253 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Coch_1538 on replicon NC_013162
Organism: Capnocytophaga ochracea DSM 7271



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013162  Coch_1538  von Willebrand factor type A  100 
 
 
347 aa  706    Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.634535  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02145  hypothetical protein  54.07 
 
 
346 aa  380  1e-104  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0720  von Willebrand factor, type A  51.16 
 
 
344 aa  317  3e-85  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.799777  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0906  von Willebrand factor type A  41.2 
 
 
345 aa  228  2e-58  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.519509  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG1583  batB protein  37.97 
 
 
339 aa  224  2e-57  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1482  von Willebrand factor type A  38.73 
 
 
344 aa  222  6e-57  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.428182  normal  0.250576 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1122  von Willebrand factor type A  35.87 
 
 
335 aa  179  5.999999999999999e-44  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.51147  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0441  von Willebrand factor type A  34.3 
 
 
339 aa  149  6e-35  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.126065  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4900  von Willebrand factor type A  32.99 
 
 
337 aa  149  8e-35  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0523  von Willebrand factor type A  35.62 
 
 
344 aa  148  2.0000000000000003e-34  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5483  von Willebrand factor type A  31.97 
 
 
320 aa  142  9.999999999999999e-33  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0657  von Willebrand factor, type A  32.99 
 
 
595 aa  141  1.9999999999999998e-32  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.676457  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2451  von Willebrand factor, type A  29.37 
 
 
337 aa  140  3.9999999999999997e-32  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2395  von Willebrand factor type A  31.67 
 
 
611 aa  138  2e-31  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.850853  normal  0.642372 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02150  aerotolerance-related membrane protein  35.82 
 
 
334 aa  137  3.0000000000000003e-31  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2438  von Willebrand factor type A  34.59 
 
 
315 aa  137  4e-31  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1481  von Willebrand factor type A  29.9 
 
 
332 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.587986  normal  0.160763 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1887  von Willebrand factor, type A  36.2 
 
 
334 aa  131  2.0000000000000002e-29  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.615946  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0243  von Willebrand factor type A  27.94 
 
 
343 aa  129  6e-29  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0131225  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2318  von Willebrand factor type A  31.56 
 
 
339 aa  125  7e-28  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0719  von Willebrand factor, type A  30.41 
 
 
334 aa  125  1e-27  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.887647  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1908  hypothetical protein  31.76 
 
 
319 aa  125  1e-27  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.137204 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1220  von Willebrand factor, type A  32.16 
 
 
337 aa  124  2e-27  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.356622  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2319  von Willebrand factor type A  30.18 
 
 
331 aa  124  3e-27  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0442  von Willebrand factor type A  29.21 
 
 
329 aa  124  3e-27  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.570722  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2291  von Willebrand factor type A  30.53 
 
 
340 aa  122  7e-27  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1582  batA protein  31.39 
 
 
327 aa  122  9e-27  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0430  hypothetical protein  27.9 
 
 
336 aa  121  1.9999999999999998e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2667  von Willebrand factor type A  28.19 
 
 
320 aa  119  7.999999999999999e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0137073  normal  0.240647 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1123  von Willebrand factor type A  30.34 
 
 
373 aa  118  9.999999999999999e-26  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2085  von Willebrand factor type A  32.4 
 
 
336 aa  117  3.9999999999999997e-25  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2086  von Willebrand factor type A  29.85 
 
 
327 aa  115  1.0000000000000001e-24  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1811  von Willebrand factor type A  32.4 
 
 
331 aa  115  1.0000000000000001e-24  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2455  von Willebrand factor type A  26.65 
 
 
338 aa  114  2.0000000000000002e-24  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1812  von Willebrand factor type A  32.71 
 
 
318 aa  113  4.0000000000000004e-24  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1680  von Willebrand factor type A  28.01 
 
 
333 aa  111  2.0000000000000002e-23  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.233991  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1777  von Willebrand factor type A  35.36 
 
 
754 aa  110  5e-23  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.582496  normal  0.264323 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2439  von Willebrand factor type A  31.49 
 
 
331 aa  108  2e-22  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0852  von Willebrand factor type A  30.53 
 
 
345 aa  104  2e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.591496  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2147  hypothetical protein  29.35 
 
 
321 aa  105  2e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.130278  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0242  von Willebrand factor type A  29.96 
 
 
336 aa  104  2e-21  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0239154  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2655  BatA-like protein, aerotolerance-related  29.07 
 
 
351 aa  104  2e-21  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1403  von Willebrand factor, type A  30.82 
 
 
338 aa  104  2e-21  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.520734  hitchhiker  0.0000232326 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2603  von Willebrand factor type A  29.8 
 
 
336 aa  104  2e-21  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2785  von Willebrand factor type A  30.64 
 
 
340 aa  103  5e-21  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1468  von Willebrand factor, type A  30.48 
 
 
338 aa  103  6e-21  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00210714 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1456  von Willebrand factor, type A  30.48 
 
 
338 aa  103  6e-21  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000144994 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4901  hypothetical protein  28.43 
 
 
330 aa  103  6e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.908989  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1593  von Willebrand factor type A  30.32 
 
 
340 aa  102  9e-21  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000650656 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02705  von Willebrand factor, type A  31.06 
 
