208 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphamn1_2318 on replicon NC_010831
Organism: Chlorobium phaeobacteroides BS1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010831  Cphamn1_2318  von Willebrand factor type A  100 
 
 		 339 aa  683    Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0243  von Willebrand factor type A  41.39 
 
 		 343 aa  251  1e-65  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0131225  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2291  von Willebrand factor type A  42.33 
 
 		 340 aa  222  8e-57  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2451  von Willebrand factor, type A  40.81 
 
 		 337 aa  220  1.9999999999999999e-56  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1887  von Willebrand factor, type A  38.92 
 
 		 334 aa  199  3.9999999999999996e-50  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.615946  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2085  von Willebrand factor type A  41.19 
 
 		 336 aa  192  5e-48  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0906  von Willebrand factor type A  33.33 
 
 		 345 aa  142  8e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.519509  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1482  von Willebrand factor type A  31.47 
 
 		 344 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.428182  normal  0.250576 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0441  von Willebrand factor type A  38.43 
 
 		 339 aa  132  6e-30  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.126065  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02145  hypothetical protein  25.66 
 
 		 346 aa  127  2.0000000000000002e-28  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1538  von Willebrand factor type A  34.29 
 
 		 347 aa  125  1e-27  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.634535  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1122  von Willebrand factor type A  28.48 
 
 		 335 aa  124  3e-27  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.51147  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1583  batB protein  30.13 
 
 		 339 aa  120  3.9999999999999996e-26  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0720  von Willebrand factor, type A  30.28 
 
 		 344 aa  117  3e-25  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.799777  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2455  von Willebrand factor type A  27.03 
 
 		 338 aa  106  6e-22  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0523  von Willebrand factor type A  29.08 
 
 		 344 aa  103  3e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2438  von Willebrand factor type A  39.57 
 
 		 315 aa  102  7e-21  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2139  hypothetical protein  28.27 
 
 		 530 aa  97.8  3e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.488109  decreased coverage  0.00345429 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1481  von Willebrand factor type A  26.77 
 
 		 332 aa  96.3  7e-19  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.587986  normal  0.160763 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1908  hypothetical protein  31.52 
 
 		 319 aa  95.9  8e-19  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.137204 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1743  TPR domain-containing protein  29.18 
 
 		 658 aa  93.2  6e-18  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1812  von Willebrand factor type A  37.97 
 
 		 318 aa  92.8  7e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001268  TPR domain protein in aerotolerance operon  28.71 
 
 		 599 aa  91.7  1e-17  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4901  hypothetical protein  27.71 
 
 		 330 aa  90.5  4e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.908989  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3846  von Willebrand factor type A  34.16 
 
 		 339 aa  89.4  8e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.341342  normal  0.622551 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3054  TPR repeat-containing protein  30.68 
 
 		 533 aa  89.4  8e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.350986  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05143  hypothetical protein  28.57 
 
 		 601 aa  88.2  2e-16  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1107  hypothetical protein  28.76 
 
 		 646 aa  88.2  2e-16  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1455  TPR repeat-containing protein  26.97 
 
 		 690 aa  87.4  3e-16  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000000112359 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2395  von Willebrand factor type A  28.35 
 
 		 611 aa  87.8  3e-16  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.850853  normal  0.642372 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3094  TPR domain-containing protein  26.62 
 
 		 679 aa  87  4e-16  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0242  von Willebrand factor type A  33.17 
 
 		 336 aa  86.3  8e-16  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0239154  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1582  batA protein  29.17 
 
 		 327 aa  85.1  0.000000000000001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1680  von Willebrand factor type A  28.16 
 
 		 333 aa  85.5  0.000000000000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.233991  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2913  hypothetical protein  26.07 
 
 		 310 aa  85.1  0.000000000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1402  TPR repeat-containing protein  26.97 
 
 		 681 aa  85.5  0.000000000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000103328 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1467  TPR repeat-containing protein  26.97 
 
 		 687 aa  85.5  0.000000000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.510289  hitchhiker  0.00291188 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2667  von Willebrand factor type A  30.67 
 
 		 320 aa  85.1  0.000000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0137073  normal  0.240647 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2767  hypothetical protein  26.07 
 
 		 310 aa  85.1  0.000000000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5483  von Willebrand factor type A  26.44 
 
 		 320 aa  84  0.000000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000305  TPR domain protein in aerotolerance operon  30.19 
 
 		 576 aa  84  0.000000000000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0430  hypothetical protein  25.75 
 
 		 336 aa  82.8  0.000000000000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1251  batB protein, putative  26.38 
 
 		 322 aa  82  0.00000000000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.711324  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1623  TPR repeat-containing protein  26.71 
 
 		 644 aa  82  0.00000000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000210321 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2682  TPR repeat-containing protein  25.61 
 
 		 701 aa  81.6  0.00000000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6107  von Willebrand factor type A  30.08 
 
 		 359 aa  79.7  0.00000000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0099  von Willebrand factor, type A  24.58 
 
 		 651 aa  78.2  0.0000000000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2319  von Willebrand factor type A  29.63 
 
 		 331 aa  78.2  0.0000000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0719  von Willebrand factor, type A  24.58 
 
 		 334 aa  77.4  0.0000000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.887647  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0072  TPR repeat-containing protein  28.32 
 
 		 664 aa  76.6  0.0000000000005  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2816  TPR repeat-containing protein  26.45 
 
