188 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_A2139 on replicon NC_007951
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007951  Bxe_A2139  hypothetical protein  100 
 
 		 530 aa  1067    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.488109  decreased coverage  0.00345429 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3054  TPR repeat-containing protein  44.34 
 
 		 533 aa  416  9.999999999999999e-116  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.350986  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2887  tetratricopeptide TPR_4  43.2 
 
 		 544 aa  392  1e-108  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0337019  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3802  TPR repeat-containing protein  41.33 
 
 		 522 aa  370  1e-101  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.292136  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5137  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  39.54 
 
 		 517 aa  348  2e-94  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.398593  normal  0.644601 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4531  hypothetical protein  40.91 
 
 		 531 aa  329  8e-89  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.536979  normal  0.0526442 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1743  TPR domain-containing protein  35.56 
 
 		 658 aa  260  6e-68  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1658  TPR repeat-containing protein  35.93 
 
 		 647 aa  244  3e-63  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.95456  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2682  TPR repeat-containing protein  33.33 
 
 		 701 aa  243  7.999999999999999e-63  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0072  TPR repeat-containing protein  31.6 
 
 		 664 aa  239  8e-62  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3094  TPR domain-containing protein  33.99 
 
 		 679 aa  235  2.0000000000000002e-60  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000305  TPR domain protein in aerotolerance operon  33.8 
 
 		 576 aa  229  1e-58  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3117  hypothetical protein  33.96 
 
 		 503 aa  228  3e-58  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.10336  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3555  von Willebrand factor, type A  32.06 
 
 		 573 aa  218  2.9999999999999998e-55  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3385  von Willebrand factor, type A  33.16 
 
 		 573 aa  215  1.9999999999999998e-54  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.465184 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0568  von Willebrand factor, type A  31.88 
 
 		 573 aa  213  4.9999999999999996e-54  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02344  tetratricopeptide repeat domain protein  34.45 
 
 		 607 aa  208  2e-52  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1455  TPR repeat-containing protein  34.07 
 
 		 690 aa  208  2e-52  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000000112359 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2465  TPR repeat-containing protein  35.23 
 
 		 663 aa  208  2e-52  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02706  TPR domain protein  31.61 
 
 		 667 aa  205  2e-51  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2766  TPR repeat-containing protein  35.49 
 
 		 690 aa  204  2e-51  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2861  TPR repeat-containing protein  35.04 
 
 		 692 aa  201  3e-50  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0393834 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1623  TPR repeat-containing protein  30.66 
 
 		 644 aa  201  3e-50  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000210321 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1402  TPR repeat-containing protein  33.63 
 
 		 681 aa  201  3.9999999999999996e-50  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000103328 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1467  TPR repeat-containing protein  33.63 
 
 		 687 aa  201  3.9999999999999996e-50  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.510289  hitchhiker  0.00291188 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1592  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  35.04 
 
 		 692 aa  200  5e-50  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000228279 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2786  TPR repeat-containing protein  34.28 
 
 		 693 aa  200  5e-50  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3763  TPR domain protein  33.19 
 
 		 572 aa  192  1e-47  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.519367  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2933  TPR repeat-containing protein  33.97 
 
 		 588 aa  192  1e-47  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3231  TPR repeat-containing protein  35.25 
 
 		 612 aa  191  2e-47  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.439888  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1717  TPR repeat-containing von Willebrand factor, type A  32.91 
 
 		 572 aa  189  1e-46  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0523  hypothetical protein  29.17 
 
 		 619 aa  188  2e-46  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3714  TPR repeat-containing protein  32.2 
 
 		 572 aa  188  2e-46  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.325605  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2431  TPR repeat-containing protein  34.22 
 
 		 693 aa  187  4e-46  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0167557 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1560  TPR repeat-containing protein  32.98 
 
 		 571 aa  185  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.535158 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1524  TPR repeat-containing protein  34.24 
 
 		 691 aa  185  2.0000000000000003e-45  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2028  TPR domain-containing protein  32 
 
 		 572 aa  184  4.0000000000000006e-45  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24390  TPR domain-containing protein  35.31 
 
 		 586 aa  182  1e-44  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00557521  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3212  hypothetical protein  32.52 
 
 		 578 aa  181  2.9999999999999997e-44  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.190926 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_18790  tetratricopeptide (TPR) repeat and VWA domain-containing protein  34.77 
 
 		 577 aa  178  3e-43  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.00254687  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2816  TPR repeat-containing protein  28.8 
 
 		 657 aa  177  3e-43  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3163  TPR domain-containing protein  30.26 
 
 		 690 aa  177  5e-43  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.185864  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1107  hypothetical protein  32.15 
 
 		 646 aa  176  7e-43  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1740  hypothetical protein  27.16 
 
 		 564 aa  176  9e-43  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05143  hypothetical protein  29.96 
 
 		 601 aa  176  9.999999999999999e-43  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2173  TPR domain-containing protein  32.53 
 
 		 701 aa  172  1e-41  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.081888 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1588  TPR repeat-containing protein  30.85 
 
 		 572 aa  171  3e-41  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00107949 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001268  TPR domain protein in aerotolerance operon  30.56 
 
 		 599 aa  170  7e-41  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3032  TPR repeat-containing protein  29.6 
 
 		 650 aa  169  1e-40  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.198571  normal  0.0885065 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2066  hypothetical protein  32.34 
 
