252 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_5137 on replicon NC_012848
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012848  Rleg_5137  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  100 
 
 		 517 aa  1034    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.398593  normal  0.644601 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3802  TPR repeat-containing protein  51.26 
 
 		 522 aa  523  1e-147  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.292136  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2887  tetratricopeptide TPR_4  48.14 
 
 		 544 aa  453  1.0000000000000001e-126  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0337019  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4531  hypothetical protein  47.48 
 
 		 531 aa  423  1e-117  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.536979  normal  0.0526442 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2139  hypothetical protein  40.19 
 
 		 530 aa  365  1e-99  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.488109  decreased coverage  0.00345429 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3054  TPR repeat-containing protein  39.69 
 
 		 533 aa  346  5e-94  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.350986  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3117  hypothetical protein  34.17 
 
 		 503 aa  272  1e-71  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.10336  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2682  TPR repeat-containing protein  31.94 
 
 		 701 aa  263  6e-69  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1658  TPR repeat-containing protein  34.81 
 
 		 647 aa  251  2e-65  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.95456  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1743  TPR domain-containing protein  34.16 
 
 		 658 aa  248  1e-64  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000305  TPR domain protein in aerotolerance operon  30.65 
 
 		 576 aa  243  7e-63  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3094  TPR domain-containing protein  34.07 
 
 		 679 aa  241  2e-62  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2173  TPR domain-containing protein  35.82 
 
 		 701 aa  236  1.0000000000000001e-60  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.081888 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1623  TPR repeat-containing protein  31.6 
 
 		 644 aa  234  3e-60  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000210321 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0072  TPR repeat-containing protein  31.53 
 
 		 664 aa  230  5e-59  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3163  TPR domain-containing protein  30.46 
 
 		 690 aa  226  9e-58  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.185864  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1524  TPR repeat-containing protein  33.47 
 
 		 691 aa  223  4.9999999999999996e-57  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3032  TPR repeat-containing protein  32.86 
 
 		 650 aa  222  9.999999999999999e-57  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.198571  normal  0.0885065 
 
 
-
 
NC_002977  MCA3086  TPR domain-containing protein  35.68 
 
 		 579 aa  218  2e-55  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.503806  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1455  TPR repeat-containing protein  33.04 
 
 		 690 aa  216  8e-55  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000000112359 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1402  TPR repeat-containing protein  33.48 
 
 		 681 aa  214  2.9999999999999995e-54  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000103328 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1467  TPR repeat-containing protein  33.48 
 
 		 687 aa  214  2.9999999999999995e-54  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.510289  hitchhiker  0.00291188 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2028  TPR domain-containing protein  31.11 
 
 		 572 aa  214  3.9999999999999995e-54  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2465  TPR repeat-containing protein  32.38 
 
 		 663 aa  214  3.9999999999999995e-54  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3763  TPR domain protein  32.54 
 
 		 572 aa  212  1e-53  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.519367  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02706  TPR domain protein  30 
 
 		 667 aa  212  1e-53  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2604  TPR repeat-containing protein  33.92 
 
 		 653 aa  212  1e-53  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3714  TPR repeat-containing protein  30.76 
 
 		 572 aa  211  3e-53  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.325605  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1717  TPR repeat-containing von Willebrand factor, type A  29.51 
 
 		 572 aa  209  8e-53  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1588  TPR repeat-containing protein  31.08 
 
 		 572 aa  209  1e-52  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00107949 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1560  TPR repeat-containing protein  30.3 
 
 		 571 aa  208  2e-52  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.535158 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24390  TPR domain-containing protein  29.81 
 
 		 586 aa  207  4e-52  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00557521  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2861  TPR repeat-containing protein  32.37 
 
 		 692 aa  206  9e-52  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0393834 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2766  TPR repeat-containing protein  32.37 
 
 		 690 aa  206  1e-51  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1592  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  32.14 
 
 		 692 aa  204  3e-51  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000228279 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2933  TPR repeat-containing protein  30 
 
 		 588 aa  204  4e-51  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0523  hypothetical protein  29.91 
 
 		 619 aa  203  7e-51  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_18790  tetratricopeptide (TPR) repeat and VWA domain-containing protein  32.62 
 
 		 577 aa  201  1.9999999999999998e-50  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.00254687  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2786  TPR repeat-containing protein  32.52 
 
 		 693 aa  200  6e-50  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0568  von Willebrand factor, type A  29.17 
 
 		 573 aa  197  6e-49  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3212  hypothetical protein  30.03 
 
 		 578 aa  196  7e-49  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.190926 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2816  TPR repeat-containing protein  29.33 
 
 		 657 aa  196  8.000000000000001e-49  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3385  von Willebrand factor, type A  29.55 
 
 		 573 aa  195  2e-48  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.465184 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001268  TPR domain protein in aerotolerance operon  29.93 
 
 		 599 aa  195  2e-48  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05143  hypothetical protein  29.35 
 
 		 601 aa  192  1e-47  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3555  von Willebrand factor, type A  29.17 
 
 		 573 aa  192  2e-47  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2431  TPR repeat-containing protein  29.9 
 
 		 693 aa  186  1.0000000000000001e-45  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0167557 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1949  TPR repeat-containing protein  30.69 
 
 		 612 aa  185  2.0000000000000003e-45  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.931925  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2066  hypothetical protein  29.39 
 