 		 657 aa  76.3  0.0000000000006  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2861  TPR repeat-containing protein  27.2 
 
 		 692 aa  76.3  0.0000000000007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0393834 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0657  von Willebrand factor, type A  25.23 
 
 		 595 aa  75.9  0.0000000000008  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.676457  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1592  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  27.2 
 
 		 692 aa  75.9  0.0000000000008  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000228279 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2786  TPR repeat-containing protein  27.2 
 
 		 693 aa  75.9  0.000000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0523  hypothetical protein  24.34 
 
 		 619 aa  75.5  0.000000000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2766  TPR repeat-containing protein  27.2 
 
 		 690 aa  75.5  0.000000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3385  von Willebrand factor, type A  28.33 
 
 		 573 aa  74.3  0.000000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.465184 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3555  von Willebrand factor, type A  28.33 
 
 		 573 aa  75.1  0.000000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3032  TPR repeat-containing protein  25.21 
 
 		 650 aa  74.7  0.000000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.198571  normal  0.0885065 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2465  TPR repeat-containing protein  26.67 
 
 		 663 aa  75.1  0.000000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2655  BatA-like protein, aerotolerance-related  22.91 
 
 		 351 aa  73.9  0.000000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4900  von Willebrand factor type A  25.17 
 
 		 337 aa  74.3  0.000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2431  TPR repeat-containing protein  28.65 
 
 		 693 aa  73.9  0.000000000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0167557 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0052  von Willebrand factor type A  31.71 
 
 		 589 aa  73.6  0.000000000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.649054  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1220  von Willebrand factor, type A  28.44 
 
 		 337 aa  73.2  0.000000000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.356622  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0568  von Willebrand factor, type A  28.63 
 
 		 573 aa  72.4  0.00000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0649  von Willebrand factor, type A  23.86 
 
 		 471 aa  71.2  0.00000000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1949  TPR repeat-containing protein  29.9 
 
 		 612 aa  71.6  0.00000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.931925  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1658  TPR repeat-containing protein  25.93 
 
 		 647 aa  70.5  0.00000000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.95456  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1732  TPR repeat-containing protein  23.96 
 
 		 587 aa  70.5  0.00000000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.966886  normal  0.26357 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02706  TPR domain protein  26.47 
 
 		 667 aa  70.1  0.00000000005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0442  von Willebrand factor type A  28.57 
 
 		 329 aa  70.1  0.00000000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.570722  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1524  TPR repeat-containing protein  29.94 
 
 		 691 aa  68.9  0.0000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3802  TPR repeat-containing protein  29.75 
 
 		 522 aa  68.9  0.0000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.292136  normal  1 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0173  von Willebrand factor type A domain protein  26.29 
 
 		 333 aa  68.2  0.0000000002  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.0526529  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0457  hypothetical protein  26.14 
 
 		 340 aa  67.8  0.0000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.367166  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0172  von Willebrand factor type A domain protein  26.91 
 
 		 290 aa  67.4  0.0000000003  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.141772  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2604  TPR repeat-containing protein  26.7 
 
 		 653 aa  67  0.0000000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0710  von Willebrand factor type A domain protein  23.78 
 
 		 371 aa  67  0.0000000005  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.283279 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3801  von Willebrand factor type A  27.74 
 
 		 334 aa  67  0.0000000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.142641  normal  0.822741 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3163  TPR domain-containing protein  29.12 
 
 		 690 aa  66.6  0.0000000006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.185864  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02344  tetratricopeptide repeat domain protein  26.52 
 
 		 607 aa  65.1  0.000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1247  von Willebrand factor, type A  29.26 
 
 		 319 aa  65.9  0.000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.513072 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1137  von Willebrand factor type A  29 
 
 		 319 aa  65.5  0.000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.178204  hitchhiker  0.0000350269 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02150  aerotolerance-related membrane protein  22.26 
 
 		 334 aa  64.3  0.000000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2086  von Willebrand factor type A  33.11 
 
 		 327 aa  64.3  0.000000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2452  von Willebrand factor, type A  28.16 
 
 		 344 aa  63.9  0.000000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1250  batA protein, putative  26.05 
 
 		 332 aa  62  0.00000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.367863  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2127  von Willebrand factor type A  29.08 
 
 		 317 aa  62.4  0.00000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000421408 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1205  hypothetical protein  27.22 
 
 		 304 aa  61.2  0.00000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1560  TPR repeat-containing protein  27.03 
 
 		 571 aa  61.6  0.00000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.535158 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2887  tetratricopeptide TPR_4  27.18 
 
 		 544 aa  61.6  0.00000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0337019  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2173  TPR domain-containing protein  28.07 
 
 		 701 aa  62  0.00000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.081888 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1740  hypothetical protein  25.75 
 
 		 564 aa  61.2  0.00000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1778  von Willebrand factor type A  25.88 
 
 		 328 aa  60.8  0.00000003  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.357635  normal  0.258709 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2396  von Willebrand factor type A  26.24 
 
 		 377 aa  60.8  0.00000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.939741  normal  0.854107 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2147  hypothetical protein  30.05 
 
 		 321 aa  60.8  0.00000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.130278  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2206  BatA  22.5 
 
 		 317 aa  60.1  0.00000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0553658  normal  0.0945164 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0522  von Willebrand factor type A  26.52 
 
 		 346 aa  59.7  0.00000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>