 
349 aa  102  1e-20  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2860  von Willebrand factor type A  30.3 
 
 
339 aa  102  1e-20  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.140424  normal  0.0110983 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2765  von Willebrand factor type A  30.87 
 
 
339 aa  102  1e-20  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.644793  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1743  TPR domain-containing protein  28.26 
 
 
658 aa  101  2e-20  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3846  von Willebrand factor type A  30.67 
 
 
339 aa  101  2e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.341342  normal  0.622551 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3093  von Willebrand factor type A domain-containing protein  29.6 
 
 
338 aa  100  3e-20  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2430  von Willebrand factor, type A  35.26 
 
 
339 aa  100  3e-20  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.0141267 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2464  von Willebrand factor, type A  30.64 
 
 
339 aa  100  3e-20  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3031  von Willebrand factor type A  30.71 
 
 
330 aa  100  5e-20  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.239159  normal  0.0768499 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2914  hypothetical protein  28.57 
 
 
344 aa  98.6  1e-19  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2768  hypothetical protein  28.57 
 
 
344 aa  98.2  2e-19  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6107  von Willebrand factor type A  26.8 
 
 
359 aa  98.2  2e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1886  von Willebrand factor, type A  29.31 
 
 
329 aa  97.4  3e-19  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0648  von Willebrand factor, type A  30.04 
 
 
307 aa  97.1  4e-19  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1624  von Willebrand factor, type A  30 
 
 
330 aa  96.3  7e-19  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000050495 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0522  von Willebrand factor type A  27.69 
 
 
346 aa  96.3  7e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2300  hypothetical protein  28.53 
 
 
320 aa  96.3  7e-19  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00522588  hitchhiker  0.00113064 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2681  von Willebrand factor, type A  30.51 
 
 
334 aa  96.3  7e-19  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1137  von Willebrand factor type A  28.09 
 
 
319 aa  95.9  8e-19  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.178204  hitchhiker  0.0000350269 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2080  von Willebrand factor type A  27.05 
 
 
327 aa  95.9  9e-19  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.829092  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1525  von Willebrand factor, type A  29.78 
 
 
330 aa  95.9  9e-19  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001268  TPR domain protein in aerotolerance operon  26.43 
 
 
599 aa  95.1  2e-18  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05143  hypothetical protein  25.84 
 
 
601 aa  94  3e-18  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2292  von Willebrand factor type A  25.46 
 
 
325 aa  94  3e-18  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA3085  batB protein, putative  30.42 
 
 
328 aa  94  4e-18  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4532  hypothetical protein  25.6 
 
 
334 aa  93.6  5e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.143586 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1797  von Willebrand factor type A  28.81 
 
 
315 aa  93.2  5e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.152806  normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5138  von Willebrand factor type A  28.86 
 
 
329 aa  92  1e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.585465 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0796  von Willebrand factor type A  25.32 
 
 
328 aa  92  1e-17  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000000000131986  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0524  hypothetical protein  27.4 
 
 
320 aa  91.7  2e-17  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1733  von Willebrand factor type A  27.34 
 
 
342 aa  90.9  3e-17  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.818001  normal  0.561199 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2469  von Willebrand factor type A  33.16 
 
 
325 aa  90.9  3e-17  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.597694 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1739  von Willebrand factor type A  29.85 
 
 
328 aa  90.5  4e-17  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3801  von Willebrand factor type A  26.67 
 
 
334 aa  90.5  4e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.142641  normal  0.822741 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2396  von Willebrand factor type A  26.79 
 
 
377 aa  90.1  4e-17  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.939741  normal  0.854107 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1251  batB protein, putative  23.43 
 
 
322 aa  90.1  5e-17  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.711324  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0099  von Willebrand factor, type A  27.35 
 
 
651 aa  90.1  5e-17  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0173  von Willebrand factor type A domain protein  29.88 
 
 
333 aa  89.7  7e-17  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.0526529  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2888  von Willebrand factor, type A  26.1 
 
 
340 aa  89.4  8e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1247  von Willebrand factor, type A  28.4 
 
 
319 aa  89.4  8e-17  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.513072 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2452  von Willebrand factor, type A  26.07 
 
 
344 aa  89.4  9e-17  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1107  hypothetical protein  28.85 
 
 
646 aa  89  1e-16  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1106  hypothetical protein  29.08 
 
 
318 aa  88.6  1e-16  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1744  BatB protein, putative  28.84 
 
 
341 aa  88.2  2e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2172  von Willebrand factor type A domain-containing protein  28.63 
 
 
327 aa  88.2  2e-16  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.0626942 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2751  hypothetical protein  28.67 
 
 
335 aa  88.2  2e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.333251 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1778  von Willebrand factor type A  29.65 
 
 
328 aa  87.8  3e-16  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.357635  normal  0.258709 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0073  von Willebrand factor, type A  26.54 
 
 
349 aa  87  4e-16  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3211  von Willebrand factor, type A  27.47 
 
 
359 aa  86.7  6e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.161906 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3055  von Willebrand factor type A  28.45 
 
 
324 aa  86.7  6e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2932  von Willebrand factor, type A  31.65 
 
 
334 aa  86.3  7e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.922939  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>