 		 585 aa  183  7e-45  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1107  hypothetical protein  31.37 
 
 		 646 aa  181  4e-44  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02344  tetratricopeptide repeat domain protein  31.33 
 
 		 607 aa  179  1e-43  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1740  hypothetical protein  25.44 
 
 		 564 aa  172  2e-41  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3231  TPR repeat-containing protein  31.39 
 
 		 612 aa  161  3e-38  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.439888  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1205  hypothetical protein  36.99 
 
 		 304 aa  159  1e-37  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0853  TPR repeat-containing protein  32.54 
 
 		 680 aa  155  2e-36  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1732  TPR repeat-containing protein  24.41 
 
 		 587 aa  152  1e-35  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.966886  normal  0.26357 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1206  TPR repeat-containing protein  41.24 
 
 		 220 aa  137  5e-31  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2767  hypothetical protein  27.41 
 
 		 310 aa  119  9.999999999999999e-26  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2913  hypothetical protein  27.11 
 
 		 310 aa  115  2.0000000000000002e-24  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2395  von Willebrand factor type A  33.6 
 
 		 611 aa  108  3e-22  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.850853  normal  0.642372 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0649  von Willebrand factor, type A  23.81 
 
 		 471 aa  101  4e-20  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0657  von Willebrand factor, type A  23.11 
 
 		 595 aa  97.8  5e-19  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.676457  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5483  von Willebrand factor type A  26.34 
 
 		 320 aa  96.7  8e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1122  von Willebrand factor type A  27.68 
 
 		 335 aa  92.4  2e-17  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.51147  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0099  von Willebrand factor, type A  24.17 
 
 		 651 aa  85.5  0.000000000000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0906  von Willebrand factor type A  26.32 
 
 		 345 aa  84.3  0.000000000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.519509  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1482  von Willebrand factor type A  25.48 
 
 		 344 aa  84.3  0.000000000000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.428182  normal  0.250576 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2455  von Willebrand factor type A  27.53 
 
 		 338 aa  83.2  0.000000000000009  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0052  von Willebrand factor type A  33.33 
 
 		 589 aa  79.3  0.0000000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.649054  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0720  von Willebrand factor, type A  24.66 
 
 		 344 aa  78.2  0.0000000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.799777  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1538  von Willebrand factor type A  26.89 
 
 		 347 aa  78.6  0.0000000000003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.634535  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2667  von Willebrand factor type A  27.27 
 
 		 320 aa  73.9  0.000000000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0137073  normal  0.240647 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2912  hypothetical protein  41.46 
 
 		 293 aa  73.6  0.000000000008  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2766  hypothetical protein  41.46 
 
 		 278 aa  73.6  0.000000000008  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1887  von Willebrand factor, type A  29.29 
 
 		 334 aa  73.6  0.000000000008  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.615946  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02145  hypothetical protein  25.1 
 
 		 346 aa  73.2  0.00000000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1583  batB protein  28.07 
 
 		 339 aa  71.2  0.00000000004  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0441  von Willebrand factor type A  30.14 
 
 		 339 aa  68.2  0.0000000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.126065  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0523  von Willebrand factor type A  31.21 
 
 		 344 aa  67.4  0.0000000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1908  hypothetical protein  23.59 
 
 		 319 aa  67.4  0.0000000006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.137204 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2438  von Willebrand factor type A  29.29 
 
 		 315 aa  65.5  0.000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0243  von Willebrand factor type A  26.67 
 
 		 343 aa  63.2  0.00000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0131225  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2467  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  39.78 
 
 		 273 aa  62.4  0.00000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.724582 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2914  hypothetical protein  25.58 
 
 		 344 aa  62.4  0.00000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_18800  von Willebrand factor, type A (VWA) domain protein  28.57 
 
 		 335 aa  61.6  0.00000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.00117552  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0073  von Willebrand factor, type A  28.51 
 
 		 349 aa  61.6  0.00000004  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02150  aerotolerance-related membrane protein  25.29 
 
 		 334 aa  61.2  0.00000004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1812  von Willebrand factor type A  31.2 
 
 		 318 aa  61.2  0.00000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1659  von Willebrand factor, type A  25.7 
 
 		 343 aa  60.8  0.00000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.863974  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1220  von Willebrand factor, type A  24.52 
 
 		 337 aa  60.8  0.00000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.356622  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1886  von Willebrand factor, type A  27.18 
 
 		 329 aa  60.5  0.00000007  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3996  tetratricopeptide TPR_2  46.15 
 
 		 1694 aa  60.5  0.00000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.271204  normal  0.601264 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1318  von Willebrand factor type A  33.54 
 
 		 318 aa  60.1  0.00000009  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.598912  normal  0.213186 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1106  hypothetical protein  25.45 
 
 		 318 aa  60.1  0.00000009  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2085  von Willebrand factor type A  26.79 
 
 		 336 aa  59.7  0.0000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2768  hypothetical protein  25.36 
 
 		 344 aa  59.3  0.0000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1247  von Willebrand factor, type A  26.82 
 
 		 319 aa  59.3  0.0000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.513072 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1787  TPR repeat-containing protein  27.98 
 
 		 543 aa  58.9  0.0000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.662156  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1300  TPR repeat-containing protein  39.25 
 
 		 878 aa  58.9  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2791  TPR repeat-containing protein  31.78 
 
 		 243 aa  58.2  0.0000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.185879 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>