1e-167  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2431  TPR repeat-containing protein  52.91 
 
 		 693 aa  574  1.0000000000000001e-162  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0167557 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2173  TPR domain-containing protein  46.37 
 
 		 701 aa  513  1e-144  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.081888 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1658  TPR repeat-containing protein  37.74 
 
 		 647 aa  365  1e-99  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.95456  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2816  TPR repeat-containing protein  36 
 
 		 657 aa  342  2e-92  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1743  TPR domain-containing protein  38.32 
 
 		 658 aa  315  9.999999999999999e-85  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3163  TPR domain-containing protein  38.93 
 
 		 690 aa  315  1.9999999999999998e-84  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.185864  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0072  TPR repeat-containing protein  33.39 
 
 		 664 aa  312  1e-83  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1107  hypothetical protein  42.48 
 
 		 646 aa  302  1e-80  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05143  hypothetical protein  39.21 
 
 		 601 aa  293  7e-78  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0523  hypothetical protein  37.44 
 
 		 619 aa  292  2e-77  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001268  TPR domain protein in aerotolerance operon  38.27 
 
 		 599 aa  291  4e-77  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02706  TPR domain protein  32.77 
 
 		 667 aa  288  2e-76  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1949  TPR repeat-containing protein  33.5 
 
 		 612 aa  237  5.0000000000000005e-61  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.931925  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3802  TPR repeat-containing protein  32.02 
 
 		 522 aa  237  5.0000000000000005e-61  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.292136  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA3086  TPR domain-containing protein  30.37 
 
 		 579 aa  228  4e-58  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.503806  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1717  TPR repeat-containing von Willebrand factor, type A  32.29 
 
 		 572 aa  215  1.9999999999999998e-54  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02344  tetratricopeptide repeat domain protein  30.02 
 
 		 607 aa  215  1.9999999999999998e-54  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3763  TPR domain protein  33.93 
 
 		 572 aa  210  8e-53  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.519367  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2139  hypothetical protein  31.64 
 
 		 530 aa  209  9e-53  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.488109  decreased coverage  0.00345429 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5137  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  32.27 
 
 		 517 aa  209  1e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.398593  normal  0.644601 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2887  tetratricopeptide TPR_4  29.36 
 
 		 544 aa  207  5e-52  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0337019  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3054  TPR repeat-containing protein  32.77 
 
 		 533 aa  195  3e-48  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.350986  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0853  TPR repeat-containing protein  33.41 
 
 		 680 aa  194  6e-48  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_18790  tetratricopeptide (TPR) repeat and VWA domain-containing protein  35.84 
 
 		 577 aa  192  2e-47  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.00254687  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1732  TPR repeat-containing protein  28.88 
 
 		 587 aa  192  2e-47  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.966886  normal  0.26357 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4531  hypothetical protein  30.43 
 
 		 531 aa  190  8e-47  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.536979  normal  0.0526442 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000305  TPR domain protein in aerotolerance operon  28.24 
 
 		 576 aa  185  2.0000000000000003e-45  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3212  hypothetical protein  32 
 
 		 578 aa  184  5.0000000000000004e-45  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.190926 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3714  TPR repeat-containing protein  29.59 
 
 		 572 aa  180  9e-44  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.325605  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2028  TPR domain-containing protein  29.4 
 
 		 572 aa  177  4e-43  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2933  TPR repeat-containing protein  34.37 
 
 		 588 aa  177  5e-43  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3231  TPR repeat-containing protein  30.31 
 
 		 612 aa  173  6.999999999999999e-42  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.439888  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1560  TPR repeat-containing protein  30.14 
 
 		 571 aa  171  4e-41  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.535158 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3117  hypothetical protein  28.27 
 
 		 503 aa  169  2e-40  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.10336  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24390  TPR domain-containing protein  32.85 
 
 		 586 aa  167  5.9999999999999996e-40  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00557521  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2066  hypothetical protein  31.61 
 
 		 585 aa  163  9e-39  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1588  TPR repeat-containing protein  29.55 
 
 		 572 aa  155  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00107949 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3555  von Willebrand factor, type A  29.05 
 
 		 573 aa  150  8e-35  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3385  von Willebrand factor, type A  29 
 
 		 573 aa  148  4.0000000000000006e-34  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.465184 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2767  hypothetical protein  34.59 
 
 		 310 aa  147  9e-34  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2913  hypothetical protein  34.28 
 
 		 310 aa  146  1e-33  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0568  von Willebrand factor, type A  28.44 
 
 		 573 aa  137  5e-31  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0657  von Willebrand factor, type A  24.96 
 