 		 585 aa  169  1e-40  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2604  TPR repeat-containing protein  29.84 
 
 		 653 aa  161  3e-38  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA3086  TPR domain-containing protein  31.26 
 
 		 579 aa  160  4e-38  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.503806  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1949  TPR repeat-containing protein  31.15 
 
 		 612 aa  158  2e-37  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.931925  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1205  hypothetical protein  38.65 
 
 		 304 aa  158  2e-37  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1732  TPR repeat-containing protein  27.17 
 
 		 587 aa  157  3e-37  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.966886  normal  0.26357 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0853  TPR repeat-containing protein  32.2 
 
 		 680 aa  143  7e-33  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2767  hypothetical protein  29.05 
 
 		 310 aa  115  1.0000000000000001e-24  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2913  hypothetical protein  28.75 
 
 		 310 aa  111  3e-23  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1206  TPR repeat-containing protein  34.33 
 
 		 220 aa  105  2e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0657  von Willebrand factor, type A  23.54 
 
 		 595 aa  101  3e-20  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.676457  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2318  von Willebrand factor type A  28.47 
 
 		 339 aa  100  8e-20  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0906  von Willebrand factor type A  26.07 
 
 		 345 aa  95.5  2e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.519509  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2395  von Willebrand factor type A  31.68 
 
 		 611 aa  92.4  2e-17  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.850853  normal  0.642372 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1122  von Willebrand factor type A  25.64 
 
 		 335 aa  91.3  4e-17  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.51147  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0649  von Willebrand factor, type A  22.46 
 
 		 471 aa  89.4  1e-16  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5483  von Willebrand factor type A  24.14 
 
 		 320 aa  89.7  1e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0243  von Willebrand factor type A  28.21 
 
 		 343 aa  82  0.00000000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0131225  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1887  von Willebrand factor, type A  31.82 
 
 		 334 aa  80.5  0.00000000000007  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.615946  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1583  batB protein  26.51 
 
 		 339 aa  79  0.0000000000002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2912  hypothetical protein  39.2 
 
 		 293 aa  79  0.0000000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2766  hypothetical protein  43.3 
 
 		 278 aa  77.8  0.0000000000004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0523  von Willebrand factor type A  28.84 
 
 		 344 aa  75.5  0.000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1482  von Willebrand factor type A  24.26 
 
 		 344 aa  74.7  0.000000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.428182  normal  0.250576 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02145  hypothetical protein  21.89 
 
 		 346 aa  71.6  0.00000000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0441  von Willebrand factor type A  32.43 
 
 		 339 aa  70.5  0.00000000007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.126065  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0052  von Willebrand factor type A  33.51 
 
 		 589 aa  70.5  0.00000000008  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.649054  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0720  von Willebrand factor, type A  27.22 
 
 		 344 aa  70.5  0.00000000008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.799777  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1538  von Willebrand factor type A  23.5 
 
 		 347 aa  70.1  0.00000000009  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.634535  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2667  von Willebrand factor type A  26.13 
 
 		 320 aa  68.6  0.0000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0137073  normal  0.240647 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2455  von Willebrand factor type A  24.79 
 
 		 338 aa  68.2  0.0000000004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0099  von Willebrand factor, type A  24.83 
 
 		 651 aa  67  0.0000000009  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1797  von Willebrand factor type A  26.91 
 
 		 315 aa  65.9  0.000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.152806  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2438  von Willebrand factor type A  28.12 
 
 		 315 aa  65.1  0.000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0442  von Willebrand factor type A  30.14 
 
 		 329 aa  64.3  0.000000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.570722  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2085  von Willebrand factor type A  27.45 
 
 		 336 aa  63.5  0.00000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0430  hypothetical protein  24.74 
 
 		 336 aa  62.8  0.00000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1220  von Willebrand factor, type A  24.79 
 
 		 337 aa  62.4  0.00000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.356622  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1318  von Willebrand factor type A  29.5 
 
 		 318 aa  62  0.00000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.598912  normal  0.213186 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2147  hypothetical protein  27.09 
 
 		 321 aa  62  0.00000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.130278  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2291  von Willebrand factor type A  28.19 
 
 		 340 aa  61.2  0.00000005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1481  von Willebrand factor type A  24.6 
 
 		 332 aa  60.8  0.00000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.587986  normal  0.160763 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2495  von Willebrand factor type A  26.44 
 
 		 316 aa  61.2  0.00000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.142903  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3846  von Willebrand factor type A  25.24 
 
 		 339 aa  59.7  0.0000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.341342  normal  0.622551 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1777  von Willebrand factor type A  25.56 
 
 		 754 aa  58.9  0.0000002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.582496  normal  0.264323 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22360  hypothetical protein  27.94 
 
 		 326 aa  58.5  0.0000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0925694  normal  0.626592 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0073  von Willebrand factor, type A  27.56 
 
 		 349 aa  58.2  0.0000004  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1908  hypothetical protein  22.35 
 
 		 319 aa  57.8  0.0000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.137204 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3026  von Willebrand factor, type A  30.14 
 
 		 316 aa  57.8  0.0000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.443806 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0827  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  38.24 
 
 		 312 aa  57.8  0.0000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.257865  normal  0.362947 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2655  BatA-like protein, aerotolerance-related  21.52 
 
 		 351 aa  57.8  0.0000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>