 		 595 aa  135  1.9999999999999998e-30  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.676457  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0099  von Willebrand factor, type A  29.67 
 
 		 651 aa  116  1.0000000000000001e-24  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1740  hypothetical protein  26.86 
 
 		 564 aa  112  2.0000000000000002e-23  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0649  von Willebrand factor, type A  23.66 
 
 		 471 aa  100  1e-19  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2395  von Willebrand factor type A  29.92 
 
 		 611 aa  96.3  2e-18  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.850853  normal  0.642372 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1205  hypothetical protein  36.75 
 
 		 304 aa  94.7  5e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1122  von Willebrand factor type A  28.38 
 
 		 335 aa  89.4  2e-16  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.51147  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1482  von Willebrand factor type A  26.12 
 
 		 344 aa  87.8  6e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.428182  normal  0.250576 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2318  von Willebrand factor type A  26.01 
 
 		 339 aa  86.7  0.000000000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1583  batB protein  27.47 
 
 		 339 aa  83.6  0.00000000000001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0906  von Willebrand factor type A  31.32 
 
 		 345 aa  79  0.0000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.519509  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0523  von Willebrand factor type A  30.11 
 
 		 344 aa  77.8  0.0000000000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1538  von Willebrand factor type A  28.32 
 
 		 347 aa  77  0.000000000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.634535  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5483  von Willebrand factor type A  26.25 
 
 		 320 aa  76.6  0.000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0460  hypothetical protein  34 
 
 		 299 aa  75.5  0.000000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1206  TPR repeat-containing protein  38.61 
 
 		 220 aa  73.2  0.00000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0243  von Willebrand factor type A  27.96 
 
 		 343 aa  72.4  0.00000000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0131225  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1887  von Willebrand factor, type A  29.9 
 
 		 334 aa  72.4  0.00000000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.615946  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1481  von Willebrand factor type A  30.71 
 
 		 332 aa  71.6  0.00000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.587986  normal  0.160763 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2912  hypothetical protein  41.18 
 
 		 293 aa  71.6  0.00000000005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02145  hypothetical protein  24.79 
 
 		 346 aa  70.9  0.00000000007  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0052  von Willebrand factor type A  32.45 
 
 		 589 aa  70.9  0.00000000008  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.649054  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2766  hypothetical protein  41.18 
 
 		 278 aa  70.5  0.00000000009  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2455  von Willebrand factor type A  26.69 
 
 		 338 aa  67.8  0.0000000006  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1777  von Willebrand factor type A  26.42 
 
 		 754 aa  67  0.000000001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.582496  normal  0.264323 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2438  von Willebrand factor type A  30.73 
 
 		 315 aa  65.9  0.000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1680  von Willebrand factor type A  30 
 
 		 333 aa  66.2  0.000000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.233991  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3846  von Willebrand factor type A  34.58 
 
 		 339 aa  65.5  0.000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.341342  normal  0.622551 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0719  von Willebrand factor, type A  27.92 
 
 		 334 aa  64.7  0.000000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.887647  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0441  von Willebrand factor type A  33.53 
 
 		 339 aa  62.4  0.00000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.126065  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1812  von Willebrand factor type A  33.64 
 
 		 318 aa  62.8  0.00000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1388  TPR repeat-containing protein  30.36 
 
 		 298 aa  63.2  0.00000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0606731  normal  0.0848814 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_4012  hypothetical protein  31.79 
 
 		 311 aa  62.4  0.00000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.523385  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0720  von Willebrand factor, type A  29.91 
 
 		 344 aa  61.2  0.00000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.799777  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4901  hypothetical protein  28.45 
 
 		 330 aa  61.2  0.00000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.908989  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0430  hypothetical protein  30.13 
 
 		 336 aa  61.2  0.00000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2451  von Willebrand factor, type A  25.95 
 
 		 337 aa  60.1  0.0000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1582  batA protein  33.11 
 
 		 327 aa  58.9  0.0000003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3280  hypothetical protein  30.77 
 
 		 311 aa  58.5  0.0000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.207213  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6107  von Willebrand factor type A  35.96 
 
 		 359 aa  57.8  0.0000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0793  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  27.56 
 
 		 312 aa  57  0.000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0444795 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02150  aerotolerance-related membrane protein  31.48 
 
 		 334 aa  56.6  0.000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0442  von Willebrand factor type A  33.33 
 
 		 329 aa  55.5  0.000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.570722  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2467  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  28.49 
 
 		 273 aa  55.5  0.000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.724582 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>